RESUMO
O aprimoramento das características fenotípicas de interesse produtivo em bovinos vem sendo o alvo de grandes empreendimentos no setor pecuário. Uma das áreas que tem assistido grande avanço na última década é a seleção assistida por marcadores (MAS). Entre as abordagens utilizadas para a MAS está o mapeamento genético de locos de tratos quantitativos (QTL). Nesse sentido o objetivo deste projeto foi de identificar QTL associados a características de interesse econômico com vistas à implantação de programa de seleção animal assistido por marcadores. Trinta e um marcadores do tipo microssatélite, localizados nos cromossomos 4, 5, 14 e 20, foram analisados em animais de duas famílias constituídas por 187 e 189 fêmeas meia-irmãs da raça Nelore (Bos indicus), filhas de dois touros distintos, respectivamente. As informações genotípicas, os índices da diferença esperada na progênie (DEP) de peso ao nascimento, peso à desmama, efeito materno total, ganho de peso em 345 dias (entre a desmama e os 18 meses de idade), peso ao sobreano (18 meses), perímetro escrotal, musculosidade, altura, precocidade de carcaça, conformação corporal e precocidade sexual, além do posicionamento dos marcadores utilizando o mapa ligação do Meat Animal Research Center (MARC), foram correlacionados utilizando o programa QTL Express. Identificou-se QTL com evidência significativa de 5% no genoma associado à característica de peso ao sobreano no cromossomo 4 e QTL com evidências sugestivas afetando as características relacionadas ao crescimento nos cromossomos 4, 5 e 14. Apesar de tratar-se do primeiro relato positivo da identificação de QTL em população da raça Nelore, mais estudos se fazem necessários para confirmar estes resultados em outras populações da raça Nelore assim como em outras raças bovinos...
Assuntos
Animais , Feminino , Bovinos/genética , Melhoramento Genético/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase/métodosRESUMO
The main goal of our research was to search for SSRs in the Eucalyptus EST FORESTs database (using a software for mining SSR-motifs). With this objective, we created a database for cataloging Eucalyptus EST-derived SSRs, and developed a bioinformatics tool, named Satellyptus, for finding and analyzing microsatellites in the Eucalyptus EST database. The search for microsatellites in the FORESTs database containing 71,115 Eucalyptus EST sequences (52.09 Mb) revealed 20,530 SSRs in 15,621 ESTs. The SSR abundance detected on the Eucalyptus ESTs database (29% or one microsatellite every four sequences) is considered very high for plants. Amongst the categories of SSR motifs, the dimeric (37%) and trimeric ones (33%) predominated. The AG/CT motif was the most frequent (35.15%) followed by the trimeric CCG/CGG (12.81%). From a random sample of 1,217 sequences, 343 microsatellites in 265 SSR-containing sequences were identified. Approximately 48% of these ESTs containing microsatellites were homologous to proteins with known biological function. Most of the microsatellites detected in Eucalyptus ESTs were positioned at either the 5 or 3 end. Our next priority involves the design of flanking primers for codominant SSR loci, which could lead to the development of a set of microsatellite-based markers suitable for marker-assisted Eucalyptus breeding programs