Molecular survey of tick-borne pathogens in small mammals from Brazilian Amazonia / Levantamento molecular de patógenos transmitidos por carrapatos em pequenos mamíferos da Amazônia brasileira

Abstract Small non-volant mammals (marsupials and small rodents) were captured at three different timepoints from 23 forest fragments across three municipalities (Alta Floresta, Sinop and Cláudia) covering the Amazonian biome of the Mato Grosso State in Midwestern Brazil. The animal tissues (liver and spleen) and blood were screened using molecular tools for the detection of Babesia, Coxiella, Cytauxzoon, Hepatozoon, Theileria, and Anaplasmataceae agents. A total of 230 specimens (78 rodents and 152 marsupials) were trapped. Hepatozoon and Piroplasmorida agents were detected in the common opossums (Didelphis marsupialis). In turn, all samples (blood, liver, or spleen) collected from the small mammals were negative for the genus Coxiella and the family Anaplasmataceae, as detected by polymerase chain reaction (PCR). Phylogenetic analyses inferred from partial sequences of the 18S rRNA gene highlighted the occurrence of new Hepatozoon and Piroplasmorida haplotypes. Future studies determining the role of common opossum (D. marsupialis) in the epidemiological cycles of Hepatozoon and Babesia under natural conditions in the Amazonian biome are necessary.

Resumo Pequenos mamíferos não voadores (marsupiais e pequenos roedores) foram capturados em três diferentes períodos, ao longo de 23 fragmentos florestais de três municípios (Alta Floresta, Sinop e Cláudia), localizados no bioma amazônico do Estado de Mato Grosso, no centro-oeste do Brasil. Os tecidos dos animais (fígado e baço) e sangue foram selecionados e submetidos a ensaios moleculares para a detecção do DNA de Babesia, Coxiella, Cytauxzoon, Hepatozoon, Theileria e agentes Anaplasmataceae. Um total de 230 espécimes (78 roedores e 152 marsupiais) foram capturados. Hepatozoon e agentes Piroplasmorida foram detectados em gambás (Didelphis marsupialis). Ao contrário, todas as amostras (sangue, fígado ou baço) coletadas dos pequenos mamíferos foram negativas para o gênero Coxiella e a família Anaplasmataceae, conforme detectado pela reação em cadeia da polimerase (PCR). Análises filogenéticas inferidas pelas sequências parciais do gene 18S rRNA evidenciaram a ocorrência de novos haplótipos de Hepatozoon e Piroplasmorida. Futuros estudos determinando a importância do gambá-comun (D. marsupialis) nos ciclos epidemiológicos de Hepatozoon e Babesia em condições naturais, no bioma amazônico, são necessários.

Analysis of soybean cropland expansion in the southern Brazilian Amazon and its relation to economic drivers / Análise da expansão do cultivo da soja no sul da Amazônia brasileira utilizando imagens de satélite e sua relação com forçantes econômicas

ABSTRACT The agricultural dynamics of soybean expansion have long been recognized as a major driver of excessive land cover change on the southwestern border of the Brazilian Amazon. The hypothesis that the soybean market exerts an influence on land use was investigated by the association between economic indicators and soybean crop dynamics in the state of Mato Grosso (western Brazil). We integrated a historical series of satellite data of soybean cropland expansion and the two main economic variables (selling prices and production costs) for soybean in Mato Grosso. We focused on the relation between profit (the difference between the average soybean price and production costs) and land-use transition to soybean from 2001 to 2013. The spatially explicit analysis showed that the overall accuracy between the resulting first-time use and the most recent soybean crop area in 2013 was 96.75%, with a Kappa index of 0.63. However, dissimilar values found between Omission and Commission indicators suggest that most of the expanded areas prior to 2013 (5.57 million ha) were under a high dynamical range of land uses. Although there is no direct relation between either the deforestation rate or expansion trends (first-time-use rate) and profit, the results strongly suggest (R2=0.81) that profit exerts a direct and non-negligible influence on the evolution of consolidated land use for soybean in Mato Grosso State.

RESUMO A dinâmica agrícola relacionada à expansão da soja tem sido reconhecida como um dos principais fatores da excessiva conversão da cobertura do solo no Estado de Mato Grosso, no sudoeste da Amazônia brasileira. A hipótese de que o mercado de soja exerce influência no uso do solo, foi investigada pela associação de indicadores econômicos com a dinâmica da cultura de soja no Mato Grosso. Integramos séries históricas de dados de satélite para expansão da área de cultivo de soja e de suas duas principais variáveis ​​econômicas associadas (preço de venda e custo de produção). Enfocamos a relação entre lucro (a diferença entre as médias do preço da soja e do custo de produção) e a conversão do uso do solo para soja de 2001 a 2013. A análise espacial explícita revelou que a precisão global na comparação entre o mapa resultante de first-time-use de cultivo de soja em 2013 foi de 96,75%, com índice Kappa de 0,63. Entretanto, a divergência obtida entre os indicadores de erro por comissão e omissão, sugerem que a maior parte da expansão da soja ocorrida antes de 2013 (5,57 milhões de ha) esteve sob influência de uma intensa dinâmica de uso do solo. Embora seja claro não haver relação direta entre a taxa de desmatamento ou tendências de expansão (taxa de uso pela primeira vez) e o lucro, os resultados sugerem fortemente (R2=0,81) que o lucro exerce influência direta e não-negligenciável na evolução do uso do solo consolidado com soja no estado de Mato Grosso.