Hueso nasal como marcador de aneuploidías y resultado perinatal / Nasal bone as a marker of aneuploidies and perinatal outcome

Objetivo: Describir el resultado perinatal de los embarazos en función de la evaluación del hueso nasal como marcador de aneuploidía. Métodos: De 1006 embarazadas, 607 cumplieron con los criterios de inclusión para este estudio prospectivo, descriptivo, correlacional no causal donde se correlacionó la ausencia/presencia de hueso nasal con la presencia de síndrome de Down a través de cariotipo fetal prenatal y/o posnatal, así como examen clínico neonatal. Los datos fueron analizados mediantes frecuencias absolutas, porcentajes, capacidad diagnóstica del hueso nasal (índice de Youden), sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo, valor predictivo negativo y cocientes de probabilidad, positivo y negativo. Resultados: La prevalencia de síndrome de Down fue de 1,48 %, la ausencia del hueso nasal como marcador aislado, obtuvo un índice de Youden de 0,55 (0,23 - 0,88), sensibilidad de 55,56 %, especificidad de 99,50 %, valor predictivo positivo de 62,5 %, valor predictivo negativo de 99,33 %, cocientes de probabilidad positivo (hueso nasal ausente) 111 (IC 95 % 31 - 394) y cocientes de probabilidad negativo (hueso nasal presente) de 0,45 (IC 95 % 0,22 -0,93). Conclusión: La ausencia de hueso nasal en primer trimestre aumenta el riesgo de síndrome de Down en 111 veces y la presencia del mismo lo disminuye, sin valor como prueba diagnóstica sino de pesquisa debe considerarse como un marcador secundario(AU)

Objective: To know the perinatal outcome based on nasal bone evaluation as an aneuploidy marker. Methods: From 1006 pregnant women, 607 met the inclusion criteria for this prospective, descriptive, correlational not causal research correlating nasal bone absence / presence with Down syndrome through prenatal / postnatal fetal karyotype and neonatal clinical examination. Absolute frequencies and percentages, nasal bone performance as a diagnostic test (Youden índex), sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, likelihood ratios positive and negative, were calculated. Results: 1.48 % was the Down syndrome prevalence on the sample. The nasal bone absence as an isolated marker obtained an 0,55 Youden index (0.23 to 0.88 ), sensitivity 55,56%, specificity 99,50%, positive predictive value 62,5%, negative predictive value 99,33%, likelihood ratios positive (absent nasal bone) 111, (95% CI 31-394) and likelihood ratios negative (nasal bone present ) 0,45 (95% CI 0 22 -0.93 ). Conclusion: The nasal bone absence in first trimester increases Down syndrome risk 111 times and nasal bone presence decreases it with poor performance as a diagnostic test, so it should be considered a screening test and a secondary marker. Recommendations correlate these results with other markers to improve detection rates and quantify nasal bone measurements in order to make nasal bone nomograms in first trimester pregnancies(AU)

Determinación de tiempos quirúrgicos estándar de los procedimientos más comunes de cirugía general y su probabilidad de extensión para eficientizar la programación de cirugías / Estimation of the standard surgical times of the most common general surgery procedures and the probability of extending them to make surgery scheduling more efficient

RESUMEN Objetivo: Determinar los tiempos quirúrgicos estándar de los cuatro procedimientos más comunes en cirugía general (hernioplastia inguinal unilateral, hernioplastia inguinal bilateral, hernioplastia umbilical y colecistectomía) de un hospital de segundo nivel y calcular la probabilidad de extensión de cada uno de los procedimientos. La eficiencia es un fenómeno ampliamente estudiado en el ámbito económico, pues hace referencia a la necesidad de menor cantidad de factores para la producción de un determinado nivel de bienes y servicios, por ello, es de vital importancia incluirlo en el ámbito quirúrgico. Materiales y métodos: Estudio observacional, descriptivo y retrospectivo. Se utilizaron los registros de quirófano de un hospital de segundo nivel del año 2017 al 2019 del servicio de Cirugía General. A partir de esta información, se estandarizó el tiempo necesario para cada procedimiento mediante la media de cada uno (hernioplastia umbilical, hernioplastia inguinal unilateral o bilateral y colecistectomía). Se calculó la probabilidad de extensión de las cirugías tomando en consideración los datos obtenidos y el intervalo de confianza. Resultados: Para el procedimiento de hernioplastia inguinal unilateral se obtuvo una media de 76 min (IC 95,00 %: 72-80 min, DE 23); en hernioplastia inguinal bilateral, una media de 104,38 min (IC 95,00 %: 91-116 min, DE 41,7); en hernioplastia umbilical, una media de 59,31 min (IC 95,00 %: 54-63 min, DE 29,9), y en colecistectomía, una media de 85,735 min (IC 95,00 %: 83-88 min). La probabilidad de que se programen tres cirugías y todas estén a tiempo (límite superior del IC) es de 92,69 %, la probabilidad de que se programen tres cirugías y todas se prolonguen es de 0,0016 % (límite inferior del IC). Conclusiones: Es posible realizar la planeación de las cirugías programadas mediante el uso de tiempos quirúrgicos estandarizados. Se requiere contar con estadística actualizada de los procedimientos quirúrgicos (promedios del tiempo de realización de cada procedimiento), ya que es posible detectar y supervisar de manera más precisa la dinámica de quirófano mediante la detección de las áreas de oportunidad, de esta manera, se eficientizará el tiempo de quirófano para beneficio de los sistemas de salud y los pacientes.

ABSTRACT Objective: To determine the standard surgical times of the four most common general surgery procedures (unilateral inguinal hernioplasty, bilateral inguinal hernioplasty, umbilical hernioplasty and cholecystectomy) in a second-level hospital and to estimate the probability of extending the time of each of the procedures. Efficiency is a widely studied subject in economics. It involves the need for fewer elements in the production of a certain level of goods and services. Therefore, it is extremely important to consider it in the field of surgery. Materials and methods: An observational, descriptive and retrospective study. It used the operating room records from 2017 to 2019 of the General Surgery service in a second-level hospital. Based on this information, the time required for each procedure was standardized using the mean for each one (umbilical hernioplasty, unilateral or bilateral inguinal hernioplasty and cholecystectomy). The probability of extending surgical times was estimated based on the obtained data and confidence interval. Results: The mean for unilateral inguinal hernioplasty was 76 min (95.00 % CI: 72-80 min, SD 23), for bilateral inguinal hernioplasty 104.38 min (95.00 % CI: 91-116 min, SD 41.7), for umbilical hernioplasty 59.31 min (95.00 % CI: 54-63 min, SD 29.99) and for cholecystectomy 85.735 min (95.00 % CI: 83-88 min). The probability of scheduling three surgical interventions and completing all of them on time (upper limit of the CI) is 92.69 %, and the probability of scheduling three surgical interventions and extending the time of all of them is 0.0016 % (lower limit of the CI). Conclusions: Planning scheduled operations using standardized surgical times is feasible. Updated statistics on surgical procedures (average time for each procedure) are required since it is possible to more accurately detect and supervise operating room dynamics by identifying opportunity areas. This will make operating room time more efficient for the benefit of health care systems and patients.

Nota epidemiológica: razón de ODDS (OR) / Epidemiologic note: ODDS ratio (OR)

Introducción: el Odds Ratio es una medida de efecto para la cual existen diversas traducciones al español. En este documento lo denominaremos OR (Razón de Odds). Es una medida que a través de la historia ha contribuido a establecer asociaciones relevantes para la salud pública. Objetivo: realizar una nota epidemiológica donde se presentan los principales aspectos teórico práctico de la razón de Odds. Metodología: búsquedas en las bases de datos biomédica (Pubmed, Cochrane Library, LILACS), metabuscadores (Google) y a través de la estrategia en bola de nieve y referencias claves. Esta nota metodológica contiene introducción, escenario clínico, desarrollo de concepto, ejemplos, discusión y conclusiones. Resultados: un Odds es el cociente entre la probabilidad de ocurrencia de un evento (p) sobre la probabilidad de que dicho evento no ocurra (1-p). El OR o razón de Odds, es un cociente entre dos Odds. Es una medida del efecto que permite a los investigadores plantear posibles asociaciones entre una exposición y un desenlace. Conclusiones: el OR puede determinarse en diferentes tipos de diseños y por medio del análisis estratificado (método Mantel-Haenszel) y el multivariado utilizando regresión logística, controla variables de confusión.

Introduction: The Odds ratio (OR) is a measure of effect, which has many Spanish equivalents. The term Razón de Odds will be used in this document to designate OR. Throughout history OR has contributed to establish associations in public health. Objective: to conduct an epidemiologic note presenting the main theoretical and practical aspects of Odds ratio. Methodology: a search was conducted in the Pubmed, Cochrane Library and LILACS biomedical databases, Google meta-searchers and through the snowball key references strategy. This methodologic note includes an introduction, clinical scenario, concept development, examples, discussion and conclusions. Results: an Odds is the quotient between the probability of occurrence of an event (p) over the probability of absence of said event (1-p), OR (Odds ratio), is the quotient between two Odds. It is a measure of effect which allows researchers to identify how strongly an exposure is associated with an outcome. Conclusions: OR may be determined using different types of study designs and by means of a stratified analysis (Mantel-Haenszel method) and the multivariate method by logistic regression and control for confounding variables.

Estimación de factores de riesgo del retardo en la cicatrización en pacientes quemados / Estimation of Risk Factors for Delayed Healing in Burn Patients

Introducción: La atención al paciente con retardo en la cicatrización parte de la optimización en sus cuidados. La reversión del cuadro requiere del conocimiento de los factores de riesgo. La literatura nacional e internacional describen factores locales o relacionados con la herida y generales o relacionados al estado general del paciente. Objetivo: Estimar los factores de riesgo del retardo en la cicatrización en pacientes quemados. Métodos: Estudio analítico de casos y control en pacientes quemados ingresados en el Servicio de Caumatología del Hospital Universitario Manuel Ascunce Domenech en el período 2017 a 2021. La población objeto de estudio comprendió a 267 pacientes. Se calculó el odds ratio y el intervalo de confianza. Resultados: El desarrollo de retardo en la cicatrización resultó tres veces y media más probable en pacientes quemados con 45 años y más, odds ratio 3,591. Además, fue nueve veces más probable en enfermedades crónicas asociadas, hasta seis veces en quemaduras no accidentales, 163 veces en la complicación local y 89 veces en la complicación sistémica. Conclusiones: Los factores de riesgo del retardo en la cicatrización en pacientes quemados identificados fueron los siguientes: edad de 45 años y más, presencia de comorbilidad, el fuego directo como agente causal, el modo de producción no accidental, la presencia de más de seis zonas anatómicas afectadas, la quemadura hipodérmica, la quemadura de 20 porciento de superficie corporal quemada y más de extensión, el apoyo de la lesión, el índice cubano de pronóstico con riesgo vital, la complicación local y la complicación sistémica(AU)

Introduction: The care for the patient with delayed healing starts from the optimization of their care. Reversing such condition requires knowledge of the risk factors. The national and international literature describes local factors related to the injury and general factors related to the patient's general condition. Objective: To estimate the risk factors for delayed healing in burn patients. Methods: An analytical case-control study was carried out with burn patients admitted to the caumatology service at Hospital Universitario Manuel Ascunce Domenech in the period from 2017 to 2021. The study population consisted of 267 patients. Odds ratio and confidence interval were calculated. Results: The development of delayed healing was three and a half times more likely in burn patients aged 45 years or over (odds ratio: 3.591). In addition, it was nine times more likely for associated chronic diseases, up to six times in nonaccidental burns, 163 times in local complications, and 89 times in systemic complications. Conclusions: The identified risk factors for delayed healing in burn patients were the following: age 45 years or over, presence of comorbidity, direct fire as causative agent, nonaccidental way of production, presence of more than six affected anatomical areas, hypodermic burn, burn extension of 20 percent or over on the burned body surface, injury contact pressure, the Cuban index of prognostic vital risk, as well as the local or the systemic complications(AU)

Predicción fisicomatemática de la dinámica semestral de la malaria en Antioquia, Colombia / Physico-mathematical prediction of the biannual dynamics of malaria in Antioquia, Colombia

Introducción: La malaria es una enfermedad endémica en Colombia, cuyas características biológicas, fisiopatológicas y el impacto socioeconómico que genera la han posicionado como una enfermedad de interés en salud pública. Objetivo: Predecir el número de casos notificados de malaria para el segundo semestre del año 2020 en el departamento de Antioquia, a través de la aplicación de la teoría de la probabilidad y la caminata al azar. Métodos: Se realizó un estudio observacional longitudinal retrospectivo. Se analizó la dinámica geométrica del comportamiento semestral de la epidemia de malaria en el departamento de Antioquia durante los años 2008-2020 con los datos del Sistema Nacional de Vigilancia en Salud Pública, como una caminata al azar probabilística. En relación con los aumentos y disminuciones consecutivas semestrales, se determinó el número de infectados más probable para el segundo semestre del año 2020. Resultados: El valor de la predicción fue de 3433. Al ser comparado con los valores reportados por el Sistema Nacional de Vigilancia en Salud Pública, se obtuvo un porcentaje de acierto del 95,4 %. Conclusiones: Al predecir con alta precisión el número de infectados para el segundo semestre del año 2020 en el departamento de Antioquia, se evidencia la potencialidad de la metodología para implementarse como una herramienta de vigilancia en salud pública y como un medio que sirva para apoyar la toma de decisiones en materia de políticas públicas.

Introduction: Malaria is an endemic disease in Colombia. Due to its biological and pathophysiological characteristics and socioeconomic impact, it is positioned as a disease of public health interest. Objective: To predict the number of reported cases of malaria for the second semester of 2020 in Antioquia department using the theory of probability and probabilistic random walk. Methods: A retrospective, longitudinal, observational study was conducted. The geometric dynamics of the biannual development of malaria epidemic in Antioquia department from 2008 to 2020 was analyzed using the data from the National Surveillance System in Public Health as a probabilistic random walk. Regarding the consecutive biannual reductions and increments, the most probable number of infected individuals was determined for the second semester of 2020. Results: The predictive value was 3433. When it was compared to the values reported by the National Surveillance System in Public Health, a 95.4% accuracy rate was obtained. Conclusions: By predicting with high accuracy the number of infected individuals for the second semester of 2020 in Antioquia department, it is evident the methodology potential as a public health surveillance tool and as a means to support public policy decision making.

Analysis of antepartum cardiotocography based on S/k proportions and probability in 20 minutes / Análisis de la cardiotocografía anteparto mediante las relaciones S/k y la probabilidad en 20 minutos

Abstract Objectives: although mortality and perinatal asphyxia in newborns have been considerably reduced, there are still deficiencies in screening and diagnosis methods for intrapartum fetal well being that aim to detect its early alterations. Therefore, the purpose of this research was to apply a methodology based on probability and entropy and confirm its capacity to detect normal and abnormal fetal cardiac dynamics from 20-minute cardiotocographic tracings. Methods: 80 cardiotocographic tracings of pregnant women in the last trimester were collected, of which the minimum and maximum fetal heart rate were evaluated every 10 seconds, as well as its repetitions along with their probability and the diagnostic S/k ratio. Finally, the statistical analysis was carried out to establish the diagnostic capacity of the method concerning the clinical evaluation and interpretation of the cardiotocographic tracing, taken as the Gold Standard. Results: it was confirmed that S/k ratio values differentiated normal from abnormal fetal cardiac dynamics with sensitivity and specificity values of 100% and a Kappa coefficient of 1. Conclusion: the applicability of a diagnostic mathematical method of cardiotocography was confirmed, which suggests its implementation in the clinical context to detect alterations in fetal well-being in 20 minutes.

Resumo Objetivos: aunque se ha logrado reducir considerablemente la mortalidad y asfixia perinatal en neonatos, aún hay deficiencias en los métodos de tamizaje y diagnóstico del bienestar fetal intraparto que detecten sus alteraciones tempranas. Por lo anterior, el propósito de esta investigación fue aplicar una metodología basada en la probabilidad y la entropía y confirmar su capacidad para diagnosticar la dinámica cardíaca fetal normal de la anormal a partir de trazados cardiotocográficos de 20 minutos. Métodos: se recolectaron 80 trazados cardiotocográficos de gestantes en el último trimestre, de los cuales se evaluaron frecuencia cardíaca fetal mínima y máxima cada 10 segundos al igual que sus repeticiones, su probabilidad y la proporción S/k diagnóstica. Finalmente, se realizó un análisis estadístico para establecer la capacidad diagnóstica del método con respecto a la interpretación el trazado cardiotocográfico y la evaluación clínica, tomadas como Gold Standard. Resultados: se confirmó que los valores de la proporción S/k diferenciaron las dinámicas cardíacas fetales normales de las anormales con valores de sensibilidad y especificidad del 100% y un coeficiente Kappa de 1. Conclusión: se confirmó la aplicabilidad de un método matemático diagnóstico de la cardiotocografía, lo cual sugiere que su implementación en la clínica para detectar alteraciones del bienestar fetal en 20 minutos.

Predictive methodology of the dynamics of the number of COVID-19 cases: application to China, Belgium, and South Korea / Metodología predictiva de la dinámica del número de casos de COVID-19: aplicación a China, Bélgica y Corea del Sur

Abstract Objectives: Multiple methodologies based on probability theory have been developed to establish predictions of dengue, malaria, HIV, obesity epidemics, among others. This research aimed to develop a new method for predicting the dynamics of the number of COVID-19 cases for China, Belgium, and South Korea based on the probability theory that allows the evaluation and comparison of their increment. Material and methods: Probability ranges of the number of COVID-19 cases were established, which were assigned to each of the daily number of COVID-19 cases reported by China, Belgium, and South Korea that were evaluated during 74, 50, and 50 days respectively. The frequency and probability of each daily range for each country was calculated. Their total probability and the probability of the dynamics in intervals of 8 consecutive days were calculated, and the values between countries were compared to evaluate their differences. Results: Probability values of 1.21E-30, 2.03E-22, and 3.15E-12 were established for China, Belgium, and South Korea, which allows the quantitative differentiation of the characteristics of their dynamics. The probability differences of the 8-day subspaces ranged from 0.003 to 1, allowing the temporal changes in the dynamics to be evaluated. Conclusion: The ranges established for the evaluation of the number of COVID-19 cases allow to differentiate the behavior of epidemics between countries and to stratify the severity of expansion. Highlighting an underlying mathematical order for this phenomenon permitted quantitatively predict its spatiotemporal dynamic and indirectly, the efficacy of public health politics implemented for each country.

Resumen Objetivos: Se han desarrollado múltiples metodologías basadas en la teoría de la probabilidad para establecer predicciones de epidemias de dengue, malaria, VIH, obesidad, entre otras. Esta investigación tuvo como objetivo desarrollar un nuevo método de predicción de la dinámica del número de casos de COVID-19 para China, Bélgica y Corea del Sur, basado en la teoría de la probabilidad que permite evaluar y comparar su crecimiento. Materiales y métodos: Se establecieron rangos de probabilidad del número de casos de COVID-19, los cuales fueron asignados a cada uno de los valores diarios del número de casos de COVID-19 reportados por China Bélgica y Corea del Sur evaluados durante 74, 50 y 50 días, respectivamente. Se calculó la frecuencia y probabilidad de cada rango diario para cada país. Se calculó su probabilidad total y la probabilidad de la dinámica en intervalos de 8 días consecutivos y se compararon los valores entre países para evaluar sus diferencias. Resultados: se establecieron valores de probabilidad de 1.21E-30, 2.03E-22 y 3.15E-12 para China, Bélgica y Corea del Sur, lo que permite diferenciar cuantitativamente las características de su dinámica. Las diferencias de probabilidad de los subespacios de 8 días variaron de 0,003 a 1, lo que permitió evaluar los cambios temporales en la dinámica. Conclusión: los rangos establecidos para la evaluación del número de casos de COVID-19 permiten diferenciar el comportamiento de las epidemias entre países y estratificar la severidad de la expansión, destacando un orden matemático subyacente para este fenómeno que permite predecir cuantitativamente su dinámica espacio-temporal y indirectamente, la eficacia de las políticas de salud pública implementadas para cada país.

Estrategia de predicción pacientes con casos de coronavirus; reporte de experiencia Pereira, Risaralda, marzo-abril 2020 / Prediction strategy for patients with coronavirus cases; experience report Pereira, Risaralda, March- April 2020

Resumen Introducción: la infección por COVID 19 corresponde actualmente al evento infeccioso con mayor impacto en salud púbica a nivel mundial, en Colombia, al 30 de abril de 2020 se registraron 6465 casos acumulados, 360 defunciones y 2186 casos recuperados, dado el aumento en los casos reportados mediante los sistemas de vigilancia epidemiológica se precisa de herramientas que faciliten el diagnóstico oportuno y la predicción en el comportamiento de los casos a nivel nacional. Objetivos: proponer un modelo estadístico que permita predecir la probabilidad de cursar con diagnóstico de COVID-19 en la población atendida por sospecha de infección por el mismo en una institución de tercer nivel del municipio de Pereira- Risaralda entre marzo y abril de 2020. Materiales y métodos: se presenta un estudio descriptivo de corte trasversal en el cual se analizaron 82 casos, se realizó un modelo predictivo basado en compuertas lógicas AND y OR, y análisis por estadística descriptiva e inferencial. Resultados: de los 82 registros analizados se encontró una relación hombre: mujer de 1:2; el 6% de los pacientes tuvo alta probabilidad para diagnóstico de COVID 19, el 20% tuvo probabilidad intermedia y el 72% registró baja probabilidad para COVID19, la concordancia del modelo con los resultados de las pruebas fue inferior a 0,5. Conclusiones: el modelo estadístico planteado fue insuficiente para lograr la predicción de la totalidad de los casos de COVID-19 basados en el perfil de riego de la población, se precisan nuevas investigaciones con tamaños de muestra superiores, diseños y análisis distintos. MÉD.UIS.2022;35(1): 57-69.

Abstract Introduction: COVID 19 infection currently corresponds to the infectious event with the greatest impact on public health worldwide, in Colombia, as of April 30, 2020, 6465 accumulated cases, 360 deaths and 2186 recovered cases were registered, given the increase in cases reported through epidemiological surveillance systems, tools are needed to facilitate timely diagnosis and prediction in the behavior of cases at the national level. Objectives: to propose a statistical model that allows predicting the probability of a diagnosis of COVID-19 in the population treated for suspected coronavirus infection in a third-level institution in the population of Pereira-Risaralda between March and April 2020. Materials and methods: a descriptive cross-sectional study is presented, in which 82 cases were analyzed, a predictive model based on AND and OR logic gates, analyzes by descriptive and inferential statistics were performed. Results: of the 82 records analyzed, a male: female ratio of 1: 2 was found; 6% of the patients had a high probability for the diagnosis of COVID 19, 20% had an intermediate probability and 72% had a low probability for COVID19, the agreement of the model with the test results was less than 0.5. Conclusions: the proposed statistical model was insufficient to achieve the prediction of all the cases of COVID-19 based on the irrigation profile of the population. New investigations are required with larger sample sizes associated with longitudinal designs and combined statistical analyzes that allow to refine the proposed model. MÉD.UIS.2022;35(1): 57-69.

Factores que afectan la suficiencia e interpretación de la citología de cuello uterino / Factors affecting cervical cytological sample adequacy and interpretation

Objetivo: evaluar los factores que afectan la suficiencia e interpretación de la citología de cuello uterino. Materiales y métodos: estudio transversal y retrospectivo en el Hospital Central "Dr. Urquinaona", Maracaibo, Venezuela con la revisión de las historias clínicas e informes de las citologías de cuello uterino de la consulta de ginecología y obstetricia de enero a diciembre 2019. Se analizan las características generales y la clasificación de los informes (satisfactorios para la evaluación, satisfactorios pero limitados por y no satisfactorios). Resultados: se seleccionaron 581 informes de los cuales 329 (56,6%) eran muestras satisfactorias, 233 (40,1%) satisfactorias pero limitadas y 19 (3,3%) insatisfactorios. El análisis univariante demostró que la muestra insatisfactoria, la presencia síntomas al momento de la toma y el tipo de método anticonceptivo fueron factores que se asociaron significativamente (p < 0,0001). Los que influyeron para un resultado anormal de la citología cervical fueron frotis satisfactorio (razón de probabilidad, 4,78; intervalo de confianza del 95%, 3,127-8,136) y presencia de síntomas (razón de probabilidad, 11,652; intervalo de confianza del 95%, 2,992-38,55). Esta asociación continuó siendo significativa luego de ajustarlos a los factores de edad, paridad, edad al momento de la toma de la primera citología y método de anticoncepción (p < 0,0001). Conclusión: la suficiencia de la muestra de citología es un factor importante para la detección de anomalías celulares de cuello uterino y evitar resultados falsos negativos, retrasando la detección del cáncer.

Objective: to evaluate factors that affect cervical cytological sample adequacy and interpretation. Materials and methods: a retrospective cross-sectional study conducted at Hospital Central "Dr. Urquinaona", Maracaibo, Venezuela by a review of the gynecology and obstetrics outpatient clinic medical records and cervical smear reports from January to December 2019. The general characteristics and classification of the reports (as, satisfactory, satisfactory but limited by and not satisfactory for cytological evaluation), were analyzed. Results: out of 581 reports selected, 329 (56.6%) were satisfactory, 233 (40.1%) satisfactory but limited and 19 (3.3%) not satisfactory. A univariate analysis showed that not satisfactory samples, presence of symptoms at the time of collection and type of contraceptive method were significantly associated factors (p < 0.0001). Those influencing an abnormal result were satisfactory smears (odds ratio, 4.78; confidence interval 95%, 3.127-8.136) and the presence of symptoms (odds ratio, 11.652; confidence interval 95%, 2.992-38.55). This association remained significant after considering other variables such as age, parity, age at first Pap smear and contraceptive method (p < 0.0001). Conclusion: cytological sample adequacy is an important factor for identifying cell abnormalities and avoiding false negative results which delay cancer detection.

Predicción de la prevalencia de la enfermedad periodontal en la población colombiana en el contexto de la caminata al azar probabilista / Prediction Of The Prevalence Of Periodontal Disease In The Colombian Population In The Context Of Probabilistic Random Walking

Introducción: La enfermedad periodontal es un problema de salud pública que requiere de un seguimiento en el tiempo que permita la implementación de planes de salud apropiados. Objetivo: Establecer el comportamiento de la dinámica de la enfermedad periodontal a través de la caminata al azar probabilista mediante la simulación de los valores de la prevalencia de la enfermedad periodontal en Colombia. Métodos: Se tomaron los valores disponibles y reportados por el Estudio Nacional de Salud Bucal II al IV de la prevalencia de la enfermedad periodontal, y a partir de estos se realizaron tres simulaciones de este comportamiento, para hacer predicciones de los valores de la prevalencia para los años 1998 y 2014 mediante la caminata al azar probabilista. Adicionalmente, se realizaron tres simulaciones predictivas para la dinámica de la prevalencia hasta el año 2030, para establecer el comportamiento teórico que esta variable pueda seguir. Resultados: Las tres simulaciones teóricas permitieron hacer predicciones del índice de prevalencia para el año 1998 y 2014 con un porcentaje de acierto cercano al 100 por ciento. Adicionalmente se observó que el evento más probable es que se presente un aumento en índice de prevalencia para el año 2030 respecto al valor obtenido para el 2014. Conclusiones: Es posible realizar predicciones del comportamiento de la dinámica de la enfermedad periodontal que permitan evaluar los planes de acción en salud orientados a disminuir la prevalencia de las enfermedades periodontales(AU)

Introduction: Periodontal disease is a public health problem which requires follow-up over time that allows the implementation of appropriate health plans. Objective: Establish the behavior of the dynamics of periodontal disease through probabilistic random walking by simulating the values of periodontal disease prevalence in Colombia. Methods: The values available and reported by the National Oral Health Study II to IV on periodontal disease prevalence were taken, and from these, three simulations of this behavior were carried out to make predictions of the prevalence values for the years 1998 and 2014 through probabilistic random walking. Additionally, three predictive simulations were performed for the dynamics of prevalence until 2030 to establish the theoretical behavior that this variable can follow. Results: The three theoretical simulations allowed to make predictions of the prevalence rate for the years 1998 and 2014 with a percentage of success close to 100 percent. Additionally, it was observed that the most likely event is that there will be an increase in the prevalence rate by 2030 compared to the value obtained by 2014. Conclusions: It is possible to make predictions of the periodontal disease's dynamics behavior that allow evaluating health action plans aimed at reducing the prevalence of periodontal diseases(AU)

Regla de predicción para determinar infestación canina por Echinococcus granulosus / Prediction rule to determine canine infestation by Echinococcus granulosus

Nuestro objetivo fue determinar un score que ayude a predecir la probabilidad de infestación canina por Echinococcus en una zona endémica en hidatidosis. Se realizó un estudio longitudinal en 3 anexos de la provincia de Concepción ubicado en los andes centrales de Perú. La infección canina por Echinococcus granulosus fue definido por la presencia de antígeno identificado en la muestra de heces. El modelo predictivo se obtuvo mediante un análisis de regresión logística basado en los parámetros sociodemográficos, esta regla fue internamente validada por remuestreo de tipo bootstrap. Resultados: De 152 canes que se sometieron al estudio de heces, 76 tuvieron infección por Echinococcus confirmada por antígeno reactivo. Se identificaron 4 factores ponderados dentro de la regla de predicción que, en suma, dieron el puntaje: El can que duerme fuera de casa (3 puntos), alimentar con vísceras crudas al can (3 puntos) y sacrificar al ganado dentro de la casa (2 puntos) y el can se alimenta con croquetas (-2 puntos). Se encontró que esta regla de predicción tuvo valor del área bajo la curva ROC 0,78; (IC 95%: 0,70 ­ 0,86). Estos parámetros de predicción con un puntaje ≥ 3 tenía una sensibilidad del 75% y especificidad del 65,8%, con un valor predictivo positivo del 85,3%. Esta regla ayudará al personal de la salud a identificar a los canes infestados por Echinococcus granulosus, para su intervención anti parasitaria y preventiva en sus dueños(AU)

Cystic hydatidosis is an endemic disease in Andean regions, our objective was to determine a score that helps to predict canine Echinococcus infestation in an endemic area with hydatidosis. A longitudinal study was carried out in 3 annexes of the province of Concepción located in the central Andes of Peru. Canine echinococcosis infection was defined by the presence of E. granulosus antigen identified in the stool sample. The predictive model was obtained through a logistic regression analysis based on the sociodemographic parameters, this rule was internally validated by bootstrap type resampling. Results: Of 152 dogs that underwent the stool study, 76 had an Echinococcus infection confirmed by reactive antigen. Four weighted factors were identified within the prediction rule that, in sum, gave the score: The dog that sleeps outside the home (3 points), feeding raw viscera to the dog (3 points), slaughtering the cattle inside the house (2 points) and the dog is fed with croquettes (-2 points). This prediction rule was found to have a value of the area under the ROC curve 0.78 (95% CI: 0.70 - 0.86). At a cutoff point of ≥ 3 points, the prediction rule was found to have a sensitivity of 75% and a specificity of 65.8%, with a positive predictive value of 85.3%. This rule will help health personnel to identify canes infested by Echinococcus granulosus, for their anti-parasitic and preventive intervention in their owners(AU)

Pertinencia de la solicitud del dímero D en pacientes de un servicio de urgencias / Pertinence of D-dimer request in patients in emergency services / Relevância da solicitação de D-dímero em pacientes de um setor de emergência

Introducción. El tromboembolismo pulmonar y la trombosis venosa profunda son urgencias cardiovasculares relativamente comunes, se han descrito diferentes predictores clínicos para la estratificación del riesgo, biomarcadores séricos y pruebas de imagenología. Dentro de los biomarcadores séricos se ha descrito el dímero D. Debido a que la enfermedad tromboembólica venosa es un reto diagnóstico para el clínico, el objetivo del presente estudio fue evaluar la pertinencia de la solicitud del dímero D, en el servicio de urgencias de un centro de tercer nivel en la ciudad de Bogotá durante los años 2018-2019. Metodología. Estudio observacional, descriptivo y transversal retrospectivo de pacientes que consultaron al servicio de urgencias, de una clínica de tercer nivel, de la ciudad de Bogotá, durante el periodo 2018-2019. Resultados. Se revisaron 583 historias clínicas, se excluyeron 107 pacientes, con un total final de 474 (57.3% mujeres y 42.6% hombres). De estos, 21 pacientes presentaron estudios positivos (angiotomografía y Doppler venoso). El dímero D presentó un valor predictivo negativo inferior al 50%. Discusión. A pesar de los resultados y de ser un estudio de un solo centro se evidencian las dificultades que tienen los médicos de los servicios de urgencias al momento de solicitar pruebas diagnósticas. Conclusiones. Este estudio evidencia la dificultad que existe en los servicios de urgencias al momento de la evaluación diagnóstica y cómo la solicitud de los paraclínicos tiene que ser un proceso estandarizado, guiado por los motivos de consulta y hallazgos al examen físico, y así no perder las características operativas de las pruebas diagnósticas y su utilidad al momento de la evaluación clínica.

Introduction. Pulmonary thromboembolisms and deep vein thromboses are relatively common cardiovascular emergencies. Various clinical predictors, serial biomarkers and imaging tests have been described for the stratification of the risk. D-dimer has been described within the serial biomarkers. Since venous thromboembolic disease is a diagnostic challenge for doctors, the objective of this study was to assess the pertinence of the D-dimer request in emergency services in a level three center in Bogotá during 2018-2019. Methodology. An observational, descriptive and cross-sectional retrospective study of patients who resorted to emergency services in a level three clinic in Bogotá during 2018-2019. Results. 583 medical records were reviewed, and 107 patients were excluded, with a final total of 474 patients (57.3% women and 42.6% men). Of these, 21 patients had positive studies (angiotomography and venous doppler ultrasound). D-dimer had a negative predictive value of less than 50%. Discussion. Despite the results and it being a study in a single clinic, the difficulties emergency service doctors experience when requesting diagnostic tests can be observed. Conclusions. This study shows the difficulties in emergency services when performing a diagnosis. The request for complementary tests has to be a standardized process guided by the reasons for the consultation and findings from the physical exam, in order not to lose the operational characteristics of the diagnostic tests and their usefulness during the clinical evaluation.

Introdução. Tromboembolismo pulmonar e trombose venosa profunda são emergências cardiovasculares relativamente comuns. Têm sido descritos diferentes preditores clínicos para estratificação de risco, biomarcadores séricos e testes de imagem. Entre os biomarcadores séricos, foi descrito o D-dímero. Considerando que a doença tromboembólica venosa é um desafio diagnóstico para o clínico, o objetivo deste estudo foi avaliar a relevância da solicitação de D-dímero no serviço de emergência de um centro de terceiro nível na cidade de Bogotá ao longo dos anos 2018-2019. Metodologia. Estudo observacional, descritivo e transversal retrospectivo de pacientes que consultaram o serviço de emergência de uma clínica de terceiro nível na cidade de Bogotá, no período de 2018-2019. Resultados. Foram revisados 583 prontuários, excluídos 107 pacientes, totalizando 474 (57.3% mulheres e 42.6% homens). Destes, 21 pacientes apresentaram estudos positivos (angiotomografia e Doppler venoso). D-dímero apresentou valor preditivo negativo inferior a 50%. Discussão. Apesar dos resultados e do fato de se tratar de um estudo só de um centro, são evidentes as dificuldades que os médicos de emergência apresentam ao solicitarem exames diagnósticos. Conclusões. Este estudo mostra a dificuldade que existe nos serviços de emergência no momento da avaliação diagnóstica e como a solicitação dos testes paraclínicos tem que ser um processo padronizado, orientado pelos motivos da consulta e pelos resultados do exame físico, e assim não perder as características operacionais dos exames diagnósticos e sua utilidade no momento da avaliação clínica.

Tasas de letalidad y factores de riesgo por COVID-19 en México / Case fatality rates and risk factors by COVID-19 in Mexico

Introducción: La COVID-19 es una enfermedad viral diseminada a nivel mundial, que es considerada una pandemia con alta tasa de mortalidad, cuyo estudio epidemiológico es fundamental para entender el riesgo asociado a poblaciones específicas. Objetivos: Estimar las tasas de letalidad y factores de riesgo asociados a mortalidad por COVID-19 en cinco Estados con más contagios en México. Métodos: Se analizaron de 297 230 pacientes positivos a COVID-19 mediante prueba de RT-PCR procedentes de 475 unidades de monitoreo en cinco Estados de México. Se estimaron tasas de letalidad y razones de probabilidad mediante el ajuste de un modelo de regresión logística multivariada. Se consideraron los factores de riesgo en un modelo que incluyó los efectos del sexo, edad, hábitos de fumador, historial de hospitalización, diagnóstico de neumonía y comorbilidades como diabetes, hipertensión, enfermedad pulmonar obstructiva crónica, asma, inmunodepresión, enfermedad renal crónica y enfermedades cardiovasculares, entre otras. Resultados: Existe mayor contagio entre las personas de 41 a 60 años de edad. Más del 90 por ciento de los fallecimientos ocurrieron después de los 41 años, con aumento de la tasa de letalidad a mayor edad. Los hombres mostraron mayor proporción de casos, fallecimientos y tasa de letalidad. El análisis logístico multivariado mostró que la edad, sexo, hospitalización, neumonía, diabetes y enfermedad renal crónica son factores de riesgo significativos (p < 0,0001) para mortalidad por COVID-19. Conclusiones: En México la edad, el sexo, la hospitalización, neumonía, diabetes y enfermedad renal crónica son factores que aumentan el riesgo de mortalidad por COVID-19. Se sugiere tener en cuenta esta información para determinar los grupos vulnerables e incrementar la atención sobre ellos para disminuir, en la medida de lo posible, el riesgo de contagio y mortalidad(AU)

Introduction: COVID-19 is a viral disease disseminated worldwide, considered a pandemic with a high mortality rate, whose epidemiological study is fundamental to understand the risk associated with specific populations. Objectives: Estimate the case fatality rates and risk factors associated with mortality from COVID-19 in the five states with more infections in Mexico. Methods: 297,230 COVID-19 positive patients were analyzed using RT-PCR tests from 475 monitoring units in five states of Mexico. Case fatality rates and probability ratios were estimated by adjusting a multivariate logistic regression model. Risk factors were considered in a model that included the effects of sex, age, smoking habits, hospitalization history, pneumonia diagnosis, and comorbidities such as diabetes, hypertension, chronic obstructive pulmonary disease, asthma, immunosuppression, chronic kidney disease, and cardiovascular disease, among others. Results: There is greater contagion among people aged 41 to 60 years. More than 90percent of deaths occurred after the age of 41, with the case fatality rate increasing at an older age. Men showed a higher proportion of cases, deaths and case fatality rate. Multivariate logistic analysis showed that age, sex, hospitalization, pneumonia, diabetes, and chronic kidney disease are significant risk factors (p < 0.0001) for COVID-19 mortality. Conclusions: In Mexico, age, sex, hospitalization, pneumonia, diabetes and chronic kidney disease are factors that increase the risk of mortality from COVID-19. It is suggested to take this information into account to determine vulnerable groups and increase attention to them to reduce, as far as possible, the risk of contagion and mortality(AU)

Precisión del método de Moyers para predecir tamaño de dientes no erupcionados. Municipio Centro Habana. 2020 / Accuracy of the Moyers method to predict size of non-erupted teeth. Centro Habana Municipality. 2020

Introducción: El método de Moyers se utiliza en Cuba para predecir el tamaño de caninos y bicúspides no erupcionados. Objetivo: Determinar la precisión del método de Moyers para predecir tamaño de dientes no erupcionados en pacientes de Centro Habana. Material y métodos: Investigación de desarrollo en el Policlínico Luis Galván Soca de marzo 2019 a mayo de 2020. Universo formado por individuos de 12 a 24 años. Muestra de 100 personas seleccionadas por muestreo aleatorio simple. Se analizó la tabla de Moyers por sexos para todos los percentiles. Resultados: En el sexo femenino para la arcada superior e inferior el error cuadrático medio menor correspondió al percentil 50: 0,476 y 0,464 respectivamente; único donde las diferencias entre el valor estimado y el real no fueron significativas. Por tanto, el percentil elegible para féminas en ambas arcadas sería el 50 por ciento. En masculinos para la arcada superior el error cuadrático medio menor (0,576) para el percentil 65 con diferencias entre el valor estimado y el real no significativas(p=0,269); mientras en la arcada inferior fue de 0,592 para el percentil 75. Por tanto, el percentil elegible para hombres en la arcada superior fue el 65 y en la inferior el 75; la fuerza de esta correspondencia es intensa para ambas arcadas. Conclusiones: En la población que se estudia el método de Moyers, para predecir el tamaño de dientes no erupcionados es preciso en el sexo femenino, pero no en el masculino(AU)

Introduction: In Cuba, the Moyers method is used to predict the size of non-erupted canines and bicuspids. Objective: To determine the precision of the Moyers method to predict the size of non-erupted teeth in patients from Centro Habana municipality. Material and Methods: A development research was conducted in Luis Galván Soca Polyclinic from March 2019 to May 2020. The universe consisted of individuals aged 12-24 years. The sample was composed of 100 people who were selected by simple random sampling. Moyers table was analyzed by sex for all percentiles. Results: In the female sex, the lower mean square error for the upper and lower arches corresponded to the 50th percentile: 0.476 and 0.464 respectively, the only one in which the difference between the estimated and the real values was not significant. Therefore, for females, the eligible percentile in both arches would be 50 percent. In males, in the upper arches, the lower mean square error (0.576) for the 65th percentile showed no significant differences between the estimated and the real values (p = 0,269); however, in the lower arch it was 0,592 for the 75th percentile. Therefore, in the upper arch, the eligible percentile for males was 65 while, in the lower arch, it was 75; the strength of this correspondence is intense for both arches. Conclusions: In the population studied, the Moyers method was found to be accurate in predicting the size of non-erupted teeth in females, but not in males(AU)

Statistical modeling of hospital admissions for pneumonia in Campo Grande / Modelagem estatística das internações hospitalares por pneumonia em Campo Grande / Modelado estadístico de ingresos hospitalarios por neumonía en Campo Grande

Justification and Objectives: Brazil lacks consistent epidemiological data on the respiratory morbidity of children and older adults, which makes it difficult to plan and execute effective preventive and health promotion actions. The objective of this study was to analyze the adjustments of distributions (Weibull, Normal, Gamma, Logistic) of historical series of hospitalizations for respiratory diseases (total hospitalizations), from 2011 to 2015, in Campo Grande, Mato Grosso do Sul. Methods: to determine the statistical models, four statistical indicators (coefficient of determination, mean root square error, mean absolute error and mean absolute percentage error) were performed from 2011 to 2015. Parameter estimates are obtained for the models adopted in the study, with and without a regression structure. Results: the results showed that Weibull, Gamma, Normal and Logistic distributions, applied to the series of hospitalizations for respiratory diseases in Campo Grande, were satisfactory in determining the shape and scale parameters, and the statistical indicators R2 , MAE, RSME and MAPE confirmed the data goodness-of-fit, and the graphical analysis indicated a satisfactory distribution fit. Conclusion: the analysis of monthly values indicates that Gamma is the best of the four distributions based on those selected. The regression model can be adjusted to the data and used as an alternative distribution that describes the hospitalization data considered in Campo Grande, Brazil.(AU)

Justificativa e Objetivos: o Brasil carece de dados epidemiológicos consistentes sobre a morbidade respiratória de crianças e idosos, o que dificulta o planejamento e a execução de ações efetivas de prevenção e promoção da saúde. O objetivo deste estudo foi analisar os ajustes das distribuições (Weibull, Normal, Gamma, Logística) da série histórica de internações por doenças respiratórias (total de internações), no período de 2011 a 2015, em Campo Grande, Mato Grosso do Sul. Métodos: para determinar os modelos estatísticos, foram executados quatro indicadores estatísticos (coeficiente de determinação, erro quadrático médio, erro absoluto médio e erro percentual absoluto médio) de 2011 a 2015. As estimativas dos parâmetros são obtidas para os modelos adotados no estudo com e sem uma estrutura de regressão. Resultados: os resultados mostraram que as distribuições Weibull, Gamma, Normal e Logística, aplicadas à série de internações por doenças respiratórias em Campo Grande, foram satisfatórias na determinação dos parâmetros de forma e escala, e os indicadores estatísticos R2, MAE, RSME e MAPE confirmaram a qualidade do ajuste dos dados, e a análise gráfica apontou um ajuste satisfatório das distribuições. Conclusão: a análise dos valores mensais indica que a Gamma é a melhor das quatro distribuições baseadas nos selecionados. O modelo de regressão pode ser ajustado aos dados e ser usado como uma distribuição alternativa que descreve os dados de internação considerados em Campo Grande, Brasil.(AU)

Justificación y Objetivos: el Brasil carece de datos epidemiológicos consistentes sobre la morbilidad respiratoria de niños y ancianos, lo que dificulta la planificación y ejecución de acciones efectivas de prevención y promoción de la salud. El objetivo de este estudio fue analizar los ajustes de las distribuciones (Weibull, Normal, Gamma, Logística) de la serie histórica de hospitalizaciones por enfermedades respiratorias (hospitalizaciones totales), de 2011 a 2015, en Campo Grande, Mato Grosso do Sul. Métodos: para la determinación de los modelos estadísticos, se realizaron cuatro indicadores estadísticos (coeficiente de determinación, raíz del error cuadrático medio, error medio absoluto y error porcentual absoluto medio) de 2011 a 2015. Se obtienen estimaciones de los parámetros para los modelos adoptados en el estudio, con y sin estructura de regresión. Resultados: los resultados mostraron que las distribuciones Weibull, Gamma, Normal y Logística, aplicadas a la serie de internaciones por enfermedades respiratorias en Campo Grande, fueron satisfactorias en la determinación de los parámetros de forma y escala, y los indicadores estadísticos R2, MAE, RSME y MAPE confirmaron la calidad de ajuste de los datos, y el análisis gráfico indicaron un ajuste satisfactorio de las distribuciones. Conclusión: el análisis de los valores mensuales indica que la Gamma es la mejor de las cuatro distribuciones en base a las seleccionadas. El modelo de regresión se puede ajustar a los datos y utilizar como una distribución alternativa que describe los datos de hospitalización considerados en Campo Grande, Brasil.(AU)

Confirmación diagnóstica de la metodología diseñada para evaluar los registros Holter durante 18 horas mediante la entropía proporcional / Diagnostic confirmation of the methodology designed to evaluate the Holter registers for 18 hours through proportional entropy

Resumen Introducción: Los sistemas dinámicos, la entropía y la probabilidad han contribuido de forma significativa al desarrollo de nuevas metodologías que caracterizan al grado de complejidad de la dinámica cardíaca. Objetivo: Confirmar la aplicabilidad clínica de la metodología fundamentada en la teoría de los sistemas dinámicos, la probabilidad y la entropía para evaluar la dinámica cardíaca durante 18 horas. Material y métodos: Se tomaron 570 registros Holter normales en diferentes enfermedades. Para cada uno se construyó un atractor en un mapa de retardo y se evaluó la probabilidad de ocupación de pares ordenados de frecuencias cardíacas durante 18 horas, así como la entropía y sus proporciones. Se compararon las medidas obtenidas con los valores de normalidad y enfermedad establecidos previamente para obtener el diagnóstico matemático de cada Holter. Las conclusiones del Holter se revelaron luego de aplicar la metodología fisicomatemática para calcular sensibilidad, especificidad y coeficiente kappa respecto de la norma de referencia clínica. Resultados: Con las proporciones de la entropía de los atractores se diferenciaron dinámicas cardíacas agudas, crónicas, normales y la evolución entre estos estados con resultados de sensibilidad y especificidad del 100% con una concordancia entre la norma de referencia y el diagnóstico fisicomatemático evaluado con el coeficiente kappa de 1. Conclusiones: Este estudio confirma que la metodología aplicada logra diagnosticar objetivamente la dinámica cardíaca, ya que establece predicciones de estados de normalidad o del nivel de agravamiento de la dinámica, y evidencia la aplicabilidad de esta metodología, lo cual sugiere su potencial uso en el contexto clínico.

Abstract Introduction: Dynamic systems, entropy and probability have contributed significantly in the development of new methodologies that characterize the degree of complexity of cardiac dynamics. Objective: To confirm the clinical applicability of the methodology based on the theory of dynamic systems, probability and entropy to evaluate cardiac dynamics during 18 hours. Material and methods: 570 normal Holter records with different pathologies were taken. For each one an attractor was built on the delay map and the probability of occupation of ordered pairs of heart rates during 18 hours was evaluated, as well as the entropy and its proportions. The measurements obtained were compared with the values of normality and illness established previously to obtain the mathematical diagnosis of each Holter. The conclusions of the Holter were unblinded after having applied the physical-mathematical methodology to calculate sensitivity, specificity and Kappa coefficient with respect to the Gold-Standard. Results: With the proportions of the entropy of the attractors, acute, chronic, normal, and evolution cardiac dynamics were differentiated between these states. the application of the methodology showed a sensitivity and specificity of 100 %. The agreement between the Gold-Standard and the physical-mathematical diagnosis evaluated with the kappa coefficient was 1. Conclusions: This study confirms that the applied methodology manages to objectively diagnose cardiac dynamics, establishing predictions of normality states or the level of aggravation of the dynamics, evidencing the applicability of this methodology, suggesting its potential use in the clinical context.

Pruebas diagnósticas: Razones de probabilidad / Diagnostic tests: Probability Ratios

La utilidad de una prueba diagnóstica se cuantifica mediante el cálculo de las medidas de probabilidad y las medidas de razones de probabilidad. Las medidas de probabilidad son la sensibilidad, la especificidad, valor predictivo positivo y el valor predictivo negativo. La sensibilidad y la especificidad se usan para escoger la mejor prueba a utilizar, entre varias disponibles; sin embargo, no pueden ser utilizadas para estimar la probabilidad de determinada enfermedad en un paciente en particular. En la práctica clínica es esencial saber cuál es la probabilidad de que un paciente con un resultado positivo en una prueba diagnóstica presente la enfermedad y cuál es la probabilidad de que un paciente con un resultado negativo en una prueba diagnóstica no presente la enfermedad. Los valores predictivos positivos y negativos nos brindan la respuesta a esta cuestión, sin embargo, dependen tanto de la sensibilidad y especificidad, como de la prevalencia de la enfermedad en la muestra del estudio. Las medidas de razones de probabilidad también describen el rendimiento o utilidad de una prueba diagnóstica y poseen dos propiedades importantes: resumen el mismo tipo de información que la sensibilidad y la especificidad, y pueden utilizarse para calcular la probabilidad de la enfermedad después de una prueba positiva o negativa. El propósito de esta publicación fue definir el concepto de razones de probabilidad, exponer sus principales fortalezas y explicar cómo se calculan las razones de probabilidad cuando la prueba de interés expresa sus resultados en forma dicotómica, en más de dos categorías o de forma ordinal

The usefulness of a diagnostic test is quantified by calculating the probability measures and the probability ratio measures. Probability measures are sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value. Sensitivity and specificity are used to choose the best test to use, among several available; however, they cannot be used to estimate the probability of a certain disease in a particular patient. In clinical practice it is essential to know what is the probability that a patient with a positive result in a diagnostic test will present the disease and what is the probability that a patient with a negative result in a diagnostic test will not present the disease. The positive and negative predictive values provide us with the answer to this question, however, it depends both on the sensitivity and specificity, and on the prevalence of the disease in the study sample. Probability ratio measures also describe the performance or usefulness of a diagnostic test and possess two important properties: they summarize the type of information that sensitivity and specificity, and they can be used to calculate the probability of disease after a positive or positive test. negative. The purpose of this publication was to define the concept of probability ratio measures, expose its main strengths, and explain how probability ratio measures are calculated when the test of interest expresses its results dichotomously, in more than two categories or ordinally

Encuesta de infección por coronavirus tipo 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2), a nivel comunitario en habitantes de un barrio vulnerable urbano de la ciudad de Buenos Aires: un ejemplo de muestreo probabilístico / Survey of infection by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), community level in inhabitants of a marginal urban neighborhood of the city of Buenos Aires: an example of a probability sampling

Entre el 1 y el 26 de junio se llevó a cabo el estudio de investigación "Encuesta de infección por coronavirus tipo 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2), nivel comunitario en habitantes de un barrio vulnerable urbano de la ciudad de Buenos Aires", que determinó que un 54,3% de los habitantes del barrio presentaban anticuerpos inmunoglobulina tipo G para SARS-CoV-2. El objetivo de este artículo es proporcionar un ejemplo de un muestreo probabilístico que fue utilizado para estimar la prevalencia de seropositividad en este estudio. (AU)

Between 1st and 26th of june, a research named "Survey of infection by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), community level in inhabitants of a marginal urban neighborhood of the city of Buenos Aires" was carried on. The study showed that 54.3% of the that 54.3% of the people of the neighborhood had antibodies immunoglobulin type G for SARS-CoV-2. The objective of this article is to provide an example of a probability sampling carried out in the study, to measuring the prevalence of seropositivity. (AU)

The diagnostic yield of three clinical prediction rules for pulmonary embolism / Rendimiento diagnóstico de tres reglas de predicción clínica para embolia pulmonar

Abstract Objective: pulmonary embolism (PE) is the third cause of cardiovascular death worldwide. The evaluation of pre-test probability using the Wells, Geneva and Pisa clinical prediction rules has been amply validated in prior studies. However, there are insufficient data for evaluating their diagnostic yield in a Colombian population. The goal of this article is to evaluate the yield of these scales in our population. Methods: this was a retrospective cohort study with diagnostic test analysis in a tertiary level hospital from 2009 to 2017, which included all subjects over the age of 18 who had undergone a chest computed tomography angiography (CTA) due to a clinical suspicion of PE. All the necessary variables for constructing the Wells, Geneva and Pisa rules were recorded. Each score was calculated numerically and then classified according to probability. Pulmonary embolism was diagnosed through a CTA read by a radiologist. The data were entered on an Excel spreadsheet and analyzed using a licensed SPSS statistical program. Results: a total of 507 subjects were included for Wells and Geneva scores and 339 for the Pisa score. The average age was 56 years (SD: 19.8) and 56.6% were males. A statistically significant relationship was found between the different calculated scores and the diagnosis of pulmonary embolism: low, intermediate and high Wells probability p<0.001; less probable and probable Wells p<0.001; low, intermediate and high Geneva p=0.006; and low, intermediate, moderate and high Pisa p=0.001. The ACOR for Wells was 0.715 (95% CI:0.663-0.767) (p<0.001), for Geneva was 0.611 (95% CI:0.553-0.668) (p<0.001), and for Pisa was 0.643 (95% CI:0.574-0.713) (p<0.001). Conclusions: the study showed a greater PE diagnostic yield using the Wells score in our setting. There are limitations to the application and development of the Pisa score asociated with a lower yield in our patients.(Acta Med Colomb 2020; 45. DOI:https://doi.org/10.36104/amc.2020.1384).

Resumen Objetivo: la embolia pulmonar (EP) es la tercera causa de muerte cardiovascular en el mundo. La evaluación de la probabilidad pre test a través de reglas de predicción clínica Wells, Ginebra y Pisa ha sido ampliamente validada en estudios previos. Sin embargo, hay datos insuficientes que evalúen el rendimiento diagnóstico de las mismas en población colombiana, este artículo tiene como fin evaluar el rendimiento de estas escalas en nuestra población. Métodos: estudio de cohorte retrospectivo con análisis de prueba diagnóstica en un hospital de III nivel de atención entre los años 2009 y 2017, donde se incluyeron todos los sujetos mayores de 18 años con realización de angiotomografía de tórax (ATC) solicitada por sospecha clínica de EP. Se registraron todas las variables necesarias para la construcción de las reglas de Wells, Ginebra y Pisa. Cada uno de los puntajes se calculó de manera numérica y posteriormente se clasificó según la probabilidad. El diagnóstico de EP se realizó mediante ATC leída por radiólogo. Los datos se ingresaron en una hoja de cálculo de Excel y se analizaron con el programa estadístico SPPS licenciado. Resultados: se ingresaron 507 sujetos para los puntajes de Wells y Ginebra y 339 para el puntaje de Pisa. El promedio de edad fue de 56 años (DS:19.8) y 56.6% de sexo masculino, se encontró una relación estadísticamente significativa entre los diferentes puntajes evaluados y el diagnóstico de embolia pulmonar, Wells probabilidad baja, intermedia y alta p<0.001, Wells menos probable y probable p<0.001, Ginebra bajo, intermedio y alto p=0.006, Pisa bajo, intermedio, moderada y alta p=0.001. El ACOR para Wells fue 0.715(IC95%:0.663-0.767) (p<0.001), Ginebra 0.611(IC95%:0.553-0.668) (P<0.001), Pisa 0.643(IC95%:0.574-0.713) (p<0.001). Conclusiones: se determinó un rendimiento superior para el diagnóstico de EP con el puntaje de Wells en nuestro medio, hay limitaciones con la aplicación y desarrollo del puntaje de Pisa asociado a un rendimiento inferior en nuestros pacientes.(Acta Med Colomb 2020; 45. DOI:https://doi.org/10.36104/amc.2020.1384).

Evaluation of the Romosinuano cattle population structure in Mexico using pedigree analysis / Evaluación de la estructura poblacional de bovinos Romosinuano en México mediante el análisis de pedigrí / Avaliação da estrutura populacional de bovinos Romosinuano no México usando análise de pedigree

Abstract Background: Romosinuano cattle breed in Mexico has endured isolation and it is necessary to characterize it in order to facilitate sustainable genetic management. Objective: To assess the evolution of the structure and genetic diversity of the Romosinuano breed in Mexico, through pedigree analysis. Methods: Pedigree data was obtained from Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). The ENDOG program (4.8 version) was used to analyze two datasets, one that includes upgrading from F1 animals (UP) and the other with only straight-bred cattle (SP). For both datasets, three reference populations were defined: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2), and 2010-2017 (RP3). The pedigree included 3,432 animals in UP and 1,518 in SP. Demographic parameters were: Generation interval (GI), equivalent number of generations (EG), pedigree completeness index (PCI), and gene flow among herds. Genetic parameters were: Inbreeding (F) and average relatedness (AR) coefficients, effective population size (Nec), effective number of founders and ancestors, and number of founder genome equivalents. Results: The GI varied from 6.10 to 6.54 for UP, and from 6.47 to 7.16 yr for SP. The EG of the UP and SP improved >63% from RP1 to RP3. The PCI increased over time. No nucleus or isolated herds were found. For RP3, F and AR reached 2.08 and 5.12% in the UP, and 2.55 and 5.94% in the SP. For RP3, Nec was 57 in the UP and 45 in the SP. Genetic diversity losses were attributed mainly (>66%) to genetic drift, except for RP3 in the SP (44%). Conclusions: A reduction of the genetic diversity has been occurring after the Romosinuano breed association was established in Mexico, and this is mainly due to random loss of genes.

Resumen Antecedentes: La raza bovina Romosinuano ha estado prácticamente aislada en México y requiere ser caracterizada para un manejo genético sostenible. Objetivo: Evaluar la evolución de la estructura y diversidad genética de la raza Romosinuano en México, mediante el análisis del pedigrí. Métodos: Los datos genealógicos provinieron de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). Los análisis se realizaron con el programa ENDOG (versión 4.8) para dos bases de datos, una que incluyó animales en cruzamiento absorbente (UP) a partir de F1 y la otra con sólo animales puros (SP). Para ambas bases de datos se definieron tres poblaciones de referencia: 1998-2003 (RP1), 2004- 2009 (RP2), y 2010-2017 (RP3). El pedigrí incluyó 3.432 animales en la UP y 1.518 en la SP. Los parámetros demográficos fueron: intervalo generacional (GI), número de generaciones equivalentes (EG), índice de completitud del pedigrí (PCI), y flujo de genes entre hatos. Los parámetros genéticos fueron: coeficientes de consanguinidad (F) y de relación genética aditiva (AR), tamaño efectivo de la población (Nec), número efectivo de fundadores y ancestros, y número equivalente de genomas fundadores. Resultados: El GI varió de 6,10 a 6,54 para la UP, y de 6,47 a 7,16 años para la SP. El EG de la UP y la SP mejoró >63%, de RP1 a RP3. El PCI aumentó a través de los años, pero más para la SP que para la UP. No se encontraron hatos núcleo o aislados. Para RP3, F y AR alcanzaron 2,08 y 5,12% en la UP, y 2,55 y 5,94% en la SP. Para RP3, Nec fue 57 en la UP y 45 en la SP. Más de 66% de las pérdidas en diversidad genética se debieron a deriva genética, excepto para RP3 en la UP (44%). Conclusiones: una reducción de la diversidad genética ha estado ocurriendo después de que se formó la asociación de criadores de ganado Romosinuano en México, y es debida principalmente a pérdidas aleatorias de genes.

Resumo Antecedentes: A raça bovina Romosinuano tem estado praticamente isolada no México e precisa ser caracterizada para um manejo genético sustentável. Objetivo: Avaliar a evolução da estrutura e diversidade genética da raça Romosinuano no México, através da análise de pedigree. Métodos: Os dados genealógicos vieram da Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). As análises foram feitas com o programa ENDOG (versão 4.8) para duas bases de dados, uma que incluiu animais em cruzamento absorvente (UP) a partir da F1 e a outra base de dados somente com animais puros (SP). Para ambas bases de dados foram definidas três populações de referência: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2) e 2010-2017 (RP3). O pedigree incluiu 3.432 animais na UP e 1.518 na SP. Os parâmetros demográficos foram: intervalo entre gerações (GI), número de gerações equivalentes (EG), índice de completude do pedigree (PCI), e fluxo de genes entre rebanhos. Os parâmetros genéticos foram: coeficiente de consanguinidade (F) e da relação genética aditiva (AR), tamanho efetivo da população (Nec), número efetivo de fundadores e ancestrais, e número equivalente de genomas fundadores. Resultados: O GI variou de 6,10 a 6,54 para a UP, e de 6,47 a 7,16 anos para a SP. EG da UP e a SP melhorou >63%, de RP1 a RP3. O PCI aumentou ao longo dos anos, mas mais para a SP do que para o UP. Não se encontraram rebanhos núcleo ou isolados. Para RP3, F e AR alcançaram 2,08 e 5,12% na UP, e 2,55 e 5,94% na SP. Para RP3, Nec foi 57 na UP e 45 na SP. Mais de 66% das perdas em diversidade genética foram ocasionadas pela deriva genética, exceto para RP3 no UP (44%). Conclusões: Depois que a associação da raça Romosinuano foi estabelecida no México, tem ocorrido uma redução da diversidade genética, principalmente devido a perdas aleatórias de genes.