RÉSUMÉ
Abstract Although invasive infections and mortality caused by Candida species are increasing among compromised patients, resistance to common antifungal agents is also an increasing problem. We analyzed 60 yeasts isolated from patients with invasive candidiasis using a PCR/RFLP strategy based on the internal transcribed spacer (ITS2) region to identify different Candida pathogenic species. PCR analysis was performed from genomic DNA with a primer pair of the ITS2-5.8S rDNA region. PCR-positive samples were characterized by RFLP. Restriction resulted in 23 isolates identified as C. albicans using AlwI, 24 isolates as C. parapsilosis using RsaI, and 13 as C. tropicalis using XmaI. Then, a group of all isolates were evaluated for their susceptibility to a panel of previously described killer yeasts, resulting in 75% being susceptible to at least one killer yeast while the remaining were not inhibited by any strain. C. albicans was the most susceptible group while C. tropicalis had the fewest inhibitions. No species-specific pattern of inhibition was obtained with this panel of killer yeasts. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri and Wickerhamomyces anomalus were the strains that inhibited the most isolates of Candida spp.
Resumo Embora as infecções invasivas e a mortalidade causada por espécies de Candida estejam aumentando entre pacientes comprometidos, a resistência a agentes antifúngicos comuns também é um problema crescente. Analisamos 60 leveduras isoladas de pacientes com candidíase invasiva utilizando como estratégia PCR/RFLP baseada na região espaçadora transcrita interna (ITS2) para identificar diferentes espécies patogênicas de Candida. A análise por PCR foi realizada a partir de ADN genómico com um par de iniciadores da região ITS2-5.8S rDNA. As amostras PCR-positivas foram caracterizadas por RFLP. A restrição resultou em 23 isolados identificados como C. albicans usando AlwI, 24 isolados como C. parapsilosis usando RsaI e 13 como C. tropicalis usando XmaI. Em seguida, avaliou-se o grupo de todos os isolados quanto à sua susceptibilidade a um painel de leveduras killer previamente descritas, resultando em 75% sendo suscetíveis a pelo menos uma levedura killer, enquanto que as restantes não foram inibidas por qualquer cepa. C. albicans foi o grupo mais suscetível enquanto C. tropicalis teve o menor número de inibições. Não se obteve um padrão de inibição específico da espécie com este painel de leveduras killer. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri e Wickerhamomyces anomalus foram as cepas que inibiram a maioria dos isolados de Candida spp.
Sujet(s)
Humains , Adulte , Candida/effets des médicaments et des substances chimiques , Candidose invasive/traitement médicamenteux , Antifongiques/pharmacologie , Polymorphisme de restriction , Candida/génétique , Tests de sensibilité microbienne/méthodes , Réaction de polymérisation en chaîne/méthodes , Candidose invasive/microbiologieRÉSUMÉ
Abstract Although invasive infections and mortality caused by Candida species are increasing among compromised patients, resistance to common antifungal agents is also an increasing problem. We analyzed 60 yeasts isolated from patients with invasive candidiasis using a PCR/RFLP strategy based on the internal transcribed spacer (ITS2) region to identify different Candida pathogenic species. PCR analysis was performed from genomic DNA with a primer pair of the ITS2-5.8S rDNA region. PCR-positive samples were characterized by RFLP. Restriction resulted in 23 isolates identified as C. albicans using AlwI, 24 isolates as C. parapsilosis using RsaI, and 13 as C. tropicalis using XmaI. Then, a group of all isolates were evaluated for their susceptibility to a panel of previously described killer yeasts, resulting in 75% being susceptible to at least one killer yeast while the remaining were not inhibited by any strain. C. albicans was the most susceptible group while C. tropicalis had the fewest inhibitions. No species-specific pattern of inhibition was obtained with this panel of killer yeasts. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri and Wickerhamomyces anomalus were the strains that inhibited the most isolates of Candida spp.
Resumo Embora as infecções invasivas e a mortalidade causada por espécies de Candida estejam aumentando entre pacientes comprometidos, a resistência a agentes antifúngicos comuns também é um problema crescente. Analisamos 60 leveduras isoladas de pacientes com candidíase invasiva utilizando como estratégia PCR/RFLP baseada na região espaçadora transcrita interna (ITS2) para identificar diferentes espécies patogênicas de Candida. A análise por PCR foi realizada a partir de ADN genómico com um par de iniciadores da região ITS2-5.8S rDNA. As amostras PCR-positivas foram caracterizadas por RFLP. A restrição resultou em 23 isolados identificados como C. albicans usando AlwI, 24 isolados como C. parapsilosis usando RsaI e 13 como C. tropicalis usando XmaI. Em seguida, avaliou-se o grupo de todos os isolados quanto à sua susceptibilidade a um painel de leveduras killer previamente descritas, resultando em 75% sendo suscetíveis a pelo menos uma levedura killer, enquanto que as restantes não foram inibidas por qualquer cepa. C. albicans foi o grupo mais suscetível enquanto C. tropicalis teve o menor número de inibições. Não se obteve um padrão de inibição específico da espécie com este painel de leveduras killer. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri e Wickerhamomyces anomalus foram as cepas que inibiram a maioria dos isolados de Candida spp.
RÉSUMÉ
Abstract Although invasive infections and mortality caused by Candida species are increasing among compromised patients, resistance to common antifungal agents is also an increasing problem. We analyzed 60 yeasts isolated from patients with invasive candidiasis using a PCR/RFLP strategy based on the internal transcribed spacer (ITS2) region to identify different Candida pathogenic species. PCR analysis was performed from genomic DNA with a primer pair of the ITS2-5.8S rDNA region. PCR-positive samples were characterized by RFLP. Restriction resulted in 23 isolates identified as C. albicans using AlwI, 24 isolates as C. parapsilosis using RsaI, and 13 as C. tropicalis using XmaI. Then, a group of all isolates were evaluated for their susceptibility to a panel of previously described killer yeasts, resulting in 75% being susceptible to at least one killer yeast while the remaining were not inhibited by any strain. C. albicans was the most susceptible group while C. tropicalis had the fewest inhibitions. No species-specific pattern of inhibition was obtained with this panel of killer yeasts. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri and Wickerhamomyces anomalus were the strains that inhibited the most isolates of Candida spp.
Resumo Embora as infecções invasivas e a mortalidade causada por espécies de Candida estejam aumentando entre pacientes comprometidos, a resistência a agentes antifúngicos comuns também é um problema crescente. Analisamos 60 leveduras isoladas de pacientes com candidíase invasiva utilizando como estratégia PCR/RFLP baseada na região espaçadora transcrita interna (ITS2) para identificar diferentes espécies patogênicas de Candida. A análise por PCR foi realizada a partir de ADN genómico com um par de iniciadores da região ITS2-5.8S rDNA. As amostras PCR-positivas foram caracterizadas por RFLP. A restrição resultou em 23 isolados identificados como C. albicans usando AlwI, 24 isolados como C. parapsilosis usando RsaI e 13 como C. tropicalis usando XmaI. Em seguida, avaliou-se o grupo de todos os isolados quanto à sua susceptibilidade a um painel de leveduras killer previamente descritas, resultando em 75% sendo suscetíveis a pelo menos uma levedura killer, enquanto que as restantes não foram inibidas por qualquer cepa. C. albicans foi o grupo mais suscetível enquanto C. tropicalis teve o menor número de inibições. Não se obteve um padrão de inibição específico da espécie com este painel de leveduras killer. Metschnikowia pulcherrima, Pichia kluyveri e Wickerhamomyces anomalus foram as cepas que inibiram a maioria dos isolados de Candida spp.
RÉSUMÉ
This work evaluated the antagonism of killer positive yeast strains (isolated from 11 samples of different frozen fruit pulps) against the strains of Penicillium expansum and Aspergillus ochraceus. Of the total 41 killer yeasts tested in YM agar, 19 showed antibiosis against P. expansum and A. ochraceus, with inhibition zone ranging from 10 to 18 mm and 10 to 19 mm, respectively. In the following step, the extracellular activity of Kluyveromyces sp. FP4(13) was tested performing the assay in YM broth. The antifungal activity of Kluyveromyces sp. FP4(13) cell-free culture supernatant (25ºC/96 h) was more effective against the conidia germination, showing inhibition rates of 93.33 and 86.44% for P. expansum and A. ochraceus, respectively. The micelial growth inhibition was 28.45 and 21.0%, respectively. The antagonism showed by the selected yeasts could be used as a promising alternative tool to reduce and control the postharvest fungal spoilage of the fruits. However, further studies should be carried out in order to better elucidate the role of innocuous characters in antagonistic microorganisms, as well as the purification and characterization of new killer toxins.
RÉSUMÉ
The aim of this work was to study the in vitro antibacterial activity possessed by killer yeast strains against bacteria contaminating alcoholic fermentation (Bacillus subtilis, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus fermentum and Leuconostoc mesenteroides), in cell X cell and cell X crude toxin preparations. The bacteria were not inhibited by any S. cerevisiae killer strains (5 out of 11). The inhibition caused by two crude toxin preparations (Trichosporon figueirae and Candida sp) against L. plantarum was surprisingly high but not in the same extent for B. subtilis, especially with three killer strains (Candida glabrata, Pichia anomala and Candida sp). L. mesenteroides and L. fermentum strains were neither inhibited in cell X cell nor crude toxin X cell tests. The results suggested that killer activity of yeasts might operate over bacteria and it could be used for the biocontrol of contaminating bacteria from alcoholic fermentation if additional tests on toxin application in fermentation shown to be successful. A wider panel of S. cerevisiae killer strains should be used to confirm that they were really unable to control the growth of these Gram-positive bacteria.
Este estudo mostrou a atividade antibacteriana in vitro de linhagens de leveduras killer contra bactérias contaminantes da fermentação alcoólica (Bacillus subtilis, Lactobacillus plantarum, Lactobacillus fermentum and Leuconostoc mesenteroides), em testes célula X célula e célula X toxina bruta. As bactérias não foram inibidas por linhagens killer de Saccharomyces cerevisiae (5 dentre 11). Os preparados brutos de toxina de duas leveduras (Trichosporon figueirae e Candida sp) causaram uma alta inibição no crescimento de L. plantarum, mas não na mesma extensão para B. subtilis, especialmente para três leveduras killer (Candida glabrata, Pichia anomala e Candida sp). Linhagens de L. mesenteroides e L. fermentum não foram inibidas em nenhum dos testes. Os resultados obtidos neste estudo sugerem a ação de toxinas killer de leveduras contra bactérias, a qual poderia ser utilizada para o biocontrole de bactérias contaminantes da fermentação alcoólica se testes posteriores de aplicação da toxina dentro das dornas de fermentação se mostrarem eficientes. Um número maior de linhagens killer de S. cerevisiae deveria ser utilizado para confirmar se elas realmente são incapazes de controlar o crescimento destas bactérias Gram-positivas.