Draft genome analysis of Dietzia sp. 111N12-1, isolated from the South China Sea with bioremediation activity

Abstract Dietzia sp. 111N12-1, isolated from the seawater of South China Sea, shows strong petroleum hydrocarbons degradation activity. Here, we report the draft sequence of approximately 3.7-Mbp genome of this strain. To the best of our knowledge, this is the first genome sequence of Dietzia strain isolated from the sea. The genome sequence may provide fundamental molecular information on elucidating the metabolic pathway of hydrocarbons degradation in this strain.

A Case of Catheter-Related Bacteremia of Tsukamurella pulmonis / 대한진단검사의학회지

Tsukamurella pulmonis is an aerobic actinomycete. We report a catheter-related bacteremia of T. pulmonis. A 39 yr-old male with ALL was hospitalized to receive bone marrow transplantation (BMT). Although the patient developed a high fever at the 7th hospital day (HD), it subsided with vancomycin treatment, and he received BMT at 9th HD. Fever resurged at 16th HD despite sustained treatment with vancomycin, meropenem, and amphotericin B, but subsided with removal of Hickman catheter (HC) at 19th HD. Three sets of blood cultures comprising one from the HC and two from venipunctures were taken at 7th, 16th, and 19th HD, and the distal tip of the HC was also cultured. The aerobic vials of all 3 HC-withdrawn blood cultures and one peripheral blood culture taken at 19HD and the HC tip culture grew long, straight, thin gram-positive rods that were positive on modified Kinyoun stain. This organism showed tiny, rough, grey colonies after 3-day incubation and grew to large flat colonies when incubation was extended. It was catalase-positive, urease-positive, and alkaline-slant/alkaline-deep on triple sugar iron agar, and hydrolyzed hypoxanthine. The sequence of 1,296 base pairs of 16S rRNA of this organism showed a 100.0% homology with the published sequence of T. pulmonis DSM 44142T. To our knowledge, this is the first report of T. pulmonis bacteremia in Korea.

Micetoma por Actinomadura madurae en el pie: reporte de un caso en Chile / Actinomadura madurae mycetoma of the foot: report of one case

Mycetoma is a chronic infection that affects skin, subcutaneous tissue and bone. Its etiology can be mycotic or bacterial. It affects mainly the lower extremities ofmiddie age men livingin tropical climates. We repon a 44 year-old male ¡ivingin a template zone, consulting for swelling and pain in the left foot, lasting for 10 years. Physical examination showed a swollen left foot with hyperpigmented skin and a few crustedpapules. Radiology showed an extensive bone involvement of the midfoot with several oval and radiolucid images. Magnetic resonance showed son and bone tissue involvement, with múltiple oval and low intensity images in TI and T2. The biopsy was compatible with an unspecific chronic osteomyelitis. A bacterial identification by polymerase chain reaction and sequencing in the biopsy determined the presence of an Actinomadura madurae. Treatment with cotrimoxazol was started).

Identificación y producción de antibiosis por actinomycetales aislados del suelo / The identification y produced of antibiosis, for actinomycetales isolated of sail

La literatura mundial describe numerosas especies de actinomycetales aislados de los suelos con capacidad de sintetizar antibioticos; por tal motivo, nos propusimos identificar algunos de estos microorganismos aislados de suelos venezolanos y determinar la producción de antibióticos de los mismos. Las cepas se obtuvieron de la "Colección Tejera". La identificación se realizó por medio de criterios morfológicos fisiológicos (capacidad para degradar diversas fuentes de carbono, nitrogeno, bases nitrogenadas y resistencia a la lisozima) y citoquímicos (cromatografía en cepa fina de lípidos y aminoácidos). La determinación de la capacidad de antibiosis se basó en la formación de halos de inhibición del crecimiento en cepas testigo de Staphylococcus aureus y Escherichia coli. De las 35 cepas estudiadas, aproximadamente el 66 por ciento fue identificado como Streptomyces sp; un 11 por ciento como Nocardia sp: otro 12 por ciento repartido entre los géneros Actinomadura sp., Rhodococcus sp. y Micromonospora sp. El 11 por ciento restante no pudo ser identificado, por su falta de viabilidad. el 20 por ciento de las cepas produjo antibiosis, siendo todas ellas ubicadas dentro del género Streptomyces

Aislamiento, identificación y producción de antibiosis por Actinomycetales aislados de suelos de la ciudad de Mérida, Venezuela / Isolation identification and production of antibiosis for actinomycetales isolated of soil of the city of Merida, Venezuela

Desde hace muchos años se conoce que el hábitat natural más común de los Actinomycetales es el suelo; también que muchos de sus géneros poseen la habilidad para antibiótica. Por tal motivo, se realizó el aislamiento selectivo de algunas cepas de estos microorganismos por medio de filtros de membrana, antibióticos y calentamiento previo de las muestras de suelo, las cuales se tomaron en una localidad de la ciudad de Mérida, Venezuela. Posteriormente se efectuó la identificación de las mismas, basándose en estudios morfológicos, fisiológicos y citoquímicos. Por último, se determinó la capacidad de producir antibiosis sobre cepas de Staphylococcus aureus y Echerichia coli. Se logró aislar 17 cepas, el 76,5 por ciento de las cuales se recuperó de las muestras que se calentaron previamente. Del total de las cepas, el 11,8 por ciento se identificó dentro del género Actinomadura, otro 11,8 por ciento como Nocardia, un 29,4 por ciento como Rhodococcus y el 47 por ciento restante dentro de los Streptomyces. Solamente una cepa logró producir antibiosis sobre S.aureus, siendo identificada como Actinomadura

Los actinomicetos termofilos de JuJuy: I. Monosporados / The Actinomycetes thermophiles of Jujuy, Argentina: I. Monosporium

Se aislaron cepas de Thermoactinomyces thalpophilus, T. dichotomica y Saccharomonospora viridis, a partir de restos vegetales y residuos de la industria azucarera obtenidos en la zona subtropical jujeña. Estas especies están consideradas como agentes causales de neumonitis alérgica