Discordancia entre pruebas de susceptibilidad genotípicas y fenotípicas para tuberculosis en Cali, Colombia: un reto en la práctica clínica / Discordance between genotypic and phenotypic susceptibility tests for tuberculosis in Cali, Colombia: a challenge in the clinical practice

INTRODUCCIÓN: La detección de patrones de resistencia de Mycobacterium tuberculosis se basa en pruebas de susceptibilidad fenotípicas y genotípicas. Los resultados discordantes entre ellas son un desafío clínico para el manejo de pacientes con tuberculosis resistente a fármacos. OBJETIVO: Evaluar la concordancia entre pruebas fenotípicas y moleculares en pacientes con tuberculosis resistente a fármacos atendidos en una institución de Cali, Colombia. MATERIALES Y MÉTODOS: Se realizó un estudio transversal en el que se obtuvo el perfil de sensibilidad fenotípico de cultivos de micobacterias y la susceptibilidad genotípica con las pruebas moleculares Xpert-MTB/ RIF® o Genotype-MDRTBplus ®. Se evaluó el porcentaje de resistencia y porcentaje de acuerdo entre los resultados de las pruebas fenotípicas y genotípicas. Se estimó un coeficiente de kappa de Cohen (κ) para cada tipo de resistencia según la prueba utilizada. RESULTADOS: Se incluyeron 30 casos con resultados de pruebas genotípicas y fenotípicas. Las pruebas fenotípicas detectaron resistencia a fármacos de primera línea en 29/30 casos, mientras que las moleculares detectaron la resistencia en todos los casos evaluados. El porcentaje de resistencia a rifampicina detectado entre la prueba fenotípica y Genotype-MDRTBplus ® &e 61,5% (acuerdo global 41,1%, κ = 0,40, p = 0,96), mientras que el porcentaje de resistencia detectado con Xpert-MTB/RIF® fue 100% (acuerdo global 81,82%, κ: 0,00, p < 0,001) para este mismo medicamento. El porcentaje de resistencia a isoniacida detectado entre la prueba fenotípica y Genotype-MDRTBplus ® fue 94,4% (acuerdo global 89,47%, κ: -0,055 p = 0,59). CONCLUSIONES: La discordancia entre los resultados de las pruebas genotípicas y fenotípicas es posible, por lo que es importante usar e interpretar ambos tipos de pruebas de manera complementaria en el diagnóstico de la resistencia a fármacos de primera línea en la infección por M. tuberculosis.

BACKGROUND: The detection of Mycobacterium tuberculosis resistance patterns is based on phenotypic and genotypic susceptibility tests. The discordant results between them are a clinical challenge for the management of patients with drug-resistant tuberculosis. Aim: To evaluate the concordance between phenotypic and molecular tests in patients with drug-resistant tuberculosis treated in an institution in Cali, Colombia. METHODS: A cross-sectional study was conducted. A phenotypic sensitivity profile was obtained from mycobacterial cultures. The genotypic susceptibility was obtained with Xpert-MTB/ RIF® or Genotype-MDRTBplus ®. The percentage of resistance and percentage of agreement between the results of the phenotypic and genotypic tests were evaluated. A Cohen's kappa coefficient (κ) was estimated for each type of resistance according to the test used. RESULTS: A total of 30 cases with both genotypic and phenotypic testing were included. The phenotypic tests detected resistance to first-line drugs in 29/30 cases, while the molecular tests detected resistance in all the cases evaluated. The percentage of resistance detected between Genotype-MDRTBplus® and the phenotypic test for rifampicin was 61.5% (overall agreement 41.1%, κ = 0.40, p = 0.96), while the percentage of resistance detected with XpertMTB/RIF® was 100% (overall agreement 81.82%, κ: 0.00, p < 0.001) for this same drug. Resistance to isoniazid detected by both types of tests was 94.4% (overall agreement 89.47%, κ: -0.055 p = 0.59). CONCLUSIONS: Discordance between the results of genotypic and phenotypic tests is possible, so it is important to use and interpret both types of tests in a complementary way in the diagnosis of resistance to first-line drugs in M. tuberculosis infection.

Sensibilidad de Escherichia coli frente a fosfomicina, en infecciones urinarias provenientes de personas con discapacidad que acudieron a la Secretaría Nacional por los Derechos Humanos de las Personas con Discapacidad-SENADIS / Susceptibility of Escherichia coli against fosfomycin in urinary tract infections from people with disabilities who attended SENADIS

INTRODUCCIÓN: Fosfomicina es un antimicrobiano de amplio espectro utilizado para el tratamiento de las infecciones urinarias bajas; tiene actividad sobre bacilos gramnegativos y cocos grampositivos, así también sobre microorganismos multirresistentes, además de ofrecer una alternativa terapéutica de administración vía oral en dosis única, alcanzando una efectividad de 90%. OBJETIVO: Conocer la sensibilidad in vitro de Escherichia coli frente a fosfomicina, en infecciones urinarias provenientes de personas con discapacidad. MATERIAL Y MÉTODO: Estudio observacional, descriptivo, prospectivo, en el que se incluyó un total de 273 muestras de urocultivo, de pacientes de ambos sexos que acudieron a SENADIS, y que en el momento de la consulta presentaban síntomas de infección del tracto urinario, por lo que se les solicitó el análisis de orina simple y cultivo. De las muestras procesadas en el laboratorio de microbiología, que fueron positivas con crecimiento bacteriano significativo, se procedió a la identificación bacteriana y a la realización del antibiograma según las recomendaciones de CLSI. RESULTADOS: De estas 273 muestras, 91 fueron positivas para diferentes uropatógenos, 62/91 (68%) resultaron ser E. coli. De estas cepas de E. coli, 59/62 (95%) mostraron sensibilidad in vitro a fosfomicina. Comentario: Aunque el número de muestra obtenido es pequeño y no extrapolable ampliamente, pretendemos extender el trabajo por un tiempo más para compararlo más adelante. CONCLUSIONES: Se observa que fosfomicina presenta buena actividad in vitro frente a cepas de E. coli aisladas de urocultivo, pudiendo representar una buena alternativa terapéutica a ser utilizada en la población en estudio.

BACKGROUND: Fosfomycin is a broad-spectrum antibiotic used for the treatment of lower urinary tract infections, it is active against gramnegative bacilli and grampositive cocci, as well as against multi-resistant microorganism, in addition to offering a therapeutic alternative for oral administration in a single dose, reaching an effectiveness of 90%. AIM: To study the susceptibility of Escherichia coli to fosfomycin in urinary tract infections, of isolated strains obtained from patients with disabilities. METHODS: It is an observational, descriptive, prospective study in which a total of 273 urine culture samples of patients of both sexes who attended the SENADIS were included, and who at the time of the consultation presented symptoms of urinary tract infection. The urine positive cultures with significant bacterial growth were performed to determine its bacterial identification and the antibiogram according to CLSI recommendations. RESULTS: Of these 273 samples, 91 samples were positive for different uropathogens, with 62/91 (68%) being positive for E. coli. Of these E. coli strains, 59/62 (95%) showed in vitro susceptibility to fosfomycin. Comment: Although the number of samples obtained is small and it cannot be extrapolated, we pretend to extend the work for a while longer to be able to compare it later. CONCLUSION: Fosfomycin has good activity in vitro against E. coli isolated from urine culture in our institution, representing a good alternative to be used in our study population

Streptococcus agalactiae y susceptibilidad en gestantes de un hospital en Palmira, Valle / Streptococcus agalactiae and Susceptibility in Pregnant Women at a Hospital in Palmira, Valle / Streptococcus agalactiae e susceptibilidade em gestantes de um hospital em Palmira, no departamento do Valle

Resumen: Streptococcus agalactiae o estreptococo del grupo B es un coco grampositivo, saprofito, colonizador del tracto gastrointestinal y genitourinario que causa infecciones fundamentalmente en recién nacidos, embarazadas y en raras ocasiones en adultos con enfermedades de base. La portación de este microorganismo puede ser causa importante de corioamnionitis y endometritis posparto. Se describirá la susceptibilidad de S. agalactiae en gestantes que asistieron al servicio de obstetricia en un hospital nivel II de Palmira entre el primero de enero de 2018 y el 31 de diciembre de 2019, mediante un estudio descriptivo retrospectivo. Se obtuvieron 58 cultivos rectovaginales positivos para S. agalactiae mediante hisopado vaginal y rectal, datos suministrados por el laboratorio del Hospital Raúl Orejuela Bueno. La prueba de susceptibilidad antimicrobiana se realizó utilizando el método automatizado VITEK-2. En los 58 cultivos rectovaginales positivos para Streptococcus agalactiae se observó una sensibilidad del 100 % a la ampicilina, levofloxacino y moxifloxacino; 98 % a la quinupristina, linezolid y vancomicina sensible.

Abstract: Streptococcus agalactiae, or Group B streptococcus, is a gram-positive coccus, saprophyte, and colonizer of the gastrointestinal and genitourinary tracts, causing infections primarily in newborns, pregnant women, and rarely in adults with underlying diseases. The carriage of this microorganism can be a significant cause of chorioamnionitis and postpartum endometritis. This study describes the susceptibility of S. agalactiae in pregnant women attending the obstetrics service at a level II hospital in Palmira between January 1, 2018, and December 31, 2019, through a retrospective descriptive study. A total of 58 rectovaginal cultures positive for S. agalactiae were obtained through vaginal and rectal swabs, data provided by the laboratory of the Raúl Orejuela Bueno Hospital. Antimicrobial susceptibility testing was performed using the automated VITEK-2 method. In the 58 rectovaginal cultures positive for Streptococcus agalactiae, a sensitivity of 100% was observed for ampicillin, levofloxacin, and moxifloxacin; 98% for quinupristin, linezolid, and vancomycin.

Resumo: Streptococcus agalactiae, também conhecido como estreptococo do grupo B, é uma bactéria gram-positiva, saprófita, colonizadora do trato gastrointestinal e geniturinário, causando infecções principalmente em recém-nascidos, gestantes e, raramente, em adultos com doenças subjacentes. A presença desse microrganismo pode ser uma causa significativa de corioamnionite e endometrite pós-parto. Este estudo descreverá a susceptibilidade do S. agalactiae em gestantes que estiveram no serviço de obstetrícia em um hospital de nível II em Palmira, no período de 1 de janeiro de 2018 a 31 de dezembro de 2019, através de um estudo descritivo retrospectivo. Foram obtidos 58 cultivos retovaginais positivos para S. agalactiae por meio de amostras com cotonetes vaginal e retal, dados fornecidos pelo laboratório do Hospital Raúl Orejuela Bueno. O teste de susceptibilidade antimicrobiana foi realizado utilizando o método automatizado VITEK-2. Nos 58 cultivos retovaginais positivos para Streptococcus agalactiae, foi observada uma sensibilidade de 100% à ampicilina, levo- floxacino e moxifloxacino; 98% à quinupristina, linezolida e vancomicina sensível.

Susceptibilidad in vitro a antifúngicos de especies de Cándida / In vitro antifungal susceptibility of Candida spp

Resumen Objetivo. Analizar la susceptibilidad in vitro de aislamientos de Candida spp. provenientes de onicomicosis obtenidos entre 2016 y 2019, para contribuir con el conocimiento sobre la necesidad o no de realizar pruebas de susceptibilidad a los microorganismos aislados antes de prescribir el tratamiento. Métodos. El estudio consistió en identificar 23 aislamientos de Candida spp. utilizando el sistema automatizado Vitek2® (bioMérieux, Francia). Se determinó la susceptibilidad in vitro de estos aislamientos ante dos antifúngicos tópicos (amorolfina y ciclopirox) y dos antifúngicos sistémicos (fluconazol e itraconazol) por el método de microdilución en caldo M27-A3 del Instituto Estándares para el Laboratorio Clínico (CLSI por sus siglas en inglés) de los Estados Unidos de América. Resultados. La mayoría de los aislamientos correspondieron a Candida parapsilosis (34,8 %), seguido por C. albicans (30,3 %), C. guilliermondii (17,4 %), C. tropicalis (8,7 %), C. dubliniensis (4,4 %) y C. krusei (4,4 %). No se encontraron diferencias estadísticamente significativas entre las CIMs de los diferentes antifúngicos y en promedio hubo susceptibilidad para todos los antifúngicos analizados. Sin embargo, para fluconazol se encontró un aislamiento con CIM alta de C. guilliermondii y un aislamiento resistente de C. parapsilosis. Conclusiones. Las directrices internacionales recomiendan pruebas de susceptibilidad para Candida spp. de hemocultivos o tejidos tras infecciones sistémicas. En todas las demás candidiasis se identifica la especie y se revisan sus patrones de susceptibilidad en la literatura. Por lo tanto, es de importancia conocer que aislamientos de onicomicosis de Candida no-albicans, especialmente de C. guilliermondii y C. parapsilosis, presentan una susceptibilidad disminuida a ciertos antifúngicos que se utilizan como tratamiento, por lo que se recomienda realizar pruebas de susceptibilidad en caso de no tener una buena respuesta al tratamiento en casos de onicomicosis por estas levaduras.

Abstract Aim. The purpose of this investigation was to determine the in vitro susceptibility patterns of Candida spp. isolated from onychomycosis, in order to contribute with strategies for optimal clinical laboratory management of patients with onychomycosis infected with these yeasts. Methods . A total of 23 isolates of Candida spp. were identified with the automatized system Vitek®2 (system bioMérieux, France). In vitro susceptibility patterns were evaluated with two topic antifungals (amorolfine and ciclopirox) and two systemic antifungals (fluconazole and itraconazole) using the Clinical Laboratory and Standards Institute (CLSI) broth microdilution M27-A3 guidelines. Results . Most of the isolates were identified as Candida parapsilosis (34,8 %), followed by C. albicans (30,3 %), C. guilliermondii (17,4 %), C. tropicalis (8,7 %), C. dubliniensis (4,4 %) and C. krusei (4,4 %). There were no statistically significant differences among the MICs of the antifungals tested. However, there was one isolate of C. guilliermondii with high MIC for fluconazole and one fluconazole resistant isolate of C. parapsilosis. Conclusions. Susceptibility tests are only recommended internationally for Candida spp. isolated from blood stream or tissue in systemic infections. In every other candidiasis there is only a species identification, while its susceptibility pattern for treatment is reviewed in literature. Therefore, it is important to report that Candida no-albicans isolates from onychomycosis, especially C. guilliermondii and C. parapsilosis, have a reduced susceptibility to some antifungals commonly used for treatment. According to the obtained in vitro results, we recommend performing antifungal susceptibility testing in those cases of onychomycosis caused by Candida spp. no responsive to treatment.

Análisis retrospectivo de perfil microbiológico y resistencia antimicrobiana en infección urinaria pediátrica de hospitales públicos de Quito-Ecuador

Objetivo: Determinar el perfil microbiológico y resistencia antimicrobiana en infección urinaria en niños. Materiales y métodos: Estudio descriptivo, transversal, observacional y multicéntrico. Se estudiaron 445 urocultivos procesados y los resultados de antibiogramas en tres hospitales públicos de Quito (Ecuador). En relación con los agentes causales se establecieron frecuencias absolutas y proporciones. En el análisis bivariable entre el antecedente de malformación renal o de la vía urinaria y el riesgo de infección, se aplicó el test Chi2 (p < 0,05) y la RP [IC 95 %; p < 0,05]. Resultados: Se evidenció una resistencia ante aminopenicilinas del 73,5 %; ampicilina más sulbactam 31,8 %; trimetoprim-sulfametoxazol 55,5 %; cefalosporinas de primera y segunda generación hasta 33 %; cefalosporinas de tercera y cuarta generación del 21,3 al 47 %. Ante malformación urinaria y aislamiento de bacterias diferentes a Escherichia coli, se identificó a Klebsiella pneumoniae RP 2,66 [IC 95 %, 1,9-3,6; p < 0,05] y Pseudomonas aeruginosa RP 2,07 [IC 95 %, 1,2-3,5; p < 0,05]. Conclusiones: En nuestro medio, ante el diagnóstico de infección urinaria, no parece adecuado iniciar tratamiento antibiótico con aminopenicilinas, trimetoprim-sulfametoxazol ni cefalosporinas de primera a cuarta generaciones por su elevada resistencia. La presencia de malformación urinaria se asocia a infección por bacterias diferentes de Escherichia coli.

Objective: Determine the microbiological profile and antimicrobial susceptibility in urinary infection in children. Materials and methods: Descriptive, cross-sectional, observational, and multicenter study. 445 urine cultures and the results of antibiograms were studied in three public hospitals in Quito (Ecuador). In relation to the causal agents, absolute frequencies and proportions were established. In the bivariate analysis, Chi-squared test (p < 0.05) and PR [CI 95 %; p < 0.05] were applied between history of kidney or urinary tract malformation and risk of infection. Results: There was evidence of resistance to aminopenicillins of 73.5 %; ampicillin plus sulbactam 31.8 %; trimethoprim-sulfamethoxazole 55.5 %; first and second generation cephalosporins up to 33 %; resistance to third and fourth generation cephalosporins from 21.3 to 47%. In relation to urinary malformation and the isolate of a bacteria different from Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae PR 2,66 [CI 95 %, 1.9-3.6; p < 0.05] and Pseudomonas aeruginosa PR 2.07 [CI 95 %, 1.2-3.5; p < 0.05] were identified. Conclusions: In our locality it wouldn't be appropriate to start antibiotic treatment with aminopenicillins, trimethoprim-sulfamethoxazole or first to fourth generation cephalosporins in urinary tract infection due to their resistance. The presence of urinary malformation is associated with infection by bacteria other than Escherichia coli.

Occurrence of the bacteria in a hospital environment and their sensitivity profile to the main antimicrobials in a reference general hospital in Curitiba, Brazil / Ocorrência de bactérias em ambiente hospitalar, e seu perfil de sensibilidade aos principais antimicrobianos em um hospital de referência em Curitiba, Brasil / Ocurrencia de bacterias en ambiente hospitalario y su perfil de sensibilidad a los principales antimicrobianos en un hospital de referencia en Curitiba, Brasil

Introduction: Antimicrobial resistance rates are increasing in both hospital and community settings, creating a favorable environment for the development of superbacteria. Therefore, local studies are necessary for the proper management of current antimicrobial arsenals and for addressing the current bacteriological scenario. Aim: The aim of this study is to profile bacterial epidemiology in a hospital in Curitiba, Brazil and associate it with the effectiveness of antimicrobial therapy. Methodology: Data from 2019 to 2021 were collected by the Center for Epidemiology and Hospital Infection Control (CEHIC), and this was a quantitative single-center study. Results: The most commonly detected microorganisms were Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, and Enterobacter cloacae. A. baumannii and K. pneumoniae had the lowest mean sensitivity coefficients, while S. aureus was the most sensitive. Erythromycin was the least effective antimicrobial agent, while daptomycin was the most effective. Conclusion: These results are consistent with the literature and can be used to optimize empiric therapies, as there are already important therapeutic failures associated with antimicrobial resistance.

Introdução: As taxas de resistência antimicrobiana estão em ascensão tanto em ambientes hospitalares como comunitários, criando um cenário propício para o desenvolvimento de superbactérias e, assim, torna-se necessário estudos locais para uma gestão adequada dos arsenais antimicrobianos atuais e frente ao cenário bacteriológico atual. Objetivo: O escopo desse estudo visa traçar o perfil epidemiológico bacteriano num hospital em Curitiba, Brasil e associá-lo à eficácia da terapia antimicrobiana. Metodologia: Os dados de 2019 a 2021 foram recolhidos pelo Centro de Epidemiologia e Controle de Infecções Hospitalares (CECIH), sendo este um estudo unicêntrico quantitativo. Resultados: Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, e Enterobacter cloacae foram os microrganismos mais comuns detectados. A. baumannii e K. pneumoniae tinham as médias de coeficiente de sensibilidade mais baixas, enquanto S. aureus era o mais sensível. A eritromicina era o agente antimicrobiano menos eficaz, enquanto a daptomicina era o mais eficaz. Conclusão: Estes resultados estão de acordo com a literatura e podem ser utilizados para otimizar as terapias empíricas, visto que já há falhas terapêuticas importantes associadas a resistência antimicrobiana.

Introducción: Las tasas de resistencia antimicrobiana están en aumento tanto en el ámbito hospitalario como en el comunitario, creando un escenario propicio para el desarrollo de superbacterias, por lo que son necesarios estudios locales para una gestión adecuada de los actuales arsenales antimicrobianos y hacer frente al escenario bacteriológico actual. Objetivo: El alcance de este estudio pretende trazar el perfil epidemiológico bacteriano en un hospital de Curitiba, Brasil y asociarlo a la eficacia de la terapia antimicrobiana. Metodología: Los datos de 2019 a 2021 fueron recogidos por el Centro de Epidemiología y Control de Infecciones Hospitalarias (CECIH), siendo un estudio cuantitativo unicéntrico. Resultados: Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis y Enterobacter cloacae fueron los microorganismos más frecuentes detectados. A. baumannii y K. pneumoniae presentaron los coeficientes medios de sensibilidad más bajos, mientras que S. aureus fue el más sensible. La eritromicina fue el agente antimicrobiano menos eficaz, mientras que la daptomicina fue el más eficaz. Conclusión: Estos resultados concuerdan con la literatura y pueden ser utilizados para optimizar las terapias empíricas, pues ya existen importantes fracasos terapéuticos asociados a la resistencia antimicrobiana.

Fatores associados à toxoplasmose na gestação / Factores asociados a la toxoplasmosis durante la gestación / Factors associated with toxoplasmosis in pregnancy

Objetivos: estimar a soroprevalência e analisar fatores associados a Toxoplasmose na gestação. Método: investigação epidemiológica, analítica e transversal com mulheres no pré-natal em Ribeirão Preto-SP. Os dados foram obtidos por meio de exames sorológicos e questionário. Modelo de regressão logística foi utilizado, com a seleção das variáveis independentes realizada por meio dos testes Exato de Fisher, ou Qui-quadrado, e t de Student, calculadas razões de chances brutas e ajustadas, com nível de significância de 5%. Resultados: amostra foi composta de 165 mulheres, com soroprevalência total, 34,5% [27,3; 41,8], reagentes para IgG. A chance de ser reagente ao anticorpo antitoxoplasma IgG é 1,09 vezes maior para cada ano a mais de idade; 19,48 para aquelas com Ensino Fundamental I incompleto; 4,41 para o contato direto com a terra. Conclusão: saneamento básico e a rede de serviços de saúde no município estudado favorecem a prevenção da Toxoplasmose na gestação.

Objetivos: estimar la seroprevalencia y analizar factores asociados a Toxoplasmosis en la gestación. Método: investigación epidemiológica, analítica y transversal con mujeres en el prenatal en Ribeirão Preto-SP. Los datos fueron obtenidos por medio de exámenes serológicos y cuestionario. Modelo de regresión logística fue utilizado, con la selección de las variables independientes realizada por medio de las pruebas Exacto de Fisher, o Chi-cuadrado, y t de Student, calculadas razones de probabilidades brutas y ajustadas, con nivel de significación del 5%. Resultados: muestra compuesta de 165 mujeres, con seroprevalencia total, 34,5% [27,3; 41,8], reactivos para IgG. La probabilidad de ser reactivo al anticuerpo antitoxoplasma IgG es 1,09 veces mayor para cada año a más de edad; 19,48 para aquellas con Enseñanza Fundamental I incompleto; 4,41 para el contacto directo con la tierra. Conclusión: saneamiento básico y la red de servicios de salud en el municipio estudiado favorecen la prevención de la Toxoplasmosis en la gestación.

Objectives: to estimate seroprevalence and analyze factors associated with Toxoplasmosis in pregnancy. Method: epidemiological, analytical and cross-sectional investigation with women in prenatal care in Ribeirão Preto-SP. Data were obtained through serological tests and questionnaire. Logistic regression model was used, with the selection of independent variables performed using the Fisher's exact test, or Chi-square test, and Student's t, calculated crude and adjusted odds ratios, with significance level of 5%. Results: sample was composed of 165 women, with total seroprevalence, 34.5% [27.3; 41.8], reagents for IgG. The chance of being reactant to the IgG antitoxoplasm antibody is 1.09 times higher for each year of age; 19.48 for those with incomplete Elementary School I; 4.41 for direct contact with the earth. Conclusion: basic sanitation and the network of health services in the municipality studied favor the prevention of Toxoplasmosis in pregnancy.

Caracterización fenotípica y molecular de cepas de Klebsiella pneumoniae productores de carbapenemasas tipo OXA-48 circulantes en Chile / Phenotypic and molecular characterization of OXA-48 like producing Klebsiella pneumoniae isolates in Chile

INTRODUCCIÓN: La aparición y diseminación de Enterobacterales resistentes a carbapenémicos ha generado un gran impacto en las infecciones asociadas a la atención de salud en el mundo. Recientemente, en Chile se detectó un brote por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas tipo oxacilinasas (OXA) de la subfamilia tipo OXA-48, reportándose los primeros casos en pacientes hospitalizados mayoritariamente en la zona norte del país. OBJETIVO: Determinar los perfiles fenotípicos, genotípicos y de susceptibilidad antimicrobiana de 16 cepas referidas durante mayo del año 2021 desde las regiones de Antofagasta y Metropolitana al Laboratorio de Referencia del Instituto de Salud Pública. METODOLOGÍA: Las cepas provenientes de muestras clínicas fueron analizadas mediante técnicas tradicionales (Kirby-Bauer y epsilometría) y automatizadas, además de técnicas colorimétricas, inmunocromatográficas y moleculares (RPC y PFGE). Resultados: Se detectó la presencia de los genes blaoxa-48 y blaoxa-232 con una resistencia inusual, tanto a carbapenémicos (ertapenem, imipenem y meropenem) como a cefalosporinas (cefepime, cefotaxima y ceftazidima), además de piperacilina/tazobactam y temocilina. Se detectaron dos subtipos por PFGE, siendo predominante el clon CL-Kpn-Spe-329 (93,8%) con dos mecanismos de resistencia identificados: carbapenemasa y β-lactamasa de espectro extendido (BLEE). CONCLUSIÓN: Ante esta alerta epidemiológica es necesario unificar criterios existentes en la red asistencial nacional para la oportuna detección, vigilancia y control de posibles brotes de cepas productores de oxacilinasa tipo OXA-48.

BACKGROUND: The appearance and spread of carbapenems-resistant Enterobacterales have generated a major impact on health care-associated infections worldwide. Recently, a Klebsiella pneumoniae outbreak expressing OXA-48 like-carbapenemases was detected in Chile, the first reported cases corresponded to hospitalized patients mainly from northern Chile. AIM: To characterize the phenotypic and genotypic profiles of antimicrobial susceptibility of 16 clinical isolates referred during May 2021 from Antofagasta and Metropolitan regions to the Reference Laboratory of Instituto de Salud Publica. METHODS: Antimicrobial susceptibility of all strains was analyzed using traditional (Kirby-Bauer and epsilometry) and automated methods, and complemented with colorimetric, immunochromatographic and molecular (PCR and PFGE) techniques. RESULTS: As a result of the genetic characterization, blaoxa-48 and blaoxa-232 genes were detected, showing the isolates an unusual resistance profile to both carbapenems (ertapenem, imipenem, and meropenem) and cephalosporins (cefepime, cefotaxime, and ceftazidine), as well as piperacillin/ tazobactam and temocillin. Two subtypes were detected by PFGE, with a predominant clone CL-Kpn-Spe-329 (93.8%), with two resistance mechanisms identified: carbapenemase and extended-spectrum β-lactamase (ESBL). CONCLUSION: Due to this epidemiological alert, it is essential the establishment of national guidelines for early detection, surveillance, and control of future outbreaks of OXA-48 like carbapenemases isolates.

Evaluación de la Susceptibilidad Antimicrobiana de Porphyromonas gingivalis Aisladas de Pacientes Periodontales en Población Chilena

RESUMEN: Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) es un microorganismo frecuentemente aislado en pacientes con periodontitis, en los que también se incluye los de la población chilena. El modelo de "Keystone bacteria" demostró que P. gingivalis induce la disbiosis del biofilm subgingival y permite el desarrollo de algunas especies sobre otras, modulando la patogenicidad de la comunidad microbiológica completa. El tratamiento de la periodontitis es principalmente mecánico, pero en condiciones específicas es necesario el complemento con antibioterapia. Los estudios globales de antibióticos evaluados en ensayos clínicos y estudios in vitro han mostrado resultados mixtos en cuanto a eficacia y susceptibilidad. Este estudio descriptivo tuvo como objetivo evaluar el perfil de susceptibilidad antimicrobiana in vitro a metronidazol, clindamicina, amoxicilina más ácido clavulánico, moxifloxacino y azitromicina de P. gingivalis aisladas de pacientes periodontales chilenos. Se obtuvieron muestras microbiológicas de pacientes con diagnóstico de periodontitis estadíos III y IV generalizada, las que se sometieron a procesos de identificación mediante un espectrómetro de masas (MALDI-TOF MS). Posteriormente, a cada muestra positiva a P. gingivalis se aplicó el protocolo gold standard de susceptibilidad para los cinco antimicrobianos evaluados (Dilución en Agar Sangre Brucella- McFarland 0.5). Se seleccionaron 50 pacientes (25 mujeres, 25 hombres) entre 34-69 años. Finalmente, se recuperaron 25 cepas de P. gingivalis (50 %) para el análisis de susceptibilidad y todas ellas fueron sensibles a todos los antibióticos evaluados (100 % susceptibilidad). Las cepas de P. gingivalis fueron altamente sensibles a los cinco antibióticos evaluados en esta población, lo que podría implicar contar con diferentes alternativas de tratamiento farmacológico antimicrobi ano como complemento al tratamiento mecánico convencional en pacientes específicos.

ABSTRACT: Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) is a microorganism frequently isolated in patients with periodontitis, which also include those of Chilean population. The "Keystone bacteria" model demonstrated that P. gingivalis induces dysbiosis of the subgingival biofilm and allows the development of some species over others, modulating the pathogenicity of the entire microbiological community. The treatment of periodontitis is mainly mechanical; nevertheless, under specific conditions the complement with antibiotherapy is needed. Global studies of antibiotics evaluated in clinical trials and in vitro studies have shown mixed results in terms of efficacy and susceptibility. This descriptive study aimed to evaluate antimicrobial susceptibility profile in vitro to metronidazole, clindamycin, amoxicillin plus clavulanic acid, moxifloxacin and azithromycin of P. gingivalis isolated from Chilean periodontal patients. Microbiological samples were obtained from patients with a diagnosis of generalized periodontitis stages III and IV, which were exposed to identification processes by a mass spectrometer (MALDI-TOF MS). Subsequently, the gold standard susceptibility protocol for the five antimicrobials evaluated was applied to each P. gingivalis- positive sample (Dilution in Brucella-McFarland Blood Agar 0.5). 50 patients (25 women, 25 men) between 34-69 years old were selected. Finally, 25 P. gingivalis strains (50 %) were recovered for susceptibility testing and all of them were susceptible to all antibiotics tested (100 % susceptibility). P. gingivalis strains were highly susceptible to the five antibiotics evaluated in this population, which could implies counting different antimicrobial pharmacological treatment alternatives as a complement to conventional mechanical treatment in specific patients.

Recomendaciones para diagnóstico y tratamiento de la infección del tracto urinario en pediatría. Parte 1: Grupo de trabajo asociado al Comité de Antimicrobianos, Sociedad Chilena de Infectología (SOCHINF) / Recommendations for the diagnosis and treatment of urinary tract infection in pediatrics. Part 1: Working group associated with the Antimicrobial Committee, Chilean Society of Infectology

Resumen La infección del tracto urinario (ITU) es una de las infecciones bacterianas más frecuentes en la infancia. Un adecuado diagnóstico es esencial para poder realizar un tratamiento racional, eficiente y eficaz; sin embargo, existe gran heterogeneidad en los métodos diagnósticos, específicamente en el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana. El objetivo de estas recomendaciones es entregar herramientas para uniformar los criterios diagnósticos, el estudio de susceptibilidad bacteriana in vitro y el tratamiento antimicrobiano de la ITU en la población pediátrica, con un enfoque de uso racional de los antimicrobianos. En esta primera parte, se presentan las recomendaciones en cuanto a cómo obtener una adecuada muestra de orina, el diagnóstico de laboratorio incluyendo puntos de corte -unidades formadoras de colonias/mL de orina-, además de consideraciones microbiológicas para el estudio de susceptibilidad y finalmente, el manejo de la ITU en pediatría. En la segunda parte se detalla el tratamiento antimicrobiano de sus complicaciones, el manejo de ITU en situaciones especiales y consideraciones farmacocinéticas y farmacodinámicas de los antimicrobianos a indicar en ITU.

Abstract The urinary tract infection (UTI) is one of the most common bacterial infections in childhood. An adequate diagnosis is essential to be able to carry out a rational, efficient and effective treatment, however, there great heterogeneity in diagnostic methods, specifically in the study of antimicrobial susceptibility. The aim of these recommendations is to provide tools to homogenize the diagnosis criteria, susceptibility study and antimicrobial treatment of urinary tract infection in the pediatric population, with a rational use of antibiotics approach. In the first part, the recommendations regarding diagnosis are presented, such as sampling and cut-off points, as well as microbiological considerations for susceptibility study and management of UTI in pediatrics. The second part details the management of complications, UTI in special situations, and pharmacokinetic and pharmacodynamic considerations of antimicrobials to be prescribed in UTI.

Polimorfismos en genes de reparación del daño al material genético y cáncer de pulmón

RESUMEN Introducción: El cáncer de pulmón es uno de los principales problemas de salud en Cuba y el mundo. Las diferencias genéticas a causa de polimorfismos de un solo nucleótido, son factores importantes involucrados en la susceptibilidad genética a esta enfermedad. En Cuba son escasos los datos disponibles sobre los polimorfismos de un solo nucleótido y su posible influencia sobre la aparición y pronóstico del cáncer. Objetivo: Exponer la importancia del estudio de los polimorfismos de un solo nucleótido en genes de la reparación del daño al ADN en el cáncer de pulmón. Desarrollo: El tabaquismo es el principal factor de riesgo para desarrollar cáncer de pulmón, sin embargo, aproximadamente el 15 % de los fumadores desarrollará la enfermedad. Los polimorfismos de un solo nucleótido son factores involucrados en la predisposición genética a las enfermedades. La presencia de variantes polimórficas puede modificar la eficacia de los sistemas de reparación, favoreciendo la aparición de genotoxicidad y/o mutagénesis. También pueden modificar la respuesta a los tratamientos oncológicos y la supervivencia de los pacientes. Por consiguiente, además de ser marcadores de susceptibilidad, los polimorfismos se consideran marcadores de pronóstico individual de respuesta a la terapia. Este trabajo enfatiza la utilidad de su evaluación como biomarcadores clínicos y de susceptibilidad genética a enfermedades en la población cubana. Conclusiones: El estudio de polimorfismos de un solo nucleótido permitirá el abordaje personalizado de enfermedades oncológicas, lo cual podría contribuir a su detección temprana y a definir grupos de individuos con alto riesgo de padecer cáncer de pulmón.

ABSTRACT Introduction: Lung cancer is one of the main health problems in Cuba and worldwide. Genetic differences due to single nucleotide polymorphisms are important factors involved in the genetic susceptibility to this disease. In Cuba, there are scarce data available on single nucleotide polymorphisms and their possible influence on the incidence and prognosis of cancer. Objective: To expose the importance of the study of single nucleotide polymorphisms in DNA damage repair genes in lung cancer. Results: Smoking is the main risk factor for developing lung cancer, however, approximately 15 % of smokers will develop the disease. Single nucleotide polymorphisms are important factors involved in genetic predisposition to diseases. The presence of polymorphic variants can modify the efficacy of repair systems, favoring the occurrence of genotoxicity and/or mutagenesis. They can also modify the response to oncological treatments and patient´s survival. Therefore, in addition to being susceptibility markers, polymorphisms are considered individual prognostic markers of response to therapy. This work emphasizes the usefulness of evaluating single nucleotide polymorphisms as clinical and susceptibility biomarkers in the Cuban population. Conclusions. The study of single nucleotide polymorphisms will allow a personalized approach to oncological diseases, which could contribute to define groups of individuals at high risk of getting lung cancer, therefore, early disease detection.

Variación en un solo nucleótido en genes de citocinas como marcadores de enfermedades / Single nucleotide variation in cytokine genes as disease markers

Resumen Objetivo: Describir la asociación de las variantes en los genes que codifican por citocinas participantes en el proceso inflamatorio con la susceptibilidad y la gravedad clínica de las enfermedades. Métodos: Se realizó un estudio documental con revisión de literatura científica encontrada en las siguientes bases de datos: Pubmed, Science Direct, Scopus, Scielo, PLOS, Hinari, Redalyc, Dialnet, Taylor, ProQuest. Se revisaron 84 referencias relacionadas con artículos de investigación, revisiones sistemáticas y metaanálisis con los términos ''variante'', ''variante en un solo nucléotido'', ''polimorfismo de nucleótido único'', ''citocinas proinflamatorias'', ''citocinas antiinflamatorias'', ''interleucinas'', ''factor de necrosis tumoral'', ''susceptibilidad genética'', ''enfermedades'' y ''patologías''. Resultados: La evidencia señala que las variantes en un solo nucleótido se detectan principalmente en regiones promotoras de genes que codifican para citocinas reguladoras de procesos inflamatorios, como son: IL-1, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL-17, IL-18, IL-22 y el factor de necrosis tumoral. Conclusiones: La expresión y la producción diferencial de estas citocinas desempeñan un papel relevante en la patogenia y la predisposición a sufrir enfermedades, especialmente metabólicas, malignas, autoinmunes e infecciosas. Se mostró también un efecto diferencial de las variantes según las características étnicas, lo que resulta ser una herramienta eficaz en la medicina preventiva.

Abstract Aim: To describe the association of variations in cytokine genes that participate in the inflammatory process with the susceptibility and clinical severity of diseases. Methods: A documentary study was carried out with a review of the scientific literature of the database: Pubmed, Science Direct, Scopus, Scielo, PLOS, Hinari, Redalyc, Dialnet, Taylor, ProQuest. Eighty-four references were reviewed that included research articles, systematic reviews and meta-analyzes, using the terms ''Variants'', ''Single Nucleotide Variation'', ''Proinflammatory cytokines'', ''Anti-inflammatory cytokines'', ''Interleukins'', ''Tumor Necrosis Factor'', ''genetic susceptibility'', ''diseases'', pathologies''. Results: The evidence indicates that Single Nucleotide Variants are detected mainly in promoter regions of genes that code for cytokines that regulate inflammatory processes such as: IL-1, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL -17, IL-18, IL-22 and tumoral necrosis factor. Conclusions: The expression and differential production of these cytokines play a role in the pathogenesis and predisposition to diseases, especially metabolic, malignant, autoimmune, and infectious. A differential effect of variants according to ethnic characteristics is also observed, which turns out to be an effective tool to be used in preventive medicine.

Patrones de susceptibilidad de gramnegativos en un hospital pediátrico de tercer nivel: 2013 vs. 2018 / Gram-negative susceptibility patterns in a tertiary pediatric hospital: 2013 vs. 2018

Resumen Introducción: Los gramnegativos continúan siendo los causantes de infecciones asociadas a la atención a la salud (IAAS). Material y métodos:: Analizamos la resistencia antimicrobiana de patógenos durante el 2013 vs. 2018 y lo comparamos con lo publicado en 2006 vs. 2012. Resultados: Identificamos nueve patógenos gramnegativos, de un total de 404 aislamientos, con una prevalencia en 2013 (N = 227 [0.22]) vs. 2018 (N = 177 [0.17]) y una incidencia por egresos (6,607 en el 2013 y 7,778 en el 2018) del 3.4 y 2.2% respectivamente. Destacaron tres patógenos: Klebsiella pneumoniae (129 [31.93%]), Pseudomonas aeruginosa (85 [21.03%]) y Escherichia coli (80 [19.80%]). Estos, llamados patógenos ESKAPE-E, prevalecieron como causantes de IAAS. Identificamos un aumento en los patrones de resistencia para muchos patógenos en 2018. Conclusión: La multirresistencia a patógenos ESKAPE-E es un serio problema de salud pública, por carecer de alternativas terapéuticas para enfrentar este reto. Los mapas de resistencia bacteriana ayudan en la prescripción antibiótica.

Abstract Background: Gram-negatives continue to be the cause of infections associated with health care (HCAI). Material and methods: We analyzed the antimicrobial resistance of pathogens during 2013 vs. 2018 and we compare it with what was published in 2006 vs. 2012. Results: We identified 9 gram-negative pathogens, out of a total of 404 isolates, with a prevalence in 2013 (N = 227 [0.22]) vs. 2018 (N = 177 [0.17]) and an incidence due to discharges (6,607 in 2013 and 7,778 in 2018) of 3.4 and 2.2%, respectively.Three pathogens stood out Klebsiella pneumoniae (129 [31.93%]), Pseudomonas aeruginosa (85 [21.03%]) and Escherichia coli (80 [19.80%]). These, called ESKAPE-E pathogens, prevailed as the cause of HCAI. We identified an increase in resistance patterns for many pathogens in 2018. Conclusion: Multi-resistance to ESKAPE-E pathogens is a serious public health problem, due to the lack of therapeutic alternatives to face this challenge. Bacterial resistance maps help in antibiotic prescription.

Actitudes hacia el endeudamiento hedónico en estudiantes secundarios chilenos / Attitudes towards hedonic indebtedness in Chilean high school students

Resumen Introducción: El consumo se ha instaurado como medio de interacción social generando altos niveles de endeudamiento en la población chilena. Los adolescentes han sido especialmente sensibles a esto, producto que a través del consumo acceden a elementos simbólicos asociados a la construcción de la identidad. El objetivo de la presente investigación es determinar la existencia de relaciones entre valores materiales, susceptibilidad al efecto de pares y actitudes hacia el dinero con respecto a las actitudes hacia el endeudamiento hedónico en estudiantes secundarios chilenos. Método: La muestra es de 1297 estudiantes secundarios chilenos, el 46% es hombre y el 54% es mujer, correspondientes a las ciudades de La Serena, Coquimbo, Santiago y Temuco. Se aplicaron las escalas de Actitudes hacia el Endeudamiento, Materialismo para Adolescentes, Escala de Susceptibilidad a la Influencia de los Pares y la Escala de Actitudes hacia el Dinero. Los datos fueron analizados a través de una regresión lineal múltiple jerárquica. Resultados: Se evidencian relaciones estadísticamente significativas entre sexo, valores materiales, susceptibilidad al efecto de pares y las actitudes hacia el dinero con respecto al endeudamiento hedónico. Conclusiones: Los resultados obtenidos en este estudio entregan pistas al momento de abordar la educación financiera, donde debe considerarse que la cultura materialista del modelo económico neoliberal impacta en las actitudes, valores y propensión al endeudamiento de los adolescentes y posteriormente adultos.

Abstract Introduction: Consumer spending has established itself as a means of social interaction, generating high levels of indebtedness among the Chilean population. Adolescents have been especially sensitive to this situation, since through consumption they have access to symbolic elements associated with the construction of identity. The objective of this research is to determine the existence of relationships between material values, influence of peers, and attitudes towards money with regard to attitudes towards hedonic indebtedness in Chilean high school students. Method: Of a sample of 1297 Chilean high school students, 46% are men and 54% are women, corresponding to the cities of La Serena, Coquimbo, Santiago and Temuco. The scales of Attitudes towards Indebtedness, Materialism for Adolescents, Scale of Susceptibility to the Influence of Peers and the Scale of Attitudes towards Money were applied. The data were analyzed through a hierarchical multiple linear regression. Results: The results indicate that there is a statistically significant relationship between sex, material values, peer effect and attitudes towards money with respect to hedonic indebtedness. Conclusion: The results obtained in this study provide clues when approaching financial education in adolescents, where it must be considered that the materialistic culture of the neoliberal economic model impacts on the attitudes, values ​​and propensity to indebtedness of adolescents and later adults.

MicroRNA-146a and its target gene IRAK1 polymorphisms confer susceptibility to systemic lupus erythematosus / El microARN-146a y sus polimorfismos del gen diana IRAK1 confieren susceptibilidad al lupus eritematoso sistémico

ABSTRACT Objective: To clarify the association between miR-146a, miR-499, and IRAK1 polymorphism and systemic lupus erythematosus (SLE) predisposition. Methods: A literature search was conducted until 12 September 2020 in accordance with the PRISMA guidelines. The keywords "miRNA-146a", "miRNA-499", "IRAK1" and "SLE" were used in combination to obtain case-control studies evaluating the abovementioned gene polymorphism and the risk of SLE. Results: Patients harbouring C allele of miRNA-146a rs2431697 exhibited low SLE risk (CC vs. TC + TT, OR = .77, 95% CI = .62-.95, p = .019; TC vs. CC + TT, OR = .84, 95% CI = .71-.98, p = .027; and TC vs. TT, OR = .73, 95% CI = .61-.86, p = .000), whereas patients carrying the A allele and AA genotype of rs3027898 in IRAK1 had significantly decreased SLE susceptibility (A vs. C, OR = .73, 95% CI = .60-.87, p = .001; AA vs. CA + CC, OR = .64, 95% CI = .42-.97, p = .037; AA + CA vs. CC, OR = .71, 95% CI = .56-.88, p = .003, and AA vs. CC, OR = .49, 95% CI = .31-.77, p = .002). No association was observed between miRNA-146a rs2910164 and miRNA-499 rs3746444 with SLE risk. Conclusion: This study demonstrates associations between miRNA-146a and IRAK1 polymor phisms with SLE risk. Larger studies on these associations are needed in the future to support our results.

RESUMEN Objetivo: Aclarar la asociación entre el polimorfismo de miR-146a, miR-499 e IRAK1 y la predisposición al lupus eritematoso sistémico (LES). Métodos: Se realizó una búsqueda bibliográfica hasta el 12 de septiembre del 2020, de acuerdo con las guías PRISMA. Las palabras clave «miRNA-146a¼, «miRNA-499¼, «IRAK1¼ y «LES¼ se utilizaron en combinación para obtener estudios de casos y controles que evaluaran el polimorfismo de los genes antes mencionados y el riesgo de LES. Resultados: Los pacientes que albergan el alelo C del miRNA-146a rs2431697 mostraron un bajo riesgo de LES (CC frente a TC + TT; OR = 0,77; IC 95% = 0,62-0,95; p = 0,019; TC frente a CC + TT; OR = 0,84; IC 95% = 0,71-0,98; p = 0,027; y TC vs. TT; OR = 0,73; IC 95% = 0,61-0,86; p = 0,000), mientras que los pacientes portadores del alelo A y el genotipo AA de rs3027898 en IRAK1 redujeron significativamente la susceptibilidad al LES (A vs. C; OR = 0,73; IC 95% = 0,60 0,87; p = 0,001; AA vs. CA + CC; OR = 0,64; IC 95% = 0,42-0,97; p = 0,037; AA + CA vs. CC; OR = 0,71; IC 95% = 0,56-0,88; p = 0,003 y AA vs. CC; OR = 0,49; IC 95% = 0,31-0,77; p = 0,002). No se observó asociación entre miRNA-146a rs2910164 o miRNA-499 rs3746444 con riesgo de LES. Conclusión: Este estudio demuestra asociaciones entre los polimorfismos de miRNA-146a e IRAK1 y el riesgo de LES. En el futuro se necesitan estudios más amplios sobre estas asociaciones para garantizar nuestros resultados.

Identificación y susceptibilidad de Candida spp. en el área ginecológica

Resumen La candidiasis es una infección causada por la acción patógena de Candida spp., catalogada como la segunda causa a nivel mundial de infección vaginal en mujeres con edades comprendidas entre 15 y 45 años. Siendo Candida albicans la más prevalente con distribución global. Uno de los problemas de importancia clínica es la resistencia a los antifúngicos debido al uso irracional de los mismos como terapia empírica y profilaxis. Objetivo . Caracterizar la infección por Candida spp., según: perfiles de susceptibilidad y frecuencias de candidiasis vulvo - vaginal relacionada con el balance de contenido vaginal. Así como, la presencia de coinfecciones en mujeres de edad fértil en las ciudades Cuenca - Azogues, que asisten a consulta en el Hospital Monte Sinaí, periodo enero - noviembre de 2020. Materiales y métodos . Estudio de tipo descriptivo, documental de corte transversal, la muestra estuvo conformada por 136 aislados clínicos, se utilizó un muestreo por cobertura total. Resultados . El grupo etario que prevaleció fue de 19 - 39 años. Candida albicans fue la más prevalente en muestras de secreción vaginal con 92.6 %, seguido de Candida glabrata 6.6 % y Candida parapsilosis con 0.7 %. Las tasas de resistencia se diferenciaron en Miconazol con 19.9 %, Itraconazol 16.9 %, y Fluconazol 14%. Conclusiones . El agente etiológico causal de candidiasis vulvo - vaginal fue Candida albicans. La interpretación del balance de contenido vaginal y perfiles de susceptibilidad, son herramientas clave para el óptimo tratamiento de la paciente con infecciones vaginales, evitando la automedicación y la farmacorresistencia.

Abstract Candidiasis is an infection caused by the pathogenic action of Candida spp., Classified as the second worldwide cause of vaginal infection in women aged between 15 and 45 years. Being Candida albicans the most prevalent with global distribution. One of the clinically important problems is resistance to antifungals due to their irrational use as empirical therapy and prophylaxis. Objective : To characterize the infection by Candida spp., according to: susceptibility profiles and frequencies of vulvo-vaginal candidiasis related to the balance of vaginal content. As well as, the presence of co-infections in women of childbearing age in Cuenca - Azogues cities, who attend a consultation at the Monte Sinaí Hospital, January - November 2020 period. Materials and methods . A descriptive, observational cross-sectional study, the sample consisted of 136 clinical isolates, a full coverage sampling was used. Results. The age group that prevailed was 19 - 39 years. Candida albicans was the most prevalent in vaginal discharge samples with 92.6%, followed by Candida glabrata 6.6% and Candida parapsilosis with 0.7%. Resistance rates differed in Miconazole with 19.9%, Itraconazole 16.9%, and Fluconazole 14%. Conclusions . The causative etiological agent of vulvo-vaginal candidiasis was Candida albicans. The interpretation of the balance of vaginal content and susceptibility profiles are a key tool for the optimal treatment of the patient with vaginal infections, avoiding self-medication and drug resistance.

Resumo Candidíase é uma infecção causada pela ação patogênica de Candida spp., Classificada como a segunda causa mundial de infecção vaginal em mulheres com idade entre 15 e 45 anos. Sendo Candida albicans a mais prevalente com distribuição global. Um dos problemas clinicamente importantes é a resistência aos antifúngicos devido ao seu uso irracional como terapia empírica e profilaxia. Objetivo . Caracterizar a infecção por Candida spp., De acordo com: perfis de suscetibilidade e frequências de candidíase vulvovaginal relacionadas ao equilíbrio do conteúdo vaginal. Assim como, a presença de coinfecções em mulheres em idade fértil nos municípios de Cuenca - Azogues, atendidas em consulta no Hospital Monte Sinaí, período janeiro - novembro de 2020. Materiais e métodos . Estudo descritivo, observacional, transversal, a amostra foi composta por 136 isolados clínicos, foi utilizada uma amostra de cobertura total. Resultados . A faixa etária prevalente foi de 19 a 39 anos. Candida albicans foi a mais prevalente nas amostras de corrimento vaginal com 92,6%, seguida por Candida glabrata 6,6% e Candida parapsilosis com 0,7%. As taxas de resistência diferiram no Miconazol com 19,9%, Itraconazol 16,9% e Fluconazol 14%. Conclusões . O agente etiológico causador da candidíase vulvovaginal foi Candida albicans. A interpretação do equilíbrio do conteúdo vaginal e dos perfis de suscetibilidade é uma ferramenta fundamental para o tratamento ideal da paciente com infecções vaginais, evitando a automedicação e a resistência aos medicamentos

Genes implicados en la gravedad de la infección por SARS-cov- 2

Resumen El COVID-19 es una patología producida por el SARS-CoV-2, virus de carácter zoonótico capaz de producir patologías multiorgánicas. La sintomatología que produce es variada. Ante la infección algunos pacientes presentan condiciones de gravedad. Los estudios han demostrado que el rol genético tiene gran afluencia sobre la respuesta ante la infección. El objetivo de investigación es detallar los genes que están implicados en la gravedad de la infección por SARS-CoV- 2. Metodología . Se realizó una revisión sistemática, con base a la búsqueda y análisis de artículos originales en bases de datos de alto impacto como PudMed, Google Académico, Scopus, Taylor & Francis, ProQuest SciencieDirect; se utilizaron operadores booleanos, criterios de inclusión y exclusión con el objetivo de obtener información precisa. Los genes de inmunidad como el HLA, ACE2 y TMPRSS2 están directamente involucrados con la gravedad de la infección por SARS-CoV- 2. Los polimorfismos de los genes del polyQ del receptor de andrógenos, factor ABO coadyuvan a un deterioro del estado patológico como consecuencia de la COVID-19. Conclusión. Los estudios demostraron que existen genes involucrados en la gravedad ante la infección de SARS -CoV-2, pues mencionan que los polimorfismos de los genes; HLA, del polyQ del receptor de andrógenos y factor ABO producen susceptibilidad ante el COVID-19. Así mismo los genes ACE2 y TMPRSS2 intervienen en el ingreso y expansión del virus. En las diversas razas existen variantes de los genes CCL2 y MBL lo que indica que algunas poblaciones son más susceptibles que otras.

Abstract COVID-19 is a pathology caused by SARS-CoV-2, a zoonotic virus capable of producing multi-organ pathologies. The symptomatology it produces is varied. Some patients present severe conditions after infection. Studies have shown that the genetic role has a great influence on the response to infection. Methodology . A systematic review was carried out, based on the search and analysis of original articles in high impact databases such as PudMed, Google Scholar, Scopus, Taylor & Francis, ProQuest SciencieDirect; Boolean operators, inclusion and exclusion criteria were used in order to obtain accurate information. Immunity genes such as HLA, ACE2 and TMPRSS2 are directly involved with the severity of SARS-CoV- 2 infection. Polymorphisms of androgen receptor polyQ genes, ABO factor contribute to a deterioration of the pathological state as a consequence of COVID-19. Conclusion . The studies demonstrated that there are genes involved in the severity of SARS-CoV-2 infection, since they mention that polymorphisms of the HLA, androgen receptor polyQ and ABO factor genes produce susceptibility to COVID-19. Likewise, ACE2 and TMPRSS2 genes intervene in the entry and expansion of the virus. In the different breeds there are variants of the CCL2 and MBL genes, which indicates that some populations are more susceptible than others.

Resumo COVID-19 é uma patologia causada pelo SARS-CoV-2, um vírus zoonótico capaz de produzir patologias multiorganismos. Os sintomas que ela produz são variados. Alguns pacientes se apresentam com condições severas após a infecção. Estudos demonstraram que o papel da genética desempenha um papel importante na resposta à infecção. O objetivo desta pesquisa é detalhar os genes que estão envolvidos na gravidade da infecção pelo SARS-CoV- 2. Metodologia. Foi realizada uma revisão sistemática, baseada na busca e análise de artigos originais em bancos de dados de alto impacto como PudMed, Google Scholar, Scopus, Taylor & Francis, ProQuest SciencieDirect; operadores booleanos, critérios de inclusão e exclusão foram utilizados para obter informações precisas. Resultados. Os genes de imunidade como HLA, ACE2 e TMPRSS2 estão diretamente envolvidos na gravidade da infecção pelo SARS-CoV- 2. Os polimorfismos dos genes receptores de androgênio polyQ, fator ABO contribuem para uma deterioração do estado patológico como conseqüência da COVID-19. Conclusão. Os estudos demonstraram que existem genes envolvidos na gravidade da infecção pelo SRA-CoV-2, pois mencionam que os polimorfismos dos genes HLA, androgênio receptor policarbonato e fator ABO produzem suscetibilidade à COVID-19. Os genes ACE2 e TMPRSS2 também estão envolvidos na entrada e propagação do vírus. Existem variantes dos genes CCL2 e MBL nas diferentes raças, indicando que algumas populações são mais suscetíveis do que outras.

BRCAR: herramienta de soporte en la evaluación del riesgo para cáncer de mama / BRCAR: Support Tools for Risk Evaluation of Breast Cancer

Introducción: El cáncer de mama es el tumor maligno más frecuente en el mundo, en Cuba, es la segunda causa de muerte en mujeres. La insuficiencia en el diagnóstico precoz y la existencia de novedosas estrategias de tratamiento plantean la necesidad de establecer formas eficaces para identificar el riesgo en personas sanas, sin embargo en nuestro país no se cuenta con un método eficaz para predecir el riesgo y direccionar las acciones preventivas y terapéuticas. Objetivo: Crear un estándar nacional orientado a la identificación del cáncer de mama como soporte a la práctica médica y como herramienta de apoyo en la evaluación del riesgo. Método: Se combinaron 28 variables (determinadas por los factores de riesgo de cáncer de mama) a las cuales se les atribuyeron parámetros de ponderación asociados al nivel de incidencia registrado en la literatura médica, utilizando un algoritmo de votación como elemento matemático central. Resultados: Se desarrolló un sistema computarizado para la evaluación del riesgo de cáncer de mama en personas sanas. Conclusiones: BRCAR es una herramienta de soporte para objetivar el riesgo del cáncer de mama, al determinar el impacto de determinados factores de riesgo, con el fin de direccionar los métodos de estudio para la detección precoz(AU)

Introduction: Breast cancer is the most frequent malignant tumour in the world; it is the second cause of women death in Cuba. The insufficiency in early diagnosis and the existence of novel treatment strategies raise the need to establish effective ways to identify risk in healthy people, however in our country there is no effective method to predict risk and direct preventive actions and therapeutic. Objective: To create a national standard aimed at identifying breast cancer as a support to medical practice and support tool in risk assessment. Method: 28 variables (determined by risk factors for breast cancer) were combined; assigning to those variables weighting parameters associated with the level of incidence recorded in the medical literature, using a voting algorithm as the central mathematical element. Results: A computerized system was developed to assess the risk of breast cancer in healthy people. Conclusions: BRCAR is a support tool to objectify the risk of breast cancer, by determining the impact of certain risk factors, in order to direct study methods for early detection(AU)

Validación del método comercial ATB FUNGUS 3 frente al método de referencia M27 - A2, para determinar la susceptibilidad de Candida albicans a diferentes antifúngicos / Validation of the commercial method ATB FUNGUS 3 against the reference method M27-A2, to determine the susceptibility. of Candida albicans to different antifungals

INTRODUCCIÓN: el aumento de la incidencia de las micosis ha generado la necesidad de desarrollar técnicas in vitro para el estudio de la susceptibilidad a los antifùngicos; El documento CLSI M27-A2 es el método de referencia para estudios de sensibilidad en levaduras. No obstante, este no subsana las necesidades de rutina de los laboratorios, principalmente por ser laboriosos; en consecuencia, métodos alternativos surgen ante la necesidad de contar con técnicas más sencillas, una de ellos es el ATB FUNGUS 3 que permite determinar la sensibilidad de Candida frente a diferentes antifùngicos. OBJETIVO: validar el método comercial ATB FUNGUS 3, frente al método de referencia M27-A2, con el fin de conocer su valor diagnóstico. MATERIAL Y MÉTODOS: se determinó la eficacia del método a través de parámetros de test diagnóstico; además, se evaluó la sensibilidad de 50 cepas de Candida albicans frente a Fluconazol (FLZ) e Itraconazol (ITZ) mediante el método comercial y el de referencia. RESULTADOS: se encontró que el ATB - FUNGUS 3 presenta una especificidad para FLZ de 100%, sensibilidad de 91%, valor predictivo positivo (VPP) de 56%, valor predictivo negativo (VPN) de 100%, con una eficacia diagnóstica de 92%, calculados para un intervalo de confianza (IC) de 95%; para ITZ la especificidad y sensibilidad fue de 88 % y 90% respectivamente, con un VPP de 64%, un VPN de 97%, eficacia diagnóstica de 90%, IC 95%. Para las pruebas de concordancia, el índice Kappa para FLZ e ITZ fue de 0,67 y 0,68 respectivamente. La prueba de Likelihood ratio para el FLZ fue (LR+) de 11,25 mientras que el (LR-) fue 0; para el ITZ (LR+) de 9,19 y el (LR-) fue 0,14. Reproducibilidad de 90 % (FLZ) y 85% (ITZ). CONCLUSIONES: el ATB FUNGUS 3, es una técnica rápida, de fácil realización y reproducible; pero el desempeño global de la técnica, sugiere que aún no es confiable para el diagnóstico en laboratorios, debido a los valores bajos obtenidos en los VPP, que indican que se podría derivar en errores al momento de determinar una cepa como sensible o resistente, punto importante al momento de decidir la conducta terapéutica.

INTRODUCTION: the higher incidence of mycoses has generated the need to develop in vitro techniques for susceptibility study to antifungal agents. CLSI M27-A2 is a reference method for yeast susceptibility studies. However, this method does not meet the needs of routine laboratories because it is difficult to follow all the processes. Consequently, alternative methods arise due to the need for simpler techniques. Then, one of them is ATB FUNGUS 3 which allows determining Candida's sensitivity to different antifungal agents. OBJECTIVE: validate the commercial method ATB FUNGUS 3 compared with the reference method M27-A2 in order to know its diagnostic value. MATERIAL AND METHODS: efficacy was determined by diagnostic test parameters. Moreover, sensitivity of 50 strains of Candida albicans at Fluconazole (FLZ) and Itraconazole (ITZ) was evaluated by the commercial and reference methods. RESULTS: ATB - FUNGUS 3 presents a specificity for FLZ of 100%, sensitivity of 91%, positive predictive value (PPV) 56%, negative predictive value (NPV) 100% with a diagnostic efficacy of 92%, calculated for a 95% confidence interval (CI). For ITZ, the specificity and sensitivity were 88% and 90% respectively, with a PPV 64%, a NPV 97% with a diagnostic efficacy of 90%, 95% CI. For the concordance tests, the Kappa index for FLZ and ITZ was 0.67 and 0.68 respectively. The Likelihood ratio test for FLZ was (LR +) of 11.25 while the (LR-) was 0; for ITZ (LR +) of 9.19 and the (LR-) was 0.14. Reproducibility of 90% (FLZ) and 85% (ITZ). CONCLUSIONS: the ATB FUNGUS 3 is a fast, easy and reproducible technique. However, the overall performance of the technique suggests that this method hasn't been reliable for diagnostic laboratory yet, because PPVS obtained low values. These PPVS indicate that it could lead to errors when determining a strain as sensitive or resistant. This is an important point when deciding the therapeutic conduct.

Fungemia por Malassezia sympodialis en una Unidad de Cuidados Intensivos Neonatal de Colombia / Fungemia by malassezia sympodialis in a neonatal intensive care unit in Colombia

Resumen El género Malassezia comprende levaduras lipofílicas, comensales de la piel de humanos y animales, responsables de infecciones dermatológicas y sistémicas, particularmente en recién nacidos pretérmino hospitalizados en Unidades de Cuidados Intensivos Neonatal (UCIN) con catéteres venosos centrales, antibióticos de amplio espectro y nutrición parenteral rica en lípidos. La información acerca de las fungemias por este microorganismo es limitada, sin embargo, la mayoría de infecciones invasivas reportadas en la literatura han sido asociadas con M. furfur y M. pachydermatis. Se reporta un caso de fungemia por M. sympodialis en un recién nacido pretérmino hospitalizado en la UCIN de un hospital colombiano con sospecha clínica de sepsis neonatal, antibioticoterapia de amplio espectro y hemocultivos de rutina negativos. El aislamiento fue susceptible a fluconazol y voriconazol, y resistente a anfotericina B. Existen pocos reportes de fungemia producida por M. sympodialis, pero todos concuerdan en que es una levadura subestimada en individuos con factores predisponentes.

Abstract The genus Malassezia comprises lipophilic yeasts, commensals of the skin of humans and animals, responsible for dermatological and systemic infections, particu larly in preterm infants hospitalized in Neonatal Intensive Care Units (NICU) with central venous catheters, broad-spectrum antibiotics and parenteral nutrition rich in lipids. Information about fungemia by this microorganism is limited, however, the majority of invasive infections reported in the literature have been associated with M. furfur and M. pachydermatis. A case of M. sympodialis fungemia is reported in a preterm newborn hospitalized in the NICU of a Colombian hospital with clinical suspicion of neonatal sepsis, broad-spectrum antibiotic therapy and negative routine blood cultures. The isolation was susceptible to fluconazole and voriconazole, and resistant to amphotericin B. There are few reports of fungemia produced by M. sympodialis, but all agree that it is an underestimated yeast in individuals with predisposing factors.