Diagnóstico micológico por técnicas no convencionales en el siglo XXI / Mycological diagnosis by non-conventional techniques in the 21st century

Introducción: En la actualidad las infecciones fúngicas representan un problema para la salud humana. Las infecciones causadas por especies patógenas de hongos registran un incremento constante y se ubican entre el cuarto y décimo lugar como causa de muerte, particularmente en las unidades de cuidado intensivo. Un diagnóstico adecuado y precoz impacta directamente en la morbilidad y mortalidad asociadas a estas. Objetivo: Describir las principales técnicas de diagnóstico no convencional de las enfermedades fúngicas más frecuentes, en especial las relacionadas con el diagnóstico serológico y molecular. Métodos: Se realizó una revisión de la literatura científica sobre el tema, publicada entre 2000 y 2019. Se revisaron un total de 63 trabajos. Como motores de búsqueda se emplearon Google y Google Scholar. Se revisaron las bases de datos Medline, PubMed, Science Direct, BUCea y SciELO. Análisis y síntesis de la información: Las técnicas serológicas se emplean en el diagnóstico de las micosis invasivas o sistémicas por ser fáciles, rápidas y confiables. La detección de anticuerpos tiene utilidad limitada en el diagnóstico de las micosis invasivas debido a que la respuesta puede estar retrasada, reducida o no existir en pacientes inmunocomprometidos. La detección de componentes no antigénicos liberados por los hongos durante la infección y la secuenciación de ácidos nucleicos fúngicos son otras opciones para el diagnóstico de las micosis. Conclusiones: El desarrollo biotecnológico aporta nuevas herramientas que incrementan las oportunidades de identificación de las micosis. En la actualidad se disponen de métodos basados tanto en la detección de marcadores inmunológicos como de elementos moleculares específicos. La eficacia de las herramientas no convencionales para el diagnóstico depende de la correcta combinación de estas(AU)

Introduction: Fungal infections are a current human health problem. Infections caused by pathogenic fungal species constantly increase in number, and are ranked between the fourth and tenth leading causes of death, particularly in intensive care units. Early accurate diagnosis has a direct impact on the morbidity and mortality of fungal infections. Objective: Describe the main non-conventional diagnostic techniques for the most common fungal diseases, especially those related to serological and molecular diagnosis. Methods: A review was conducted of the scientific literature about the topic published between the years 2000 and 2019. A total 63 publications were reviewed. The search engines used were Google and Google Scholar. The databases Medline, PubMed, Science Direct, BUCea and SciELO were reviewed. Data analysis and synthesis: Serological techniques are used for the diagnosis of invasive or systemic mycoses because they are easy, fast and reliable. The detection of antibodies has a limited usefulness in invasive mycosis diagnosis, for the response may be delayed, reduced or inexistent in immunocompromised patients. Detection of non-antigenic components released by fungi during infection and sequencing of fungal nucleic acids are other mycosis diagnosis options. Conclusions: Biotechnological development contributes new tools increasing mycosis identification opportunities. Methods are currently available which are based on detection of immunological markers and specific molecular elements. The efficacy of non-conventional diagnostic tools depends on their appropriate combination(AU)

Enfermedad fúngica invasora (EFI) por hongos filamentosos en la Región de Valparaíso, Chile, desde la implementación del diagnóstico rápido de laboratorio / Invasive fungal disease (IFD) by filamentous fungi in the Valparaíso Region, Chile, since implementation of rapid laboratory diagnosis

Introduction: Invasive fungal diseases (IFD) by filamentous fungi are a common cause of morbidity and mortality in immunocompromised patients, especially those with myeloid leukemia. In 2011 a protocol for the rapid diagnosis of IFD by filamentous fungi was implemented in Valparaiso Region. Objectives: To describe cases of IFD by filamentous fungi of the Valparaíso Region, since the implementation of rapid diagnosis and to compare results with the period 2004-2009. Materials and Method: Descriptive and prospective study conducted in two public hospitals: Carlos van Buren at Valparaiso and Gustavo Fricke at Viña del Mar. We selected patients with a diagnosis of filamentous fungal diseases considering the EORTC/MSG criteria. Demographics, underlying diseases, risk factors for EFI, galactomannan (GM) results in blood and bronchoalveolar lavage, cultures and biopsies, treatment and overall lethality rates at 30 days were registered. Results: Eighteen patients were detected, 6 with proven and 12 probable IFD. Nine were diagnosed by GM, 8 by culture and two with both methods. In cases which the agent (9/18) was isolated from Rhizopus oryzae was the most frequent. When comparing overall lethality with the period 2004-2009, there was a reduction of 47.8%, which was statistically significant. Conclusions: Compared to data previously published in the region, demographic and comorbidities of patients with IFD caused by filamentous fungi are similar, however the currently rapid diagnosis protocol has improved survival of patients and lethality experienced overall decrease.

Introducción: la enfermedad fúngica invasora (EFI) por hongos filamentosos es una causa frecuente de morbilidad y mortalidad en pacientes inmunocomprometidos, en especial en aquellos con leucemia mieloide. En el 2011 se implementó en la Región de Valparaíso un protocolo de diagnóstico rápido de la EFI por hongos filamentosos. Objetivos: describir los casos de EFI por hongos filamentosos de la Región de Valparaíso, desde la implementación del diagnóstico rápido y compararlos con el período 2004-2009. Materiales y Método: Estudio descriptivo y prospectivo realizado en los hospitales públicos Carlos van Buren de Valparaíso y Gustavo Fricke de Viña del Mar. Se seleccionaron aquellos pacientes con diagnóstico de EFI por hongos filamentosos considerando los criterios EORTC/MSG. Se obtuvieron datos demográficos, enfermedad de base, factores de riesgo para EFI, resultados de galactomanano (GM), cultivos y biopsias, tratamiento y letalidad global a 30 días. Resultados: Se identificaron 18 pacientes, seis con EFI probadas y 12 probables. Nueve fueron diagnosticados con galactomanano, ocho con cultivos y uno con los dos métodos. En los casos en que se aisló el agente (9/18), Rhizopus oryzae fue el más frecuente. Al comparar la letalidad global con la del período 2004-2009, hubo una reducción de 47,8%, la cual fue estadísticamente significativa. Conclusiones: En relación a lo publicado anteriormente en la región, se conservan las características demográficas y de co-morbilidad de los pacientes con EFI por hongos filamentosos; sin embargo, la introducción del nuevo protocolo de diagnóstico rápido se asoció a una disminución en la letalidad global.

Mortality due to systemic mycoses as a primary cause of death or in association with AIDS in Brazil: a review from 1996 to 2006

Deaths caused by systemic mycoses such as paracoccidioidomycosis, cryptococcosis, histoplasmosis, candidiasis, aspergillosis, coccidioidomycosis and zygomycosis amounted to 3,583 between 1996-2006 in Brazil. When analysed as the underlying cause of death, paracoccidioidomycosis represented the most important cause of deaths among systemic mycoses (~ 51.2 percent). When considering AIDS as the underlying cause of death and the systemic mycoses as associated conditions, cryptococcosis (50.9 percent) appeared at the top of the list, followed by candidiasis (30.2 percent), histoplasmosis (10.1 percent) and others. This mortality analysis is useful in understanding the real situation of systemic mycoses in Brazil, since there is no mandatory notification of patients diagnosed with systemic mycoses in the official health system.

Factors associated with the catastrophic decline of a cloudforest frog fauna in Guatemala

Comparison of recent and historical surveys of frog populations in cloudforest habitat in Sierra de las Minas,Guatemala,indicated population declines and local extirpation of several species.Pathological exams of diseased tadpoles indicated infection by amphibian chytridiomycosis. The local habitat has been severely altered by recent establishment of large-scale leatherleaf fern production.Analysis of water chemistry at our study site suggested increased nitrogenation associated with the leatherleaf industry

Una comparación entre un inventario anterior y otro reciente de poblaciones de ranas de bosque nublado en la Sierra de Las Minas de Guatemala demostró disminuciones poblacionales y ausencia localizada de varias especies.El examen patológico de un renacuajo muerto indicó infección por un hongo quítrido propio de los anfibios.El hábitat local ha sido gravemente alterado por el establecimiento reciente de producción a gran escala de helechos ornamentales.El análisis químico del agua en el área de estudio señaló un aumento en nitrogenación asociado al cultivo de helechos

Micosis sistémica en niños

Debido a que las micosis sistémicas son entidades particularmente severas en los niños y que no hay información sobre la magnitud del problema en Colombia, se llevó a cabo un estudio retrospectivo en un período de 10 años (1983-1994) en dos centros de referencia para las enfermedades micóticas del país. Se diagnosticaron 57 casos de micosis sitémicas en este grupo de pacientes, distribuidos así: 39 de histoplasmosis, 14 de criptococosis y cuatro de paracoccidioidomicosis. La edad de los pacientes osciló entre uno y 14 años. La histoplasmosis se presentó en niños menores (promedio 6.1 años), la criptococosis y la paracoccidioidomicosis, en mayores (promedio 8 y 11 años, respectivamente). La evolución de los síntomas antes del diagnóstico inicial fue de 4.3 meses en la histoplasmosis, de 2.3 en la criptococosis y de 12 en la paracoccidioidomicosis. Los síntomas y signos predominantes en la histoplasmosis pulmonar y la paracoccidioidomicosis fueron fiebre (51.5 por ciento), tos (42.2 por ciento), adenopatías (33.3 por ciento), pérdida de peso (30.3 por ciento), anorexia (24.2 por ciento) y hepatoesplenomegalia (18.1 por ciento). En las formas meníngeas de histoplasmosis y de criptococosis predominaron cefalea (62 por ciento), fiebre (41.3 por ciento), papiledema bilateral (34.4 por ciento), anorexia (27.5 por ciento) y astenia (13.8 por ciento). Las radiografías de tórax mostraron infiltrados sólo en 14 casos (25 por ciento). Los métodos que permitieron el diagnóstico etiológico fueron los procedimientos inmunológicos para determinar anticuerpos y antígeno, los cultivos, los exámenes directos y la biopsia. Las primeras fueron indispensables para el pronto diagnóstico de estos pacientes. En la criptococosis se encontraron patologías asociadas tales como leucemia, VIH, lupus, desnutrición e involución del timo. Diez de los pacientes con histoplasmosis y los cuatro con paracoccidioidomicosis estaban desnutridos.

Micoses profundas em transplantados renais: indicaçäo de alerta clínico / Deep mycosis in kidney transplantation: indication of alert clinic

A imunossupressao dada a receptores de transplantes renais torna-os suscetíveis a infecçoes oportunísticas. Os autores estudaram o impacto das micoses profundas numa populaçao de 502 transplantados renais (525 transplantes) num período de 20 anos.Vinte e quatro receptores (4,6 por cento) desenvolveram micose profunda. Histoplasmose e criptococose foram as micoses mais prevalentes e as maiores responsáveis pela relativamente alta percentagem de óbitos observada (5O por cento). Revisao sobre métodos diagnósticos e de tratamento das mesmas é apresentada.Transplantados renais com micose profunda representam possivelmente um grupo imunossuprimido em excesso que deve ser seguido de perto para se tentar evitar mortalidade excessiva.

Fungemias en pacientes críticamente enfermos / Fungemia in patients critically illness

En las últimas décadas y debido al uso de potentes antibióticos de amplio espectro, el empleo de técnica invasivas, tanto diagnósticas como terapéuticas y la mayor sobrevida de pacientes inmunosuprimidos han traido como consecuencia un incremento significativo en la frecuencia de infecciones micóticas sistémicas, que como microorganismos oportunistas, representan una importante causa de morbi-mortalidad en pacientes críticammente enfermos. Esta revisión tiene el objetivo de hacer énfasis en los principales aspectos tanto etiológicos, diagnósticos, terapéuticos y especialmente preventivos, que sirvan de guía práctica para el manejo de esta preocupante patología

Study of systemic fungal infections in autopsy material.

A retrospective study of 2526 autopsy cases was done in order to find out the pattern of systemic fungal infections. The autopsy records were reviewed for case histories, gross and histological findings. The histological sections from cases showing evidence of fungalo infections were reviewed. The fungal infections were found in 28 cases. Of these 11 (93.29 percent) were aspergillosis, 8 (28.27 percent) were mucormyosis, 6 (21.43 percent) were monilial infections and 3 (10.71 percent) were monilial infections and 3 (10.71 percent) were cryptococcosis. The incidence of systemic fungal infection was 1.11 percent. The most common type of fungal infection was aspergillosis. The maximum number of fungal infection was seen in the respiratory system. The fungal infections presented as opportunistic infections in all but one case. The metabolic disturbance was the most frequent predisposing condition for systemic fungal infections.