Survey of glycine-rich proteins (GRPs) in the Eucalyptus expressed sequence tag database (ForEST)

The occurrence of quasi-repetitive glycine-rich peptides has been reported in different organisms. Glycine-rich regions are proposed to be involved in protein-protein interactions in some mammalian protein families. In plants, a set of glycine-rich proteins (GRPs) was characterized several years ago, and since then a wealth of new GRPs have been identified. GRPs may have very diverse sub-cellular localization and functions. The only common feature among all different GRPs is the presence of glycine-rich repeat domains. The expression of genes encoding GRPs is developmentally regulated, and also induced, in several plant genera, by physical, chemical and biological factors. In addition to the highly modulated expression, several GRPs also show tissue-specific localization. GRPs specifically expressed in xylem, phloem, epidermis, anther tapetum and roots have been described. In this paper, the structural and functional features of these proteins in Eucalyptus are summarized. Since this is the first description of GRPs in this species, particular emphasis has been given to the expression pattern of these genes by analyzing their abundance and prevalence in the different cDNA-libraries of the Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium (ForEST). The comparison of GRPs from Eucalyptus and other species is also discussed

Classification, expression pattern and comparative analysis of sugarcane expressed sequences tags (ESTs) encoding glycine-rich proteins (GRPs)

Desde o isolamento da primeira proteína rica em glicina (GRP) em plantas, um grande número de novas GRPs vem sendo identificado. Seu padräo de expressäo altamente específico, embora variado, em conjunto com as diferentes localizações sub-celulares de alguns dos tipos de GRPs, claramente indica que estas proteínas encontram-se envolvidas em diversos processos fisiológicos independentes. Embora ainda sem uma clara definiçäo do papel de GRPs na célula vegetal, estudos realizados com estas proteínas têm resultado em novos e interessantes esclarecimentos da biologia celular e molecular de plantas. Promotores com regulaçäo complexa, assim como distintos mecanismos de regulaçäo da expressäo gênica tem sido demonstrados. Novas vias de endereçamento de proteínas tais como a exportaçäo de GRPs para diferentes tipos celulares, tem sido observados. Estes dados mostram que as GRPs podem constituir marcadores e/ou modelos interessantes para a compreensäo de distintos aspectos da biologia vegetal. Neste trabalho, características estruturais e funcionais deste tipo de proteínas em cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) foram analisadas. Uma vez que esta é a primeira descriçäo deste tipo de proteínas, em cana-de-açúcar, especial atençäo foi dada para o padräo de expressäo destes genes, analisando-se a abundância e prevalência de cada um dos genes nas diferentes bibliotecas de cDNA do projeto Sequenciamento de ESTs de cana-de-açúcar (SUCEST). A comparaçäo das GRPs de cana-de-açúcar com as GRPs descritas em outras espécies também será discutida.