Résumé
Background: Cytomegalovirus (CMV) infection is frequent in HIV adults. It is unknown usefulness of quantitative methods for diagnosing the CMV disease in Chilean patients. Aim: To determine the performance of antigenemia and real time polymerase chain reaction (rtPCR) in the diagnosis of CMV disease in Chilean HIV adults. Method: Detection of CMV by viral isolation (AVR), antigenemia and quantitative rtPCR in HIV adults. Results: The 102 adults with suspected CMV disease had lower LTCD4 count and higher HIV viral load than 77 patients without suspicion (p < 0.05). Antigenemia and PCR were positive in 47 (46.1%) and 37 (36.3%) adults with clinical suspicion and in 2 (2.6%) and 4 (5.2%) of 77 without suspicion. The sensitivity, specificity, positive and negative predictive value of antigenemia and RPCtr were 92%, 80%, 72% and 95% and 72%, 95%, 92% and 80%, respectively. The cutoff values were ≥ lcell (+) and ≥ 5.5 log10 copies/2 x 10(6) cells. CMV was isolated in 6/179 patients (3.4%), all symptomatic. Conclusión: Positivity of antigenemia and rtPCR are similar for diagnosing CMV disease in Chilean HIV adults. AVR is inappropriate as a gold standard for its low performance.
Introducción: La infección por citomegalovirus (CMV) es frecuente en adultos con virus de inmunodeficiencia humana (VIH). No se ha establecido la utilidad de los métodos cuantitativos para diagnosticar enfermedad por CMV en pacientes chilenos. Objetivo: Determinar la positividad de antigenemia y reacción de polimerasa en cadena en tiempo real (RPC-TR) en el diagnóstico de enfermedad por CMV en adultos chilenos con infección por VIH. Metodología: Se detectó CMV mediante aislamiento viral rápido (AVR), antigenemia y reacción de polimerasa en cadena en tiempo real (RPC-TR) cuantitativa en adultos infectados por VIH, con y sin sospecha de enfermedad por CMV. Resultados: El recuento de LT CD4 fue menor y mayor la carga de VIH en 102 sintomáticos respecto a 77 asintomáticos (p < 0,05). La antigenemia y la RPC-TR fueron positivas en 46 y 36% de los enfermos y en 3 y 5% de los asintomáticos respectivamente. La sensibilidad, especificidad, valor predictor positivo y negativo de la antigenemia y la RPC-TR fueron 92%, 80%, 72% y 95% y 72%, 95%, 92% y 80%, respectivamente. Los valores de corte fueron ≥ 1 núcleo (+) y ≥ 5,5 log10 copias/2 x 10(6) céls. Se aisló CMV en 3,4%, todos los sintomáticos. Conclusión: La antigenemia y la RPC-TR tienen una positividad similar para diagnosticar enfermedad por CMV en adultos chilenos con infección por VIH. El AVR es inapropiado como referencia por su baja positividad.
Sujets)
Adulte , Femelle , Humains , Mâle , Adulte d'âge moyen , Jeune adulte , Infections opportunistes liées au SIDA/diagnostic , Antigènes viraux/immunologie , Infections à cytomégalovirus/diagnostic , Cytomegalovirus/immunologie , ADN viral/sang , Infections opportunistes liées au SIDA/immunologie , Infections opportunistes liées au SIDA/virologie , Antigènes viraux/sang , Chili , Infections à cytomégalovirus/immunologie , Valeur prédictive des tests , Réaction de polymérisation en chaine en temps réel , Sensibilité et spécificité , Charge viraleRésumé
Introduction: Identification of patients with methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and vancomycin resistant Enterococci (VRE) is essential to limit the spread of these agents, through the use of isolation and contact precautions. Traditional microbiology has a long turn around time (3-5 days) extending the time of isolation, increasing complexity and cost of these patients. Objectives: To implement a new real time polymerase chain reaction (PCR) GeneXpert R for SAMR and VRE detection. To compare costs and turn around time of PCR versus traditional cultures. Methods: Two periods were compared, in the first, traditional microbiology (standard group) was used, and in the second, only PCR was used (PCR group). Results: MRSA or VRE were identified in 29.9% of patients in the PCR group and in 9.6% in the standard group. Turn around time was 15 ± 9 hours in PCR group and 53 ± 23 hours in standard group. PCR group had a net cost of USD 245 per patient and standard group USD 530 per patient. Discussion: PCR technique GeneXpert R for MRSA and VRE had a positive impact in the management of these patients and justifies its inclusion.
Introducción: La identificación de pacientes con Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) y Enterococcus resistente a vancomicina (ERV), permite limitar su diseminación usando aislamiento en cohorte y precauciones de contacto. Los resultados de los cultivos microbiológicos demoran 3 a 5 días, lo que retrasa el retiro de las precauciones y agrega costos económicos. Objetivos: Implementar técnica de reacción de polimerasa en cadena en tiempo real (RPC), GeneXpert R, para SARM y ERV y comparar tiempos de respuesta y costos en relación al uso de microbiología convencional. Material y Métodos: Se compararon dos períodos, uno en que se usó solo RPC (grupo RPC) y otro histórico, en el que se usó microbiología tradicional (grupo estándar) Resultados: Se confirmó SARM y/o ERV en 29,9% de los pacientes del grupo RPC, y en 9,6% del grupo estándar. Los tiempos de respuesta fueron 15 ± 9 h (grupo RCP) y 53 ± 23 h (grupo estándar). Los costos directos por paciente fueron de USD 245 en el grupo RPC y de USD 530 en el grupo estándar. Discusión: La RPC en tiempo real, GeneXpert, para SAMR y ERV tuvo un alto impacto alto clínico que justifica su incorporación.
Sujets)
Humains , Enterococcus/isolement et purification , Staphylococcus aureus résistant à la méticilline/isolement et purification , Transfert de patient , Réaction de polymérisation en chaine en temps réel/économie , Infections à staphylocoques/microbiologie , Résistance à la vancomycine , Enterococcus/effets des médicaments et des substances chimiques , Réaction de polymérisation en chaine en temps réel/méthodes , Infections à staphylocoques/diagnostic , Infections à staphylocoques/économie , Facteurs tempsRésumé
Background: Cytomegalovirus (CMV) infections are an important cause of morbidity and mortality in transplant recipient. To date, the antigenemia assay is the most used technique for diagnostic and management of CM V infections. However, quantification of CMV viral load by real time polymerase chain reaction (RT-PCR) has becoming the method of choice to detect CMV in a rapid, sensitive and specific manner. Objective: To compare antigenemia and RT-PCR assays in the detection of CMV in blood sample from solid organ and bone marrow transplant (BMT) in children attended at the Dr. Luis Calvo Mackenna Hospital. Methods: In a prospective study, we detect the presence of CMV in blood sample by RT-PCR and antigenemia assays. Results: We analyzed 219 blood samples from 68 children subjected to kidney, liver and BMT. Out of 219 samples analyzed, 147 were negative and 33 were positive for CMV by both techniques. Thirty-seven samples were positive only by RT-PCR and 2 by antigenemia. Considering the antigenemia as a reference, RT-PCR shows 94 percent, 80 percent, 34 percent and 99 percent sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, respectively. The kappa coefficient between both techniques was 0.528. Conclusion: Quantitative determination of CMV viral load by RT-PCR is a sensitive technique with excellent negative predictive valué compared to antigenemia. Our results support the use of RT-PCR as a technique that might facilítate the diagnostic and treatment of active CMV infection in pediatric transplants.
Antecedentes: Las infecciones por citomegalovirus (CMV) corresponden a una importante causa de morbilidad y mortalidad en pacientes sometidos a trasplantes. Hasta la fecha, la detección de CMV en células infectadas en sangre periférica mediante la técnica de inmunofluorescencia (antigenemia) es la más utilizada para el diagnóstico y monitorización de la infección por este agente. Sin embargo, en el último tiempo la cuantificación de la carga de ácido nucleico (ADN) de CMV en sangre mediante la técnica de reacción de polimerasa en cadena en tiempo real (RPC-TR) ha permitido la detección de CMV de forma más rápida, sensible y específica. Objetivos: Comparar las técnicas de antigenemia y RPC-TR para la detección de CMV en sangre en niños sometidos a trasplante de órganos sólidos y trasplante de precursores hematopoyéticos (TPH) en el Hospital Dr. Luis Calvo Mackenna. Metodología: En un estudio prospectivo de seguimiento preventivo de reactivación se detectó la presencia de CMV en muestras de sangre utilizando las técnicas de RPC-TR y antigenemia. Resultados: Se analizaron 219 muestras de sangre, correspondiente a 68 niños sometidos a trasplante de hígado, riñon y TPH. De las muestras analizadas, 147 fueron negativas y 33 positivas para CMV utilizando ambas técnicas. Treinta y siete muestras resultaron ser positivas sólo por RPC-TR y dos sólo por antigenemia. Tomando en cuenta la antigenemia como referencia, la RPC-TR mostró una sensibilidad, especificidad, valor predictor positivo y negativo de 94 por ciento, 80 por ciento, 34 por ciento y 99 por ciento, respectivamente. El índice de concordancia entre ambas técnicas tuvo un valor de kappa = 0,528. Conclusión: La determinación cuantitativa de ADN de CMV por RPC-TR es una técnica sensible, con un gran valor predictor negativo comparada con la antigenemia. Los resultados obtenidos en este trabajo apoyan el uso de RPC-TR para el diagnóstico y tratamiento oportuno de las infecciones activas por CMV en niños sometidos a trasplantes.