Diagnóstico de tuberculosis con ensayo Xpert® MTB/RIF en la región oriental de Cuba

Introducción: La infección por tuberculosis repercute en el mundo a pesar de los años de estudio y avances tecnológicos en su diagnóstico. El ensayo Xpert® MTB/RIF permite, en gran medida, la identificación del bacilo de Koch en cualquier muestra patológica, y lo hace con una alta sensibilidad, especificidad y rapidez con respecto a otros métodos. Objetivo: Realizar el diagnóstico de tuberculosis con ensayo Xpert® MTB/RIF. Método: Se realizó un estudio transversal en 46 muestras analizadas (n=46) de las provincias orientales de Cuba con ensayo Xpert® MTB/RIF, entre abril y septiembre de 2023, por el Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Holguín. Las variables estudiadas fueron: provincia de procedencia, edad, sexo, tipo de muestra, factores de riesgo, resultado al ensayo y resistencia a la rifampicina. Resultados: Santiago de Cuba y Guantánamo fueron las provincias que mayor cantidad de casos reportaron, con 14 casos cada una (30,4 %). El sexo masculino fue el de mayor incidencia, 33 casos (71,7 %), independientemente de la provincia. El grupo de edad de 25 a 34 años fue el de mayor prevalencia, con el 26,1 %. Los grupos de riesgos más afectados fueron: los fumadores (37,0 %), los reclusos (32,6 %), los adultos mayores de 60 años (26,6 %) y los alcohólicos (23,9 %). Conclusiones: La introducción del GeneXpert en su diagnóstico es muy efectivo, por su alta sensibilidad y especificidad con relación a los estudios tradicionales, como son la baciloscopia y el cultivo, además de la rapidez en la obtención del resultado.Informa también sobre la resistencia a la rifampicina, atribuible al gen rpoβ, lo que resulta muy oportuno en momentos en que la multidrogorresistencia aumenta aceleradamente.

Introduction: Tuberculosis infection affects the world despite years of study and technological advances in its diagnosis.The Xpert® MTB/RIF test allows, to a largeextent, the identification of Koch bacillus in any pathological sample, and does so with high sensitivity, specificity and speed compared too ther methods. Objective: To diagnose tuberculosis with the Xpert® MTB/RIF test. Method: A cross-sectional study was carried out on 46 analyzed samples (n 46) from the eastern provinces of Cuba with the Xpert® MTB/RIF test, between April and September 2023, by the Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Holguín (Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology of Holguín).The variables studied were: province of origin, age, sex, type of sample, risk factors, test resultand resistance to rifampicin. Results: Santiago de Cuba and Guantánamo were the provinces that reported the highest number of cases, with 14 cases each(30.4%).The maleshad the highest incidence, 33 cases (71.7%), regardless of the province.The age group of 25 to 34 years was the one with the highest prevalence, with 26.1%.The most affected risk groups were: smokers (37.0%), prisoners (32.6%), adults over 60 years of age (26.6%) and alcoholics (23.9%). Conclusions: The introduction of GeneXpert in tuberculosis diagnosis is very effective, due to its high sensitivity and specificity in relation to traditional studies, such as smear microscopy and culture, in addition to the speed in obtaining the result. It also reports on resistance to rifampicin, attributable to the rpoβ gene, which is timely at a moment when multidrug resistance is increasing rapidly.

Introdução: A infecção tuberculosa afeta o mundo apesar de anos de estudo e avanços tecnológicos no seu diagnóstico.O ensaio Xpert® MTB/RIF permite, em grande medida, a identificação do bacilo de Koch em qualquer amostra patológica, e fá-lo com elevada sensibilidade, especificidade e rapidez em comparação com outros métodos. Objetivo: Diagnosticar tuberculose com o ensaio Xpert® MTB/RIF. Método: Foi realizado um estudo transversal em 46 amostras analisadas (n 46) das províncias orientais de Cuba com o ensaio Xpert® MTB/RIF, entre abril e setembro de 2023, pelo Centro Provincial de Higiene, Epidemiologia e Microbiologia de Holguín.As variáveis estudadas foram: província de origem, idade, sexo, tipo de amostra, fatores de risco, resultado de exame e resistência à rifampicina. Resultados: Santiago de Cuba e Guantánamo foram as províncias que notificaram o maior número de casos, com 14 casos cada (30,4%).O sexo masculino teve a maior incidência, 33 casos (71,7%), independentemente da província.A faixa etária de 25 a 34 anos foi a que apresentou maior prevalência, com 26,1%.Os grupos de risco mais acometidos foram: fumantes (37,0%), presidiários (32,6%), adultos acima de 60 anos (26,6%) e alcoolistas (23,9%). Conclusões: A introdução do GeneXpert no seu diagnóstico é muito eficaz, devido à sua alta sensibilidade e especificidade em relação aos estudos tradicionais, como baciloscopia e cultura, além da rapidez na obtenção do resultado.Também relata a resistência à rifampicina, atribuível ao gene rpoβ, que é muito oportuna numa altura em que a resistência a múltiplos medicamentos está a aumentar rapidamente.

Mapa microbiológico: software para los laboratorios de microbiología

Introducción: El mapa microbiológico permite conocer desde una situación infecciosa particular hasta la epidemiología de toda la institución en torno a las infecciones, así como las opciones terapéuticas. Objetivos: Crear una base de datos que analice los datos registrados mediante consultas y formularios a partir de criterios de búsqueda. Métodos: Se confeccionó una base de datos empleando Microsoft Access, y se organizó la información usando lenguajes de programación SQL y VBA mediante consultas y formularios. Resultados: Se obtuvieron tablas, consultas y formularios para proporcionar la información de acuerdo a las exigencias del laboratorio y el servicio que lo solicita. Conclusiones: El software ofrece una solución al acceso de la información de forma digital, rápida y certera, además de segura. El registro de los datos es el único proceder manual, con lo que se minimizan las jornadas dedicadas al desarrollo del informe final. Se sugiere el empleo del mapa microbiológico en Microsoft Access como herramienta en los laboratorios de microbiología.

Introduction: The microbiological map allows us to know from a particular infectious situation to the epidemiology of the entire institution regarding infections, as well as therapeutic options. Objectives: To create a database that groups the results of microorganisms isolated in the laboratory and their susceptibility (according to the antibiogram), capable of grouping queries and accounts based on search criteria. Methods: A database was created using Microsoft Access, and the information was organized using SQL and VBA programming languages, through queries and forms. Results: Tables, consultations and forms were obtained to provide information according to the requirements of the laboratory and the service that requests it. Conclusions: The software offers a solution to access information digitally, quickly, accurately, and safely. Data recording is the only manual procedure, thus minimizing the days dedicated to the development of the final report. The use of the microbiological map using Microsoft Access is suggested as a tool in microbiology laboratories.

Elementos claves para evitar la contaminación en el Laboratorio de Biología Molecular de la provincia Holguín / Key elements to avoid contamination at the Molecular Biology Laboratory in Holguin province

Introducción: La técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una herramienta diagnóstica altamente específica, pero muy sensible. Su susceptibilidad a la contaminación constituye el principal problema en los laboratorios. Por ello, es urgente conocer las posibles causas de su origen, así como prevenirlas y contar con varios métodos para su eliminación. Objetivo: Describir los elementos claves para evitar la contaminación en el Laboratorio de Biología Molecular de la provincia Holguín. Métodos: Se realizó una revisión bibliográfica en la base de datos de Google académico y en artículos relevantes relacionados con el tema. Además, se tomó como referencia las Orientaciones sobre la bioseguridad en el laboratorio relacionada con la COVID-19 de la Organización Mundial de la Salud, versión 2021. Información, análisis y síntesis: Se recomienda llevar a cabo una valoración institucional del riesgo para identificar los peligros específicos de cada etapa del proceso: exposición a aerosoles, posibles salpicaduras, derrames de materiales y riesgos químicos relacionados con los reactivos. Cada etapa debe tener su riesgo evaluado. La prevención de la contaminación de una PCR comienza con la distribución de las zonas, por eso el flujo de trabajo en un laboratorio de biología molecular es solo en una dirección: de pre-PCR a PCR. Además de la aplicación de normas generales, se deben tomar otras medidas de eliminación de riesgos como el control de ingeniería, la eficacia germicida de la luz ultravioleta y el control de la contaminación del laboratorio. Conclusiones: Evitar la contaminación en el laboratorio de Biología Molecular de la provincia Holguín en el curso de la pandemia de SARS-CoV-2 es de vital importancia en la calidad de los servicios de salud.

Introduction: The polymerase chain reaction (PCR) technique is a highly specific but very sensitive diagnostic tool. Its susceptibility to contamination is the main problem in laboratories. Therefore, taking into account the possible causes of its origin, preventing it and having several methods for its elimination is of paramount importance. Objective: To describe the key elements to avoid contamination at the Molecular Biology Laboratory in Holguin province. Methods: A literature review was conducted in the Google Scholar database and in relevant articles related to the topic. In addition, the Laboratory biosafety guidance related to coronavirus disease (COVID-19) version 2021 was used as a reference. Information, analysis and synthesis: It is recommended to conduct an institutional risk assessment to identify the specific hazards of each stage of the process: exposure to aerosols, possible splashes, material spills and chemical hazards related to reagents. Preventing contamination of a PCR starts with the layout of the areas, that is why the workflow in a molecular biology laboratory is only in one direction: from pre-PCR to PCR. In addition to the application of general standards, other hazard elimination measures such as engineering control, germicidal efficacy of ultraviolet light, and laboratory contamination control must be taken. Conclusions: Avoiding contamination in the Molecular Biology Laboratory in Holguin province in the course of the SARS-CoV-2 pandemic is vital for the quality of health services.