Nuevos nombres para antiguas especies fúngicas de importancia médica

En las últimas décadas ha existido un reordenamiento de los géneros y especies fúngicas de importancia médica debido a los constantes avances en la biología molecular. Desde la declaración de Amsterdam en el año 2011, se han ido abandonando la taxonomía de dos nombres (sexual y asexual) por cada especie, además se ha priorizado al primer nombre descrito. Dado que se recomienda comenzar a utilizar los nombres actualizados de los géneros y especies de levaduras y hongos filamentosos, se propone una transición utilizando el nombre actual, y el antiguo entre paréntesis escrito con minúscula, con el fin de evitar confusiones en los médicos clínicos ya acostumbrados a la nomenclatura previa.

In recent decades there has been a rearrangement of fungal genera and species of medical importance due to constant advances in molecular biology. Since the Amsterdam declaration in 2011, the taxonomy of two names (sexual and asexual) for each species has been abandoned, and the first name described has also been prioritized. Since it is recommended to start using the updated names of the genera and species of yeasts and filamentous fungi, a transition is proposed using the current name, and the old one in parentheses written with lower case, in order to avoid confusion in clinician physicians already accustomed to the previous nomenclature.

Experiencia en el uso de los protocolos Biomed-2 para el estudio de reordenamientos de TCR e inmunoglobulinas en proliferaciones linfoides en el Instituto Nacional de Cancerología, Colombia / Experience with the BIOMED-2 standardized polymerase chain reaction protocol for immunoglobulin and T- cell receptor clonality analysis in the Instituto Nacional de Cancerología, Colombia

Introducción. El consorcio europeo BIOMED-2 se creó para determinar si una población linfoide de difícil clasificación patológica es clonal. En Colombia, la implementación de estas pruebas comenzó en el 2015 en el Instituto Nacional de Cancerología E.S.E. (Bogotá). Objetivos. Determinar el comportamiento de las pruebas de reordenamiento clonal o clonalidad linfoide. y determinar las dificultades de su uso en nuestro medio verificando su adaptación local y los resultados en una serie retrospectiva de casos y consecutiva de proliferaciones linfoides sometidas a los protocolos BIOMED-2. Materiales y métodos. A partir de las historias clínicas, se recolectaron los datos clínicos e histológicos y los resultados de los análisis de los reordenamientos en todos los casos de proliferaciones linfoides sometidas a los protocolos BIOMED-2, entre febrero de 2015 y mayo de 2019. Resultados. Se hallaron 132 casos, de los cuales 47 se clasificaron mediante los protocolos de Biomed-2 como hiperplasias linfoides reactivas, 62 como linfomas T, 19 como linfomas B y 3 como neoplasias linfoides de linaje no establecido. Solo en un caso falló la extracción de ADN. Según estos resultados, la mayor dificultad diagnóstica para el patólogo fue el análisis de los infiltrados linfoides T, la mayoría (44) de los cuales correspondía a lesiones cutáneas. Conclusiones. Las pruebas de clonalidad pueden usarse en tejidos de diversa calidad en nuestro medio como ayuda en el diagnóstico de proliferaciones linfoides de difícil clasificación. Es importante hacerlas e interpretarlas de manera multidisciplinaria y considerar cada caso por separado.

Introduction: The European BIOMED-2 consortium was created to evaluate clonality in lymphoproliferations that are difficult to diagnose. In Colombia, the implementation of these tests began in 2015 at the Instituto Nacional de Cancerología E.S.E., Bogotá. Objectives: To determine the behavior of the rearrangement tests for lymphoid clonality and the difficulties of its implementation in our field through a series of retrospective and consecutive cases of lymphoid proliferation subjected to the BIOMED-2 protocols. Materials and methods: Clinical and histological data and the results of the rearrangement analysis of all cases of lymphoid proliferation subjected to the BIOMED-2 protocols between February 2015 and May 2019 were collected from clinical histories. Results: We recovered 132 samples from which 47 corresponded to reactive lymphoid hyperplasias, 62 to T lymphomas, 19 to B lymphomas, and three to lymphoid neoplasms of unestablished lineage. Only in one case did DNA extraction fail. According to these results, the greatest diagnostic difficulty for the pathologist was the analysis of T lymphoid infiltrates, most of which (44) were skin lesions. Conclusions: Clonality tests can be used in tissues of different quality to help in the diagnosis of lymphoid proliferations that are difficult to classify. It is important to implement and interpret them in an interdisciplinary way considering each case separately.

Enfermedad residual medible mediante reordenamientos de inmunoglobulinas y receptores de linfocitos-T / Measurable residual disease by rearrangements of immunoglobulins and T-lymphocyte receptors

Resumen Las leucemias agudas constituyen la neoplasia más frecuente en pacientes pediátricos. Actualmente, el 80% de los niños con leucemia linfoblástica aguda (LLA) logran curarse con quimioterapia con vencional pero el 20% de los mismos presentarán una reaparición de la enfermedad. La enfermedad residual medible (ERM) ha sido descripta como un importante factor pronóstico, que permite evaluar la respuesta de los pacientes al tratamiento. Una de las técnicas más sensibles par a estudiar ERM es la cuantificación de reordena mientos génicos de inmunoglobulinas (Ig) y receptores de linfocitos-T (TCR). Los objetivos del presente trabajo fueron describir los reordenamientos detectados de Ig/TCR, evaluar el efecto de la ERM en la supervivencia de niños con LLA y comparar la ERM por Ig/TCR con la cuantificada mediante citometría de flujo multiparamétrica (CFM). Del total de 455 pacientes estudiados, en el 96% fue posible caracterizar al menos un reordenamiento de Ig/TCR. El total de reordenamientos clonales detectados fue de 1550. La ERM pudo ser estudiada en forma exitosa en el 89% de los casos. El valor de ERM positiva combinada al día 33 y 78 de tratamiento, permitió identificar pacientes de alto riesgo, entre los previamente estratificados por la ERM mediante CFM al día 15. La comparación entre la determinación de ERM mediante reordenamientos Ig/TCR y CFM mostró una excelente correlación. El presente trabajo constituye un estudio de ERM mediante Ig/TCR realizado en un número muy significativo de pacientes diagnosticados en forma consecutiva, tratados en el marco de un protocolo homogéneo y con excelente seguimiento clínico.

Abstract Acute leukemias are the most common neoplasm in pediatric patients. Currently, 80% of children with diagnosis of acute lymphoblastic leukemia (ALL) are cured with conventional chemotherapy, but 20% of them will have a recurrence of the disease. Measurable Residual Disease (MRD) has been described as an important prognostic factor that allows evaluating the response of patients to treatment. One of the most sensitive techniques to study MRD is the quantification of immunoglobulins (Ig) and T-lymphocyte receptors (TCR) genes rearrangements. The aims of this study were to describe the detected Ig/TCR rearrangements, to evaluate the prognostic impact of MRD in our population of children with ALL and to compare the MRD values by Ig/TCR with those obtained by multiparametric flow cytometry (MFC). A total of 455 patients were studied. In 96% of the cases, it was possible to characterize at least one Ig/TCR rearrangement. The total number of Ig/TCR rear rangements detected was 1550. MRD was successfully applied in 89% of the cases. The combined positive MRD values at day 33 and 78 of treatment allow the identification of high-risk patients in cases previously stratified by MRD using flow cytometry at day 15. The comparison between MRD determination by Ig/TCR rearrangements and FC showed excellent correlation. The present work constitutes a study of MRD by Ig/TCR carried out in a very significant number of patients consecutively diagnosed, treated within a homogeneous protocol and with excellent clinical follow-up.

Absence of RET/PTC1 rearrangement in a sample of Colombian individuals with papillary thyroid carcinoma / Ausencia del rearreglo RET/PTC1 en una muestra de sujetos colombianos con carcinoma papilar de tiroides

Abstract Introduction: Papillary thyroid carcinoma is the most common endocrine neoplasm; therefore, markers with possible prognostic utility have been evaluated. Objective: To analyze the presence of RET/PTC1 rearrangement, lymphocytic thyroiditis and associated clinical features in patients with papillary thyroid cancer treated at the Hospital de San José in Bogotá, Colombia. Materials and methods: Clinical records of patients with complete thyroidectomy and diagnosis of papillary cancer were retrospectively identified. RNA was extracted from tumor tissue, and cDNA was obtained using inverse transcriptase to detect the rearrangement of the RET/PTC1 gene by means of qPCR. Results: 55 patients with papillary thyroid cancer were selected; 93% were females, and the mean age was 45.8 years. The most frequent histological variant was classic (49%). A relationship was found between lymphocytic thyroiditis and the number of positive nodes in segments other than central draining, as well as thyroiditis and antithyroid antibody value. No RET/PTC1 rearrangement expression was found. Conclusions: A relationship between lymphocytic thyroiditis and the number of positive nodes in segments other than central draining was found. Other molecular markers should be searched to differentiate the prognosis of these patients.

Resumen Introducción. El carcinoma papilar de tiroides es la neoplasia endocrina más común, por lo que se han evaluado marcadores con posible utilidad pronóstica. Objetivo. Analizar la presencia del rearreglo del RET/PTC1, tiroiditis linfocítica y características clínicas asociadas en pacientes con cáncer papilar de tiroides en el Hospital de San José de Bogotá D.C., Colombia. Materiales y métodos. Los casos con diagnóstico de cáncer papilar y tiroidectomía completa fueron seleccionados utilizando el registro de historias clínicas; el ARN se extrajo a partir del tejido tumoral y el ADNc se obtuvo utilizando una transcriptasa inversa para luego detectar el rearreglo del gen RET/PTC1 por medio de qPCR. Resultados. Se seleccionaron 55 pacientes con cáncer papilar de tiroides; 93% correspondió a género femenino, la edad promedio fue de 45.8 años y la variante histológica más frecuente fue la clásica (49%). Se evidenció una relación entre tiroiditis linfocítica y la cantidad de ganglios positivos en segmentos distintos al vaciamiento central, así como la tiroiditis y el valor de los anticuerpos antitiroideos. No se identificó la expresión del rearreglo RET/PTC1 en las muestras analizadas. Conclusiones. Se muestra una relación entre tiroiditis linfocítica y la cantidad de ganglios positivos en segmentos distintos al vaciamiento central. Se debe continuar la búsqueda de otros marcadores moleculares que permitan diferenciar el pronóstico en estos pacientes.

Presencia de duplicación 2p25.3 y síndrome de microdeleción 2q37.3 en un mismo individuo / Presence of 2p25.3 Duplication and 2q37.3 Microdeletion Syndrome in the Same Individual / Presença de duplicação 2p25.3 e síndrome da microdeleção 2p25.3 no mesmo indivíduo

Resumen: El estudio del cromosoma 2 en los seres humanos ha permitido reconocer que su alteración, basada en una localización específica, puede conducir a diversas enfermedades asociadas. Mediante la identificación fenotípica, sustentada en el estudio molecular de hibridación genómica comparativa y un estudio bioinformático posterior, se detectó la presencia de una duplicación patogénica en la región cromosómica 2p25.3p24.3, relacionada con la afección de 36 genes. Adicionalmente, se identificó una deleción patogénica en la citobanda 2q37.3, relacionada con la afección de 36 genes. El análisis bioinformático demostró interacciones entre genes que explican características sintomatológicas. Esta es la primera vez que se presentan estas dos variantes en un mismo individuo. Ambas alteraciones se han asociado con retraso psicomotor moderado, autismo, neurohipófisis ectópica, aracnodactilia, cardiopatía congénita y alteraciones cardiovasculares. Se ha propuesto que la mutación HDAC4 es la causante de la mayoría de las características del síndrome de microdeleción 2q37. El fenotipo clínico heterogéneo es el resultado del reordenamiento cromosómico encontrado, lo cual permite describir, interpretar y dar un tratamiento oportuno y dirigido a la paciente y la respectiva conserjería genética familiar. Finalmente, esta es la primera vez que se reporta este tipo específico de reordenamiento cromosómico.

Abstract: The study of chromosome 2 in humans has allowed recognizing that its alteration, based on a specific location, can lead to various associated diseases. Through the phenotypic identification, supported by comparative genomic hybridization and subsequent bioinformatic analysis, the presence of a pathogenic duplication was detected in the chromosomal region 2p25.3p24.3 affecting 36 genes. Additionally, a pathogenic deletion was identified in cytoband 2q37.3 affecting 36 genes. The bioinformatic analysis showed interactions among genes that explain symptomatic characteristics. This is the first time that these two variants are present in the same individual. Both disorders have been associated with moderate psychomotor retardation, autism, ectopic neurohypophysis, arachnodactyly, congenital heart disease, and cardiovascular disorders. The hdac4 mutation has been suggested to cause most of the features of 2q37 microdeletion syndrome. The heterogeneous clinical phenotype derives from the chromosomal rearrangement found, which allows describing, interpreting, and providing the patient with timely targeted treatment and the respective family genetic counseling. Finally, this specific type of chromosomal rearrangement has been reported for the first time.

Resumo: O estudo do cromossomo 2 em seres humanos nos permitiu reconhecer que sua alteração, com base em uma localização específica, pode levar a diversas doenças associadas. Por meio da identificação fenotípica, apoiada no estudo molecular da hibridação genômica comparativa e em um estudo bioinformático posterior, foi detectada a presença de uma duplicação patogénica na região cromossômica 2p25.3p24.3, relacionada a 36 genes afetados. Além disso, uma deleção patogénica foi identificada na citobanda 2q37.3, relacionada a 36 genes afetados. A análise bioinformática mostrou interações entre genes que explicam características sintomáticas. É a primeira vez que essas duas variantes são apresentadas no mesmo indivíduo. Ambos os distúrbios tém sido associados a retardo psicomotor moderado, autismo, neuro-hipófise ectópica, aracnodactilia, doenças cardíacas congénitas e distúrbios cardiovasculares. Propõe-se que a mutação hdac4 é a causa da maioria das características da síndrome de microdeleção 2q37. O fenótipo clínico heterogéneo é o resultado do rearranjo cromossômico encontrado, que permite descrever, interpretar e oferecer um tratamento oportuno direcionado ao paciente e ao respectivo aconselhamento genético familiar. Finalmente, também é a primeira vez que esse tipo específico de rearranjo cromossômico é relatado.

Determinación de la clonalidad en tejidos humanos / Clonality evaluation in human tissues / Determinação da clonagem em tecidos humanos

Las proliferaciones malignas suelen ser clonales. La mayoría de las veces el potencial de una lesión se establece por medio del análisis clínico y el estudio anatomopatológico, pero algunos casos son de difícil diagnóstico. Por otra parte, existen situaciones en las que se producen clonas dominantes cuyo análisis es importante, tal como ocurre en enfermedades autoinmunes e inmunodeficiencias. Este artículo presenta de manera comprensible las técnicas principales para el estudio de la clonalidad, a saber: la evaluación de los reordenamientos génicos del receptor de antígeno y la evaluación del gen del receptor de antígeno humano.

Malignant proliferations are usually clonal. While most times the biological potential can be established through routine pathologic and clinical examinations, some cases are difficult to classify. Moreover, in some situations there are dominant clones whose analysis is important, such as in autoimmune diseases and immunodeficiency. This paper presents in an understandable way the main techniques for the study of clonality, namely: evaluation of gene rearrangements of antigen receptor, and evaluation of human antigen receptor gene.

As proliferações malignas costumam ser clonadas. A maioria das vezes o potencial biológico de uma lesão se estabelece por meio da análise clínica e o estudo anatomopatológico, mas alguns casos são de difícil diagnóstico. Por outra parte, existem situações nas que se produzem clones dominantes cujo análise é importante, tal como ocorre em doenças autoimunes e imunodeficiências. Este artigo apresenta de maneira compreensível as técnicas principais para o estudo da clonagem, a saber: a avaliação dos reordenamentos genéticos do receptor de antígeno e a avaliação do gene do receptor de antígeno humano.

Immunoglobulin heavy chain gene rearrangement in non B-cell haematological malignancies / Reordenamiento del gen de la cadena pesada de inmunoglobulina en las neoplasias hematológicas de linfocitos no B

PURPOSE: Clonality detection through amplifying immunoglobulin heavy chain (IGH) gene rearrangements by polymerase chain reaction (PCR) is a useful tool in diagnosis of various B-lymphoid malignancies. Immunoglobulin heavy chain gene rearrangement can be an optimal target for clonality detection in B-lymphoid malignancies. In the present study, we evaluated the presence of IGH gene rearrangement in non B-cell haemato-oncologypatients including T-cell acute lymphoblastic leukaemia (T-ALL), acute myeloblastic leukaemia (AML) and biphenotypic leukaemia. METHODS: We studied 18 cases of haematological malignancies which comprised five patients with TALL, 12 patients with AML and one with biphenotypic leukaemia. RESULTS: We found that the incidence of IGH gene rearrangement in T-ALL and AML were three (60%) and two (16.7%), respectively. The patient with biphenotypic leukaemia was negative for IGH gene rearrangement. CONCLUSION: Immunoglobulin gene rearrangement, which occurs in almost all haematological malignancies of B-cell lineage, also presents in a very small proportion of T-cell or myeloid malignancies.

OBJETIVO: La detección de la clonalidad mediante amplificación de los reordenamientos del gen de la cadena pesada (IGH) de inmunoglobulina por reacción en cadena de la polimerasa (RCP) es una herramienta útil en el diagnóstico de varios tumores malignos linfoides de células B. El reordenamiento del gen de la cadena pesada de inmunoglobulina puede ser un objetivo óptimo de la detección de la clonalidad en tumores malignos linfoides de células B. En el presente estudio, se evaluó la presencia de reordenamiento del gen IGH en pacientes de hemato-oncología de células no B, incluyendo la leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T), leucemia mieloblástica aguda (LMA), y leucemia bifenotípica. MÉTODOS: Se estudiaron 18 casos de neoplasias malignas hematológicas que abarcaron cinco pacientes con (LLA-T), 12pacientes con AML y uno con leucemia bifenotípica. CONCLUSIÓN: Reordenamiento del gen de la inmunoglobulina que ocurre en casi todas las neoplasias malignas hematológicas del linaje de las células B, también se presenta en una proporción muy pequeña de células T o las neoplasias mieloides.

Dengue / Dengue

El dengue es hoy la más importante arbovirosis, por su gran carga de enfermedad e implicaciones sociales. El mosquito Aedes aegypti, su principal transmisor convive con el hombre en su hábitat domestico y peridoméstico. El cuadro clínico es de fiebre, cefalea, dolor retroocular, dolores corporales, exantema y mucho decaimiento. El enfermo puede empeorar súbitamente y presentar choque por dengue, con grandes hemorragias digestivas y elevada mortalidad. No existe droga antiviral, pero la muerte puede evitarse mediante la infusión intravenosa precoz de soluciones cristaloides. Algunos candidatos vacunales están actualmente en ensayo clínico. La prevención depende del control del vector, mediante educación sanitaria y reordenamiento ambiental.

Reordenamiento del gen MLL en pacientes pediátricos con leucemia aguda / MLL gene rearrangement in pediatric patients with acute leukemia

Los reordenamientos del gen MLL están presentes en la mayoría de los casos de leucemia aguda (LA) infantil y están asociados con variables biológicas específicas y con pobres resultados clínicos. Con el objetivo de analizar su incidencia y relevancia pronóstica realizamos un estudio molecular mediante la técnica de Southern blot, en 29 niños de nuestra institución con LA, los cuales se encontraban al inicio o en recaída de la enfermedad. Para el estudio empleamos la sonda FA4, que es un inserto genómico del gen MLL. Pudimos detectar reordenamiento genético en 3 pacientes menores de 1 año que tenían una LMA de tipo morfológico M5, con altos conteos leucocitarios y con visceromegalia. Estos 3 pacientes fallecieron sin alcanzar la remisión, lo que confirmó el valor del reordenamiento del gen MLL como indicador de leucemia de alto riesgo, y por tanto, como una herramienta apropiada para la administración oportuna de terapia adaptada al riesgo.

MLL gene rearrangements are present in most of the cases with infant acute leukemia (AL) and are associated with specific biological variables and with poor clinical outcomes. In order to analyze its incidence and prognostic relevance, a molecular study was conducted in 29 children with AL from our institution by the Southern blot technique. These patients were at the onset of the disease or into a relapse. The FA4 probe that is a genomic insertion of the MLL gene was used in this study. We could detect genetic rearrangement in 3 patients under 1 that had a morphological type M5 AML with high white cell counts and with visceromegaly. These 3 patients died without attaining remission, which confirmed the value of the MLL gene rearrangement as an indicator of high risk leukemia and, therefore, as an appropiate tool for the timely administration of therapy adapted to risk.

Estudio molecular del gen MLL en 30 pacientes con leucemias agudas / Molecular study of MLL gen in 30 patients with acute leukemias

Los reordenamientos del gen MLL en la banda cromosómica 11q23 son frecuentes en leucemias agudas (LA) en niños y en las LA secundarias desarrolladas después de la terapia con inhibidores de la enzima topoisomerasa II. En menor medida también se aprecia en adultos con LA. La presencia de estos reordenamientos se considera un indicador de mal pronóstico asociado con resultados clínicos desfavorables, por ello es muy importante realizar su determinación en las LA. En este trabajo mostramos los resultados preliminares de la introducción del estudio del gen MLL en nuestro país mediante la técnica de Southern. Analizamos ADN de 30 pacientes con LA, incluidos niños y adultos, que en el momento del estudio se encontraban al debut o en recaída. El estudio molecular se realizó con la sonda FA4, que es un inserto genómico del gen MLL. Sólo uno de los 30 pacientes mostró bandas de reordenamiento con 2 enzimas de restricción diferentes, el resto mostró el gen MLL en configuración germinal. Es interesante destacar que el paciente con el reordenamiento era un niño con leucemia mieloblástica aguda subtipo M5b, lo cual concuerda con la literatura, donde se describe que estos reordenamientos están estrechamente correlacionados con los subtipos mielomonocítico (M4) y monocítico (M5) de leucemia mieloide aguda (LMA).

Rearrangements of MLL gen in llq23 chromosomal band are frequents in childhood type of acute leukemia (AL) and in secondary AL, developed after therapy with II topoisomerase enzyme. To a lesser extent also is seen in adults with AL. Presence of theses rearrangements is considered to be a worse prognosis indicator, associated with unfavourable clinical results, that is why it is very important to carry our its assessment in AL. In this paper authors present preliminary results from introduction of study on MLL gen in our country through Southern technique. DNA from 30 patients was analized, including children and adults, that at the very moment when study was performed, they were in the onset or in relapse. Molecular study was carried out using FA4 probe, which is a genomic insertion of MLL gen. Only one out of 30 patients, presented rearrangement band with 2 distinct restriction enzymes, remainder showed MLL gen in germinal form. It is interesting to underline that patient with rearrangement was a child presenting subtype M5b acute myeloblastic leukemia, which agree with literature showing that these rearrangements are closely correlated to subtype myelomonocytic (M4) and monocytic (M5) of acute myeloid leukemia (AML).