Genome association analysis for pregnancy status following parturition in crossbred beef cattle / Estudo de associação genômica de prenhez pós-parto em vacas de corte

The aim of this study was to evaluate genetic diversity of nine molecular markers, six short tandem repeats - STRs (BM4325, BMS3004, ILSTS002, IDVGA51, HEL5, AFZ1) and three single nucleotide polymorphisms (SNPs; LepSau3A1 A-B, LepSau3A1 1-2, and FSHRAlu1), linked to genes involved in reproductive function and their possible effect on reproductive performance. For this purpose, 81 crossbred beef cows were used in this study. The animals were classified into two groups (fertile and sub-fertile cows) based on their pregnancy status after two breeding seasons. High genetic diversity level was observed highlighted by the polymorphic content information ranging 0.23 to 0.87 and expected heterozygosity from 27 to 89%, with an average of 62%. Alleles BM4325 103, BMS3004 129, ILSTS002 137, IDVGA51 177, LEPSau3A1 A, LEPSau3A1 1, HEL5 149, AFZ1 119 and FSHRAlu1 G presented high frequencies. Two STRs (IDVGA51 and ILSTS002), linked to Leptin and LH genes, respectively, were associated to reproductive performance. These data support previous findings suggesting the potential use of IDVGA51 and ILSTS002 STRs for reproductive performance selection.

Foi avaliada a diversidade genética de nove marcadores moleculares, dos quais seis do tipo short tandem repeats - STR (BM4325, BMS3004, ILSTS002, IDVGA51, HEL5, AFZ1) e três do tipo single nucleotide polymorphisms - SNPs (LepSau3A1 A-B, LepSau3A1 1-2 e FSHRAlu1), ligados a genes envolvidos na reprodução e seus efeitos na performance reprodutiva. Foram examinadas amostras de sangue de 81 vacas sem raça definida, os animais foram classificados em dois grupos (vacas férteis e subférteis) baseado nas taxas de prenhez de duas estações reprodutivas. Alto nível de diversidade genética foi observado, revelando alto conteúdo de informação polimórfica, variando de 0,23 a 0,87 e heterozigosidade esperada de 27 a 89% com 62% em média. Os alelos mais frequentes foram BM4325 103*, BMS3004 129*, ILSTS002 137*, IDVGA51 177*, LEPSau3A1 A, LEPSau3A1 1, HEL5 149*, AFZ1 119* e FSHRAlu1 G. Os marcadores IDVGA51 e ILSTS002, ligados aos genes da leptina e LH, respectivamente, foram associados a performance reprodutiva. Esses dados suportam achados prévios que sugerem o potencial uso desses marcadores na seleção de animais com maior performance reprodutiva.

Isolamento de Salmonella Braenderup em arara-azul (Anodorhynchus hyacinthinus) / Salmonella Braenderup isolation in Hyacinth macaw (Anodorhynchus hyacinthinus)

O monitoramento sanitário de populações de arara-azul (Anodorhynchus hyacinthinus) de vida livre visa a permitir ajustes de manejo em ambiente natural alterado. Para avaliar a ocorrência de Salmonella spp. em filhotes dessa espécie, foram coletados swabs de cloaca no Pantanal de Miranda, Mato Grosso do Sul (MS). Uma colônia morfológica e bioquimicamente compatível com Salmonella spp. foi isolada e sorotipada como Salmonella Braenderup. Devido ao alto potencial zoonótico desse microrganismo, é importante o controle sanitário de psitacídeos em vida livre. Na literatura pesquisada não foi encontrado relato sobre o isolamento dessa bactéria em arara-azul, tanto em vida livre, como em cativeiro.

The sanitary monitoring of free-living Hyacinth macaw (Anodorhynchus hyacinthinus) allows adjusting the management in altered natural habitat. To evaluate the occurrence of Salmonella spp. it was collected cloacal swabs of this nestlings species, in the Pantanal wetlands, in the state of Mato Grosso do Sul, Brazil. One Salmonella-like colony was serologically typed and identified as Salmonella Braenderup. Due to the high zoonotical potential of this microorganism, it is important an effective sanitary control of wildlife psittacines. In the literature searched it was not found any report on isolation of this bacterium in Hyacinth macaw for both free-living and captive animals.

Genetic polymorphisms at the leptin receptor gene in three beef cattle breeds

The genetic diversity of a single nucleotide polymorphism (SNP) at the exon 20 (T945M) of the leptin receptor gene (LEPR) and of three short tandem repeats (STRs BM7225, BMS694, and BMS2145) linked to LEPR was investigated in three beef cattle herds (Brangus Ibagé, Charolais, and Aberdeen Angus). A cheap and effective new method to analyze the T945M polymorphism in cattle populations was developed and the possible role of these polymorphisms in reproduction and weight gain of postpartum cows was evaluated. High levels of genetic diversity were observed with the average heterozygosity of STRs ranging from 0.71 to 0.81. No significant association was detected between LEPR markers and reproductive parameters or daily weight gain. These negative results suggest that the LEPR gene polymorphisms, at least those herein described, do not influence postpartum cows production.

Identification of molecular markers on bovine chromosome 18 associated to calving interval in a Brangus-Ibagé cattle herd

In the detection phase of a bovine marker assisted selection program, this paper investigated the genetic variability of three microsatellites on the chromosome 18 (BTA 18). The possible associations between genotypes or alleles of these markers versus weight at first calving and a lifetime calving interval (as indicators of reproductive performance) were evaluated in a beef cattle herd (5/8 Aberdeen Angus x 3/8 Nelore). Eleven alleles were detected in TGLA227 and ILSTS002 and three in BMS3004, the most frequent being TGLA227*79, ILSTS002*133, ILSTS002*135 and BMS3004*129. Polymorphic information content ranged from 0.41 to 0.84, while heterozygosity ranged from 49 percent to 86 percent, with an average value of 77 percent. The association analyses performed between genotype classes for the genetic markers versus weight at first calving indicated no significant result. Also, no correlation was observed between calving interval (CI) and TGLA227 genotypes. However, positive associations were detected between ILSTS002 and BMS3004 and CI. Animals carrying at least one ILSTS002*135 allele presented a CI about 39 days longer than the individuals with other genotypes; animals heterozygous for BMS3004 presented a CI about 35 days shorter than the homozygous. On these grounds, it can be concluded that these markers can be useful as an aid to fertility selection, in this herd.

Na fase de detecção, em um programa de seleção assistida por marcadores, em bovinos, este trabalho investigou a variabilidade genética de três microssatélites no cromossomo 18 (BTA 18). As possíveis associações entre genótipos ou alelos destes marcadores versus o peso ao primeiro parto e o intervalo entre partos (como indicadores do desempenho reprodutivo) foram avaliados em um rebanho de gado de corte (5/8 Aberdeen Angus x 3/8 Nelore). Onze alelos foram detectados em TGLA227 e ILSTS002 e três em BMS3004, os mais freqüentes sendo TGLA227*79, ILSTS002*133, ILSTS002*135 e BMS3004*129. O conteúdo polimórfico de informação variou de 0,41 a 0,84, enquanto a heterozigosidade variou de 49 a 86 por cento, com média de 77 por cento. As análises de associação efetuadas entre classes genotípicas dos marcadores genéticos versus o peso ao primeiro parto não indicaram resultados significantes. Da mesma forma, nenhuma correlação foi observada entre o intervalo entre partos (IEP) e os genótipos de TGLA227. Entretanto, associações positivas foram detectadas entre ILSTS002 e BMS3004 com o IEP. Animais portadores de pelo menos um alelo ILSTS002*135 apresentaram IEP cerca de 39 dias mais longo que os indivíduos com outros genótipos, e animais heterozigotos para BMS3004 apresentaram IEP cerca de 35 dias mais curto que os homozigotos. Assim, pode-se concluir que esses marcadores podem ser úteis como auxiliares na seleção para fertilidade, o rebanho em questão.

Association between molecular markers linked to the Leptin gene and weight gain in postpartum beef cows

Three short tandem repeats (STRs), BMS1074, BM1500, IDVGA-51, and three single nucleotide polymorphisms (SNPs), LEPSau3AI (A/B), LEPSau3AI (+/-) and LEPKpn2I linked to the LEP gene were investigated to verify associations with productive performance in postpartum cows of two beef cattle breeds, Aberdeen Angus (AA, n=98) and Charolais (C, n=83). After polymerase chain reaction, STRs were analyzed by vertical electrophoresis and SNPs in agarose gel after endonucleases cleavage. In AA herd 79 percent of BMS1074*151 carriers had a lower average daily weight gain (ADG) when compared with the population mean daily weight gain (103g), while 62 percent of BMS1074*151 non-carriers presented a higher ADG (P<0.01); AA animals with at least one BMS1074*151 allele showed a ADG about 159g lower than that of other animals (P<0.01). In both herds, carriers of the BM1500*136 allele presented higher ADG (about 75g day-1 higher in AA, P<0.05, and 96g day-1 in C, P<0.10); animals with one BM1500*136 allele had about a 3-fold higher chance of having a higher ADG than non-cariers, in both populations.

Foram investigadas três repetições curtas em tandem (STRs), BMS1074, BM1500 e IDVGA-51 e três polimorfismos de um único nucleotídeo (SNPs) LEPSau3AI (A/B), LEPSau3AI (+/-) e LEPKpn2I, ligados ao gene da leptina, verificando-se associações com o desempenho produtivo em vacas no pós-parto, em dois rebanhos de gado de corte, Aberdeen Angus (AA, n=98) e Charolês (C, n=83). Após a reação em cadeia da polimerase, os STRs foram analisados em géis de poliacrilamida e os SNPs em gel de agarose, após a clivagem com endonucleases. Na raça AA, 79 por cento dos portadores do alelo BMS1074*151 apresentaram ganho médio de peso diário (ADG) menor, quando comparados com a média da população (103g), enquanto 62 por cento dos não-portadores mostraram ADG mais alto (P<0,01); os animais AA com pelo menos um alelo BMS1074*151 possuem ADG cerca de 159g menor que os outros animais (P<0,01). Em ambos os rebanhos, portadores do alelo BM1500*136 apresentaram ADG mais alto (em torno de 75g dia-1 em AA, P<0,05 e 96g dia-1 em C, P<0,10) e animais com um alelo BM1500*136 possuem cerca de três vezes mais chance de ter um ADG maior que os não-portadores.

Diagnóstico molecular de Leptospira spp em matrizes suínas descartadas / Molecular diagnosis of Leptospira spp in culled sows

O diagnóstico da leptospirose foi efetuado através de método molecular, histopatológico e sorológico em 30 matrizes suínas, descartadas, no Rio Grande do Sul, Brasil. Os objetivos foram comparar a eficiência dos 3 métodos, verificar a sensibilidade de um método de PCR que utiliza um primer único baseado na seqüência de um elemento repetitivo do genoma de Leptospira interrogans, bem como verificar a possível detecção de leptospiras em vários tecidos , incluindo o trato genital. Os animais foram selecionados com base no teste de algutinação microscópica para incluir tanto animais negativos como positivos e com baixos e altos títulos sorológicos. As maiores freqüências (90% dos animais positivos) e títulos (100 a 800) foram observados para L. interrogans serovar bratislava. Leptospiras foram detectadas por histopatologia em apenas 9 matrizes, todas com altos títulos (pelo menos 100). Um produto de PCR de 438 bp foi observado em todos os animais (fragmentos de 25 rins, 24 úteros e 9 avidutos). Produtos de PCR similares foram obtidos em DNA de culturas de leptospiras patogênicas, enquanto a não patogênica, L. patoc apresentou um padrão distinto. Nenhum produto de amplificação de DNA de Leptospira spp foi detectado em DNA de culturas de Escherichia coli, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella sp, Streptococcus sp and Staphylococus aureus, ou de sangue de dois leitões. O método molecular foi, assim , específico e o mais eficiente para detectar baixos níveis de patógeno, sendo capaz de difernciar leptospiras patogênicas e não patogênicas.

Leptospirosis diagnosis was performed through molecular, histopathological and serological tests in 30 culled sows in Rio Grande do Sul, Brazil. The objectives were to compare the efficiency of the three methods, to verify the sensitivity of a PCR methodology using a single primer based on the sequence of a repetitive element of Leptospira interrogans genome, as well as to verify the possible detection of Leptospira in several tissue including the genital tract of sows. The animals were selected based on the microscopic agglutination test in order to have sows with negative and positive results, presenting low and higher serologic titers. The higher frequency (90% of the positive sows) and titers (100 to 800) was observed for L. interrogans serovar bratislava. Leptospira was detected by histopathology in nine sows only, all presenting higher serologic titers (at least 100). A PCR product of 438 bp was observed in all animals (25 kidneys, 24 uterus and 9 oviduct) fragments. Similar PCR product was obtained for DNA from cultures of other pathogenic leptospires, while the pattern observed for the non-pathogenic L. patoc was distinct. No Leptospira spp DNA amplification product was detected in Escherichia coli, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella sp, Streptococcus sp and Staphylococcus aureus DNAs obtained from cultures, or in blood DNA samples of two piglets. The molecular system was therefore specific and the most effective to detect low pathogen levels, being able to differentiate pathogenic from non-pathogenic leptospires.

Diversity of microsatellites linked to the FSHbeta gene, their usefulness for individual identification and association with reproductive performance

A diversidade genética de três microssatélites (ILSTS027, MBO22, BM4325) mapeados no cromossomo bovino 15 e ligados ao gene do hormônio folículo estimulante, cadeia b (FSHbeta) foi investigada em fêmeas de um rebanho bovino Brangus Ibagé. Além de estimar a variabilidade genética do rebanho, avaliou-se a eficiência destes marcadores para a identificação individual e controle de paternidade. Verificaram-se também possíveis associações entre os marcadores e o desempenho reprodutivo. Seis alelos foram detectados em BM4325 e ILSTS027 e 12 foram observados em MB022, os mais freqüentes sendo, BM4325*101, BM4325*103, ILSTS027*169 e MB022*229. O conteúdo de informação polimórfica variou entre 0,58 a 0,88 enquanto a heterozigosidade esperada oscilou entre 65% e 89%, sendo o valor médio de 77%. Embora apenas três marcadores tenham sido investigados, os valores combinados indicam alto poder de exclusão de um falso progenitor (94%) e de identificação individual (3,8 x 10-4). As análises de associação baseadas nos parâmetros estatísticos [MB022 (n=104, CI=545,3±127,0, WFC=349,9±53,4), BM4325(n=106, CI=542,2±124,9, WFC=350,5±54,4) e ILSTS027(n=105, CI=543,4±124,5, WFC=350,1±54,5)] não indicaram associação positiva entre os microssatélites e o peso da vaca ao parto. O intervalo entre partos também não parece ser influenciado pelos marcadores ILSTS027 ou MB022. No entanto, portadores de pelo menos um alelo BM4325*101 apresentaram intervalo entre partos 54 dias mais curto que os demais animais (p=0,04; n=106). Este marcador pode ser útil para seleção assistida por marcadores, permitindo a melhoria do desempenho reprodutivo, pelo menos no rebanho Brangus Ibagé.

Phosphoglucomutase proteins in human milk

O polimorfismo do loco 4 da fosfoglicomutase foi investigado em uma amostra de colostro obtida de 652 mulheres (60% brancas e 40% negras), coletada 24 a 48 hs. após o parto, em Porto Alegre, Brasil. Uma nova amostra de leite foi obtida de 175 dessas mulheres com cerca de 17 dias de lactaçäo. No colostro observou-se um acentuado desvio no equilíbrio de hardy-Weinberg, havendo em geral um excesso de homozigotos e deficiência de heterozigotos. No leite, no entanto, esse desequilíbrio näo ocorreu. As diferenças entre as duas distribuiçöes säo devidas à detecçäo de padröes nas amostras que näo apresentavam atividade no primeiro período, assim como a variabilidade na ativaçäo enzimática, que pode ocorrer no início da lactaçäo. As frequências gênicas no leite (n = 175) foram: brancos (n = 127) PGM4*1 = 0,20, PGM4*2 = 0,41, PGM4*3 = 0,38, PGM4*4 = 0,01; negróides (n = 48) PGM4*1 = 0,15, PGM4*2 = 0,52, PGM4*3 = 0,32 e PGM4*4 = 0,01