Résumé
Abstract Globodera pallida is a white potato cyst nematode present in the Andes, which causes huge losses to Peruvian farmers. An RNA-seq analysis allowed the identification of candidate genes that could mediate resistance against this pathogen. Two varieties, "María Huanca" (Solanum andigena) clone resistant (CIP 279142.12) and "Chimbina Colorada" (Solanum chaucha) (CIP 701013) clone susceptible to G. pallida, were used to identify differentially expressed genes. Total RNA from roots was extracted 72 hours post inoculation with second stage juveniles. Sequencing was done using the Illumina Hiseq 2500 platform. Reads were screened for quality issues and then mapped to the reference potato genome (clone DM1-3516 R44 v4.03). Here, we report 27717 and 27750 genes expressed in the resistant and susceptible variety respectively. The comparative analysis of expression identified 100 candidate genes. 91 genes were associated with resistance to G. pallida with Fold Change ≥ 2 (p <0.05). The remaining 9 R genes had Fold Change ≤ 1. We show differences in the expression of an NBS-LRR protein similar to Gro1-8, genes linked to late blight and TMV virus resistance.
Resumen Globodera pallida es un nemátodo formador de quistes. En la papa (Solanum tuberosum) ocasiona daños atrofiando las raíces. En los Andes peruanos ocasiona grandes pérdidas económicas a los agricultores. A través del análisis por RNA-seq, se identificaron genes candidatos que podrían mediar la resistencia contra este nemátodo. Dos variedades de papa: "María Huanca" (S. andigena) clon resistente (CIP 279142.12) y "Chimbina Colorada" (S. chaucha) clon susceptible (CIP 701013) a G. pallida, fueron utilizados para identificar genes expresados diferencialmente. Las raíces fueron inoculadas con G. pallida en segundo estadío juvenil (J2). El ARN total fue extraído a 72 horas post inoculación. El secuenciamiento fue realizado en plataforma Illumina HiSeq 2500. Las lecturas de buena calidad fueron mapeadas al genoma de referencia de S. tuberosum (clon DM1-3516 R44 v4.03). Reportamos 27717 y 27750 genes expresados en la variedad resistente y susceptible, respectivamente. El análisis comparativo identificó 100 genes candidatos, de ellos 91 genes fueron asociados con la resistencia a G. pallida (Fold Change ≥ 2 , p <0.05) y los 9 restantes con genes R ( Fold Change ≤ 1). En este último grupo se observaron diferencias en la expresión de genes NBS-LRR similar a Gro 1-8, genes relacionados a late blight y resistencia al Virus TMV.
Résumé
Abstract This study used information about Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus Travassos, Artigas & Pereira, 1928 that had been published over a period of more than 90 years to investigate the infection and distribution patterns of this nematode in teleost freshwater fish in Brazil. This study was carried out using 181 samples from 82 fish species in 19 families within the five orders, with predominance of Characiformes species (71.6%). We organized a matrix-based parasite-host system in which the fish species were classified in different trophic levels and parasitic infection parameters according data available on host fish species with different life histories and geographic distributions across Brazilian hydrographic basins. Procamallanus (S.) inopinatus showed prevalence ranging from low to moderate, low abundance, low intensity, typically aggregated dispersion, and preferential infection of the hosts' gastrointestinal tract. There was difference in prevalence between detritivorous, omnivorous, carnivorous and piscivorous hosts, but no difference in intensity and abundance was found due to similarity in the communities of this endoparasite among the host fish species. The geographic distribution of this parasite encompasses the river of the Amazon, Paraná, São Francisco, North Atlantic, South Atlantic and Eastern basins. Lastly, suggestions regarding the life cycle of P. (S.) inopinatus, with its potential intermediate hosts, were discussed.
Resumo O objetivo deste estudo foi utilizar as informações sobre a Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus Travassos, Artigas & Pereira, 1928, publicadas ao longo de mais de 90 anos (1928 e 2019), para a busca de padrões de infecção e distribuição desse nematoide em peixes de teleósteos de água doce, no Brasil. Este estudo foi realizado usando-se 181 amostras de 82 espécies de peixes de 19 famílias, distribuídas em cinco ordens, com predominância de espécies de Characiformes (71.6%). Foi organizado um sistema parasito-hospedeiro em matrizes com espécies de peixes de acordo com cinco níveis tróficos. Foram usados parâmetros de infecção parasitária (prevalência, intensidade e abundância), conforme os dados disponíveis para peixes hospedeiros com diferentes histórias de vida e distribuição geográfica em diferentes bacias do Brasil. Procamallanus (S.) inopinatus mostrou prevalência variando de baixa a moderada, baixa abundância, baixa intensidade, dispersão tipicamente agregada e infecção preferencial pelo trato gastrointestinal dos hospedeiros. Houve diferença na prevalência entre hospedeiros detritívoro, onívoro, carnívoro e piscívoro, mas não foram encontradas diferenças na intensidade e abundância de P. (S.) inopinatus, devido a uma similaridade na comunidade desse endoparasito entre os hospedeiros. Esse parasito tem distribuição geográfica nos sistemas das bacias do Rio Amazonas, Rio Paraná, Rio São Francisco, Atlântico Norte, Atlântico Sul e Leste, e esses achados foram discutidos. Por fim, o ciclo de vida de P. (S.) inopinatus, com potenciais hospedeiros intermediários, foi finalmente sugerido e discutido.
Sujets)
Animaux , Spirurida/pathogénicité , Characiformes/parasitologie , Maladies des poissons/parasitologie , Maladies des poissons/épidémiologie , Brésil/épidémiologie , Eau douceRésumé
Abstract: The acanthocephalan species Quadrigyrus torquatus Van Cleave, 1920 has been found in different hosts from South America, but recent papers have not focused on its morphology traits. Different species of Astyanax Baird & Girard, 1854 were collected with seine nets between January 2017 and October 2017 in Pintada Island, Lake Guaíba, Porto Alegre city (30º17'11''S and 51º18'01"W), Rio Grande do Sul State, Brazil. Acanthocephalans found in cysts were processed according to the techniques for the group. Specimens of Q. torquatus were identified based mainly in the morphology of proboscis hooks and trunk spines, and by the measurements made using light microscopy. Supplemental observations on the morphology of Q. torquatus were made for the first time considering the morphology and amount of hooks and spines. The amplitude of intensity of infections was 1 (A. aff. fasciatus) and 1‒3 (A. lacustris) helminths. This difference could be related to the number of hosts examined, the feeding habit of the hosts or related to aspects in the parasite life cycle. This paper is the first report of Q. torquatus in A. aff. fasciatus and A. lacustris from Lake Guaíba, extending the distribution to the southernmost state of Brazil, thus contributing to the knowledge of acanthocephalans in freshwater fishes from South America.
Resumo: A espécie de acantocéfalo Quadrigyrus torquatus Van Cleave, 1920, tem sido encontrada em diferentes hospedeiros na América do Sul, contudo os estudos recentes não focam no estudo dos caracteres morfológicos. Diferentes espécies de Astyanax Baird & Girard, 1854 foram coletadas com redes do tipo picaré entre janeiro e outubro de 2017, na Ilha da Pintada, Lago Guaíba, Cidade de Porto Alegre (30º17'11''S e 51º18'01"W), Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os acantocéfalos encontrados encistados foram processados de acordo com as técnicas para o grupo. Os espécimes de Q. torquatus foram identificados principalmente pela morfologia dos ganchos da probóscide, espinhos do tronco e, pelas medidas realizadas através de microscopia de luz. Observações suplementares na morfologia de Q. torquatus foram realizadas pela primeira vez, considerando a morfologia e o número de ganchos e espinhos. A amplitude das infecções foi 1 (A. aff. fasciatus) e 1‒3 (A. lacustris) helmintos. Esta diferença pode estar associada com o número de hospedeiros examinados, com os hábitos alimentares dos hospedeiros, ou relacionada com aspectos no ciclo de vida do parasito. Este estudo é o primeiro registro de Q. torquatus em A. aff. fasciatus e A. lacustris do Lago Guaíba, estendendo a distribuição do parasito para o sul do Brasil, contribuindo com o conhecimento dos acantocéfalos parasitos de peixes de água doce na América do Sul.
Sujets)
Classification , Acanthocephala , HelminthesRésumé
El mono ardilla (Cebidae: Saimiri sciureus) es una especie de primate neotropical. La mayor susceptibilidad a la presencia de parásitos en estos primates se puede deber a las condiciones ex situ a las que se encuentran sometidos, en donde se exponen a diferentes factores ambientales y de manejo. A partir de las historias clínicas de una población de 94 Saimiri sciureusdel Parque Zoológico Jaime Duque (PZJD) y de la Unidad de Rescate y Rehabilitación de Animales Silvestres (Urras), instituciones ubicadas al noroccidente de los Andes suramericanos, se determinó la presencia de los parásitos diagnosticados en estas dos condiciones (exhibición y rehabilitación, respectivamente), estableciendo la posible asociación con la edad, el sexo, la sintomatología y los medicamentos. Se utilizaron histogramas y prueba de chi cuadrado para definir las diferencias de parásitos en estos dos lugares y poder determinar la mayor frecuencia presente en Saimiri sciureus. Por otro lado, el limitado conocimiento y los estudios parasitológicos de estos primates delimitan la gestión pública y dificultan el establecimiento de posibles zoonosis.
The squirrel monkey (Cebidae: Saimiri sciureus) is a species of Neotropical primate. The increased susceptibility to the presence of parasites in these primates may be due to the ex situ conditions to which they are subjected, and where they are exposed to different environmental and managerial factors. The presence of the parasites diagnosed in these two conditions (exhibition and rehabilitation, respectively) was determined based on the medical records of a population of 94 Saimiri sciureus from the Jaime Duque Zoo (PZJD) and the Wild Animal Rescue and Rehabilitation Unit (Urras), both institutions located at the northwestern part of the Andes in South America, thus establishing the possible association with age, gender, symptomatology and medicine. Histograms and chi-squared tests were used to define the parasite differences in these two places and to determine the most frequent ones in Saimiri sciureus. On the other hand, the limited knowledge and parasitological studies of these primates delimitate public management and hinder the establishment of possible zoonoses.
O macaco-de-cheiro (Cebidae: Saimiri sciureus) é uma espécie de primata neotropical. A maior suscetibilidade à presença de parasitas nestes primatas pode-se dever as condições ex situ às que se encontram submetidos, onde são expostos a diferentes fatores ambientais e de manejo. A partir das histórias clínicas de uma população de 94 Saimiri sciureus do Parque Zoológico Jaime Duque (PZJD) e da Unidade de Resgate e Reabilitação de Animais Silvestres (Urras), instituições localizadas ao noroeste dos Andes sul-americanos, determinou-se a presença dos parasitas diagnosticados nestas duas condições (exibição e reabilitação, respectivamente), estabelecendo a possível associação com a idade, o sexo, a sintomatologia e os medicamentos. Foram utilizados histogramas e prova de qui-quadrado para definir as diferenças de parasitas nestes dois lugares, e poder determinar a maior frequência presente em Saimiri sciureus. Por outro lado, o limitado conhecimento e os estudos parasitológicos destes primatas delimitam a gestão pública e dificultam o estabelecimento de possíveis zoonoses.