RÉSUMÉ
Introducción: Es importante considerar la posible implicación de microorganismos poco frecuentes en infecciones de piel y partes blandas si la muestra obtenida para cultivo es de buena calidad, y además se aísla en cultivo puro, como ocurre con Escherichia vulneris. Caso Clínico: Presentamos en caso de una mujer de 34 años, sin antecedentes mórbidos, quien desarrolló un absceso en el 4° dedo de la mano tras un traumatismo con una rama y que requirió drenaje quirúrgico y tratamiento antibiótico para su resolución. En el contenido del absceso, se aisló E. vulneris en cultivo puro, con un perfil antibiótico multisensible. Discusión y Conclusión: E. vulneris es una enterobacteria cuya patogenicidad ha estado clásicamente discutida, pero que se ha visto que puede tener participación en infección de heridas, especialmente aquellas relacionadas con material vegetal. Este microorganismo, muy relacionado con E. harmannii, presenta buena sensibilidad a los aminoglucósidos, con excepción a la penicilina y al cotrimoxazol. En las infecciones de piel y tejidos blandos causadas por E. vulneris y que cursen como un absceso, es importante realizar desbridamiento quirúrgico, si es necesario para la resolución completa del cuadro, además del tratamiento con amoxicilina/ácido clavulánico que parece adecuado.
Introduction: It is important to assess the possible involvement of rare microorganisms in skin and soft tissue infections if the sample obtained for culture is of good quality, and is isolated in pure culture, as occurs with Escherichia vulneris. Case Report: We present the case of a 34-year-old woman, with no history of morbidity, who developed an abscess in the 4th finger of the hand after trauma with a branch and which required surgical drainage and antibiotic treatment for its resolution. In the content of the abscess, E. vulneris was isolated in pure culture, with a multisensitive antibiotic profile. Discusion: E. vulneris is an Enterobacteriaceae whose pathogenicity has been classically discussed, but it has been seen that it may have participated in the infection of wounds, especially those related to plant material. This organism, closely related to E. harmannii, shows good sensitivity to aminoglycosides, with the exception of penicillin, and cotrimoxazole. In skin and soft tissue infections caused by E. vulneris and that present as an abscess, it is important to perform surgical debridement if necessary for complete resolution of the condition, in addition to treatment with amoxicillin/clavulanic acid, which seems appropriate.
RÉSUMÉ
RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.
ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.
Sujet(s)
bêta-Lactamases , Résistance microbienne aux médicaments , Escherichia coli , Épidémiologie moléculaire , Association amoxicilline-clavulanate de potassium , Intégrons , Escherichia coli entérotoxigène , AmpicillineRÉSUMÉ
RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.
ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.
Sujet(s)
bêta-Lactamases , Résistance microbienne aux médicaments , Escherichia coli , Ampicilline , Épidémiologie moléculaire , Association amoxicilline-clavulanate de potassium , Intégrons , Escherichia coli entérotoxigèneRÉSUMÉ
La resistencia a la combinación de ß-lactámico/inhibidor de ß-lactamasa en enterobacterias es un problema creciente que no ha sido estudiado intensamente en Argentina. En el presente trabajo, 54/843 enterobacterias recolectadas en un hospital universitario de la ciudad de Buenos Aires fueron resistentes a ampicilina-sulbactama, pero se mantuvieron sensibles a las cefalosporinas de segunda y tercera generación. Se analizaron los mecanismos enzimáticos presentes en los aislamientos que también fueron resistentes a amoxicilina-ácido clavulánico (AMC) (18/54). La secuenciación reveló dos variantes diferentes de blaTEM-1, donde blaTEM-1b es el alelo más frecuentemente detectado (10 Escherichia coli, 3 Klebsiella pneumoniae, 2 Proteus mirabilis y 1 Raoultella terrigena), seguidos por blaTEM-1a(1 K. pneumoniae). La resistencia a AMC parece estar asociada principalmente con la hiperproducción de TEM-1 (sobre todo en E. coli) o con la coexpresión con ß-lactamasas tipo OXA-2 y/o SHV (K. pneumoniae y P. mirabilis). Se describió una nueva variante de blaTEM(TEM-163) en un aislamiento de E. coli que presentó una CIM frente a AMC de 16/8 µg/ml. La enzima TEM-163 contiene dos sustituciones de aminoácidos respecto de TEM-1, Arg275Gln y His289Leu. Teniendo en cuenta la alta actividad específica observada y la baja IC50 para el ácido clavulánico, el patrón de resistencia de este aislamiento parece obedecer a la hiperproducción de la nueva variante de la ß-lactamasa de amplio espectro, en lugar de vincularse con un comportamiento similar al de una TEM resistente a inhibidores (IRT).
Resistance to ß-lactam/ß-lactamase inhibitors in enterobacteria is a growing problem that has not been intensively studied in Argentina. In the present work, 54/843 enterobacteria collected in a teaching hospital of Buenos Aires city were ampicillin-sulbactam-resistant isolates remaining susceptible to second-and third-generation cephalosporins. The enzymatic mechanisms present in the isolates, which were also amoxicillin-clavulanic acid (AMC)-resistant (18/54) were herein analyzed. Sequencing revealed two different variants of blaTEM-1, being blaTEM-1b the most frequently detected allelle (10 Escherichia coli, 3 Klebsiella pneumoniae, 2 Proteus mirabilis and 1 Raoultella terrigena) followed by blaTEM-1a(1 K. pneumoniae). Amoxicillin-clavulanate resistance seems to be mainly associated with TEM-1 overproduction (mostly in E. coli) or co-expressed with OXA-2-like and/or SHV ß-lactamases (K. pneumoniae and P. mirabilis). A new blaTEMvariant (TEM-163) was described in an E. coli strain having an AMC MIC value of 16/8 µg/ml. TEM-163 contains Arg275Gln and His289Leu amino acid substitutions. On the basis of the high specific activity and low IC50 for clavulanic acid observed, the resistance pattern seems to be due to overproduction of the new variant of broad spectrumß-lactamase rather than to an inhibitor-resistant TEM (IRT)-like behavior.
Sujet(s)
Humains , Association amoxicilline-clavulanate de potassium/pharmacologie , Résistance bactérienne aux médicaments/génétique , Infections à Enterobacteriaceae/microbiologie , Enterobacteriaceae/enzymologie , bêta-Lactamases/isolement et purification , Substitution d'acide aminé , Argentine/épidémiologie , Séquence nucléotidique , Infection croisée/épidémiologie , Infection croisée/microbiologie , Tests d'agents antimicrobiens par diffusion à partir de disques , ADN bactérien/génétique , Infections à Enterobacteriaceae/épidémiologie , Enterobacteriaceae/effets des médicaments et des substances chimiques , Enterobacteriaceae/génétique , Enterobacteriaceae/isolement et purification , Protéines Escherichia coli/génétique , Protéines Escherichia coli/isolement et purification , Protéines Escherichia coli/métabolisme , Escherichia coli/effets des médicaments et des substances chimiques , Escherichia coli/enzymologie , Escherichia coli/génétique , Escherichia coli/isolement et purification , Gènes bactériens , Hôpitaux d'enseignement , Hôpitaux urbains , Données de séquences moléculaires , Similitude de séquences d'acides nucléiques , Spécificité du substrat , bêta-Lactamases/génétique , bêta-Lactamases/métabolismeRÉSUMÉ
Introducción y ObjetivoSe han utilizado los antibióticos como terapia adjunta al tratamiento periodontal. La amoxicilina y la amoxicilina/ ácido clavulánico son algunos de los más utilizados. Establecer el tipo de bacterias y su sensibilidad a la amoxicilina y a la amoxicilina/ácido clavulánico en pacientes con periodontitis agresiva. Materiales y MétodosEste estudio in vitro estableció la sensibilidad a la amoxicilina y a la amoxicilina/ácido clavulánico de las bacterias aisladas de 19 pacientes con periodontitis agresiva. Se obtuvieron muestras de 6 sitios con bolsas iguales o mayores a 7 mm de profundidad, se realizó cultivo y aislamiento de colonias en condiciones anaeróbicas. Laidentificación de los microorganismos se realizó a través de la coloración de Gram y el Sistema Crystal paraanaerobios; para determinar la sensibilidad a los antibióticos se utilizó la técnica descrita por Wilkins y Thiel.ResultadosEn la periodontitis localizada los microorganismos que se presentaron con mayor frecuencia fueron Veillonellaspecies, Peptostreptococcus prevotii, Staphylococcus saccharoliticus, Bacteroides fragilis, Bacteroidesureolyticus. En la periodontitis generalizada se encontró Fusobacterium nucleatum, Veillonella species, Peptostreptococcus prevotii, Peptostreptococcus saccharolitucus, Staphylococcus saccharoliticus. De las 21 especies identificadas, en la periodontitis localizada 4 fueron resistentes a la amoxicilina y 1 resistente a la amoxicilina/Acido clavulánico. En la periodontitis generalizada se encontró 1 microorganismo resistente a laamoxicilina y 1 resistente a la amoxicilina/Acido clavulánico.ConclusiónSe encontraron bacterias resistentes a la amoxicilina y a la amoxicilina/ácido clavulánico.
Introduction and ObjectiveAntibiotics have been used as an adjunct to periodontal treatment. Amoxicillin and amoxicillin/clavulanicacid are some of the most used.To define the type of bacteria and their susceptibility to amoxycillin and to amoxicillin/clavulanic acid inpatients with aggressive periodontitis.Materials and MethodThis descriptive study stated susceptibility to amoxycillin and to amoxicillin/clavulanic acid of bacteriaisolated from 19 patients with aggressive periodontitis, selected by convenience. Samples from six(6) different sites with periodontal pockets equal or greater than 7 mm of depth were obtained. Thesamples were cultured anaerobically and the isolated colonies were identified by means of the Gramstaining procedure and the Crystal System for anaerobics. The Wilkins and Thiel test was used to assesssusceptibility.ResultsThe microorganisms with the highest presence in localized periodontitis were Veillonella species,Peptostreptococcus prevotii, Staphylococcus saccaharolyticus, Bacteroides fragilis and Bacteroidesureolyticus. Fusobacterium nucleatum, Veillonella species, Peptostreptococcus prevotii, Peptostreptococcussaccharolyticus and Staphylococcus saccharolyticus were found in generalized periodontitis. Four out ofthe 21 microorganisms species identified in localized periodontitis 4 were resistant to amoxycillin and oneto amoxicillin/clavulanic acid. One microorganism was identified as resistant to amoxycillin and one toamoxicillin/clavulanic acid in generalized periodontitis.ConclusionAmoxycillin-resistant and amoxycillin/clavulanic acid-resistant bacteria were found.