Résumé
Resumen La participación en programas de evaluación externa de la calidad (PEEC) dirigidos al diagnóstico de enfermedades genéticas permite obtener una medida objetiva del desempeño técnico y analítico de los laboratorios y es un requisito para la acreditación de los laboratorios clínicos bajo la norma ISO 15189. El objetivo de este estudio fue evaluar retrospectivamente el desempeño en los esquemas EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) y CF Network (Cystic Fibrosis European Network) en el período 2014-2022. Se participó en un total de 88 esquemas. Se recolectó la información de nuestros puntajes y las medias de los laboratorios participantes en las categorías genotipificación, interpretación y exactitud de la información del paciente/informe. Se informó en forma completa el 90,9% (n=80) de los esquemas. El desempeño en genotipificación mostró puntajes superiores a la media en el 89,3% de los esquemas; 0,8% de los informes correspondieron a falsos negativos. En interpretación, el 66,7% de los esquemas evidenció un desempeño superior a la media y el 33,3% debajo de la media. La exactitud de la información del paciente/informe presentó puntajes superiores a la media en el 97,6% de los esquemas. Se observó una diferencia estadísticamente significativa en el porcentaje de esquemas con puntaje por encima de la media en el año 2022 (10/12 esquemas) respecto al año 2014 (1/6 esquemas) en la categoría interpretación (p=0,0128). En conclusión, la participación regular en PEEC tuvo impacto positivo en la calidad de los estudios y permite realizar mejoras continuas a partir de las recomendaciones sugeridas por estos programas.
Abstract Participation in external quality assessment programmes focused on rare genetic diseases makes it possible to assess the laboratory technical and analytical performance and it is a prerequisite for accreditation according to ISO 15189. The objective of this study was to perform a retrospective evaluation of our performance in the EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) and the CF Network (Cystic Fibrosis European Network) programmes in the 2014-2022 period. The laboratory performance on genotyping, interpretation and clerical accuracy and patient identifiers in a total of 88 schemes were assessed. The information of our scores and the mean scores of all participating laboratories in the three categories were collected. A total of 90.9% of the schemes were fully completed. The performance in genotyping showed scores above the mean scores in 89.3% of the schemes; 0.8% of the reports correspond to false negative results. Regarding interpretation category, 66.7% of the schemes presented scores above the mean scores and 33.3% below the mean scores. The clerical accuracy and patient identifiers were above the mean scores in 97.6% of the schemes. A statistically significant difference in the percentage of schemes with a score above the mean for the interpretation category in the year 2022 (10/12 schemes) was observed compared to the year 2014 (1/6 schemes) (p=0.0128). In conclusion, regular participation in external quality assessment programmes had a positive impact on the quality of the studies and allows for continuous improvements based on the recommendations suggested by these programmes.
Resumo A participação em programas de avaliação externa da qualidade (PEECs) voltados para o diagnóstico de doenças genéticas permite obter uma mensuração objetiva do desempenho técnico e analítico dos laboratórios e é requisito para a acreditação dos laboratórios clínicos sob a norma ISO 15189. O objetivo desse estudo foi avaliar retrospectivamente o desempenho nos esquemas EMQN (European Molecular Genetics Quality Network) e CF Network (Cystic Fibrosis European Network) no período 2014-2022. Participou-se em um total de 88 esquemas. Foram coletadas informações de nossos escores e das médias dos laboratórios participantes nas categorias genotipagem, interpretação e precisão da informação do paciente/laudo. 90,9% (n=80) dos esquemas foram informados em sua totalidade. O desempenho na genotipagem apresentou escores acima da média em 89,3% dos esquemas; 0,8% dos laudos corresponderam a falsos negativos. Na interpretação, 66,7% dos esquemas apresentaram desempenho acima da média e 33,3% abaixo da média. A precisão das informações do paciente/laudo apresentou escores acima da média em 97,6% dos esquemas. Observou-se diferença estatisticamente significativa no percentual de esquemas com pontuação acima da média no ano de 2022 (10/12 esquemas) em relação ao ano de 2014 (1/6 esquemas) na categoria interpretação (p=0,0128). Em conclusão, a participação regular em PEECs teve um impacto positivo na qualidade dos estudos e permite fazer melhorias contínuas com base nas recomendações sugeridas por esses programas.
Résumé
Resumen Durante la ontogenia linfocitaria se produce el reordenamiento de los segmentos génicos V-(D)-J que codifican para la región variable de las cadenas de inmunoglobulinas (Ig) y receptores de linfocitos T (TCR). Durante este proceso, los segmentos se reordenan al azar y ocurren deleciones e inserciones de nucleótidos en la región de unión entre ellos. Los objetivos del presente trabajo fueron describir las incidencias de los reordenamientos Ig/TCR y de los segmentos V-(D)-J involucrados, en niños con leucemia linfoblástica aguda (LLA). Para ello se estudiaron 769 pacientes pediátricos con LLA, diagnosticados entre 1999 y 2018 por los centros de la Sociedad Argentina de Hemato-Oncología Pediátrica. Se caracterizaron reordenamientos de Ig/TCR mediante PCR-multiplex y secuenciación para la búsqueda de recombinaciones génicas IGH, IGK, TCRB, TCRG y TCRD, en muestras de ADN obtenidas de médula ósea o sangre periférica al diagnóstico. El 95% (n=730) de los casos presentaron reordenamientos Ig/TCR. En el 68% de los casos se caracterizaron recombinaciones génicas IGH, en 43% IGK, en 25% TCRB, en 49% TCRG y en el 55% TCRD. Se caracterizó un total de 2506 reordenamientos de Ig/TCR que correspondían 1161 a inmunoglobulinas y 1345 a TCR. En la mayoría de los casos los reordenamientos de IGH fueron completos, IGK involucró a IGKde, TRCB se reordenó frecuentemente con el segmento Jb2, TCRG involucró preferentemente a Vg9 y los TCRD fueron principalmente reordenamientos incompletos. Este trabajo constituye el primer estudio realizado en la Argentina sobre la caracterización de reordenamientos Ig/TCR en un número muy significativo de pacientes con LLA pediátrica.
Abstract During lymphocyte ontogeny, the variable region of immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TCR) is generated by rearrangements of the V-(D)-J gene segments. In this random process, nucleotide deletions and insertions occur between V-(D)-J segments. The aims of this work were to describe the incidence of Ig/TCR rearrangements, and the V-(D)-J segments involved in acute lymphoblastic leukemia (ALL) patients. With this purpose, 769 pediatric ALL patients belonging to Sociedad Argentina de Hemato-Oncología Pediátrica, diagnosed between 1999 and 2018, were studied. Ig/TCR rearrangements were characterized by multiplex PCR and sequencing to evaluate IGH, IGK, TCRB, TCRG and TCRD rearrangements in DNA samples obtained at diagnosis from bone marrow or peripheral blood. In total, 95% (n=730) of patients disclosed Ig/TCR rearrangements. IGH rearrangements were detected in 68% of cases; in 43% IGK, in 25% TCRB, in 49% TCRG and in 55% of cases, TCRD. A total of 2506 Ig/TCR rearrangements were characterized, being 1161 immunoglobulins and 1345 TCR. In most cases, IGH rearrangements were complete, IGK involved IGKde, TRCB was frequently rearranged with the Jb2 segment, TCRG preferentially involved Vg9, and TCRDs were mostly incomplete rearrangements. This work is the first study of Ig/TCR rearrangements characterization in a very significant number of childhood ALL carried out in Argentina.
Resumo Durante a ontogenia dos linfócitos, ocorre um rearranjo dos segmentos gênicos V-(D)-J que codificam para a região variável das cadeias de imunoglobulinas (Ig) e receptores de linfócitos T (TCR). Durante esse processo, os segmentos reorganizam-se aleatoriamente e exclusões e inserções de nucleotídeos ocorrem na região da união entre eles. Os objetivos do presente trabalho foram descrever as incidências dos rearranjos Ig/TCR e dos segmentos V-(D)-J envolvidos, em crianças com leucemia linfoide aguda (LLA). Para tanto, foram estudados 769 pacientes pediátricos com LLA, diagnosticados entre 1999 e 2018 pelos centros da Sociedade Argentina de Hemato-Oncologia Pediátrica. Rearranjos de Ig/TCR foram caracterizados através de PCR-multiplex e sequenciação para procurar recombinações gênicas IGH, IGK, TCRB, TCRG e TCRD em amostras de DNA obtidas da medula óssea ou sangue periférico no diagnóstico. Do total de pacientes estudados, 95% (n=730) apresentaram rearranjos de Ig/TCR. Os rearranjos gênicos IGH foram caracterizados em 68% dos casos, em 43% de IGK, em 25% de TCRB, em 49% de TCRG e em 55% de TCRD. Foi caracterizado um total de 2506 rearranjos de Ig/TCR, correspondendo 1161 a imunoglobulinas e 1345 a TCR. Na maioria dos casos, os rearranjos de IGH foram concluídos, o IGK envolveu o IGKde, o TRCB foi frequentemente rearranjado com o segmento Jb2, o TCRG preferencialmente envolveu o Vg9 e os TCRDs foram principalmente os rearranjos incompletos. Este trabalho constitui o primeiro estudo realizado na Argentina sobre a caracterização de rearranjos de Ig/TCR em um número muito significativo de pacientes com LLA pediátrica.