Molecular identification of Pichia guilliermondii, Debaryomyces hansenii and Candida palmioleophila

Traditional phenotypic methods and commercial kits based on carbohydrate assimilation patterns are unable to consistently distinguish among isolates of Pichia guilliermondii, Debaryomyces hansenii and Candida palmioleophila. As result, these species are often misidentified. In this work, we established a reliable method for the identification/differentiation of these species. Our assay was validated by DNA sequencing of the polymorphic region used in a real-time PCR assay driven by species-specific probes targeted to the fungal ITS 1 region. This assay provides a new tool for pathogen identification and for epidemiological, drug resistance and virulence studies of these organisms.

Sugarcane genes related to mitochondrial function

A mitocôndria funciona como uma usina geradora metabólica por meio da fosforilaçäo oxidativa e tem sido alvo de um renovado interesse devido aos progressos no entendimento de sua biogênese e na descriçäo de novos papéis ligados à senescência, morte celular e montagem dos centros Fe/S. Uma análise global dos genes de planta ligados a esta organela é agora possível. A base de dados do projeto SUCEST foi examinada para detecçäo de ESTs com similaridade a genes nucleares relacionados às funções mitocondriais usando-se proteínas de Saccharomyces cerevisiae, Homo sapiens e Arabidopsis thaliana. Foram utilizadas 869 seqüências de proteínas para varrer o banco de ESTs do projeto SUCEST por meio do programa de busca de similaridade TBLASTN, sendo examinados 81.223 agrupamentos. Encontramos 367 agrupamentos com E-value>10-10 que representam os prováveis ortólogos em cana-de-açúcar dos genes correspondentes humanos, de levedura e de Arabidopsis. Encontramos produtos gênicos relacionados a todas as categorias funcionais ligados à atividade mitocondrial de maneira que este estudo serve de ponto de partida para a identificaçäo dos genes de cana-de-açúcar envolvidos na biogênese e funçäo da organela e para o estudo da estrutura e fisiologia destes genes.