Perfil molecular de cáncer de endometrio en mujeres de Bogotá D.C., Colombia

Introducción: El cáncer de endometrio ocupa el sexto lugar en incidencia del cáncer en mujeres. La caracterización molecular de este cáncer permite optimizar la estratificación de riesgo para mejorar el tratamiento de las pacientes. Objetivo: Determinar el perfil molecular TCGA de pacientes con cáncer de endometrio en Bogotá, D.C., Colombia. Método: Estudio descriptivo en una cohorte de pacientes con cáncer de endometrio. Las mutaciones en los exones 9 a 14 del gen POLE fueron identificadas mediante amplificación por reacción en cadena de la polimerasa, seguida de secuenciación Sanger y análisis bioinformático. La expresión de las proteínas MMR y p53 se identificó mediante inmunohistoquímica. Resultados: Se incluyeron 40 pacientes con una mediana de edad de 66 años. El 15% presentaron mutaciones en el dominio exonucleasa de POLE. El 32% de las pacientes que no presentaron mutaciones manifestaron deficiencia en el sistema MMR. El 43,47% de las pacientes sin mutaciones en POLE ni alteración del sistema MMR presentaron alteración de la proteína p53. Conclusiones: La población de cáncer de endometrio analizada presenta un perfil molecular TCGA similar a lo reportado para otras poblaciones.

Introduction: Endometrial cancer ranks sixth in cancer incidence among women. Its molecular characterization allows for a more precise risk stratification with the aim of improving patient treatment. Objective: To determine the TCGA molecular profile of patients with endometrial cancer in Bogota, Colombia. Method: A descriptive study of a cohort of patients with endometrial cancer. The expression of MMR proteins and p53 was identified through immunohistochemistry. Mutations in exons 9 to 14 of the POLE gene were identified through polymerase chain reaction amplification, followed by Sanger sequencing and bioinformatic analysis. Results: Forty patients were included in the study, with a median age of 66 years, 15% of them exhibited mutations in the exonuclease domain of POLE, while 32% of patients without mutations showed deficiency in the MMR system. Forty three percent of patients without mutations in POLE or MMR alterations showed aberrant p53 protein expression. Conclusions: The analyzed population of endometrial cancer presents a TCGA molecular profile similar to that reported for other populations.

Evaluating the reliability of DNA Barcoding for Central American Pacific shallow water echinoderms identification: a molecular taxonomy and database accuracy analysis / Evaluando la fiabilidad del Código de Barras de ADN para la identificación de equinodermos en aguas poco profundas del Pacífico de América Central: un análisis de taxonomía molecular y precisión de bases de datos

Abstract Introduction: Molecular divergence thresholds have been proposed to distinguish recently separated evolutive units, often displaying more accurate putative species assignments in taxonomic research compared to traditional morphological approaches. This makes DNA barcoding an attractive identification tool for a variety of marine invertebrates, especially for cryptic species complexes. Although GenBank and the Barcode of Life Data System (BOLD) are the major sequence repositories worldwide, very few have tested their performance in the identification of echinoderm sequences. Objective: We use COI echinoderm sequences from local samples and the molecular identification platforms from GenBank and BOLD, in order to test their accuracy and reliability in the DNA barcoding identification for Central American shallow water echinoderms, at genus and species level. Methods: We conducted sampling, tissue extraction, COI amplification, sequencing, and taxonomic identification for 475 specimens. The 348 obtained sequences were individually enquired with BLAST in GenBank as well as using the Identification System (IDS) in BOLD. Query sequences were classified depending on the best match result. McNemar's chi-squared, Kruskal-Wallis's and Mann-Whitney's U tests were performed to prove differences between the results from both databases. Additionally, we recorded an updated list of species reported for the shallow waters of the Central American Pacific. Results: We found 324 echinoderm species reported for Central American Pacific shallow waters. Only 118 and 110 were present in GenBank and BOLD databases respectively. We proposed 325 solved morphology-based identities and 21 provisional identifications in 50 putative taxa. GenBank retrieved 348 molecular-based identifications in 58 species, including twelve provisional identifications in tree taxa. BOLD recovered 170 COI identifications in 23 species with one provisional identification. Nevertheless, 178 sequences retrieved unmatched terms (in 34 morphology-based taxa). Only 86 sequences (25 %) were retrieved as correct identifications and 128 (37 %) as identification errors in both platforms. We include 84 sequences for eleven species not represented in GenBank and 65 sequences for ten species in BOLD Echinoderm COI databases. The identification accuracy using BLAST (175 correct and 152 incorrect identifications) was greater than with IDS engine (110 correct and 218 identification errors), therefore GenBank outperforms BOLD (Kruskal-Wallis = 41.625, df = 1, p < 0.001). Conclusions: Additional echinoderm sample references are needed to improve the utility of the evaluated DNA barcoding identification tools. Identification discordances in both databases may obey specific parameters used in each search algorithm engine and the available sequences. We recommend the use of barcoding as a complementary identification source for Central American Pacific shallow water echinoderm species.

Resumen Introducción: Se han propuesto los umbrales de divergencia molecular para distinguir unidades evolutivas recientemente separadas, que a menudo muestran asignaciones de especies putativas más precisas en la investigación taxonómica en comparación con los enfoques morfológicos tradicionales. Esto hace que los Códigos de Barras de ADN sean una herramienta de identificación atractiva para una variedad de invertebrados marinos, especialmente para complejos de especies crípticas. Aunque GenBank y Barcode of Life Data System (BOLD) son los principales repositorios de secuencias en todo el mundo, muy pocos han probado su desempeño en la identificación de secuencias de equinodermos. Objetivo: Utilizamos secuencias de equinodermos COI de muestras locales y las plataformas de identificación molecular de GenBank y BOLD, para probar su precisión y confiabilidad en la implementación de códigos de barras de ADN para equinodermos de aguas someras de Centroamérica, a nivel de género y especie. Métodos: Realizamos muestreo, extracción de tejido, amplificación de COI, secuenciación e identificación taxonómica de 475 especímenes. Las 348 secuencias obtenidas fueron consultadas individualmente con BLAST en GenBank así como utilizando el Sistema de Identificación (IDS) en BOLD. Las secuencias consultadas se clasificaron según el mejor resultado de coincidencia. Se realizaron las pruebas chi-cuadrado de McNemar, Kruskal-Wallis y U de Mann-Whitney para comprobar diferencias entre los resultados de ambas bases de datos. Además, registramos una lista actualizada de especies reportadas para las aguas someras del Pacífico Centroamericano. Resultados: Encontramos 324 especies de equinodermos reportadas para aguas someras (< 200 m) del Pacífico centroamericano. Sólo 118 y 110 estaban presentes en las bases de datos GenBank y BOLD respectivamente. Propusimos 325 identidades resueltas basadas en morfología y 21 identificaciones provisionales en 50 taxones putativos. GenBank recuperó 348 identificaciones de base molecular en 58 especies, incluidas doce identificaciones provisionales en tres taxones. BOLD recuperó 170 identificaciones de COI en 23 especies con una identificación provisional. Sin embargo, 178 secuencias recuperaron términos no coincidentes (en 34 taxones basados en morfología). Sólo 86 secuencias (25 %) se recuperaron como identificaciones correctas y 128 (37 %) como errores de identificación en ambas plataformas. Incluimos 84 secuencias para once especies no representadas en GenBank y 65 secuencias para diez especies ausentes en las bases de datos BOLD Echinoderm COI. La precisión de la identificación usando BLAST (175 identificaciones correctas y 152 incorrectas) fue mayor que con el motor IDS (110 correctas y 218 errores de identificación), por lo tanto, GenBank supera a BOLD (Kruskal-Wallis = 41.625, df = 1, p < 0.001). Conclusiones: Se necesitan muestras adicionales de equinodermos de referencia para mejorar la utilidad de las herramientas de identificación de códigos de barras de ADN evaluadas. Las discordancias de identificación en ambas bases de datos pueden obedecer a parámetros específicos utilizados en cada algoritmo de búsqueda y a las secuencias disponibles. Recomendamos el uso de códigos de barras como fuente de identificación complementaria para las especies de equinodermos de aguas someras del Pacífico centroamericano.

Recent molecular techniques to strengthen ecological studies in echinoderms / Técnicas moleculares recientes que fortalecen los estudios ecológicos de equinodermos

Abstract Introduction: Echinoderms, an integral component of marine ecosystems worldwide, have captivated scientific interest for centuries. Despite this longstanding attention, comprehending key facets such as trophic relationships, diet composition, and host-microbiota relationships still represents a challenge using traditional techniques. Recent years, however, have witnessed a transformative shift, thanks to the emergence of advanced molecular techniques, offering new approaches to strengthen ecological studies in echinoderms. Objective: Explore how recent advancements in molecular tools have impacted ecological research on echinoderms. Specifically, we aim to investigate the potential of these tools to shed light on trophic interactions, diet composition, and the characterization of gut microbial communities in these organisms. Methods: Available literature was used to clarify how novel molecular techniques can improve ecological studies. The focus is diet, trophic relationships, and gut microbiota. Results: Traditionally, studies of stomach contents using compound microscopy have provided an idea of ingested material; nevertheless, sometimes a simple magnified visualization of dietary content does not allow exhaustive identification of the entire food spectrum, as it is limited due to the rapid digestion and maceration of food items within the echinoderm's digestive tract. The use of DNA-metabarcoding, targeting specific DNA regions, such as the mitochondrial COI gene, has allowed us to enhance the accuracy and precision of diet characterization by enabling the identification of prey items down to the species or even genetic variant level, providing valuable insights into specific dietary preferences. Another approach is the use of stable isotopes, particularly carbon and nitrogen, which provide a powerful tool to trace the origin and flow of nutrients through food webs. By analyzing the isotopic signatures in muscular tissues and food items, we can discern the sources of their primary food items and gain insights into their trophic position within the ecosystem. Lastly, a third new technique used to elucidate the characterization of the prokaryotic community is 16S rRNA sequencing. This method allows us to explore the composition and dynamics of the digestive tract microbial communities. Conclusions: This is a promising era for ecological research on echinoderms, where advances of molecular tools have enabled an unprecedented level of detail, resolving longstanding challenges in comprehending their trophic interactions, diet composition, and host-microbiota relationships, and opening new avenues of investigation in ecological studies.

Resumen Introducción: Los equinodermos, un componente integral de los ecosistemas marinos en todo el mundo, han captado el interés científico durante siglos. A pesar de esta prolongada atención, el comprender facetas clave como las relaciones tróficas, la composición de la dieta y las relaciones huésped-microbiota todavía representa un desafío utilizando técnicas tradicionales. Sin embargo, los últimos años han sido testigos de un cambio transformador, gracias a la aparición de técnicas moleculares avanzadas, que ofrecen nuevos enfoques para fortalecer los estudios ecológicos en equinodermos. Objetivo: Explorar cómo los avances recientes en herramientas moleculares han impactado la investigación ecológica sobre equinodermos. Específicamente, nuestro objetivo es investigar el potencial de estas herramientas para arrojar luz sobre las interacciones tróficas, la composición de la dieta y la caracterización de las comunidades microbianas intestinales en estos organismos. Métodos: Se utilizó la literatura disponible para aclarar cómo las nuevas técnicas moleculares pueden mejorar los estudios ecológicos. La atención se centra en la dieta, las relaciones tróficas y la microbiota intestinal. Resultados: Tradicionalmente, los estudios del contenido estomacal mediante microscopía compuesta han proporcionado una idea del material ingerido; Sin embargo, a veces una simple visualización ampliada del contenido dietético no permite una identificación exhaustiva de todo el espectro alimentario, ya que está limitado debido a la rápida digestión y maceración de los alimentos dentro del tracto digestivo del equinodermo. El uso de metabarcoding de ADN, dirigidos a regiones específicas del ADN, como el gen COI mitocondrial, nos ha permitido mejorar la exactitud y precisión de la caracterización de la dieta al permitir la identificación de presas hasta el nivel de especie o incluso de variante genética, lo que proporciona valiosos resultados sobre preferencias dietéticas específicas. Otro enfoque es el uso de isótopos estables, en particular carbono y nitrógeno, que proporcionan una poderosa herramienta para rastrear el origen y el flujo de nutrientes a través de las redes alimentarias. Al analizar las firmas isotópicas en los tejidos musculares y los alimentos, podemos discernir las fuentes de sus alimentos primarios y obtener información sobre su posición trófica dentro del ecosistema. Por último, una tercera técnica nueva utilizada para dilucidar la caracterización de la comunidad procariótica es la secuenciación del ARNr 16S. Este método nos permite explorar la composición y dinámica de las comunidades microbianas del tracto digestivo. Conclusiones: Esta es una era prometedora para la investigación ecológica sobre equinodermos, donde los avances de las herramientas moleculares han permitido un nivel de detalle sin precedentes, resolviendo desafíos de larga data en la comprensión de sus interacciones tróficas, composición de la dieta y relaciones huésped-microbiota, y abriendo nuevas vías de investigación. en estudios ecológicos.

Importancia biológica de los telómeros / Biological importance of telomeres

Se exponen los hallazgos históricos y la importancia biológica de los telómeros en la vida celular y en los aspectos genéticos del ADN humano. (AU)

The discovery and the biological importance of the telomeres are exposed. (AU)

Sequência didática com aplicação de prática de baixo custo com uso de recursos biotecnológicos / Didactic sequence with application of low-cost practice with the use of biotechnological resources / Secuencia didáctica con aplicación de prácticas de bajo costo con el uso de recursos biotecnológicos

Objetivoaplicar metodologias práticas de biologia no ensino médio em escola estadual de Feira de Santana do período noturno, utilizando a biotecnologia com intuito de proporcionar novas experiências didáticas para jovens e adultos. Método: A abordagem metodológica é de modo qualitativo e descritivo através de relato de experiência, com aplicação de aula prática com materiais de baixo custo sobre a extração de DNA.Resultados: Com relação às dificuldades enfrentadas na Educação Básica, esta forma de metodologia do trabalho realizado mostrou-se produtiva, uma vez que possibilitou um espaço para discussão e troca de experiências dos alunos associando com seu cotidiano. Conclusão: Esta pesquisa mostrou que o uso desta abordagem didática facilitou o entendimento dos conteúdos trabalhados e do diálogo aluno-professor, evidenciando-a como uma ótima ferramenta para ser trabalhada na sala de aula

Objective: to apply practical biology methodologies in high school at a state school in Feira de Santana at night, using biotechnology with the aim of providing new teaching experiences for young people and adults. Methods:The methodological approach is qualitative and descriptive through experience reports, with the application of practical classes with low-cost materials on DNA extraction. Results: In relation to the difficulties faced in Basic Education, this form of work methodology proved to be productive, as itprovided a space for discussion and exchange of students' experiences associated with their daily lives. Conclusion:This research showed that the use of this didactic approach facilitated the understanding of the content covered and the student-teacher dialogue, highlighting it as a great tool to be used in the classroom

Objetivo: aplicar metodologías prácticas de biología en la escuela secundaria en una escuela pública de Feira de Santana en horario nocturno, utilizando la biotecnología con el objetivo de brindar nuevas experiencias de enseñanza a jóvenes y adultos. Métodos: El enfoque metodológico es cualitativo y descriptivo a través de relatos de experiencia, con la aplicación de clases prácticas con materiales de bajo costo sobre extracción de ADN. Resultados: En relación a las dificultades enfrentadas en la Educación Básica, esta forma de metodología de trabajo resultó productiva, ya que brindó un espacio de discusión e intercambio de experiencias de los estudiantes asociadas a su vida cotidiana. Conclusión: Esta investigación demostró que el uso de este enfoque didáctico facilitó la comprensión de los contenidos tratados y el diálogo alumno-profesor, destacándolo como una gran herramienta para ser utilizado en el aula.

Assessment of Subgingival Biofilm and its Relationship with the Status of Tumors in a Population with Breast Cancer

This study aimed to compare the subgingival microbiota of subjects with and without breast cancer (BC). Patients with BC (Group 1; n= 50) and without BC (Group 2; n=50) with periodontitis (A) and without periodontitis (B). The study was conducted in two phases (P1 and P2). One biofilm sample was collected from each subject and analyzed by DNA-DNA Hybridization (Checkerboard DNA-DNA). The relative abundance of the subgingival microbiota differed between the Case and Control groups. However, some species were higher in patients in the Case than in Control subjects and differed between the groups in both phases. Composition of the subgingival microbial community according to the Socransky complex was related to periodontal disease, followed by clinical attachment of level (CAL ≥4mm), age, and tooth loss, which were found to be abundant in Cases when compared with controls. Patients with Tumor Grade II and III had a higher prevalence of tooth loss and CAL≥4mm. It was concluded that in individuals with BC, the sub-gingival microbiota exhibited atypical changes, but they developed periodontal disease.

El objetivo de este estudio fue comparar la microbiota subgingival de sujetos con y sin cáncer de mama (CM). Pacientes con CM (Grupo 1; n= 50) y sin CM (Grupo 2; n=50) con periodontitis (A) y sin periodontitis (B). El estudio se realizó en das fases (P1 y P2). Se recogió una muestra de biopelícula de cada sujeto y se analizó mediante hibridación ADN-ADN (tablero de ajedrez ADN-ADN). La abundancia relativa de la microbiota subgingival difirió entre los grupos de Caso y Control. Sin embargo, algunas especies fueron más altas en los pacientes del Caso que en los sujetos del Control y difirieron entre los grupos en ambas fases. La composición de la comunidad microbiana subgingival según el complejo de Socransky se relacionó con la enfermedad periodontal, seguida por el nivel de inserción clínica (CAL≥4mm), la edad y la pérdida de dientes, que se mostró abundante en los casos en comparación con los controles. Los pacientes con Tumor Grado II y III tuvieron mayor prevalencia de pérdida dental y CAL≥4mm. Se concluyó que en individuos con CM la microbiota subgingival presentó cambios atípicos, pero sin embargo, desarrollaron enfermedad periodontal.

Diagnóstico micológico de paracoccidioidomicosis en un hospital de área no endémica: metodología clásica y molecular / Mycological diagnosis of paracoccidioidomycosis in a hospital from a nonendemic area: classical and molecular methods

Introducción. La paracoccidioidomicosis es una micosis sistémica y endémica en Latinoamérica. El cambio climático y el movimiento migratorio del huésped enfatizan la necesidad de optimizar el diagnóstico de esta infección. Objetivo. Evaluar la implementación de la detección de ADN de Paracoccidioides spp. al diagnóstico micológico de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis. Materiales y métodos. Estudio retrospectivo con datos de laboratorio de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis en un hospital de área no endémica. Resultados. Se analizaron los resultados de las muestras de 19 pacientes con sospecha clínica de paracoccidioidomicosis. El 90 % de los pacientes había nacido o visitado un área endémica de esta micosis en Latinoamérica. En 14 pacientes varones adultos se confirmó paracoccidioidomicosis por diagnóstico convencional. El examen directo fue positivo en 12 pacientes con enfermedad comprobada y en 4 de ellos se obtuvo crecimiento del hongo. Se detectaron anticuerpos contra Paracoccidioides spp. en ocho pacientes con la enfermedad. Se realizó PCR anidada con muestras de 14 pacientes para detectar ADN de Paracoccidioides spp. En 9 de los 10 pacientes con diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis se obtuvo una prueba de PCR positiva. Conclusiones. La implementación de técnicas moleculares para detectar ADN de Paracoccidioides spp. complementa el diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis y permite instaurar el tratamiento antifúngico, sobre todo en los casos clínicos donde no se observa la presencia del hongo en las muestras clínicas. La migración actual de poblaciones humanas dificulta el diagnóstico de paracoccidioidiomicosis y otras infecciones endémicas, por lo que se requiere optimizar el diagnostico micológico en los laboratorios clínicos para tratar pacientes con este tipo micosis desatendida.

Introduction. Paracoccidioidomycosis is a systemic mycosis endemic in Latin America. Climate change and host migration emphasize the need to optimize this infection diagnosis. Objective. To evaluate the implementation of Paracoccidioides spp. DNA detection in the mycological diagnosis of patients with suspected paracoccidioidomycosis. Materials and methods. It is a retrospective study with laboratory data from patients with clinical suspicion of paracoccidioidomycosis, who consulted a university hospital from a non-endemic area. Results. We analyzed the laboratory results of samples from 19 patients with suspected paracoccidioidomycosis. Seventeen out of 19 patients were born in or had visited an endemic area in Latin America. Fourteen adult male patients were confirmed to have paracoccidioidomycosis by conventional diagnosis: the direct examination was positive in 12 samples while fungal growth was found only in 4. Anti-Paracoccidioides spp. antibodies were detected in 10 patients, 8 of them with proven paracoccidioidomycosis. Nested PCR for Paracoccidioides spp. detection was performed on clinical samples from 14 patients, and positive results were obtained for 9 out of 10 patients with the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. Conclusions. The incorporation of molecular techniques to detect Paracoccidioides spp. DNA complements the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. This tool allows the prescription of antifungal treatment in those cases where the fungus is not observed in the clinical samples. Current human migrations difficult the mycological diagnosis of paracoccidioidomycosis and other fungal infections. For this reason, it is necessary to improve mycological diagnosis in clinical laboratories to adequately treat patients with this neglected mycosis.

Taxonomía de los hongos: un rompecabezas al que le faltan muchas piezas / Fungal taxonomy: A puzzle with many missing pieces

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico. Los avances de las técnicas de biología molecular y las ciencias de la computación en los últimos 30 años han permitido cambios importantes dirigidos a establecer los criterios para definir una especie fúngica y alcanzar una construcción filogenética más o menos estable. Sin embargo, el camino por recorrer aún es largo, y supone un trabajo mancomunado de la comunidad científica a nivel global y el apoyo a la investigación básica.

Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

Mejoramiento de un método no comercial para la extracción de ADN de moscas de interés médico-legal

La obtención de ADN de moscas de interés médico-legal es de relevancia para una variedad de aplicaciones. Aunque existen métodos de extracción comerciales de ADN, su uso rutinario es limitado, en algunos escenarios. En este contexto, el uso de métodos no comerciales constituye una alternativa; sin embargo, su optimización es clave para mejorar el flujo de trabajo y los resultados. Este trabajo evaluó el impacto de variaciones a un método de precipitación salina sobre la concentración y la pureza del ADN recuperado. No se encontraron diferencias significativas en la concentración de ADN extraído entre los diferentes tiempos de incubación, probados durante la fase de extracción, mientras que el incremento en el volumen de etanol absoluto, en la fase de precipitación de ADN, mejoró significativamente la concentración de ADN obtenido. Las modificaciones propuestas reducen el tiempo de ejecución y la concentración de ADN obtenido comparado con el protocolo original.

Obtaining DNA from flies of medico-legal interest is relevant for a variety of applications. Although commercial extraction methods offer optimal DNA, their routine use is limited in some settings. In this context, the use of non-commercial methods constitutes an alternative in laboratories with limited resources however, its optimization is key to improving the workflow and the results. This work evaluated the impact of variations to a saline precipitation method on the concentration and purity of the recovered DNA. No significant differences were found in the concentration of extracted DNA between the different incubation times tested during the extraction phase. In contrast, the increased volume of absolute ethanol in the DNA precipitation phase significantly improved the concentration of DNA obtained. The proposed modifications reduce the runtime and DNA concentration obtained compared with the original protocol.

Genotipificación del gen RHD en ADN fetal libre en plasma de embarazadas RhD negativo / Genotyping of the RHD gene in free fetal DNA in plasma of RhD negative pregnant women

Objetivo: Determinar el grupo RhD fetal a través del estudio del gen RHD en ADN fetal que se encuentra libre en plasma de embarazadas RhD negativo. Método: Se analizó la presencia de los genes RHD, SRY y BGLO en ADNfl obtenido de plasma de 51 embarazadas RhD negativo no sensibilizadas, utilizando una qPCR. Los resultados del estudio genético del gen RHD se compararon con el estudio del grupo sanguíneo RhD realizado por método serológico en muestras de sangre de cordón, y los resultados del estudio del gen SRY fueron cotejados con el sexo fetal determinado por ecografía. Se calcularon la sensibilidad, la especificidad, los valores predictivos y la capacidad discriminativa del método estandarizado. Resultados: El gen RHD estaba presente en el 72,5% de las muestras y el gen SRY en el 55,5%, coincidiendo en un 100% con los resultados del grupo RhD detectado en sangre de cordón y con el sexo fetal confirmado por ecografía, respectivamente. Conclusiones: Fue posible deducir el grupo sanguíneo RhD del feto mediante el estudio del ADN fetal que se encuentra libre en el plasma de embarazadas con un método molecular no invasivo desarrollado y validado para este fin. Este test no invasivo puede ser utilizado para tomar la decisión de administrar inmunoglobulina anti-D solo a embarazadas RhD negativo que portan un feto RhD positivo.

Objective: To determine the fetal RhD group through the study of the RHD gene in fetal DNA found free in plasma of RhD negative pregnant women. Method: The presence of the RHD, SRY and BGLO genes in fetal DNA obtained from plasma of 51 non-sensitized RhD negative pregnant women was analyzed using qPCR. The results of the genetic study of the RHD gene were compared with the RhD blood group study performed by serological method in cord blood samples, and the results of the SRY gene study were compared with the fetal sex determined by ultrasound. Sensitivity, specificity, predictive values and discriminative capacity of the standardized method were calculated. Results: The RHD gene was present in 72.5% of the samples and the SRY gene in 55.5%, coinciding 100% with the results of the RhD group detected in cord blood, and with the fetal sex confirmed by ultrasound, respectively. Conclusions: It was possible to deduce the RhD blood group of the fetus through the study of fetal DNA found free in the plasma of pregnant women with a non-invasive molecular method developed and validated for this purpose. This non-invasive test can be used to make the decision to administer anti-D immunoglobulin only to RhD-negative pregnant women carrying an RhD-positive fetus.

Succinate dehydrogenase inhibitors fungicides: a review of their impact on human health and epigenetic changes / Fungicidas inibidores da succinato desidrogenase: uma revisao de seu impacto na saúde humana e alterares epigenéticas / Fungicidas inhibidores de la succinato deshidrogenasa: una revisión de su impacto en la salud humana y los cambios epigenéticos

Abstract Succinate dehydrogenase inhibitors (SDHIs), fungicides currently most used in agriculture in Brazil, act by blocking the enzyme succinate dehydrogenase (SDH) from plant pathogens. However, studies show that SDHIs can not only inhibit SDH activity in target fungi, but also block that activity in human cells. Considering the medical and agricultural implications of SDH, the purpose of this narrative review is to describe the relationship between exposure to fungicides SDHIs and epigenetic regulation of SDH associated with the development of gastrointestinal stromal tumor, pheochromocytoma/paraganglioma, and cancer. The results obtained with the research showed that the human SDH enzyme exhibited sensitivity to some tested SDHIs, which may cause microcephaly and defects in neurological development. Deficiency of SDH activity causes accumulation of succinate which can act as an oncometabolite inhibit-ing iron-dependent dioxygenases and alpha-ketoglutarate, eleven translocation -TET and histone demethylases, inducing epigenetic changes that lead to multiple cancers and other diseases. Therefore, further in vitro and in vivo analyzes should be performed to assess susceptibility to diseases influenced by the toxic effect of SDHIs.

Resumo Os inibidores da succinato desidrogenase (SDHIs), fungicidas atualmente mais utilizados na agricultura no Brasil, atuam bloqueando a enzima succinato desidrogenase (SDH) de fitopatógenos. No entanto, estudos mostram que SDHIs podem nao apenas inibir a atividade de SDH em fungos alvo, mas também bloquear essa atividade em células humanas. Considerando as implicares médicas e agrícolas do SDH, o objetivo desta revisao narrativa é descrever a relaqao entre a exposiqao a fungicidas SDHIs e a regulaqao epigenética do SDH associada ao desenvolvimento de tumor estromal gastrointestinal, feocromocitoma/paraganglioma e cáncer. Os resultados obtidos com a pesquisa mostraram que a enzima SDH humana apresentou sensibilidade a alguns SDHIs testados, que podem causar microcefalia e defeitos no desenvolvimento neurológico. A deficiencia da atividade da SDH causa acumulo de succinato que pode atuar como um oncometabólito inibindo as dioxigenases dependentes de ferro e alfa-cetoglutarato, onze translocaqóes -TET e histonas desmetilases, induzindo alteraqóes epigenéticas que levam a múltiplos canceres e outras doenqas. Portanto, análises adicionais in vitro e in vivo devem ser realizadas para avaliar a suscetibilidade a doenqas influenciadas pelo efeito tóxico dos SDHIs.

Resumen Los inhibidores de la succinato deshidrogenasa (SDHI), los fungicidas actualmente más utilizados en la agricultura en Brasil, actúan bloqueando la enzima succinato deshidrogenasa (SDH) de los patógenos de las plantas. Sin embargo, los estudios muestran que los SDHI no solo pueden inhibir la actividad de SDH en los hongos objetivo, sino que también bloquean esa actividad en las células humanas. Teniendo en cuenta las implicaciones médicas y agrícolas de SDH, el propósito de esta revisión narrativa es describir la relación entre la exposición a fungicidas SDHI y la regulación epigenética de SDH asociada con el desarrollo de tumores del estro-ma gastrointestinal, feocromocitoma/paraganglioma y cáncer. Los resultados obtenidos con la investigación mostraron que la enzima SDH humana mostró sensibilidad a algunos SDHI probados, lo que puede causar microcefalia y defectos en el desarrollo neurológico. La deficiencia de la actividad de SDH provoca la acumulación de succinato que puede actuar como un oncometabolito que inhibe las dioxigenasas dependientes de hierro y el alfa-cetoglutarato, once translocaciones -TET e histona desmetilasas, induciendo cambios epigenéticos que conducen a múltiples cánceres y otras enfermedades. Por lo tanto, se deben realizar más análisis in vitro e in vivo para evaluar la susceptibilidad a enfermedades influenciadas por el efecto tóxico de los SDHI.

Integridad Del ADN Espermático Y La Toxicidad Reproductiva Del Nitrato De Plomo En Ratones Machos Adultos

Introducción: La toxicidad del plomo se ha relacionado a diferentes patologías en humanos y varias evidencias sugieren una fuerte relación con el daño observado sobre la función reproductiva en humanos y roedores. Método: Se proporcionó a ratones una dosis única de nitrato de plomo (NP) (50mg/kg/pc), los cuales fueron eutanizados siete días postinyección con el objetivo de evaluar los espermatozoides que han salido de los túbulos seminíferos y están en tránsito por el epidídimo; además, se evaluó la fragmentación del ADN espermático mediante el ensayo tunel. Resultados: La disminución del peso corporal en ratones, tratados con NP (p 0,05); de igual manera, los valores fisiológicos como conteo y movilidad espermática no disminuyeron con el tratamiento (p > 0.05). El tránsito y maduración de los espermatozoides en el epidídimo no sería afectado por el NP, y al no observar aumento en la fragmentación del ADN espermático en el grupo tratado (p > 0,05), la protaminación espermática estaría cumpliendo su rol protector sobre el material genético murino, por lo que no hubo daños genotóxicos por el NP. Conclusión: La administración intraperitoneal de 50mg/kg/pc de NP, por siete días, no causa toxicidad sistémica ni efecto en la espermatogénesis en ratón.

Introduction: Lead toxicity has been linked to different diseases in humans and several evidences suggest a strong relationship with the observed damage on reproductive function in humans and rodents. Methods: Mice were given a single dose of lead nitrate (NP) (50mg/kg/bw), which were euthanized seven days post-injection with the aim of evaluating sperm to come out from the seminiferous tubules and are in transit through the epididymis. Also, the Tunel test was done to evaluate the sperm DNA fragmentation. Results: The decrease in body weight in mice treated with ln (p 0.05), in the same way physiological values such as sperm concentration and motility didn´t decrease with the treatment (p > 0.05). Transit and sperm maturation in the epididymis would not be affected by the ln, and because we did not observe increased sperm DNA fragmentation in the treated group (p > 0.05), sperm protamination would be fulfilling its protective role on murine genetic material avoiding genotoxic damage by ln. Conclusion: The intraperitoneal administration of 50mg/kg/pc of ln for seven days does not cause systemic toxicity or effect on spermatogenesis in mice.

Primeros registros de Echiophis brunneus (Teleosteo; Ophichthidae) "anguila pecosa" en el norte del Perú

Echiophis brunneus, comúnmente conocida como anguila pecosa, es una especie bentónica costera de la familia Ophichthidae. Su distribución se reporta para el Pacífico Oriental desde el Golfo de California (EE. UU.) hasta el Golfo de Guayaquil (Ecuador). Se reporta por primera vez la presencia de E. brunneus en el norte del Perú a partir de tres ejemplares capturados. Así mismo se registra una nueva talla máxima para la especie y se adiciona la secuencia COI a la base de datos BoldSystems. Una de las principales características para su determinación fue la presencia del diente canino grande localizado en la zona distal del vómer. Las distancias genéticas entre E. brunneus con E. punctifer y E. intertinctus fueron de 0.087±0.013 y 0.095±0.014 respectivamente. Con este trabajo se amplía la distribución geográfica de E. brunneus hasta Salaverry (08°13'28"S, 78°59'22"W), así mismo sugerimos el posible establecimiento de una población de esta especie en la costa norte del Perú.

Echiophis brunneus, commonly known as fangjaw eel, is a coastal benthic species belonging to the Ophichthidae family. Its distribution is reported to be in the Eastern Pacific from the Gulf of California (USA) to the Gulf of Guayaquil (Ecuador). In this study, we report for the first time the presence of E. brunneus based on three specimens captured in northern Peru. Additionally, a new maximum size for the species is recorded, and the first COI sequence is added to the BoldSystems database. One of the main characteristics for its determination was the presence of a large canine tooth located in the distal area of the vomer. The genetic distances between E. brunneus with E. punctifer and E. intertinctus were 0.087±0.013 and 0.095±0.014 respectively. With this work the geographical distribution of E. brunneus is extended to Salaverry (08°13'28"S, 78°59'22"W). We also suggest the possible establishment of a population of this species on the northern coast of Peru.

Detección molecular de la infección natural por parásitos tripanosomátidos en Didelphis marsupialis de una zona rural del norte de Colombia / Molecular detection of the natural infection by trypanosomatid parasites in Didelphis marsupialis from a rural area in northern Colombia

Se evaluó la prevalencia de infección por parásitos tripanosomátidos en Didelphis marsupialis y su relación con los aspectos morfológicos/etarios en una zona rural de El Carmen de Bolívar, Colombia. En cinco visitas (2018-2019) se instalaron trampas Tomahawk® en los ecótopos peridoméstico y silvestre en la Vereda El Alférez, durante tres noches consecutivas/visita. A los animales recolectados, se les determinaron medidas corporales, sexo y edad; y se les extrajo sangre por cardiopuntura, previa sedación, para extracción del ácido desoxirribonucleico (ADN) total y amplificación de la región conservada del ADN de minicírculos de kinetoplasto (ADNk) de parásitos tripanosomátidos. La asociación entre parámetros morfológicos de los didélfidos y su frecuencia de infección por parásitos tripanosomátidos fue determinada mediante una regresión binomial. Se recolectaron 30 individuos de D. marsupialis (60,0% hembras y 40,0% machos/66,7% adultos y 33,3% juveniles). El diagnóstico molecular reveló una frecuencia de infección por parásitos tripanosomátidos del 46,7%. El estadio (p=0,024) fue determinante para la infección. Se discute el papel de D. marsupialis como potencial reservorio de parásitos tripanosomátidos en la zona evaluada.

We studied the prevalence of infection by trypanosomatid parasites in Didelphis marsupialis and its relationship with morphological/age aspects in a rural area of El Carmen de Bolivar, Colombia. Five visits were made to the Vereda El Alférez; each of which lasted three consecutive nights. During these visits, Tomahawk® traps were installed in the peridomestic and wild ecotopes of the Vereda El Alférez. Body measurements, sex and age were determined from the collected animals. Blood was extracted by cardiopuncture, after sedation, in order to obtain total deoxyribonucleic acid (DNA) and amplify the conserved region of the kinetoplast minicircle DNA (kDNA) of parasitic trypanosomatids. The association between morphological parameters of didelphids and their frequency of infection by parasitic trypanosomatids was determined by binomial regression. Thirty D. marsupialis specimens (60.0% females and 40.0% males/66.7% adults and 33.3% juveniles) were collected. Molecular diagnosis revealed a frequency of trypanosomatid parasite infection of 46.7%. Stage (p=0.024) was a determinant for infection. We discuss the role of D. marsupialis as a potential reservoir of parasitic trypanosomatids in the Vereda El Alférez.

Efectos de un programa de entrenamiento aeróbico en el tiempo de reacción y la metilación de ADN del gen SHANK3 en niños con trastorno de espectro autista: un estudio piloto / Effects of an Aerobic Training Program on Reaction Time and DNA Methylation of SHANK3 Gene in Children with Autism Spectrum Disorder: a Pilot Study

Introducción. El trastorno del espectro autista (TEA) es un trastorno del neurodesarrollo que provoca déficits en áreas cognitivas y motoras y es causado por varios mecanismos, entre ellos la regulación epigenética. Los procesos epigenéticos pueden verse influenciados por factores ambientales como el ejercicio físico. Objetivo. Analizar el efecto de un programa de ejercicio físico aeróbico (EFA) en el tiempo de reacción simple (TRS) y la metilación del ADN de la isla 2 del gen SHANK3 en niños con TEA. Materiales y métodos. Estudio cuasiexperimental realizado con un grupo de 9 niños (7-11 años) con TEA, que participaron en un programa de EFA de 10 semanas. Las diferencias en el TRS y la metilación de ADN fueron analizadas mediante la prueba de Kruskall-Wallis, considerando un nivel de significancia de p<0.05.Resultados. La mediana del TRS disminuyó después del programa de entrenamiento. Sin embargo, no se encontró una diferencia estadísticamente significativa (p=0.53). Se observó un patrón de hipermetilación en 11 de los dinucleótidos, tanto antes como después del entrenamiento, y se encontró una diferencia estadísticamente significativa en la posición CpG108 (p=0.032). Conclusión. Un programa de entrenamiento basado en EFA de intensidad moderada a vigorosa tiene el potencial de modificar el TRS y la metilación del ADN en niños con TEA. No obstante, es necesario realizar nuevos estudios con muestras más grandes y en los que se analicen más genes, para corroborar los resultados aquí descritos y fortalecer el conocimiento sobre el efecto del ejercicio en los procesos epigenéticos de esta población

Introduction. Autism spectrum disorder (ASD) is a neurodevelopmental disorder that produces cognitive and motor deficits and it is caused by several mechanisms, including epigenetic regulation. Epigenetic processes can be influenced by environ-mental factors such as physical exercise.Objective. To analyze the effect of an aerobic physical exercise (APE) program on simple reaction time (SRT) and DNA methylation of island 2 of the SHANK3 gene in children with ASD.Materials and methods. A quasi-experimental study was carried out on a group of 9 children (7-11 years old) with ASD, who participated in a 10-week APE program. Differences in SRT and DNA methylation were analyzed using the Kruskall-Wallis test by considering a significance level p<0.05.Results. The median SRT decreased after the training program. However, no sta-tistically significant difference was found (p = 0.53). A pattern of hypermethylation was observed in 11 dinucleotides, both before and after training, and a statistically significant difference was found in the CpG108 position (p = 0.032).Conclusion. A moderate to vigorous intensity of APE program has the potential to modify SRT and DNA methylation in children with ASD. However, it requires further studies with larger samples in which more genes are analyzed, to corroborate the results described here and strengthen knowledge about the effect of exercise on the epigenetic processes of this population

Population genetics and molecular identification of Crocodylus acutus and C. moreletii (Crocodilia: Crocodylidae) in captive and wildlife populations / Genética de poblaciones e identificación molecular de Crocodylus acutus y C. moreletii (Crocodilia: Crocodylidae) en poblaciones de cautiverio y de vida libre

Abstract Introduction: There is low evidence of genetic diversity and hybridization processes within Crocodylus acutus and C. moreletii populations. Objetive: To evaluate genetic diversity and some phylogenetic relationships in wild and captive populations of C. acutus and C. moreletii using the Barcode of Life Data System (COX1, cytochrome C oxidase subunit 1 gene). Methods: 28 individuals phenotypically like C. acutus located in the state of Guerrero, Oaxaca and Quintana Roo were sampled, as well as animals belonging to C. moreletii located in the states of Tabasco, Campeche, and Quintana Roo. 641 base pairs of nucleotide sequence from COX1 were used to obtain the haplotype and nucleotide diversity per population, and a phylogenetic and network analysis was performed. Results: Evidence of hybridization was found by observing C. moreletti haplotypes in animals phenotypically determined as C. acutus, as well as C. acutus haplotypes in animals classified as C. moreletti. Low haplotypic diversity was observed for C. acutus (0.455 ± 0.123) and for C. moreletii (0.505 ± 0.158). A phylogenetic tree was obtained in which the sequences of C. acutus and C. moreletii were grouped into two well-defined clades. Organisms identified phenotypically as C. acutus but with C. moreletii genes were separated into a different clade within the clade of C. moreletii. Conclusions: There are reproductive individuals with haplotypes different from those of the species. This study provides a small but significant advance in the genetic knowledge of both crocodile species and the use of mitochondrial markers, which in this case, the COX1 gene allowed the detection of hybrid organisms in wild and captive populations. Conservation efforts for both species of crocodiles should prevent the crossing of both threatened species and should require the genetic identification of pure populations, to design effective conservation strategies considering the possibility of natural hybridization in areas of sympatry.

Resumen Introducción: Existe poca evidencia de la diversidad genética y los procesos de hibridación dentro de las poblaciones de Crocodylus acutus y C. moreletii. Objetivo: Evaluar la diversidad genética y algunas relaciones filogenéticas en poblaciones silvestres y cautivas de C. acutus y C. moreletii utilizando el Sistema de Código de Barras de la vida (COX1, subunidad I del gen del citocromo C oxidasa). Métodos: Se muestrearon 28 individuos fenotípicamente similares a C. acutus ubicados en los estados de Guerrero, Oaxaca y Quintana Roo, así como animales pertenecientes a C. moreletii ubicados en los estados de Tabasco, Campeche y Quintana Roo. Se utilizaron 641 pares de bases de la secuencia de nucleótidos de la subunidad I del gen del citocromo C oxidasa para obtener el haplotipo y la diversidad de nucleótidos por población, y se realizó un análisis filogenético y de redes. Resultados: Se encontró evidencia de hibridación al observar haplotipos de C. moreletti en animales determinados fenotípicamente como C. acutus, así como haplotipos de C. acutus en animales clasificados como C. moreletti. Se observó una baja diversidad haplotípica para C. acutus (0.455 ± 0.123) y para C. moreletii (0.505 ± 0.158). Se obtuvo un árbol filogenético en el que las secuencias propias de C. acutus y C. moreletii se agruparon en dos grandes y bien definidos clados. Los organismos identificados fenotípicamente como C. acutus pero con genes de C. moreletii se separaron en un clado diferente dentro del clado de C. moreletii. Conclusiones: Existen individuos reproductores con haplotipos diferentes a los de la especie. Este estudio aporta un pequeño pero significativo avance en el conocimiento genético tanto de las especies de cocodrilos como del uso de marcadores mitocondriales, que, en este caso, el gen COX1 permitió la detección de organismos híbridos en poblaciones silvestres y cautivas. Los esfuerzos de conservación para ambas especies de cocodrilos deben evitar el cruce de ambas especies amenazadas y deben requerir la identificación genética de poblaciones puras, para diseñar estrategias de conservación efectivas considerando la posibilidad de hibridación natural en áreas de simpatría.

Gingival state and presence of red complex bacteria in 12-Year-Old schoolchildren / Estado gingival y presencia de bacterias del complejo rojo en escolares de 12 años

Abstract The objective of this study was to determine the gingival state and presence of red complex bacteria in saliva samples of 12-year-old schoolchildren. A calibrated periodontist evaluated biofilm index (BI) (Silness and Löe, 1964), presence of calculus, and gingival index (GI) (Silness and Löe, 1967) in sixty two 12-year-old students of Carmen Lyra School. Saliva samples were collected from each student. The DNA of each sample was extracted and amplified by the polymerase chain reaction (PCR) technique, using specific primers. The BI was 1.18. Calculus was present in 40.40% of the schoolchildren examined; 19.4% was supragingival calculus and 21% both supragingival and subgingival calculus. The GI was 0.97, which according to Silness and Löe is mild gingivitis. Gingivitis was present in 96.8% of the children examined. Regarding the PCR tests: 18 of the samples (31.58%) did not present any of the bacteria analyzed and the remaining 39 samples (68.42%) were positive for at least the presence of red complex bacteria. Within the limitations of this study, it is concluded that the prevalence of gingivitis and calculus is high in the sample examined, and the gingival state observed in the study population, may be related to the presence of red complex bacteria.

Resumen El objetivo de este estudio era determinar el estado gingival y la presencia de bacterias del complejo rojo en muestras de saliva de niños de 12 años de la Escuela Carmen Lyra. Una periodoncista calibrada evaluó en 62 estudiantes de 12 años de la Escuela Carmen Lyra, el índice de biofilme (IB) (Silness y Löe, 1964), la presencia de cálculo y el índice gingival (IG) (Silness y Löe, 1967). Se recolectaron muestras de saliva de cada estudiante. El ADN de cada muestra fue extraído y amplificado por medio de la prueba PCR, empleando primers específicos, para determinar la presencia de bacterias del complejo rojo. El IB fue de 1.18. El cálculo estuvo presente en el 40.40% de la muestra, se encontró 19.4% de cálculo en supragingival y 21% tanto en supragingival como en subgingival. El IG fue de 0.97, que de acuerdo con Silness y Löe es una gingivitis leve. La gingivitis estuvo presente en el 96.8 % de los niños examinados. Con respecto a las pruebas PCR: 18 de las muestras (31.58 %) no presentaron ninguna de las bacterias analizadas y las 39 muestras restantes (68.42%) fueron positivas por lo menos a la presencia de las bacterias del complejo rojo. Dentro de las limitaciones de este estudio, se concluye que la prevalencia de gingivitis y cálculo es alta en la muestra examinada y el estado gingival observado puede estar relacionado con la presencia de bacterias del complejo rojo.

Cytogenetics of Chilean land plants (Embryophyta): state-of-the-art and prospects / CItogenética de plantas terrestres Chilenas (Embryophyta): estado del arte y perspectivas

ABSTRACT Chile is located in the south-western region of South America along the Pacific Ocean and contributes to the worldwide flora with ca. 6,120 species of Bryophyta, Pteridophyta, Pinophyta, Gnetophyta, and Magnoliophyta (1.9% of worldwide total species), exhibiting high endemism across all plant divisions. Little is known about the genetic diversity of Chilean land plants worldwide, including their cytogenetic and molecular characteristics. In 2012 we published the first state-of-the-art review in Cytogenetics of Chilean Angiosperms. The article gathered 78 publications from 1924 to 2010 accounting for approximately 139 species (2.8% of total Chilean species). The aim of this paper was to review the advances in cytogenetic studies of Chilean land plants, reporting additional cytogenetic data for species of four botanical divisions until 2020. Cytogenetic data were searched in the CPCD (Chilean Plants Cytogenetic Database). In total, we found 180 publications from both Chilean and foreign researchers. To date, cytogenetic data have been reported for 499 Chilean land plant species (8.2% of total) belonging to 244 genera and 117 families. In this context, the 2001-2020 period has been among the most productive regarding publications, with 74 available reports that include 163 additional species. Based on chromosome numbers, angiosperms and bryophytes registered the greatest diversity with 55 and 29 different 2n, respectively; both divisions having the greatest number of studied species. Given the importance of increasing information on Chilean land plants, it is expected that more publications will contribute to the knowledge of their cytogenetic diversity in the near future.

RESUMEN Chile está ubicado en la región suroeste de América del Sur a lo largo del Océano Pacífico y contribuye a la flora mundial con aproximadamente 6.120 especies de Bryophyta, Pteridophyta, Pinophyta, Gnetophyta y Magnoliophyta (1,9% del total de especies en todo el mundo), que presentan un alto endemismo en todas las divisiones de plantas. Poco se conoce sobre la diversidad genética de las plantas terrestres chilenas en todo el mundo, incluidas sus características citogenéticas y moleculares. En 2012 publicamos la primera revisión sobre el estado del arte en Citogenética de Angiospermas Chilenas. El artículo reunió 78 publicaciones desde 1924 hasta 2010, que representan aproximadamente 139 especies (2,8% del total de especies chilenas). El objetivo de este trabajo fue revisar los avances en estudios citogenéticos de plantas terrestres chilenas, reportando datos citogenéticos adicionales para especies de cuatro divisiones botánicas hasta el 2020. Los datos citogenéticos se buscaron en el CPCD (Base de Datos Citogenéticos de Plantas Chilenas). En total, encontramos 180 publicaciones sobre citogenética de plantas terrestres chilenas, con datos citogenéticos para 499 especies (8,2% del total) pertenecientes a 244 géneros y 117 familias. En este contexto, el período 2001-2020 ha sido uno de los más productivos en cuanto a publicaciones, con 74 artículos disponibles que incluyen 163 especies adicionales. Basado en los números cromosómicos, angiospermas y briófitos registran la mayor diversidad, con 55 y 29 2n diferentes, respectivamente; ambas divisiones tienen también el mayor número de especies estudiadas. Dada la importancia de incrementar la información sobre plantas terrestres chilenas, se espera que más publicaciones contribuyan al conocimiento de su diversidad citogenética en un futuro próximo.

DNA content and cytogenetic characteristics of Gymnocalycium quehlianum (Cactaceae) along an altitudinal gradient / Contenido de ADN y características citogenéticas de Gymnocalycium quehlianum (Cactaceae) a lo largo de un gradiente altitudinal

ABSTRACT Important changes in vegetation types occur along elevational gradients. The genus Gymnocalycium is endemic to southern South America, and its species are distributed along elevational gradients. In particular, Gymnocalycium quehlianum is a globular cactus endemic to the Sierras de Córdoba. Studying cytogenetic aspects and DNA content in populations throughout their distribution is key to understanding the species. DNA content and cytogenetic characteristics were analyzed in four populations of G. quehlianum (615, 744, 948 and 1257 masl). The genome size in the four populations varied between 3.55 and 4.30 pg. The populations were diploid (2n = 22). All populations showed the karyotype formula of 10 metacentrics (m) + 1 submetacentric (sm). The species presented symmetrical karyotypes and constitutive heterochromatin CMA+/DAPI- associated with nucleolar organizing regions, always found in the first pair of m chromosomes. The 18-5.8-26S rDNA locus is found in the terminal regions of the first pair of chromosomes m, and the 5S locus is adjacent to the 18-5.8-26S locus. A tendency for DNA content to decrease with increasing altitude was observed.

RESUMEN A lo largo de los gradientes altitudinales se producen cambios importantes en los tipos de vegetación. El género Gymnocalycium es endémico del sur de América del Sur y sus especies se distribuyen en gradientes altitudinales. En particular, Gymnocalycium quehlianum es un cactus globular endémico de las Sierras de Córdoba. Estudiar aspectos citogenéticos y de contenido de ADN en las poblaciones a lo largo de su distribución es clave para comprender a la especie. En cuatro poblaciones de G. quehlianum (615, 744, 948 y 1257 msnm) se analizaron el contenido de ADN y las características citogenéticas. El tamaño del genoma en las cuatro poblaciones varió entre 3,55 y 4,30 pg. Las poblaciones resultaron diploides (2n=22). Todas las poblaciones presentaron la fórmula del cariotipo de 10 metacéntricos (m) + 1 submetacéntrico (sm). La especie presentó cariotipos simétricos y heterocromatina constitutiva CMA+/DAPI- asociados con regiones organizadoras nucleolares, que siempre se encontraban en el primer par de cromosomas m. El locus de ADNr 18-5.8-26S se encuentra en las regiones terminales del primer par de cromosomas m y el locus de 5S está adyacente al locus 18-5.8-26S. Se observó una tendencia del contenido de ADN a disminuir con el aumento de la altitud.

First record of the invasive dwarf surf clam Mulinia lateralis (Say 1822) in the eastern Pacific Ocean

Mulinia lateralis is a native bivalve from the Western Atlantic Ocean, distributed from the Gulf of Saint Lawrence in Canada to Yucatan in Mexico. Based on morphological and genetic data of specimens collected in shrimp farms, in this work, we confirm the presence of M. lateralis in the Gulf of Guayaquil, Ecuador. Presence and its consequences of this invasive bivalve in the region is discussed.

Mulinia lateralis es un bivalvo nativo de las aguas del Océano Atlántico Occidental, distribuido desde el Golfo de Saint Lawrence en Canadá hasta Yucatán en México. En este trabajo, la presencia de M. lateralis es confirmada en el Golfo de Guayaquil, Ecuador, con base en datos morfológicos y genéticos de ejemplares colectados en camaroneras. Se presenta una discusión sobre la presencia y consecuencias de este bivalvo invasor en la región.