Antibody response between pigs of Piau and a commercial breed naturally infected with Porcine circovirus 2 / Resposta sorológica entre suínos da raça Piau e linhagem comercial em rebanho naturalmente infectado pelo Porcine circovirus 2

Brazilian pig population is made up of several naturalized breeds; among them the Piau breed is known for its rusticity and large fat stores. The naturalized breeds, in comparison with commercial ones, may have an increased resistance to diseases circulating in their territory. Thus, this study aimed to verify if there are differences between the serologic profile against Porcine circovirus 2 (PCV2) of Piau pigs and that of a commercial breed from a farm naturally infected by PCV2. The serum viral load was measured by qPCR, and levels of anti-PCV2 antibodies were measured by ELISA. The results showed that the serum viral load was similar across all animals. However, Piau piglets showed higher levels of antibodies compared to commercial piglets (P= 0.05), while sows of the commercial breed showed higher levels than the Piau breed (P< 0.01). There was not a statistical difference between pigs of different production stages in the seroprevalence of PCV2 or the blood viral load. This work demonstrates that, with regard to a natural PCV2 infection, the Piau breed has a different humoral immune response compared to the response developed by the commercial pigs. The results support the importance of conservation of native breeds.(AU)

O rebanho de suínos brasileiro é constituído por diversas raças naturalizadas, entre elas a raça Piau, que é conhecida por sua rusticidade e pela grande deposição de toucinho. As raças naturalizadas, em comparação com as linhagens comerciais, podem ter uma maior resistência a doenças que circulam em seu território. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo verificar se existem diferenças no perfil sorológico contra o Porcine circovirus 2 (PVC2) entre suínos da raça Piau e de uma linhagem comercial de uma granja naturalmente infectada pelo PCV2. Foram realizadas mensurações da carga viral sérica por qPCR e dos níveis de anticorpos anti-PCV2 por meio da técnica de ELISA. Os resultados mostraram que a carga viral sérica se manteve homogênea em todos os animais e que os leitões da raça Piau apresentaram níveis de anticorpos superiores em comparação com os leitões da linhagem comercial (P=0,05), enquanto as porcas de linhagem comercial apresentaram níveis superiores aos da raça Piau (P<0,01). Este trabalho fornece indícios de que a raça Piau apresenta uma resposta imune humoral distinta diante de uma infecção natural pelo PCV2, quando comparada com a resposta desenvolvida pela linhagem comercial. Os resultados obtidos reforçam a importância da conservação das raças nativas.(AU)

Expressão gênica em ovócitos suínos de diferentes classificações morfológicas / Gene expression in swine oocytes in different morphological classifications

A produção in vitro de embriões suínos tem alcançado resultados insatisfatórios: ovócitos maturados in vivo produzem uma porcentagem maior de embriões em relação aos maturados in vitro. O sucesso da maturação in vitro está diretamente relacionado com a competência ovocitária. Somente ovócitos competentes são capazes de serem fecundados e terem desenvolvimento embrionário normal. A competência ovocitária pode ser avaliada por vários parâmetros. Recentemente têm sido utilizados como parâmetro os estudos da expressão de genes associados com a competência. O presente trabalho teve por objetivo avaliar diferenças na expressão dos genes BMP15, RYBP, MATER e ZAR1 em ovócitos imaturos de diferentes classes morfológicas, sendo elas: 1, 2, 3 e 4, com a finalidade de proporcionar importantes marcadores moleculares relacionados com a capacidade ovocitária. O RNA total dos ovócitos foi extraído e utilizado como molde para a síntese da primeira fita de cDNA. Os resultados da expressão gênica foram analisados utilizando-se modelo misto, considerando os dados de expressão gênica variável dependente e as classes ovocitárias variáveis independentes. Os genes BMP15, ZAR1 e RYBP apresentaram expressão semelhante nas classes ovocitárias 1, 2 e 3; somente a categoria 4 diferiu na expressão desses genes (P<0,05). O gene MATER foi expresso de forma semelhante em todas as classes ovocitárias estudadas (P>0,05). A técnica de RT-qPCR foi eficiente para detecção desses transcritos em ovócitos de diferentes classes. No entanto, para melhor entendimento do envolvimento desses transcritos na aquisição da competência ovocitária, são necessários mais estudos avaliando ovócitos de diferentes classes morfológicas, em diferentes fases de desenvolvimento, e implicação de outros genes envolvidos com a competência ovocitária.

The in vitro production of pig embryos has achieved unsatisfactory results; in vivo matured oocytes produce a higher percentage of embryos compared to in vitro maturation. The success of in vitro maturation is directly related to oocyte competence. Only competent oocytes are capable of being fertilized and have normal embryonic development. The oocyte competence can be assessed using several parameters. Recently these parameters have been used for gene expression studies associated with competence. This work aimed to evaluate differences in gene expression BMP15, RYBP, MATER, ZAR1 as endogenous control and the constitutive gene GAPDH in immature oocytes of different morphological classes which are: 1, 2, 3 and 4, in order to provide significant molecular markers linked to the ability of development. Oocytes Total RNA was extracted and used as a template for synthesis of the first cDNA strand. The results of gene expression were analyzed using a mixed model, considering the dependent gene expression data and independent ovocitary variable classes. The genes BMP15, RYBP ZAR1 and showed similar ovocitary expression in classes 1, 2 and 3 differ only in category 4 in their expression (P<0.05). The MATER gene was similarly expressed in all ovocitary classes studied (P>0.05). The RTQ-PCR technique was effective for detection of these transcripts in oocytes from different classes. However, for better understanding of the involvement of these transcripts in the acquisition of oocyte competence more studies are needed to evaluate different morphological classes of oocytes at different stages of development and the implication of other genes involved in oocyte competence.

Seleção genômica ampla para curvas de crescimento / Genome Wide Selection for growth curves

Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano - BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação.

A methodology was proposed for the genetic evaluation of growth curves considering SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) markers. At the first step, nonlinear regression growth models (Logistic) were fitted to the weight-age of each animal, and on second step the parameter estimates of the Logistic model were used as phenotype in a regression model (Bayesian LASSO - BL) which covariates were given by SNP genotypes. This approach allows the estimation of GBV (Genomic Breeding Values) for weight at either time of growth trajectory, allowing also the production of genomic growth curves, which selected groups of individuals with larger growth efficiency. The simulated data set was constituted of 2,000 individuals (being 1,000 in the training and 1,000 in the validation population) each one with 453 SNP markers distributed along 5 chromosomes. The results indicated high efficiency of the BL method to predict GBV in the validation population using information from the training population (correlation coefficients varying between 0.79 and 0.93). The BL also presented high efficiency to detect QTL, once the most expressive estimated SNP effects were located at positions closed to true QTL position fixed in the simulation.

Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos: características de desempenho / Detection of quantitative trait loci on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15, X in pigs: performance characteristics

Mapeou-se quantitative trait loci (QTL) associados a características de desempenho nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos pertencentes a uma população F2, formada a partir do cruzamento entre dois machos da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa genético de ligação da população foi construído após a genotipagem dos animais para 35 marcadores microssatélites. As estimativas do conteúdo de informação polimórfica indicaram que os marcadores microssatélites foram adequados para as análises de QTL. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se o programa GridQTL. Encontraram-se seis QTL, sendo que o QTL genômico para idade ao abate atingiu a significância de 5% de probabilidade. As informações dos QTL detectados neste estudo são úteis para identificar genes que podem ser usados em conjunto com os métodos convencionais de seleção, aumentar a acurácia deles e prover uma compreensão dos fenótipos produtivos de suínos.

The accomplishment of the present study had the objective of mapping Quantitative Trait Loci (QTL) related to performance traits in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain). The linkage map for this population was constructed after genotyping the animals for 35 microsatellite markers. Estimates of polymorphic information content indicated that the microsatellite markers were appropriate for QTL analyses. The genotypes were analyzed by interval mapping using the GridQTL program. A total of six QTL were found, of which the QTL for slaughter age (days) was significant at the 5% genome-wise level. The information of the significant QTL detected in this study is useful for future fine-mapping studies for the identification of genes. Such information can be used together with traditional methods in breeding programs or even for a better understanding of the phenotypes of swine production.

Estimativas de herdabilidades e correlações genéticas entre características reprodutivas em touros da raça Nelore / Genetic correlations and heritability estimates of reproductive traits of Nellore bulls

Foram obtidas estimativas de variância fenotípica, genética e residual, herdabilidades e correlações genéticas para as características reprodutivas em 5.903 animais da raça Nelore. O modelo experimental utilizado foi o método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas. Os valores de herdabilidade foram de 0,24±0,05 para perímetro escrotal aos 450 dias de idade e de 0,37±0,05 aos 21 meses de idade, na ocasião do exame andrológico; de 0,24±0,05 e 0,26±0,05 para comprimento dos testículos esquerdo e direito; de 0,29±0,05 e 0,31±0,05 para largura dos testículos esquerdo e direito; de 0,12±0,04 para formato testicular; de 0,33±0,06 para volume testicular; de 0,11±0,03 para turbilhonamento; de 0,08±0,03 para motilidade e de 0,05±0,02 para vigor espermático; de 0,20±0,04, 0,03±0,02 e 0,19±0,04 para defeitos espermáticos maiores, menores e totais, respectivamente. As características biométricas testiculares apresentaram valores de herdabilidade moderados a altos, enquanto as características seminais valores baixos. Correlações genéticas entre perímetro escrotal com todas as características reprodutivas foram favoráveis, o que sugere o perímetro escrotal como característica de escolha na seleção de touros.

Estimates of phenotypic, genetics and residual variances for reproductive traits in 5903 Nellore bulls were obtained. The experimental model used was multiple trait derivative-free restricted maximum likelihood. The values obtained for heritability were 0.24±0.05 for scrotal circumference at 450 days of age and 0.37±0.05 at 21 months for age at the time of the breeding soundness evaluation; 0.24±0.05 and 0.26±0.05 for left and right testicle length; 0.29±0.05 and 0.31±0.05 for left and right testicle width; 0.12±0.04 for testicle format; 0.33±0.06 for testicle volume; 0.11±0.03 for gross motility; 0.08±0.03 for individual motility and 0.05±0.02 for spermatic vigor; 0.20±0.04, 0.03±0.02 and 0.19±0.04 for larger defects, smaller defects and total defects, respectively. The values for heritability for testicular biometric characteristics were moderate to high while the seminal characteristics, presented low values. Genetic correlations between scrotal circumference with all the reproductive traits were favorable, suggesting the scrotal circumference as a feature of choice in the selection of bulls.

Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: características de carcaça e qualidade de carne / Mapping of QTL on chromosomes 1, 2, 3, 12, 14, 15 and X in pigs: characteristics carcass and quality of meat

A realização do presente estudo teve como objetivo mapear Quantitative Trait Loci (QTL) de carcaça e qualidade de carne em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 684 animais para 35 marcadores microssatélites. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se sexo, lote e genótipo halotano como efeitos fixos e peso de carcaça ao abate, peso da carcaça direita e idade ao abate como covariáveis. Um total de 18 QTLs foi encontrado; os QTLs para maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorsolombar, e a perda por cozimento foram significativos em nível de 5% genômico. A característica espessura de toucinho foi essencialmente associada aos alelos da raça Piau, conhecido como porco tipo banha. As informações dos QTLs significativos encontrados servem para futuros estudos de mapeamento fino para identificação de genes a serem usados em conjunto com os métodos tradicionais de seleção, para melhorar a eficiência dos programas de melhoramento, assim como prover informação acerca da fisiologia envolvida no desenvolvimento das características quantitativas dos suínos.

The accomplishment of the present study had as objective to map Quantitative Trait Loci (QTL) associated to carcass and quality traits in a F2 pig population developed by mating two Brazilian Piau breed sires with 18 dams from a commercial line (Landrace × Large White × Pietrain). The linkage map for this population was constructed after genotyping the 684 animals for 35 microsatellite markers. Data were analyzed by interval mapping using sex, batch and halothane genotype as fixed effects and carcass weight at slaughter, direct carcass weight and slaugher age as covariables. A total of 18 QTL were identified, the QTL for higher backfat thickness on the shoulder region and cooking loss was significant at 5% genome-wise level. The backfat thickness trait was mainly associated with the Piau breed allele, known as a fat pig. The information of the significant QTL detected in this study is useful for future fine-mapping studies for identification of genes and might be used together with traditional selection methods to improve the efficiency of breeding programs, moreover, this information can also provide new insights to the understanding of the physiology of the quantatiative traits in pigs.

Mapeamento de locos de características quantitativas associados à composição de carcaça, no cromossomo seis de suíno / Mapping of quantitative trait loci for carcass composition on swine chromosome six

Uma população de suínos, composta de 550 animais F2, foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. O objetivo do trabalho foi mapear locos de características quantitativas (QTL) associados a cortes de carcaça. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites, distribuídos no cromossomo 6 de suínos. As características avaliadas foram: peso total do pernil, peso do pernil sem pele e sem capa de gordura, peso total da copa, peso da copa sem pele e sem capa de gordura, peso total da paleta, peso da paleta sem pele e sem capa de gordura, peso total do carré, peso do lombo, peso total do bacon, peso das costelas, peso total da papada, peso do filezinho e peso da banha rama. Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento por meio do programa QTL Express. Foram encontrados indicativos de QTL para peso de pernil limpo, peso de paleta, peso de lombo e peso de filezinho. A região genômica deve ser saturada com marcadores adicionais para confirmar a presença de QTL reais.

A swine population of 550 F2 animals was produced by outbred cross using two sires of the native Brazilian breed Piau and 18 commercial dams. The animals were genotyped for 13 microsatellite markers. The evaluated composition traits of carcass were: ham weight, skinless and fatless ham weight, boston shoulder weight, skinless and fatless boston shoulder weight, picnic shoulder weight, skinless and fatless picnic shoulder weight, total loin (bone-in) weight, loin weight, bacon weight, rib weight, jowl weight, sirloin weight, and belly fat weight. Data were analyzed by multiple regression interval mapping, using the QTL Express software. Suggestive QTL were found for skinless and fatless ham weight, picnic shoulder weight, loin weight, and sirloin weight. However, the genomic region should be saturated with additional markers in order to confirm the presence of real QTL.

Association of the heart fatty acid-binding protein gene with quality of carcass and meat traits in pigs / Associação entre o gene da proteína de ligação de ácidos graxos - coração com características de carcaça e qualidade da carne em suínos

The heart fatty acid-binding protein (HFABP) gene was sequenced in parental animals of a F2 crossing of boars of the Brazilian native Piau breed with commercial sows (Landrace x Large White Pietrain). Primers used for PCR were designed to amplify four exons of the gene. The PCR products were sequenced and compared with the GenBank sequences. Differences between the generated sequences and the GenBank sequences were observed for both genetic groups. A total of 246 F2 animals were genotyped using the Hinf I restriction enzyme. Two genotypes were identified, 198 being animals HH and 48 Hh. The Hinf I SNP was significantly associated with weights of loin (bone-in) (P<0.05), jowl (P<0.05), sirloin (P<0.10), and kidneys (P<0.01). These results showed the potential of the H-FABP gene in marker-assisted selection programs for carcass traits in pigs.

O gene da proteína de ligação de ácidos graxos - coração foi seqüenciado em animais parentais de um cruzamento F2 entre varrões da raça nativa brasileira Piau e fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). Os primers utilizados na reação em cadeia da polimerase foram desenhados para amplificarem os quatro éxons do gene. Os fragmentos amplificados foram seqüenciados e comparados com a seqüência do gene depositada no GenBank. Foram observadas divergências entre as seqüências geradas e as do GenBank para ambos os grupos genéticos. Foram genotipados 246 animais F2 utilizando-se a enzima Hinf I. Dois genótipos foram identificados, sendo 198 animais HH e 48 animais Hh. O polimorfismo apresentou efeito sobre o peso total do carré (P<0,05), o peso da papada (P<0,05), o peso do filezinho (P<0,10) e o peso dos rins (P<0,01). Os resultados indicam que o gene da H-FABP apresenta potencial para aplicação em programas de seleção assistida por marcadores moleculares em suínos.

Análise filogenética do gene da miogenina / Phylogenetic analysis of the myogenin gene

Estudou-se a filogenia do gene da miogenina, um membro da família MyoD, reguladora da miogênese, que ocorre durante o desenvolvimento embrionário, e sua história evolutiva em espécies domésticas que apresentem seqüências de DNA depositadas no Genbank, comparando-se o índice de substituição de nucleotídeos não-sinônimos pelo índice de substituição sinônima. Valores maiores do que um (1) indicaram que o gene sofreu mudanças que tornaram o organismo mais adaptado ao ambiente. As árvores filogenéticas foram obtidas por máxima verossimilhança, e os índices de substituição sinônima e não-sinônima foram analisadas pelo método de parcimônia. Os resultados indicaram que, provavelmente, o gene sofreu evolução adaptativa no grupo Ruminantia, Bos taurus e Ovis aries, depois que essas espécies divergiram do ancestral comum. Para as outras espécies analisadas, o gene parece ter evoluído de modo conservativo.

The myogenin gene, a member of the MyoD gene family, is a regulator of the myogenesis that takes place during the embryonic development. The objective of this study was to perform a phylogenic analysis of the myogenin gene to study its evolutionary history in the domestic species that have the sequencing data deposited in the Genbank. One common method to detect a gene evolution is made by comparing the ratio of nonsynonymous nucleotide substitution by the ratio of synonymous substitutions. Values greater than one (1) means that the gene has gone through changes that made the organism more adapted to the environment. The phylogenetic trees were obtained by maximum likelihood and the synonymous and nonsynonymous substitution rates were analyzed by the parsimony method. The results point out that probably the gene suffered an adaptive evolution in the Ruminantia group, Bos Taurus and Ovis aries, after these species diverged from their common ancestral. In the other species, the gene seems to be evolved in a conservative way.

Novos polimorfismos no gene da obesidade em raças divergentes de suínos / Polymorphisms in the leptin gene in divergent swine breeds

Investigou-se a existência de polimorfismo no gene da leptina (gene da obesidade) entre varrões da raça nativa Piau (porco tipo banha) e matrizes mestiças de raças comerciais (Landrace/Large White e Landrace/Large White com Pietrain), selecionadas para peso e precocidade. Oito pares de primers foram desenhados a partir da seqüência disponível no GenBank (U66254), usada, neste trabalho, como seqüência de referência. Amostras de DNA foram extraídas de células sangüíneas brancas utilizando-se solução de fenol:clorofórmio, após tratamento com proteinase K. Os fragmentos gerados por amplificação da reação em cadeia da polimerase foram purificados e seqüenciados em seqüenciador automático. As seqüências de nucleotídeos, obtidas a partir do DNA das raças comerciais de suíno, apresentaram maior similaridade com a seqüência de referência, e as seqüências geradas a partir do DNA dos animais nativos divergiram de ambas em algumas posições. Dos 28 polimorfismos encontrados, oito foram observados em apenas uma das três seqüências geradas a partir do DNA das raças nativas. Doze estavam presentes em duas seqüências, e os oito polimorfismos restantes foram encontrados nos três animais nativos.

Leptin gene (obese gene) polymorphism was investigated in Piau boars (a fat, native breed) and sows from commercial strains (Landrace/Large White and Landrace/Large White by Pietrain) chosen for rapid growth and early sexual maturity. Eight pairs of primers designed using the sequence available from GenBank (access n° U66254) were identified as the reference sequence in this project. DNA samples were extracted from white blood cells using phenol:chloroform solution, after treatment with proteinase K. Fragments generated by amplification of the Polymerase Chain Reaction were purified and sequenced in an automatic sequencer. Nucleotide sequences obtained from DNA of commercial swine breeds were similar to the reference sequence; whereas sequences generated from native breed DNA diverged from the reference sequence and from domestic breed DNA. Of the 28 polymorphisms found, eight were observed in only one of the three sequences generated from DNA of native breeds. Twelve polymorphisms were present in two sequences and the eight remaining polymorphisms were found in all three categories of DNA.

Seleção de variáveis de desempenho de suínos por meio da análise de componentes principais / Identification of informative performance traits in swine using principal component analysis

Dados de 435 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados para avaliar a possibilidade de redução da dimensão do espaço multivariado, por meio da técnica de componentes principais. Foram avaliadas as seguintes características de desempenho: tamanho da leitegada ao nascer (TLN), tamanho da leitegada à desmama (TLD), número de tetos (NT), pesos ao nascer (PN), aos 21 (P21), aos 42 (P42), aos 63 (P63) e aos 77 (P77) dias de idade e ganho médio de peso diário (GPD), consumo de ração (CR) e conversão alimentar (CA) dos 77 aos 105 dias de idade. Seis componentes principais, obtidos a partir da matriz de correlação, apresentaram variância inferior a 0,7 (auto valores inferiores a 0,7), o que sugere seis variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes, em valor absoluto, a partir do último componente principal. As variáveis descartadas apresentaram correlação linear simples significativa com as demais. Em razão do grande número de variáveis redundantes, 54,5% delas podem ser eliminadas, sendo recomendada a avaliação de apenas TLN, NT, P77, CR e CA, sem que haja perda considerável da informação.

Quantitative trait loci mapping for meat quality traits in swine chromosome 6

Realizou-se o mapeamento de QTL no cromossomo 6 suíno (SSC6), associado às características de qualidade da carne. Um total de 557 animais de uma populacão F2 foi obtido do cruzamento entre dois machos da raca nativa brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais, cujos genótipos foram obtidos para 13 marcadores microssatélites. As características avaliadas na F2 foram pH, medido 45 minutos e 24 horas post-mortem (pH45 e pH24, respectivamente); perda por gotejamento (DL); perda por cozimento (CL); perda total (TL); gordura intramuscular (IMF); maciez objetiva (OT); luminosidade (L); índice de vermelho (A); índice de amarelo (B); tonalidade de cor (h); e índice de saturacão (c). Utilizou-se o método de regressão por intervalo de mapeamento, por meio do programa QTL Express. Foram detectados QTLs significativos para pH45 e DL, sugestivos para DL, e não foram encontrados QTLs para as demais características. Constatou-se que grupos gênicos, localizados em torno de 76, 88 e 97cM, podem atuar no pH45 e no DL. Nas regiões dos picos da estatística F, onde se verificaram QTLs sugestivos para DL, devem ser incluídos mais marcadores, para confirmar a presenca de QTLs.

Associação do loco BoLA-DRB3.2 com produção de leite em bovinos da raça Gir / Association of BoLA-DRB3.2 locus with bovine milk production in Gir breed

A associação entre os alelos do loco BoLA-DRB3.2, identificados pela técnica de PCR-RFLP, e a produção de leite na raça Gir foi estudada por meio da análise de dados moleculares e fenotípicos de 424 vacas Gir, utilizando um modelo misto, sob modelo animal. Os dados moleculares consistiam dos genótipos dos animais para os alelos do loco BoLA-DRB3.2 e os dados fenotípicos eram referentes à produção de leite em até 305 dias de lactação. O loco é altamente polimórfico nesta raça, sendo identificados sete alelos (BoLA-DRB3.2*4, *8, *11, *19, *28, *41 e *48) que não haviam sido encontrados em animais zebuínos. Dois alelos (*16 e *29) estavam significativamente associados com maiores produções de leite, sugerindo que o próprio loco BoLA-DRB3.2 ou um QTL a ele ligado influencia a produção de leite de vacas Gir.

Análise de polimorfismos do gene da ß-lactoglobulina em vacas da raça Nelore e efeitos sobre o peso à desmama de suas progênies / Polimorphism analisys of ß-lactoglobulin gene on Nellore cows and effects on weaning weight of the calves

Informaçöes sobre peso à desmama de bezerros Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padräo aos 205 dias, sexo, idade da mäe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, segundo o peso de suas crias. As médias de peso dos bezerros ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padräo (LSMñSE) foram para os grupos pesados (P) e leves (L) 163,21ñ2,18kg e 134,44ñ2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas a coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da ß-lactoglobulina, por meio da técnica de PCR-RFLP. A amplificaçäo e a digestäo de um fragmento do gene da ß-lactoglobulina entre o éxon II e III identificou os genótipos 1AA, 24AB e 56BB, com as freqüências de 0,16 e 0,84 para os alelos. A e B, respectivamente. Os 24 animais com genótipo AB apresentaram LSMñSE de peso de seus produtos de 149,50ñ4,17kg, e os 56 animais de genótipo BB tiveram média de 148,44ñ2,73kg. O teste do quiquadrado näo apresentou significância (P>0,05), isto é, os grupos P e L näo diferiram entre si quanto às freqüências alélicas apresentadas para esse gene. O genótipo das reprodutrizes näo afetou o peso à desmama de suas crias, o que sugere haver outros fatores genéticos e näo genéticos de maior magnitude que afetam o peso à desmama

Análise de polimorfismos do gene da beta-lactoglobulina em vacas da raça Nelore e efeitos sobre o peso à desmama de suas progênies

Weaning weights from a Nelore herd were used after adjustment of means for 205 days of age, sex, age of dam, sire and weaning month, and resulted into two groups of cows that differed by the weaning weight of their calves. The least square means (LSM) and standard error (SE) were for heavy group 163.21± 2.18kg and for light group 134.44± 2.18kg, with 41 animals in each group. These animals were genotyped by DNA polymorphisms of beta -lactoglobulin gene, using PCR-RFLP. After amplification and digestion of a beta-lactoglobulin gene fragment between II and III exon, genotypes 1AA, 24AB and 56BB were identified, with 0.16 and 0.84 frequencies for A and B alleles, respectively. The 24AB and 56BB cows showed calves with LSM± SE of 149.50± 4.17kg and 148.44± 2.73kg respectively, for weaning weight. No difference (P>0.05) was found and the heavy and light groups were similar for the allelic frequencies for this gene. The dam’s genotype did not affect the weaning weight of the calves. This suggests of having other factors, genetic or non-genetic, with major magnitude that affect the weaning weight.

Informações sobre peso à desmama de bezerros Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão aos 205 dias, sexo, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, segundo o peso de suas crias. As médias de peso dos bezerros ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padrão (LSM± SE) foram para os grupos pesados (P) e leves (L) 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas a coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da beta-lactoglobulina, por meio da técnica de PCR-RFLP. A amplificação e a digestão de um fragmento do gene da beta-lactoglobulina entre o éxon II e III identificou os genótipos 1AA, 24AB e 56BB, com as freqüências de 0,16 e 0,84 para os alelos A e B, respectivamente. Os 24 animais com genótipo AB apresentaram LSM± SE de peso de seus produtos de 149,50± 4,17kg, e os 56 animais de genótipo BB tiveram média de 148,44± 2,73kg. O teste do qui-quadrado não apresentou significância (P>0,05), isto é, os grupos P e L não diferiram entre si quanto às freqüências alélicas apresentadas para esse gene. O genótipo das reprodutrizes não afetou o peso à desmama de suas crias, o que sugere haver outros fatores genéticos e não genéticos de maior magnitude que afetam o peso à desmama.

Análise de polimorfismo do gene da somatotropina em vacas Nelore e seu efeito sobre o peso à desmama de suas progênies / Polimorphism analisys of somatotropin gene on Nelore cows and effect on weaning weight of the calf

Informaçöes sobre peso à desmama de um rebanho Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padräo de 205 dias, sexo da cria, idade da mäe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos filhos diferiam nesse peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos foram para os grupos pesado (P) e leve (L) de 163,21ñ2,18kg e 134,44ñ2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas à coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da somatotropina bovina, pela técnica de PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). A amplificaçäo de uma regiäo entre o éxon III e V do gene da somatotropina permitiu analisar dois sítios de restriçäo. Para o sítio do éxon V, todos os animais foram identificados como monomórficos (Leu-Leu). Quanto ao sítio de íntron 3, foi possível identificar os seguintes genótipos 21 (+/-) e 60 (-/-), com as freqüências de 0,13 e 0,87 para os alelos (+) e (-), respectivamente. O peso dos filhos dos animais com o genótipo +/- foi de 152,42ñ4,41kg e os -/- 147,60 mais ou menos 2,61kg. Os grupos P e L näo diferiram entre si quanto à freqüências alélicas apresentadas. O genótipo das reprodutrizes näo afetou o peso à desmama de suas crias, existindo portanto outros efeitos genéticos e näo genéticos de maior magnitude

Análise de polimorfismo do gene da somatotropina em vacas Nelore e seu efeito sobre o peso à desmama de suas progênies

Data from a Nelore herd were used after adjustment of the weaning weight for 205 days of age, sex, age of dam, sire and weaning month and resulted into two groups of cows according to the in weaning weight of their calves (heavy and light groups). The least square means (LSM) for weaning weights were 163.21± 2,18kg and 134,44± 2.18kg, for heavy (H) and light (L) groups, with 41 animals each one. These animals were genotyped for DNA polymorphisms of the bovine somatotropin gene, using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). Amplification of a region between exons III and V of somatotropin gene allowed analysis of two restriction sites. All animals showed monomorphism for the V exon site, showing the (Leu-Leu) genotype. At intron 3 site, there were identified the 21+/- and 60 -/- genotypes, with 0.13 and 0.87 frequencies to (+) and (-) alleles, respectively. The calves from +/- counts was of 152.42± 4.41kg and of calves from -/- cows was 147.60± 2.61kg. Heavy and light groups were similar for the allelic frequencies. The dam’s genotype did not affect the weaning weight of the calves. This suggests the existence of another genetic or non-genetic factors with major magnitude.

Informações sobre peso à desmama de um rebanho Nelore foram utilizadas após ajuste para idade padrão de 205 dias, sexo da cria, idade da mãe, touro e mês de desmama, para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos filhos diferiam nesse peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos foram para os grupos pesado (P) e leve (L) de 163,21± 2,18kg e 134,44± 2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Essas reprodutrizes foram submetidas à coleta de sangue para estudo de polimorfismos do gene da somatotropina bovina, pela técnica de PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). A amplificação de uma região entre o éxon III e V do gene da somatotropina permitiu analisar dois sítios de restrição. Para o sítio do éxon V, todos os animais foram identificados como monomórficos (Leu-Leu). Quanto ao sítio do íntron 3, foi possível identificar os seguintes genótipos 21 (+/-) e 60 (-/-), com as freqüências de 0,13 e 0,87 para os alelos (+) e (-), respectivamente. O peso dos filhos dos animais com o genótipo +/- foi de 152,42± 4,41kg e os -/- 147,60± 2,61kg. Os grupos P e L não diferiram entre si quanto às freqüências alélicas apresentadas. O genótipo das reprodutrizes não afetou o peso à desmama de suas crias, existindo portanto outros efeitos genéticos e não genéticos de maior magnitude.

Análise de polimorfismos do gene da k-caseína em fêmeas da raça Nelore e efeito sobre o peso à desmama de suas progênies / Polimorphism analysis of k-casein gene on Nelore females and effect on weaning weight of the calves

Informaçöes sobre peso à desmama de um rebanho Nelore, após ajuste para idade padräo de 205 dias, sexo da cria, idade da mäe, touro e mês de desmama, foram utilizadas para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos produtos diferiam em peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padräo para os grupos pesado (P) e leve (L) foram 163,21ñ2,18kg e 134,44ñ2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Colheram-se amostras de sangue das reprodutrizes para o estudo de polimorfismos do gene da k-caseína, pela técnica de polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. A análise de um segmento do éxon IV do gene da k-caseína identificou os genótipos 71AA, 10AB e 1BB, com as freqüências de 0,92 e 0,08 para os alelos A e B, respectivamente. Os pesos à desmama dos produtos dos genótipos AA e AB foram, respectivamente, 147,73ñ2,38kg e 156,76ñ6,35kg. Os grupos P e L näo diferiram entre si quanto às freqüências alélicas apresentadas para esse gene. O genótipo das reprodutrizes näo afetou o peso à desmama de suas crias, existindo, portanto, outros efeitos genéticos e näo genéticos de maior magnitude

Análise de polimorfismos do gene da kapa-caseína em fêmeas da raça Nelore e efeito sobre o peso à desmama de suas progênies

Data from a Nelore herd were used after adjustment of the weaning weight for 205 days of age, sex, age of dam, sire and month of weaning resulting two groups of cows that differed in weaning weight of their calves. The least square means (LSM) and standard error (SE) were 163.21±2.18kg and 134.44±2.18kg, for heavy (H) and light (L) groups, with 41 animals each one. These animals were genotyped for DNA polymorphisms of kappa-casein gene, using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). The segment analysis of kappa-casein IV exon identified the genotypes 71AA, 10AB and 1BB, with frequencies of 0.92 and 0.08 for A and B alleles, respectively. The LSM±SE for weaning weight were 147.73±2.38kg and 156.76± 6.35kg for calves of AA and AB genotype cows. Heavy and light groups were similar for the allelic frequencies for this gene. The dam’s genotype did not affect the weaning weight of the calves. This suggests the existence of another genetic or non-genetic factors with major magnitude.

Informações sobre peso à desmama de um rebanho Nelore, após ajuste para idade padrão de 205 dias, sexo da cria, idade da mãe, touro e mês de desmama, foram utilizadas para separar as reprodutrizes em dois grupos, cujos produtos diferiam em peso. As médias ajustadas pelo método dos quadrados mínimos e erros-padrão para os grupos pesado (P) e leve (L) foram 163,21±2,18kg e 134,44±2,18kg, respectivamente, com 41 animais em cada grupo. Colheram-se amostras de sangue das reprodutrizes para o estudo de polimorfismos do gene da kapa-caseína, pela técnica de polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. A análise de um segmento do éxon IV do gene da kapa-caseína identificou os genótipos 71AA, 10AB e 1BB, com as freqüências de 0,92 e 0,08 para os alelos A e B, respectivamente. Os pesos à desmama dos produtos dos genótipos AA e AB foram, respectivamente, 147,73±2,38kg e 156,76±6,35kg. Os grupos P e L não diferiram entre si quanto às freqüências alélicas apresentadas para esse gene. O genótipo das reprodutrizes não afetou o peso à desmama de suas crias, existindo, portanto, outros efeitos genéticos e não genéticos de maior magnitude.

Fatores que afetam a amplificaçäo de DNA pela técnica de RAPD (random amplified polymorphic DNA) / Factors affecting DNA amplification by RAPD (rondom amplified polymorphic DNA

Alguns reagentes que afetam as amplificaçöes (MgCl2 subscrito, dNTPs, "primers", DNA) foram testados para se obter melhor resoluçäo e reprodutibilidade das impressöes digitais de DNA em bovinos. As concentraçöes dos "primers" de 0,1mM foi considerada suficiente para uma amplificaçäo satisfatória. As concentraçöes de DNA genômico de 2,5ng/ml e de dNTPs na faixa de 0,1mM foram as que obtiveram resultados mais fortes e reprodutível. Um dos fatores que demonstraram maior variaçäo no padräo de amplificaçäo foi o MgCl2 subscrito. Concentraçäo de 2,0mM demonstrou ser suficiente para uma forte amplificaçäo. Foi possível demonstrar variaçöes nos padröes de amplificaçäo obtidos e associá-los com os fatores acima citados. A padronizaçäo entre diferentes laboratórios e a reprodutibilidade dos RAPDs deve levar em consideraçäo tais fontes de variaçäo para que se faça possível o intercâmbio de informaçäo entre laboratórios e a montagem de bancos de dados seguros obtidos por RAPD