Résumé
We describe the characterization of the viral genotype involved in the first case of hantavirus pulmonary syndrome reported in Tucumán, a Northwestern province of Argentina. A 23-year-old woman, with no record of travel history and previously diagnosed with an antiphospholipid syndrome, died after 11 days of severe cardiopulmonary insufficiency. Among the four endemic regions of hantavirus pulmonary syndrome in Argentina, the Northwest Region has the highest incidence, exceeding 50% of all reported cases in the country. Until now, only Salta and Jujuy (2 out of the 6 provinces composing the Northwest Region), reported cases of hantavirus pulmonary syndrome, all of which occurred in the Yungas Forest area. Remarkably, the viral genotype characterized in this case showed higher nucleotide identity with the Andes-BsAs genotype most prevalent in Buenos Aires province, located 1400 km apart from Tucumán, than with any of the commonly found genotypes in the Northwest Region. The Andes-BsAs genotype has been associated with 30% lethality and interhuman transmission in Buenos Aires province. Interhuman transmission cannot be ruled out in the present case.
Se describe la caracterización del genotipo viral del primer caso de síndrome pulmonar por hantavirus reportado en la Provincia de Tucumán. Una mujer de 23 años, con diagnóstico previo de síndrome antifosfolipídico y sin antecedente de viaje reciente, falleció tras 11 días de enfermedad. De las cuatro regiones endémicas para este síndrome, la región Noroeste es la de mayor incidencia del país, concentrando más del 50% de los casos informados en Argentina. Hasta el momento, solamente dos de las seis provincias que componen la región Noroeste, Salta y Jujuy, habían registrado síndrome pulmonar por hantavirus con casos en áreas pertenecientes a la Selva de las Yungas. Desde ahora, se suma a dicha región la provincia de Tucumán. Llamativamente, el genotipo viral caracterizado en este caso mostró mayor identidad con el genotipo más prevalente en la provincia de Buenos Aires llamado Andes-BsAs, y no como se esperaba, con los genotipos comúnmente encontrados en la región Noroeste. El genotipo Andes-BsAs se ha asociado a letalidad próxima al 30% y también a transmisión interhumana en la provincia de Buenos Aires. No se puede descartar transmisión interhumana en el presente caso.
Sujets)
Humains , Femelle , Jeune adulte , Orthohantavirus/génétique , Syndrome pulmonaire à hantavirus/virologie , Phylogenèse , Argentine/épidémiologie , Issue fatale , Syndrome pulmonaire à hantavirus/diagnostic , Syndrome pulmonaire à hantavirus/épidémiologie , GénotypeRésumé
El virus Andes es el agente causante del síndrome pulmonar por hantavirus en Argentina y países limítrofes. Existen varios genotipos característicos en las cuatro regiones endémicas del país. En la provincia de Buenos Aires, zona central, co-circulan tres genotipos: AND-BsAs, AND-Lechiguanas y AND-Plata. A partir de los casos confirmados por ELISA y PCR en tiempo real durante el período 2009-2014 en Buenos Aires, se evaluó la distribución anual, la letalidad y la distribución geográfica dentro de la provincia; mediante RT-PCR y secuenciación nucleotídica se analizaron los genotipos implicados. También se estudió la evidencia epidemiológica para determinar la ruta de infección en casos agrupados. Se analizaron 1386 muestras de casos sospechosos de la provincia de Buenos Aires, confirmándose 88 casos de Síndrome Pulmonar por Hantavirus durante el período 2009-2014. El promedio general fue de 14.3 casos por año. El análisis del genotipo viral se realizó en el 30.7% de los casos confirmados, AND-BsAs fue el de mayor incidencia, caracterizado en el 72% de los casos estudiados. Se confirmó la ocurrencia de un brote de síndrome pulmonar por hantavirus Buenos Aires durante el año 2013, con un registro de casos 3 veces mayor respecto al promedio anual del período 2009-2012, con tendencia a normalizarse durante 2014. La letalidad general fue del 25.6%, con un valor máximo de 45.5% en 2011. Se evaluaron los datos epidemiológicos y los resultados obtenidos del análisis de comparación de genomas virales en 3 agrupamientos de 2 casos cada uno, sugiriendo fuertemente transmisión persona a persona.
Andes virus is the causative agent of hantavirus pulmonary syndrome (HPS) in Argentina and neighboring countries. In our country four different areas are affected: Northwest, Southwest, Central and Northeast, where distinct Andes virus genotypes were characterized. Three genotypes were described in Buenos Aires province (Central area): AND-Buenos Aires, AND-Lechiguanas and AND-Plata. In this work, we considered all HPS cases confirmed by ELISA and real time RT-PCR during the period 2009-2014 in Buenos Aires province. The annual distribution, fatality rate and geographic distribution were analyzed. We also analyzed the genotypes involved by RT-PCR and nucleotide sequencing. Finally we evaluated epidemiological data in order to establish the route of transmission. We analyzed 1386 suspect cases of hantavirus infection from Buenos Aires province and we confirmed 88 cases of Hantavirus Pulmonary Syndrome during 2009-2014. The overall average was 14.3 cases per year. The occurrence of a HPS outbreak was confirmed in Buenos Aires province during 2013, showing a 3 fold increase in case number compared to the annual average between 2009 and 2012, tending to normalize during 2014. The overall lethality was 25.6%, with a maximum value of 45.5% in 2011. Genotype analysis was performed in 30.7% of confirmed cases, AND-BsAs show the highest incidence, it was characterized in 72% of the studied cases. Epidemiological data and results of viral genome comparison strongly suggest person-to-person transmission in the three clusters of two cases described in our study.