Automated systems in the identification and determination of methicillin resistance among coagulase negative staphylococci

Coagulase-negative staphylococci (CoNS) are an important cause of nosocomial bacteremia, specially in patients with indwelling devices or those submitted to invasive medical procedures. The identification of species and the accurate and rapid detection of methicillin resistance are directly dependent on the quality of the identification and susceptibility tests used, either manual or automated. The objective of this study was to evaluate the accuracy of two automated systems MicroScan and Vitek - in the identification of CoNS species and determination of susceptibility to methicillin, considering as gold standard the biochemical tests and the characterization of the mecA gene by polymerase chain reaction, respectively. MicroScan presented better results in the identification of CoNS species (accuracy of 96.8 vs 78.8 percent, respectively); isolates from the following species had no precise identification: Staphylococcus haemolyticus, S. simulans, and S. capitis. Both systems were similar in the characterization of methicillin resistance. The higher discrepancies for gene mec detection were observed among species other than S. epidermidis (S. hominis, S. saprophyticus, S. sciuri, S. haemolyticus, S. warneri, S. cohnii), and those with borderline MICs.

A reação em cadeia da polimerase na detecção da resistência à penicilina em Streptococcus pneumoniae / Polymerase chain reaction used to detect Streptococcus pneumoniae resistance to penicillin

INTRODUÇAO: O Streptococcus pneumoniae é o mais freqüente agente etiológico de infecções respiratórias adquiridas na comunidade e sua resistência aos antimicrobianos tem aumentado nos últimos anos. A determinação da resistência é feita rotineiramente por método lento que depende do crescimento em cultura e determinação da concentração inibitória mínima (CIM). A reação em cadeia da polimerase (PCR) detecta os genes responsáveis pela resistência do Streptococcus pneumoniae a penicilina em cerca de 8 horas. OBJETIVO: Comparar a PCR com o método da CIM no diagnóstico da resistência da Streptococcus pneumoniae a penicilina. MÉTODO: Foram estudadas 153 amostras de Streptococcus pneumoniae, isoladas de diferentes sítios anatômicos, usando-se para detecção de mutações nos genes que codificam as proteínas ligadoras de penicilina 1a, 2b e 2x, responsáveis pela resistência à penicilina. A ocorrência das mutações foi correlacionada com a CIM de penicilina, determinada pelo teste de difusão em ágar. RESULTADOS: A resistência global à penicilina do Streptococcus pneumoniae foi de 22,8 por cento (16,3 por cento de resistência intermediária e 6,5 por cento de resistência alta). Em proporções estatisticamente significativas, as amostras sensíveis à penicilina não tinham mutações, as intermediárias apenas uma, geralmente na proteína ligadora de penicilina 2x, e as altamente resistentes tinham mutações nas três proteínas investigadas. CONCLUSAO: A PCR é um método rápido para a detecção da resistência à penicilina do Streptococcus pneumoniae, que poderá vir a ser utilizado na prática clínica.

Laboratory tests in the detection of extended spectrum beta-lactamase production: National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) screening test, the E-test, the double disk confirmatory test, and cefoxitin susceptibility testing

Extended spectrum beta-lactamase (ESBL) production by Klebsiella sp. and E. coli is an emerging problem. In this study, 107 clinical isolates (53 E. coli, 47 K. pneumoniae and 7 K. oxytoca) screened as ESBL producers by the NCCLS disk diffusion procedure were submitted to a double disk confirmatory test (DDT) and to the E-test double strip for confirmation of ESBL production by demonstration of clavulanic acid inhibition effect (CAIE). Only 72/107 (67 percent) of the isolates were confirmed as ESBL producers by DDT, with diverse results among species. By the E-test, 58/107 (54 percent) isolates were confirmed as ESBL producers, and 18/107 (17 percent) were not determinable. Susceptibility to cefoxitin was found in 57/68 (83 percent) of strains that did not show CAIE. ESBL detection remains a controversial issue and clinical laboratories are in need of a simple and effective way to recognize strains with this kind of resistance.

Antimicrobial resistance in respiratory pathogens isolated in Brazil during 1999-2000

The in vitro antimicrobial susceptibility of the respiratory pathogens Streptococcus Pneumoniae, Hemophilus influenzae, and Moraxella catarrhalis to commonly tested and prescribed agents was investigated during 1999-2000 and compared with results obtained during a previous 1997-1998 study. Of 448 isolates of S. Pneumoniae collected and tested in 1999-2000, 77.2 were susceptible, 19.9 were intermediate, and 2.9 were resistant to penicillin, demonstrating that there were no major changes in susceptibility to penicillin from 1997-1998 (77.1 susceptible, 18.7 intermediate, 4.2 resistant). All S. Pneumoniae isolates from 1999-2000 were susceptible to levofloxacin and vancomycin and >90 were susceptible to the B-lactams (amoxicillin-clavulanate, ceftriaxone, and cefuroxime) and macrolides (axithyromycin and clarithromycin), showing that susceptibility to these agents also remained unchanged since 1997-1998. The most notable increase in resistance between the two studies was demonstrated by trimethoprim-sulfamethoxazole, which increased from 23.4 to 38.6. Penicillin resistance correlated with resistance to B-lactams, macrolides, and trimethoprim-sulfamethoxazole in both studies. In H. influenzae, the prevalence of B-lactamase-producing isolates remained unchanged (10.6 in 1999-2000; 11.0 in 1997-1998). All H. influenzae isolates were susceptible to levofloxacine, ceftriaxone, cefuroxime, and azithromycin, and showed no change between the two studies. Trimethoprim-sulfamethoxazole resistance was present in 40.1 of isolates in 1999-2000, and in 45.2 in 1997-1998. In M. catarrhalis, the prevalence of B-lactamase-producing isolates was unchanged (97.9 in 1999-2000;98.0 in 1997-1998). The most active agents against M. catarrhalis were azithromycin (MIC(90),< or = 0.03 microg/ml) and levofloxacin (MIC(90),< or = 0.03 microg/ml). Overall, these results suggest that, in Brazil, between 1999-2000 and 1997-1998, there have been no significant changes in the susceptibility of respiratory pathogens to any of the commonly tested and prescribed agents with the exception of trimethoprim-sulfamethoxazole for S. Pneumoniae.

Isolation of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) serotype 091: H21 from a child with diarrhea in Porto Alegre city, RS, Brazil

We describe the isolation of one strain of Shiga toxin-producing Escherichia coli 091: H21 from a child with diarrhea in the city of Porto Alegre, RS, Brazil. Considering the pathogenic potential of STEC, these organisms should be looked for more carefully among our population.

Triagem para detecçäo de resistência de Streptococcus pneumoniae à penicilina: estudo usando discos de oxacilina de três diferentes fabricantes / Screening for penicillin resistance of Streptococcus pneumoniae: a study with oxacillin discks of three different manufacturers

Resistência de Streptococcus pneumoniae à penicilina é um problema emergente global. Triagem para resistência à penicilina com uso de discos de oxacilina em teste em difusäo em ágar permite reconheciemnto de isolados suscetíveis. Isolados resitentes por este teste säo encaminhados para determinaçäo da concentraçäo inibitória mínima. Estudamos o desempenho do teste de triagem com discos de oxacilina em 119 isolados de S. peneumoniae, determinando o valor preditivo do teste para definiçäo da resitência. Discos de oxacilina de três diferentes fontes comerciais foram empregados. O valor preditivo do teste de triagem variou de 52,6-65,5 por cento entre discos testados, näo havendo, no entando, diferença significativa entre os valores. O valor preditivo do teste de triagem foi compatível com os observados na literatura para populaçöes com prevalência de resistência semelhante

Agar diffusion tests with cefuroxime disks for predicting ceftriaxone susceptibility among isolates of "Streptococcus pneumoniae"

The performance of agar diffusion tests using disks of cefuroxine (30 micrograms) for predicting ceftriaxone susceptibility in 33 isolates of "Streptococcus pneumoniae"was studied. All 7 resistant isolates to ceftriaxone (MIC>= 1.0 microgram/ml) exhibited zones of inhibition < 28 mm. The procedure can be easily adapted to clinical laboratories.

Resistência aos níveis elevados de aminoglicosídeos entre amostras de enterococcus isoladas na Irmandade Santa Casa de Misericórdia do Porto Alegre / High-Level resitance of aminoglycosides among isolates of enterococcus from irmandade Snta Casa de Misericórdia de Porto Alegre (ISCMPA)

O Enterococcus tem emergido como um dos mais importantes patógenos nosocomiais no mundo inteiro. Cepas resistentes aos níveis elevados de aminoglicosídeos, principalmente à gentamicina e à estreptomicina, têm aparecido com certa freqüencia em ambientes hospitalares, o que tem sido causa de preocupaçäo, pois causa de preocupaçäo, pois estes antimicrobianos säo utilizados no tratamento de infecçöes sérias causadas por este microrganismo. Alguns pesquisadores do sudeste do país têm se preocupado com esses dados, mas, no Rio Grande do Sul, ainda näo há dados disponíveis em relaçäo a esta resistência. Trinta e seis amostras isoladas da Irmandade Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre (ISCMPA), 35 (97,2 por cento) de E. faecalis e uma (2,8 por cento) de E. faecium, foram analisadas. Resistência aos níveis elevados de gentamicina, estreptomicina e aos dois aminoglicosídeos foi abservada em 50 por cento, 8,33 por cento e 2,77 por cento das amostras, respectivamente. Nossos resultados, apesar de pequena amostragem, indicam que a resistência aos níveis elevados de gentamicina tem alta prevalência em nosso meio e enfatizam a necessidade de estabelecer técnicas in vitro precisas de detecçäo desta resistência

Streptococcus agalactiae näo-hemolítico: identificaçäo por automaçäo / Streptococcus agalactiae non-hemolytic: identification by automation

Säo relatados quatro isolamentos de Streptococcus agalactiae grupo B (GBS) näo-hemolítico em urina. Amostras näo-hemolíticas de GBS raramente causam doença e säo habitualmente detectadas em funçäo perinatal. A identificaçäo foi obtida usando procedimento de automaçäo com um sistema comercial. Os isolados foram provenientes de amostras com contagens superiores a 100.000UFC/ml. A natureza retrospectiva deste estudo näo permitiu utilizar testes convencionais para caracterizaçäo do S. agalactiae. É preconizada a utilizaçäo de, pelo menos, um teste convencional de características para confirmaçäo do diagnóstico

Estafilococos resistentes à Oxacilina säo encontrados entre portadores da comunidade? / Are there oxacilin resistent staphilococci among carriers in the communitty?

O objetivo deste trabalho é investigar a existência de estafilococos resistentes à oxacilina entre portadores da comunicade. Para tanto, estudamos amostras obtidas de 93 estudantes de medicina näo expostos ao ambiente hospitalar. Dois testes laboratoriais foram empregados para detecçäo de resistência à oxacilina: teste de difusäo em ágar e teste de triagem com meio salino. Isolou-se Staphylococcus aureus em 21 (22,6 por cento) dos estudantes, näo tendo sido observada resistência a oxacilina. Em três estudantes encontramos estafilococos coagulares negativos apresentando resistência a oxacilina. Os dois testes laboratoriais usados na detecçäo de resistência apresentaram boa correlaçäo. Os dados obtidos apoiam o uso de oxacilina para tratamento de estafilococcias adquiridas na comunidade

Resistência de "Haemophilus influenzae" à ampicilina: uma revisäo / Resistance of \"Haemophilus influenzae\" to ampicillin: a review

Resistência de "Haemophilus influenzae" à ampicilina é um tema pouco conhecido e discutido em nosso meio. Na presente revisäo säo abordados aspectos relativos a diferentes mecanismos de resistência do microrganismo à ampicilina e os efeitos que os mesmos tem na definiçäo de resistência. A prevalência da resistência à ampicilina em diferentes países é apresentada, observando-se considerável variaçäo regional. A controvérsia sobre as alternativas para documentaçäo laboratorial da resistência é explorada, sendo discutidas as alternativas mais viáveis para laboratórios médicos. É destacada a necessidade de mais estudos que documentem resistência de "Haemophilus influenzae" à ampicilina em nosso país

Avaliaçåo da coloraçåo de Gram e filtraçåo colorimétrica na triagem de uroculturas / Evaluation of Gram stain and colorimetric filtration for urine culture screening

Uroculturas såo responsáveis por significativa proporçåo na carga de trabalho dos laborátorios médicos, sendo que 70 a 80 por cento das amostras resultam negativas. Dois sistemas de triagem, coloraçåo de Gram de urina nåo centrifugada e filtraçåo colorimétrica, foram avaliados frente a urocultura quantitativa (definida como positiva quando mais de 10.000 UFC/mL presentes na amostra) a qual detectou 122 (16,6 por cento) urinas positivas entre 736 amostras. Para a coloraçåo de Gram obteve-se 83,6 por cento de sensibilidade, 97,4 por cento de especificidade, 86,4 por cento de valor preditivo positivo e 96,8 por cento de valor preditivo negativo. Sensibillidade, especificidade, valores preditivos positivo e negativo para a filtraçåo colorimétrica foram, respectivamente, 98,4 por cento e 77,2 por cento, 46,1 por cento e 99,6 por cento. Foi observada superioridade da filtraçåo colorimétrica sobre a coloraçåo de Gram na triagem de uroculturas negativas devido à maior sensibilidade e mais alto valor preditivo negativo. Filtraçåo colorimétrica revelou-se uma alternativa rápida e confiável paratriagem de uroculturas negativas

Escherichia coli 0157:H7 - um "novo" patogeno / Escherichia coli 0157:H7 - a new pathogen

Um "novo" patogeno da especie Escherichia coli, associado a colite hemorragica afebril e ao sindrome hemolitico uremico e focalizado. A cepa nao produz toxinas LT e ST, nao apresenta mecanismo invasor e nao se enquadra nos sorotipos da Escherichia coli enteropatogenica classica. Um meio de cultivo para isolamento primario, baseado na fermentaçao do sorbitol, foi proposto e sua conveniencia foi avaliada

Diagnostico laboratorial de legionella em amostras clinicas / The diagnosis of legionella infections

Os autores revisam as alternativas laboratoriais para o diagnostico de infecçoes por Legionella. E enfatizado o emprego de amostras clinicas acessiveis, como escarro e analisados metodos bacteriologicos e sorologicos

Relato de um caso de dermatofitose pelo Trichophyton tonsurans no rio Grande do Sul / Report of a case of dermatophytosis by Trichophyton tonsurans in Rio Grande do Sul

É relatado mais um caso de dermatofitose por Trichophyton tonsurans ocorrido no Rio Grande do Sul, e comentado seu provável significado

Coprocultura: espécies patogênicas prevalentes em laboratório privado de Porto Alegre, RS / Stool culture: prevatence of pathogenic microrganisms in a private laboratory of Porto Alegre, Brazil

Os autores apresentam os resultados de 1175 coproculturas direcionadas para a pesquisa de E. coli enteropatogênica e êntero-invasiva, Salmonella spp. Shigella spp. e Campylobacter spp., realizadas no período de um ano. Procurou-se avaliar os seguintes parâmetros: tipo de coleta, estaçäo do ano, faixa etária e presença de leucócitos fecais. Näo houve diferença significativa entre a coleta por swab retal ou emissäo espontânea das fezes. Ocorreu associaçäo significativa entre incidência de E. coli enteropatogênica e as estaçöes primavera e veräo, Shigella sonnei e outono e veräo, sendo Campylobacter spp. e Shigella flexneri mais freqüentes apenas no veräo. Quanto à faixa etária, observou-se maior incidência de Shigella sonnei, Campylobacter coli e jejuni até 10 anos de idade. Näo foi possível correlacionar os outros microrganismos isolados devido a suas baixas incidências. A análise da presença de leucócitos fecais evidenciou que, nos microrganismos E. coli enteropatogênica e Campylobacter spp., a proporçäo de amostras leucócito-negativas é maior do que a de positivas. Para os microrganismos Shigella flexneri, Salmonella spp. e Salmonella typhimurium a proporçäo de casos positivos para leucócitos fecais foi a mesma dos casos negativos

Neurocriptococose na infância: relato de três casos na primeira década de vida / Central nervous system cryptococcosis in infancy: report of 3 cases in the first decade of life

Os autores relatam três casos de neurocriptococose em crianças na primeira década de vida, no Estado do Rio Grande do Sul. O diagnóstico foi estabelecido pelo encontro do fungo Cryptococcus neoformans no líquido céfalo-raquidiano por exame direto com tinta da China e cultura em meio de Sabouraud. As formas de instalaçäo da síndrome neurológica foram aguda, subaguda e crônica. Síndrome de hipertensäo intracraniana e hidrocefalia foram complicaçöes observadas durante a evoluçäo da doença, sendo necessaria a instalaçäo de derivaçäo ventrículo-peritoneal em um caso. Desnutriçäo foi o processo mórbido associado nos três casos e infecçäo pelo bacilo da tuberculose em um caso. Terapia específica foi administrada aos três pacientes. Um paciente evoluiu para cura e dois evoluiram para óbito

Teste de Guthrie para detecçäo de fenilcetonúria (PKU-test) / Guthrie's test for detection of plenyl-ketonuria (PKU-test)

É apresentada uma análise e descriçäo da técnica de dosagem semi-quantitativa da fenilalanina no sangue pelo teste bacteriológico de Guthrie. Os instrutores do método em nosso meio e pela simplicidade do mesmo propöem-se a adoçäo como procedimento de escolha indo ao encontro das exigências atualmente solicitadas

Diagnóstico laboratorial de Cryptos poridium / Laboratory diagnosis of Cryptosporidium

Säo apresentados seis casos de pacientes nos quais foram encontrados oocistos de Cryptosporidium nas fezes. As alternativas para o diagnóstico laboratorial säo apresentadas e discutidas, sendo a modificaçäo da técnica de Ziehl - Neelsen sugerida como a mais conveniente. Os autores sugerem amplo estudo de prevalência para determinar a importância de Cryptosporidium em nosso meio