Résumé
The characterization of the human T-cell receptor (TCR) repertoire has made remarkable progress, with most of the work focusing on the TCRβ chains. Here, we analyzed the diversity and complexity of both the TCRα and TCRβ repertoires of three healthy donors. We found that the diversity of the TCRα repertoire is higher than that of the TCRβ repertoire, whereas the usages of the V and J genes tended to be preferential with similar TRAV and TRAJ patterns in all three donors. The V-J pairings, like the V and J gene usages, were slightly preferential. We also found that the TRDV1 gene rearranges with the majority of TRAJ genes, suggesting that TRDV1 is a shared TRAV/DV gene (TRAV42/DV1). Moreover, we uncovered the presence of tandem TRBD (TRB D gene) usage in ~2% of the productive human TCRβ CDR3 sequences.
Sujets)
Femelle , Humains , Mâle , Régions déterminant la complémentarité , Génétique , Amorces ADN , Chimie , Génétique , Réarrangement des gènes de la chaine bêta du récepteur pour l'antigène des cellules T , Génétique , Réarrangement des gènes de la chaine delta du récepteur pour l'antigène des cellules T , Génétique , Gènes de la chaine bêta du récepteur des lymphocytes T , Génétique , Variation génétique , Séquençage nucléotidique à haut débit , Région J d'immunoglobuline , Génétique , Région variable d'immunoglobuline , Génétique , Récepteur lymphocytaire T antigène, alpha-bêta , GénétiqueRésumé
MRDC is thefirst self-developing large integrated microbial resources database in the Chinese microbiological field. It includes Microbial Character Bank, Microbial Product Market Information Bank, Microbial Names Bank, Microbial Nomenclature Bank, RKC Code Bank for International exchange and one Microbiological Information Numerical Taxonomic System named MINTS.