Genetic variability in populations of Agave sisalana perrine detected by inter simple sequence repeats / Variabilidade genética em populações de Agave sisalana perrine detectada pela técnica inter simple sequence repeats

The aim this work was to evaluate the genetic variability within and among populations grown on sisal region of Bahia. The genetic diversity of 140 population of sisal was analyzed using ISSR molecular markers. Samples were collected in six counties in Bahia. Eighteen primers of ISSR were used, in which nine of them were effective in the amplification of DNA samples to yield 143 polymorphic loci. The average percentage of polymorphism found in the population was 64%. The average heterozygosis (He) and Shannon-Wiener index (I) were 0.180 and 0.279, respectively. 73% of the molecular variance can be due to intrapopulation differences. The populations were divided into two groups according to their geographical location, showing a structure of genetic variability in space. The GST 0.235, enough to avoid that there is a strong population differentiation. The genetic structure of sisal can be exploited for the creation of gene banks for conservation in situ and ex situ to obtain individuals of good commercial quality. There is genetic variability among sisal genotypes. ISSR molecular markers are efficient to analyze the divergence between sisal genotypes, assisting improvement work.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética existente entre e dentro das populações cultivadas na região sisaleira baiana. A diversidade genética de 140 indivíduos de sisal foi analisada por meio de marcadores moleculares ISSR. As amostras foram coletadas em seis municípios baianos. Utilizando-se dezoito primers de ISSR, dos quais, nove foram eficientes na amplificação do DNA das amostras analisadas, obtendo-se 143 locos polimórficos. O percentual médio de polimorfismo encontrado nas populações foi de 64%. A média de heterozigosidade (He) e do índice de Shannon-Wiener (I) foram de 0,180 e 0,279, respectivamente. 73% da variância molecular pode ser atribuída às diferenças intrapopulacionais. As populações foram divididas em dois grupos, de acordo com sua localização geográfica, evidenciando uma estruturação da variabilidade genética no espaço. O GST de 0,235 foi suficiente para evitar que exista uma forte diferenciação populacional. A estruturação genética do sisal pode ser explorada para a criação de bancos de germoplasma, visando à conservação in situ e ex situ, para a obtenção de indivíduos de boa qualidade comercial. Há presença de variabilidade genética entre os genótipos de sisal. Marcadores moleculares ISSR são eficientes para analisar a divergência entre os acessos de sisal, auxiliando trabalhos de melhoramento.

Caracterização molecular de cultivares de cana-de-açúcar utilizando marcadores ISSR / Molecular characterization of the sugarcane cultivars obtained by issr markers

A diversidade genética de catorze cultivares de cana-de-açúcar (Saccharum oficinarum) foi acessada por meio de marcadores moleculares ISSR. Objetivou-se caracterizar molecularmente as cultivares estudadas. Foram utilizados trinta e sete primers de ISSR, dos quais, oito foram eficientes na amplificação do DNA das amostras analisadas, sendo sete primers suficientes para distinguir todas as cultivares de cana-de-açúcar envolvidas nas análises. A faixa de amplicons variou de 300 a 2000 pb. As cultivares RB 92579 e RB 863129 apresentaram maiores coeficientes de similaridade (77 por cento) enquanto as cultivares RB 961 e RB 931611 formaram o grupo com menor similaridade (22 por cento). Os resultados indicam que os marcadores ISSR foram úteis na análise da diversidade genética e geração de padrões genéticos (fingerprint), em germoplasma de cana-de-açúcar. Marcadores ISSR cultivar-específico foram obtidos com o primer UBC 817 para as 14 cultivares testadas. Num próximo trabalho, mais primers ISSR serão utilizados para buscar mais polimorfismos dessas e de outras cultivares de cana-de-açúcar.

Genetic diversity of fourteen sugarcane cultivars was accessed by ISSR molecular markers. With the aim to characterizing and validating the efficiency of these markers in the fingerprint of studied cultivars, thirty seven ISSR primers were used, from which, eight were efficient for the DNA amplification. Seven primers were efficient to discriminate the fourteen studied sugarcane cultivars. The amplicons varied from 300 to 2000 bp. The cultivars RB 92579 and RB 863129 presented higher similarity coefficient (77 percent) while the cultivars RB 961 and RB 93611 formed the group with lower similarity (22 percent). The results suggested that ISSR markers were useful in the analysis of the genetic diversity and in the fingerprint in sugarcane germosplasm. In the next step more ISSR primers will be used in order to obtain more polymorphism from these varieties and to analyze more sugarcane cultivars.