A molecular method for a qualitative analysis of potentially coding sequences of DNA

Filogenias baseadas em seqüências totais têm baixo conteúdo informativo. Erros comuns são acreditar que a qualidade dos caracteres pode ser ignorada e que é suficiente confiar nos algoritmos computacionais. Apesar de ampla preferência por métodos a posteriori para a avaliação de caracteres, métodos a priori tornam-se necessários para produzir séries de transformação independentes das topologias das árvores. Propomos um método qualitativo passo a passo para analisar seqüências de proteínas. Codons informativos são selecionados, séries de transformação alternativas de aminoácidos são analisadas e as transformações mais parcimoniosas são hipotetizadas. Conduzimos quatro análises filogenéticas em cobras Phylodrininae. A árvore baseada em todos os nucleotídeos produz a menor resolução. Arvores baseadas na exclusão das terceiras posições, numa matriz de passos assimétrica, e em nosso protocolo de análise produzem resultados similares. Nosso método elimina ruído ao hipotetizar séries de transformação explícitas para cada aminoácido informativo para a codificação de proteínas. Essa abordagem se aproxima de métodos qualitativos para dados morfológicos, nos quais apenas caracteres interpretados com sucesso num contexto filogenético são usados em análises cladísticas. O método permite utilizar informação de caracteres contidos no alinhamento original da seqüência e, portanto, tem maior poder de resolução para inferir árvores filogenéticas que alguns métodos tradicionais (como métodos de distância).

DNA fingerprinting of mycobacterium tuberculis from patients with and without AIDS in Rio de Janeiro

Isolates of Mycobacterium tuberculosis derived from patients with AIDS from a single hospital in Rio de Janeiro were typed using a standardized RFLP technique detecting IS6110 polymorphism. Nineteen isolates were obtained from 15 different patients. Eleven distinct IS6110 patterns were found, with 4 banding patterns shared by 2 patients. The clustering value of 53 percent was much higher in comparison with clustering of M. tuberculosis strains from TB patients without clinical signs for HIV infection from randomly selected health centers. We present these results as preliminary data on M. tuberculosis strain polymorphism in Brazil and on the higher risk for recent transmission amongst patients with AIDS.

Cases of human envenoming caused by Philodryas olfersii and Philodryas patagoniensis (Serpentes: Colubridae)

O presente trabalho é um relato de dois casos de acidentes com colubrídeos (Philodryas olfersii e P. patagoniensis) considerados não peçonhentos, que destaca as manifestações clínicas e as suas evoluções. A semelhança de tais acidentes com aqueles causados por serpentes Bothrops indica a necessidade de uma melhor avaliação dos pacientes quanto à terapêutica a ser adotada.

The present paper reports two cases of human envenoming by colubrid snakes of Philodryas, considered as not poisonous, showing evidence of the clinical aspects and the evolution of the symptoms of envenoming. The similarity of these cases with those caused by Bothrops suggests a more careful evaluation on the victims considering the medical treatment to be adopted.