COL6A3 promotes cellular malignancy of osteosarcoma by activating the PI3K/AKT pathway

SUMMARY OBJECTIVE In this study, we aimed to investigate the role of COL6A3 on cell motility and the PI3K/AKT signaling pathway in osteosarcoma. METHODS The relative expression of COL6A3 was achieved from a GEO dataset in osteosarcoma tissue. siRNA technology was applied to decrease the COL6A3 expression in cells, and cell counting kit-8 (CCK-8) assay and colony formation analysis were used to examine the cell proliferation potential. Knockdown COL6A3 made the proliferation and colony formation abilities worse than the COL6A3 without interference. Likewise, in contrast to the si-con group, cell invasion and migration were inhibited in the si-COL6A3 group. Moreover, the western blot results suggested that the PI3K/AKT signaling pathway was manipulated by measuring the protein expression of the PI3K/AKT pathway-related markers, due to the COL6A3 inhibition. CONCLUSION COL6A3 plays a crucial role in modulating various aspects of the progression of osteosarcoma, which would provide a potentially effective treatment for osteosarcoma.

RESUMO OBJETIVO Neste estudo, investigamos a função do COL6A3 na mobilidade celular e na via PI3K/AKT em osteossarcomas. METODOLOGIA A expressão relativa do COL6A3 foi obtida a partir de dados GEO em tecidos de osteossarcoma. O RNA de interferência (siRNA) foi utilizado para reduzir a expressão do COL6A3 nas células, e o teste de contagem de células kit-8 (CCK-8) e a análise de formação de colônias foram realizados para examinar o potencial de proliferação celular. Além disso, o Transwell comprovou os efeitos do si-COL6A3 na invasão celular e migração em células de osteossarcoma. Para medir os níveis de expressão das proteínas e mRNAs, utilizamos transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR) e western blot. RESULTADOS O COL6A3 foi regulado nos tecidos e células do osteossarcoma quando comparado com o controle normal. A redução de COL6A3 reduziu a proliferação e a capacidades de formação de colônias em relação ao COL6A3 sem interferência. Do Mesmo modo, ao contrário do observado no grupo si-con, a invasão e migração celular foram inibidas no grupo si-COL6A3. Além disso, o resultado do western blot sugere que a via PI3K/AKT foi manipulada, medindo a expressão proteica dos marcadores relacionados à PI3K/AKT, devido à inibição do COL6A3. CONCLUSÃO O COL6A3 desempenha um papel crucial na modulação de vários aspectos da progressão do osteossarcoma, o que pode representar um possível tratamento eficaz para a doença.

RNA-seq analysis of the response of plant-pathogenic oomycete Phytophthora parasitica to the fungicide dimethomorph / Análisis RNA-seq de la respuesta del oomiceto fitopatógeno Phytophthora parasitica al fungicida dimetomorf

Phytophthora parasitica is an important oomycete that causes disease in a variety of plants, dimethomorph fungicides being specific for oomycetes. The aim of this study was to use RNA-seq to rapidly discover the mechanism by which dimethomorph acts in the treatment of P. parasitica. We found that the expression of 832 genes changed significantly after the dimethomorph treatment, including 365 up-regulated genes and 467 down-regulated genes. According to the Gene Ontology (GO) enrichment analysis, pathway enrichment and verification test results, the following conclusions are obtained: (i) the treatment of P. parasitica with dimethomorph causes changes in the expression levels of genes associated with the cell wall and cell wall synthesis; (ii) dimethomorph treatment results in reduced permeability of the cell membrane and changes in the expression of certain transport-related proteins; (iii) dimethomorph treatment increased reactive oxygen species and reduced the expression of genes related to the control of oxidative stress.

Phytophthora parasitica es un importante oomiceto que origina enfermedades en una variedad de plantas; el fungicida dimetomorf es específico contra oomicetos. El objetivo de este estudio fue utilizar la tecnología de RNA-seq para descubrir rápidamente el mecanismo por el que el dimetomorf actúa en el tratamiento de P. parasitica. Descubrimos que la expresión de 832 genes se modificaba significativamente tras el tratamiento con dimetomorf, incluyendo 365 genes que son sobrerregulados y 467 genes que son subrregulados. El análisis de enriquecimiento de ontología de genes (GO), análisis de enriquecimiento de las vías y pruebas de verificación permitieron extraer las conclusiones siguientes: 1) el tratamiento de P. parasitica con dimetomorf origina cambios en los niveles de expresión de los genes relacionados con la pared celular y su síntesis; 2) el tratamiento con dimetomorf origina una reducción de la permeabilidad de la membrana celular, así como cambios en la expresión de ciertas proteínas relacionadas con el transporte, y 3) el tratamiento con dimetomorf incrementó las especies reactivas del oxígeno y redujo la expresión de los genes relacionados con el control del estrés oxidativo.