Marcadores moleculares para la taxonomía e identificación del género Brucella (Alphaproteobacteria) / Molecular markers for the taxonomy and identification of the genus Brucella (Alphaproteobacteria)

Introducción: El género Brucella está incluido en la familia Brucellaceae que pertenece al orden Rhizobiales y es reconocido por su alto grado de patogenicidad. Las bacterias de este género son responsables de la brucelosis, enfermedad que ha sido reportada como una de las zoonosis más importantes a nivel mundial por su incidencia en el ganado y el hombre. Los estudios previos para la clasificación taxonómica del género, se han basado fundamentalmente en el análisis del gen 16S ARNr. Sin embargo, pocas investigaciones se han dirigido a la identificación de marcadores moleculares que distingan a sus miembros de otros grupos de bacterias. Objetivo: Identificar inserciones en secuencias de proteínas conservadas, que pudieran ser utilizados como marcadores moleculares para la taxonomía y diagnóstico de especies del género Brucella. Métodos: Las secuencias homólogas de las proteínas analizadas fueron obtenidas de bases de datos internacionales y, posteriormente, alineadas con el programa ClustalX2, para ello fueron considerados los parámetros sugeridos en la literatura. Resultados: Se identificaron inserciones en las proteínas oxoglutarato deshidrogenasa (componente E1) y ADN ligasa A específicas del género Brucella. Conclusiones: Las inserciones halladas pueden ser empleadas como complemento a los métodos tradicionales de clasificación taxonómica y para el diagnóstico molecular de bacterias incluidas en el género Brucella(AU)

Introduction: Brucella is a genus from the Brucellaceae family, Rhizobiales order. This genus is recognized for its high pathogenicity. Brucella bacteria cause brucellosis, a disease reported as one of the most important zoonoses worldwide due to its incidence in cattle and people. Previous studies on taxonomic classification of the genus have been mainly based on the analysis of gene 16S rDNA. However, few studies have been aimed at identification of molecular markers distinguishing its members from other groups of bacteria. Objective: Identify insertions in preserved protein sequences which could be used as molecular markers for the taxonomy and diagnosis of species from the Brucella genus. Methods: The homologous sequences for the proteins analyzed were obtained from international databases and aligned with the software ClustalX2, considering the parameters suggested in the literature. Results: Insertions were identified in the proteins oxoglutarate dehydrogenase (component E1) and DNA ligase A, specific of the genus Brucella. Conclusions: The insertions found may be used as complements to the traditional methods for taxonomic classification and for the molecular diagnosis of bacteria from the genus Brucella(AU)

Caracterización de la variabilidad genética de cepas de campo de Brucella canis aisladas en Antioquia / Characterization of the genetic variability of field strains of Brucella canis isolated in Antioquia

Brucella canis, un patógeno intracelular facultativo, es responsable de la brucelosis canina, una enfermedad zoonótica que afecta a los caninos y al hombre. En los primeros causa abortos y fallas reproductivas; en el ser humano genera síntomas inespecíficos. En el año 2005 se demostró la presencia de B. canis en Antioquia (Colombia). Las cepas halladas se identificaron como tipo 2. La secuenciación del genoma completo de una cepa de campo denominada Brucella canis str. Oliveri mostró indels específicos de especie; a partir de estos se buscó conocer características genómicas de las cepas de B. canis aisladas y establecer relaciones filogenéticas, así como el tiempo de divergencia de la cepa Oliveri. Se realizó PCR convencional y secuenciación de 30 cepas de campo, se identificaron 5 indels reconocidos en B. canis str. Oliveri, se empleó ADN de Brucella suis, Brucella melitensis y cepas vacunales de Brucella abortus como controles. Se determinó que las cepas de campo estudiadas comparten 4 de los 5 indels de la cepa Oliveri, lo que indica la presencia de más de una cepa de B. canis circulando en la región. El análisis filogenético se realizó con 24 cepas de Brucella mediante secuencias concatenadas de genes marcadores de especie. Se probó la hipótesis del reloj molecular y adicionalmente se realizó test de tasas relativas de Tajima. De esta manera se demostró que la cepa Oliveri, al igual que las otras cepas de B. canis analizadas, divergen de B. suis. Se rechazó la hipótesis del reloj molecular entre las especies de Brucella y se demostró una tasa de evolución y una distancia genética similar entre las cepas de B. canis.

Brucella canis is a facultative intracellular pathogen responsible for canine brucellosis, a zoonotic disease that affects canines, causing abortions and reproductive failure; and the production of non-specific symptoms in humans. In 2005 the presence of B. canis in Antioquia was demonstrated and the strains were identified as type 2. The sequencing of the genome of a field strain denoted Brucella canis str. Oliveri, showed species-specific indel events, which led us to investigate the genomic characteristics of the B. canis strain isolated and to establish the phylogenetic relationships and the divergence time of B. canis str. Oliveri. Conventional PCR sequencing was performed in 30 field strains identifying 5 indel events recognized in B. canis str. Oliveri. ADN from Brucella suis, Brucella melitensis and vaccine strains from Brucella abortus were used as control, and it was determined that all of the studied field strains shared 4 out of the 5 indels of the sequenced Oliveri strain, indicating the presence of more than one strain circulating in the region. Phylogenetic analysis was performed with 24 strains of Brucella using concatenated sequences of genetic markers for species differentiation. The molecular clock hypothesis and Tajima's relative rate test were tested, showing that the Oliveri strain, similarly to other canis species, diverged from B. suis. The molecular clock hypothesis between Brucella species was rejected and an evolution rate and a similar genetic distance between the B. canis were demonstrated.

Anatomic description of the ulna of the white-footed tamarin (Saguinus leucopus Günther, 1876) / Descripción anatómica de la ulna del tití gris (Saguinus leucopus Günther, 1876)

This document is a description of the macroscopic functional anatomy of the ulna bony prominences in the White-footed Tamarin (Saguinus leucopus), a neotropical endemic, and monotypic primate of Colombia. Few studies have been conducted on its anatomy, and thus its ulnar morphology, an essential element for this animal's quadrupedal arboreal locomotion, remains unknown. This study is based on eight specimens, fixed in formalin at 10 % whose ulnas were extracted in order to describe the main bony prominences along with muscular and ligamentous fixation functions. These elements of the locomotor apparatus and the multiple anatomical contours of the ulna of the White-footed Tamarin, exhibit characteristics for positional and articular adjustment with other bones of the forelimb in harmony with the attachments of the muscles, essential for quadrupedal arboreal locomotion.

El presente trabajo es una descripción de la anatomía macroscópica y funcional de los relieves óseos de la ulna del tití gris (Saguinus leucopus), un primate neotropical, endémico y monotípico de Colombia, con escasos estudios sobre su anatomía, y por ende de la morfología ulnar, elemento fundamental para la locomoción cuadrúpeda de este animal arbóreo que permanece desconocida. Para ello, se tomaron como base del estudio ocho especímenes fijados con formalina al 10 % y de ellos se extrajeron sus ulnas, describiendo los principales relieves óseos con sus funciones de fijación muscular y ligamentosa. Estos elementos del aparato locomotor con sus múltiples relieves anatómicos de la ulna del tití gris, presentan características para la adaptación posicional y articular con otros huesos del miembro torácico de manera armónica para la fijación de músculos indispensables en su locomoción cuadrúpeda arbórea.