Identificação de proteínas de superfície e secretadas e caracterização de uma nova proteína de membrana do Schistosoma mansoni / Protein identification of surface and secretory and characterization of a new protein of membrane of the Schistosoma mansoni

(...) resposta imune de humanos infectados com helmintos é direcionada a várias proteínas, inclusive aquelas secretadas ou de superfície, principalmente devido a localização no parasito que vive em contato direto com o sangue permitindo uma interação direta com componentes do sistema imune do hospedeiro. Embora várias proteínas expressas no tegumento do Schistosoma mansoni já têrem sido descritas e muitas seqüências de RNAm estarem depositadas em bancos de dados de domínio público, pouco se conhece sobre o papel das proteínas de superfície ou secretadas na biologia do parasito e na interação com o sistema imune do hospedeiro. Neste estudo predizemos proteínas secretadas e de superfície depositadas no banco de dados de proteínas da Rede ONSA/SP através dos programas de bioinformática e caracterizamos uma nova proteína de superfície do S. mansoni. A partir das 26.228 seqüências de proteínas analisadas pelos programas SignalP e Phobius observamos que 10,5 por cento foram anotadas como transmembranas, ancoradas ou secretadas e metade dessas proteínas (55,3 por cento) foi identificada por mais de um programa, reforçando a hipótese que pelo menos 5,81 por cento destas proteínas são possivelmente secretadas ou de superfície. A partir de anotações manuais observamos que a maioria das proteínas é transmembrana intracelular e extracelular (25,0 por cento e 22,1 por cento respectivamente) e apenas um pequeno número foi classificado como secretadas (6,0 por cento), presentes no retículo endoplasmático ou golgi (1,8 por cento) e ancoradas (1,7 por cento). Entretanto, o número de proteínas, com peptídeo sinal, identificadas em nossa análise, pode estar subestimado, pois as seqüências usadas em nosso estudo foram geradas por Orestes. Quando comparamos os modelos utilizados, observamos que o Phobius Transmembrana foi o programa que mais classificou corretamente as proteínas (62,1 por cento) tendo como a maioria das falso-positivas as proteínas intracelulares (40,1 por cento)...

Detection of hepatitis C virus RNA in saliva samples from patients with seric anti-HCV antibodies

We examined the frequency of HCV-RNA in saliva samples from anti-HCV positive patients. Both plasma and saliva samples from 39 HCV patients (13 with normal liver enzymes, 19 with abnormal liver enzymes and 13 with cirrhosis) were investigated. Stimulated saliva and fresh plasma were centrifuged (900 x g,10 min) and stored at -70°C, after the addition of guanidine isothiocyanate RNA extraction buffer. HCV-RNA was detected by RT- nested-PCR (amplification of HCV-cDNA for two rounds, using HCV primers 939/209 and 940/211). HCV genotyping was carried out by RFLP (using Mva I and Hinf 1 or Hae III and Rsa I restriction enzymes). Thirty-two out of 39 (82 percent; 95 percent CI=70-94 percent) anti-HCV-positive patients had HCV-RNA in plasma samples. Eight out of 39 (20.5 percent; 95 percent CI=6.6-34.4 percent) had HCV-RNA in the saliva. The HCV genotype in saliva samples from these patients matched the genotype found for plasma HCV-RNA. No significant correlation between the presence of HCV and either age, gender, HCV genotype or any risk factor for HCV infection was found. The observed prevalence (20.5 percent of anti HCV positive patients or 25 percent of the patients with HCV-RNA in plasma) was lower than that previously reported from other countries. The low frequency of HCV-RNA in saliva samples observed in our study may be due to the use of cell-free saliva. Other authors reporting higher frequencies of HCV-RNA in saliva used whole saliva, without centrifugation.

Identificação de proteínas de superfície e secretadas e caracterização de uma nova proteína de membrana do Schistosoma mansoni

A resposta imune de humanos infectados com helmintos é direcionada a várias proteínas, inclusive aquelas secretadas ou de superfície, principalmente devido a localização no parasito que vive em contato direto com o sangue permitindo uma interação direta com componentes do sistema imune do hospedeiro. Embora várias proteínas expressas no tegumento do Schistosoma mansoni já têrem sido descritas e muitas seqüências de RNAm estarem depositadas em bancos de dados de domínio público, pouco se conhece sobre o papel das proteínas de superfície ou secretadas na biologia do parasito e na interação com o sistema imune do hospedeiro. Neste estudo predizemos proteínas secretadas e de superfície depositadas no banco de dados de proteínas da Rede ONSA/SP através dos programas de bioinformática e caracterizamos uma nova proteína de superfície do S. mansoni. A partir das 26.228 seqüências de proteínas analisadas pelos programas SignalP e Phobius observamos que 10,5 porcento foram anotadas como transmembranas, ancoradas ou secretadas e metade dessas proteínas (55,3 porcento) foi identificada por mais de um programa, reforçando a hipótese que pelo menos 5,81 porcento destas proteínas são possivelmente secretadas ou de superfície

A partir de anotações manuais observamos que a maioria das proteínas é transmembrana intracelular e extracelular (25,0 porcento e 22,1 porcento respectivamente) e apenas um pequeno número foi classificado como secretadas (6,0 porcento), presentes no retículo endoplasmático ou golgi (1,8 porcento) e ancoradas (1,7 porcento). Entretanto, o número de proteínas, com peptídeo sinal, identificadas em nossa análise, pode estar subestimado, pois as seqüências usadas em nosso estudo foram geradas por Orestes. Quando comparamos os modelos utilizados, observamos que o Phobius Transmembrana foi o programa que mais classificou corretamente as proteínas (62,1 porcento) tendo como a maioria das falso-positivas as proteínas intracelulares (40,1 porcento). O SignalP Modelo Markov (MM) foi o programa que mais classificou corretamente proteínas secretadas (17,3 porcento) quando comparado com o Modelo de Rede Neural (9,3 porcento) e Phobius secretada (15,3 porcento), sendo o programa mais sensível par identificação de peptídeo sinal. Entretanto, a maioria das proteínas falso-positivas classificadas pelo SignalP (MM) foram as proteínas transmembrana extra (30,2 porcento) e intracelulares (28,8 porcento). A partir de ferramentas de bioinformática para identificação de proteínas de superfície e o estudo e utilizando imunolocalização identificamos uma nova proteína do S. mansoni, Sm262 que parece ser um receptor com papel na via de sinalização e desenvolvimento do parasito

Identificação de proteínas de superfície e secretadas e caracterização de uma nova proteína de membrana do Schistosoma mansoni / Identification of surface proteins and secreted and characterization of a new membrane protein of Schistosoma mansoni

A resposta imune de humanos infectados com helmintos é direcionada a várias proteínas, inclusive aquelas secretadas ou de superfície, principalmente devido a localização no parasito que vive em contato direto com o sangue permitindo uma interação direta com componentes do sistema imune do hospedeiro. Embora várias proteínas expressas no tegumento do Schistosoma mansoni já têrem sido descritas e muitas seqüências de RNAm estarem depositadas em bancos de dados de domínio público, pouco se conhece sobre o papel das proteínas de superfície ou secretadas na biologia do parasito e na interação com o sistema imune do hospedeiro. Neste estudo predizemos proteínas secretadas e de superfície depositadas no banco de dados de proteínas da Rede ONSA/SP através dos programas de bioinformática e caracterizamos uma nova proteína de superfície do S. mansoni. A partir das 26.228 seqüências de proteínas analisadas pelos programas SignalP e Phobius observamos que 10,5 porcento foram anotadas como transmembranas, ancoradas ou secretadas e metade dessas proteínas (55,3 porcento) foi identificada por mais de um programa, reforçando a hipótese que pelo menos 5,81 porcento destas proteínas são possivelmente secretadas ou de superfície. A partir de anotações manuais observamos que a maioria das proteínas é transmembrana intracelular e extracelular (25,0 porcento e 22,1 porcento respectivamente) e apenas um pequeno número foi classificado como secretadas (6,0 porcento), presentes no retículo endoplasmático ou golgi (1,8 porcento) e ancoradas (1,7 porcento). Entretanto, o número de proteínas, com peptídeo sinal, identificadas em nossa análise, pode estar subestimado, pois as seqüências usadas em nosso estudo foram geradas por Orestes. Quando comparamos os modelos utilizados, observamos que o Phobius Transmembrana foi o programa que mais classificou corretamente as proteínas (62,1 porcento) tendo como a maioria das falso-positivas as proteínas intracelulares (40,1 porcento). O SignalP Modelo Markov (MM) foi o programa que mais classificou corretamente proteínas secretadas (17,3 porcento) quando comparado com o Modelo de Rede Neural (9,3 porcento) e Phobius secretada (15,3 porcento), sendo o programa mais sensível par identificação de peptídeo sinal. Entretanto, a maioria das proteínas falso-positivas classificadas pelo SignalP (MM) foram as proteínas transmembrana extra (30,2 porcento) e intracelulares (28,8 porcento). A partir de ferramentas de bioinformática para identificação de proteínas de superfície e o estudo e utilizando imunolocalização identificamos uma nova proteína do S. mansoni, Sm262 que parece ser um receptor com papel na via de sinalização e desenvolvimento do parasito.

Hepatitis C and hepatitis B virus infection in different hemodialysis units in Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil

The prevalence, virological and epidemilogical aspects of the hepatitis C virus (HCV) and the hepatitis B virus (HBV) infections vary among hemodialysis patients in different countries. Aiming at analyzing these aspects of HCV and HBV infections in hemodialysis patients in Belo Horizonte, MG, Brazil, we studied three hemodialysis units including 434 patients. Serology was used to detect anti-HCV and HBsAg. Reverse trancriptase nested polymerase chain reaction (RT-nested-PCR) of the 5'-noncoding region was used to detect circulating HCV RNA and restriction fragment length polymorphism analysis for genotyping. Seroprevalence varied from 26.5 percent to 11.1 percent for hepatitis C and from 5.9 percent to 0 percent for hepatitis B. Risk factors observed for HBV and/or HCV infections were the number of patients per dialysis unit, duration of treatment, number of clinics attended, number of blood units transfused, and lower level scholarity. Alanine aminotransferase levels were altered with a higher frequency in HBV or HCV seropositive patients. Half of ten patients, negative for anti-HCV, had detectable viremia by RT-nested-PCR, indicating that this technique should be used to confirm infections in this group of patients. The HCV genotype 1 was the most frequently observed, followed by the genotype 2, but no correlation was detected between genotype and clinical or epidemiological data

Controle do Triatoma sordida no peridomicílio rural do município de Porteirinha, Minas Gerais, Brasil / Control of Triatoma sordida in the rural peridomestic environment of Porteirinha municipality, Minas Gerais, Brazil

O Triatoma sordida é uma espécie predominantemente peridomiciliar e, atualmente, a mais capturada no Brasil. Para melhor compreender a resposta deste triatomíneo as atividades de controle, uma pesquisa de infestaçao triatomínica foi realizada em outubro de 1993 em 12 localidades rurais do município de Porteirinha, MG, Brasil. Foram capturados 772 exemplares de T. sordida, dos quais 3,6 por cento estavam infectados pelo Trypanosoma cruzi. Dentre as 406 unidades domiciliares pesquisadas, 34,9 por cento estavam infestadas. Dos 695 ecótopos peridomiciliares estudados, 27,5 por cento foram positivos para a presença de T. sordida. O estudo revelou um peridomicilio simples, com poucos ecótopos positivos por unidade domiciliar e baixa densidade triatominica(colônicas de no maximo cinco insetos). O estudo constatou uma associaçao entre presença de triatomineos e ecótopos de madeira: 72,8 dos triatomineos foram capturados neste tipo de ecótopo. Entre as unidades domiciliares positivas, 62, 9 por cento ficavam a menos de 20 m das casas. O censo de animais peridomiciliares revelou que as galinhas correspondiam a 82,7 por cento dos animais. As unidades domiciliares infestadas foram imediatamente borrifadas com deltametrina (25 mg i.a./m2). Novas pesquisas de infestaçao foram feitas 7 meses (pesquisa 2) e 1 ano (pesquisa 3) após a borrifaçao. Na pesquisa 2 o número de triatomíneos correspondeu a 52,5 por cento da populaçao original e, na pesquisa 3, a 79,1 por cento da mesma. A reduçao do número de triatomíneos capturados na pesquisa 2 incidiu principalmente sobre as ninfas. A grande proporçao de adultos capturados nessa ocasiao confirma a existencia de apenas um ciclo anual do T. sordida na regiao. Na pesquisa 3 o aumento do número de ninfas demonstrou crescimento desta populaçao, utilizando-se da grande disponibilidade de galinhas para alimentaçao. Apesar das dificuldades de borrifaçao e da baixa permanência do inseticida no peridomicilio, a existência de apenas um ciclo anual do triatomíneo e a lentidao na reconstituiçao da populaçao original sugerem que uma borrifaçao anual e suficiente para controle do T.sordida. Maior eficiência poderá ser obtida com a eliminaçao dos esconderijos, atraves da substituiçao do material usado na construçao dos anexos, principalmente a madeira

Triatoma sordida, a predominantly peridomestic species, is currently the triatomine species most frequently collected in Brazil. To evaluate the effectiveness of control activities against this species, a survey to determine infestation rates was carried out in October 1993 in 12 rural localities in the municipality of Porteirinha, State of Minas Gerais, Brazil. In the survey, 772 T. sordida were captured, of which 3.6% were infected with Trypanosoma cruzi. Of the 406 dwellings investigated, 34.9% were infested, and 27.6% of 695 peridomiciliar ecotopes contained T. sordida. The area around the dwellings was relatively uniform, with few positive ecotopes per household and low triatomine densities (a maximum of five insects per colony). The study found an association between the presence of insects and wood: 72.8% of the insects were captured in this type of ecotope. The majority of the positive households (62.9%) were close to forests (12 to 299 m); 92.3% of the infested ecotopes were less than 20 m from the house. A census of peridomestic animals revealed that chickens were the most abundant (82.7%). All positive households found in the survey were sprayed immediately with deltamethrin (25 mg a.i./m2).New surveys were carried out 7 months (survey 2) and 12 months (survey 3) after spraying. In survey 2, the number of insects collected corresponded to 52.5% of the original total, and in survey 3, 79.1%. The decrease in population observed in survey 2 was mainly due to a reduction in the population of nymphs. The large proportion of adults captured in that survey supports the idea that T. sordida produces only a single generation per year in this region. In survey 3 the increase in the number of nymphs, attributable to the great availability of chickens as a source of food, resulted in population growth. Despite the difficulties of spraying and the short persistence of the insecticide, the slow population response of T. sordida suggests that one annual spraying is sufficient for effective control of this species. Higher effectiveness could be obtained by eliminating peridomestic hiding places, for example, by replacing wooden annexes with structures made from other materials.