Incidental thyroid carcinoma: Correlation between FNAB cytology and pathological examination in 1093 cases

Abstract Objective To investigate Incidental Thyroid Carcinoma (ITC) by comparing the results of Fine Needle Aspiration Biopsy (FNAB) cytology and the postoperative pathological findings. Methods Data of 1479 patients who underwent total thyroidectomy were retrieved. Three hundred eighty-six patients were excluded due to insufficient data. Each surgical specimen studied received two histopathological diagnoses: the local diagnosis ‒ for the same area in which the FNAB was performed; and the final diagnosis, which includes a study of the entire surgical specimen. Results A thousand and ninety-three patients were investigated. FNAB result was malignant in 187 patients, benign in 204, suspicious or indeterminate in 668 cases, and inconclusive in 34 cases. The prevalence of ITC was 15.1%. Most of the ITC in this series was less than 0.5 cm. The incidence of ITC was higher in Bethesda III (17.5% ITC) and IV (19% ITC) than in Bethesda II cases (1.5% false negatives and 9% ITC). Conclusion Although the incidence of false-negative results in Bethesda II nodules is only 1.5%, 9% of these patients had ITC in the thyroid parenchyma outside the nodule that underwent preoperative FNAB. The incidence of ITC in the same scenario was even higher in Bethesda III (17.5%) and Bethesda IV cases (19%). Ultrasonography-guided FNAB is an excellent method for the assessment of thyroid nodules. However, biopsy sites should be carefully selected. Despite the high incidence of incidentalomas, total thyroidectomy should not always be the treatment of choice due to its rare but potentially serious complications. The findings of the present study can assist future clinical decisions towards active surveillance strategies for the management of papillary thyroid carcinoma.

Genotype by environment interactions for body weight in Mediterranean buffaloes using reaction norm models / Interacción genotipo × ambiente para peso corporal de búfalos Mediterráneos utilizando modelos de norma de reacción / Interação genótipo × ambiente para peso corporal de búfalos Mediterrâneos utilizando modelos de norma de reação

Abstract Background: Buffalo breeding has significantly increased in Brazil over recent years. However, few genetic evaluations have been conducted. Objective: To assess Genotype x Environment Interactions in the Mediterranean Water Buffalo in Brazil, for weight at 205 days of age, using reaction norm models via random regression. Methods: Data for buffaloes born between 1990 and 2014 were collected from five farms ascribed to the Brazilian Buffaloe Improvement Program, located in the North (1), Northeast (1), South (2) and Southeast (1) regions of Brazil. The initial database consisted of 5,280 observations at 205 days of age (W205). We assessed fit using two hierarchical reaction norm models: a two-step (HRNM2s) and a one-step (HRNM1s). Model fit was estimated using the Deviance Information Criterion, Deviance Based on Bayes Factors and Deviance based on Conditional Predictive Ordinate. The environmental descriptors were created to group individuals into common production environments based on year, season, herd and sex. Results: The best fit was obtained for the hierarchical reaction norm model with one-step (HRNM1s). Direct heritability estimates for this model ranged from 0.17 to 0.67 and the maternal heritability from 0.02 to 0.11 with increasing environmental gradient. Lower correlations among the sire classifications were obtained in comparison with HRNM1s in environments with low and high management, confirming the presence of genotype x environment interactions. Conclusion: We recommend a wider application of genetic evaluation in buffalo aimed at identifying optimal genotypes within specific environments.

Resumen Antecedentes: La cría de búfalos ha aumentado significativamente en Brasil en los últimos años. Sin embargo, se han realizado escasas evaluaciones genéticas. Objetivo: Evaluar las interacciones genotipo x ambiente en búfalos de agua Mediterráneos criados en Brasil, para peso a los 205 días de edad, utilizando modelos de reacción mediante regresión aleatoria. Métodos: Los datos de búfalos nacidos entre 1990 y 2014 se obtuvieron de cinco granjas situadas en el Norte (1), Nordeste (1), Sur (2) y del Sureste (1) de Brasil. Todas estas haciendas participan en el Programa Brasileño de Mejoramiento de Búfalos. Nuestra base de datos inicial consistió de 5.280 observaciones a los 205 días de edad (P205). Evaluamos el ajuste utilizando dos modelos de norma de reacción jerárquica: de dos pasos (HRNM2s) y un paso (HRNM1s). El ajuste del modelo se estimó usando el Criterio de información de la desviación, desviación basado en los factores de bayes y desviación basado en la ordenación predictiva condicional. Los descriptores ambientales fueron creados para agrupar individuos en ambientes de producción comunes basados en año, estación, rebaño y sexo. Resultados: El mejor ajuste se obtuvo para el modelo de norma de reacción jerárquica con un paso (HRNM1s). Las estimaciones de heredabilidad directa para este modelo variaron de 0,17 a 0,67 y la heredabilidad materna de 0,02 a 0,11 con gradiente ambiental creciente. Las correlaciones más bajas entre las clasificaciones de los reproductores se obtuvieron en comparación con las HRNM1s, en ambientes con bajo y alto manejo, confirmando la presencia de interacciones genotipo x ambiente. Conclusiones: Recomendamos la aplicación amplia de la evaluación genética en búfalos para identificar genotipos óptimos en ambientes específicos.

Resumo Antecedentes: A criação de búfalos aumentou significativamente no Brasil nos últimos anos. No entanto, eles raramente foram objeto de avaliações genéticas. Objetivo: Avaliar as interações genótipo x ambiente em búfalo Mediterrâneo criados no Brasil, para peso aos 205 dias de idade, utilizando modelos de reação por meio de regressão aleatória. Métodos: Os dados para búfalos de água do Mediterrâneo nascidos entre 1990 e 2014 foram coletados de cinco fazendas localizadas nas regiões Norte (1), Nordeste (1), Sul (2) e Sudeste (1) do Brasil. Todas essas fazendas participam do Programa Brasileiro de Melhoramento dos Búfalos. Nosso banco de dados inicial consistiu de 5.280 observações aos 205 dias de idade (P205). Nós avaliamos o ajuste usando dois modelos de norma de reação hierárquica: um de dois passos (HRNM2s) e um passo (HRNM1s). O ajuste do modelo foi estimado usando o Critério de informações do desvio, desvio baseado nos fatores de bayes e desvio baseado na ordenação preditiva condicional. Os descritores ambientais foram criados para agrupar indivíduos em ambientes de produção comuns baseados em ano, estação, rebanho e sexo. Resultados: O melhor ajuste foi obtido para o modelo de norma de reação hierárquica com um passo (HRNM1s). As estimativas de herdabilidade direta para este modelo variaram de 0,17 a 0,67 e a herdabilidade materna de 0,02 a 0,11 com gradiente ambiental crescente. As correlações mais baixas entre as classificações dos reprodutores foram obtidas em comparação com as HRNM1s, em ambientes com baixo e alto manejo, confirmando a presença de interações genótipo x ambiente. Conclusões: Recomendamos a aplicação mais ampla da avaliação genética em búfalos visando identificar genótipos ótimos em ambientes específicos.

Parameters and genetic trends for reproductive characteristics of a closed Angus herd / Parámetros y tendencias genéticas de características reprodutivas de um rebaño cerrado Angus / Parâmetros e tendências de carcaterísticas reprodutivas de um rebanho fechado Angus

Abstract Background: Closed breeding populations are useful to conduct basic and applied research. The Wye Angus herd is one of them. It was founded using only a few animals. The pedigree of the descendants of the original herd can be completely described by historical records resulting from strong selection. Wye Angus genetics has influenced that of Aberdeen Angus, Red Angus, and Brangus cattle worldwide. Objective: To evaluate parameters and genetic trends associated with the reproduction traits of the Wye Angus herd between the years 1937 and 2012. Methods: We used pedigree information of 11,692 individuals. The reproductive traits assessed were age at first calving (AFC), calving interval (CI), and scrotal circumference (SC). The covariance components were estimated by Bayesian inference. The genetic trends were obtained by linear regression of the genetic values over birth years of the animals. Results: The heritability estimates for AFC, and CI were negligible, although a small genetic gain was associated with CI. Because the AFC and CI values of the herd are small, past reproductive management has produced favourable results for the heifers. Conclusion: The Wye Angus herd has enough genetic variability for genetic gain through selection on SC.

Resumen Antecedentes: Las poblaciones reproductivas cerradas son útiles para realizar investigacion básica y aplicada. El hato Wye Angus es uno de ellos. Fue fundado utilizando sólo unos pocos animales. El pedigrí de los descendientes del hato original puede describirse completamente mediante registros históricos resultantes de una fuerte selección. La genética del Wye Angus ha influido en la del Aberdeen Angus, Red Angus y Brangus en todo el mundo. Objetivo: Evaluar los parámetros y las tendencias genéticas de características reproductivas del rebaño Wye Angus en el periodo entre 1937 y 2012. Métodos: Utilizamos información de pedigrí de 11.692 individuos. Las características evaluadas fueron circunferencia escrotal (SC), edad al primer parto (AFC) y el intervalo entre partos (CI). Los componentes de (co)variancia fueron obtenidos mediante metodología Bayesiana. Las tendencias genéticas fueron obtenidas por regresión lineal ponderada de los valores genéticos sobre el año de nacimiento del animal. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para AFC y CI fueron insignificantes, aunque se asoció un pequeño beneficio genético con CI. Sin embargo, la AFC y el CI del rebaño son bajos, indicando que el manejo reproductivo ha traído resultados favorables para las novillas. Conclusion: El rebaño Wye Angus posee suficiente variabilidad genética para la ganancia genética por medio de la selección para SC.

Resumo Antecedentes: O rebanho Wye Angus foi fundado a partir de poucos animais e destaca-se por ser um rebanho fechado, com informações completas de pedigree e forte seleção, oferecendo vantagens únicas em termos de realização de pesquisas em melhoramento genético animal. Além disso, a genética de Wye Angus tem influenciado os de Aberdeen Angus, Red Angus e Brangus em todo o mundo. Objetivo: Avaliar os parâmetros genéticos e tendências de características reprodutivas do rebanho Wye Angus no período entre 1937 e 2012. Métodos: Foram usadas informações do pedigree de 11.692 individuos. As características avaliadas foram: perímetro escrotal (SC), idade ao primeiro parto (AFC), e do intervalo entre partos (CI). Componentes de (co) variância foram obtidos por meio da metodologia Bayesiana. As tendências genéticas foram obtidas por regressão linear ponderada dos valores genéticos sobre o ano de nascimento do animal. Resultados: Hereditariedade para AFC e CI foram insignificantes, embora um pequeno ganho genético tenha sido associado a CI. No entanto, os valores para AFC e CI do rebanho são baixos, indicando que o manejo reprodutivo trouxe resultados favoráveis para as novilhas. Conclusão: O rebanho Wye Angus tem variabilidade genética suficiente para ganho genético através de seleção para SC.

Malignancy rates for Bethesda III subcategories in thyroid fine needle aspiration biopsy (FNAB)

OBJECTIVES: Most thyroid diseases are nodular and have been investigated using ultrasound-guided fine needle aspiration biopsy (FNAB), the reports of which are standardized by the Bethesda System. Bethesda category III represents a heterogeneous group in terms of lesion characteristics and the malignancy rates reported in the literature. The objective of the present study was to evaluate the differences in the malignancy rates among Bethesda III subcategories. METHODS: Data from 1,479 patients who had thyroid surgery were reviewed. In total, 1,093 patients (89.6% female, mean age 52.7 (13-89) years) were included, and 386 patients were excluded. FNAB results (based on Bethesda Class) and histopathological results (benign or malignant) for coincident areas were collected. Bethesda III patients were subcategorized according to cytopathological characteristics (FLUS: follicular lesion of undetermined significance, Bethesda IIIA; AUS: atypia of undetermined significance, Bethesda IIIB). Data were correlated to obtain the malignancy rates for each Bethesda category and the newly defined subcategory. RESULTS: FNAB results for these patients were as follows: Bethesda I: 3.1%; Bethesda II: 18.6%; Bethesda III: 35.0%; Bethesda IV: 22.1%; Bethesda V: 4.1%; and Bethesda VI: 17.1%. The malignancy rates for Bethesda Class IIIB were significantly higher than those for Bethesda Class IIIA (p<0.001) and Bethesda Class IV (p<0.001). Bethesda Class IIIA showed significantly lower malignancy rates than Bethesda Class III overall (p<0.001) CONCLUSIONS: Improvements of the Bethesda System should consider this subcategorization to better reflect different malignancy rates, which may have a significant impact on the decision-making process.

Genetic variability of Leishmania infantum in naturally infected dogs in the state of Bahia, Brazil / Variabilidade genética de Leishmania infantum em cães naturalmente infectados no estado da Bahia, Brasil

Abstract In Brazil, Leishmania infantum mainly affects humans and dogs. The state of Bahia presents many dogs that are positive for this parasite. Despite the importance of epidemiology in this region, there are still very few studies that have assessed the genetic characteristics of L. infantum. The aim of this study is to investigate the genetic variability of L. infantum isolated identified in naturally infected dogs, in order to verify occurrence of subpopulation of this parasite in the different biomes existing in the state of Bahia. Thirty-two samples of L. infantum were analyzed, which were obtained isolated in dogs from the Mata Atlântica (rainforest), Caatinga (semi-arid scrub forest), and Cerrado (a vast tropical savannah eco-region) Bahia municipalities' biomes. All animals presented with clinical changes suggestive of Leishmania spp. and they exhibited positive reactions to serological tests. kDNA analysis with RFLP markers revealed the presence of genetic variability and gene flow in subpopulations of L. infantum; samples from the Mata Atlântica areas were genetically more similar to those from the areas of Caatinga and they were less likely to resemble those of the Cerrado. This data may be used to investigate the dissemination of parasite in the canine population of state of Bahia.

Resumo No Brasil a Leishmania infantum afeta principalmente o homem e os cães. O estado da Bahia apresenta elevado número de cães positivos por este parasito. Apesar da importância epidemiologia para a região, ainda há poucos estudos que avaliam as características genéticas de L. infantum. Objetivou-se com este estudo investigar a variabilidade genética de cepas de L. infantum identificadas em cães naturalmente infectados, a fim de verificar a ocorrência de sobpopulações do parasito nos diferentes biomas existentes no estado da Bahia. Foram analisadas 32 amostras de L. infantum isoladas em cães de municípios baianos distribuídos nos biomas Mata Atlântica, Caatinga e Cerrado. Todos os animais apresentavam alterações clínicas sugestivas de Leishmania spp. e reação positiva em exames sorológicos. A análise do kDNA com marcadores RFLP revelaram a presença de variabilidade genética e fluxo gênico nas subpopulações de L. infantum sendo que as amostras das áreas de Mata Atlântica foram geneticamente mais semelhantes as das áreas de Caatinga e foram mais distantes daquelas oriundas do Cerrado. Estas informações podem auxiliar em investigações de dispersão do parasito na população canino do Estado da Bahia.

Bovine babesiosis and anaplasmosis complex: diagnosis and evaluation of the risk factors from Bahia, Brazil / Complexo tristeza parasitária bovina: diagnóstico e avaliação dos fatores de risco na Bahia, Brasil

Direct diagnoses were made by using - blood smears and nested PCR (nPCR) tests on 309 blood samples from crossbred dairy cattle in the municipality of Ibicaraí, Bahia. From diagnostic blood smear slides, the observed parasitic frequencies were 31.1% for Anaplasma marginale and 20.4% for Babesia sp. From nPCR diagnoses, they were 63% for A. marginale, 34% for Babesia bigemina and 20.4% for Babesia bovis. There were significant differences (P <0.01) between the two diagnostic methods (nPCR and blood smear slides). The compliance obtained from the kappa test was 0.41 and 0.48 for A. marginale and Babesia sp., respectively. The tick samples from the six farms analyzed using nPCR were only positive for A. marginale. Evaluation of the risk factors relating to the presence of ticks and the age of the animals showed that there was a significant association (P <0.01) with the frequency of animals infected with both pathogens. Therefore, under the conditions studied, nPCR proved to be a good tool for diagnosing the agents of the bovine babesiosis and anaplasmosis complex because of its sensitivity and specificity in comparison with blood smears. The municipality of Ibicaraí is an area with endemic prevalence of bovine babesiosis and anaplasmosis confirmed by nPCR and A. marginale is the main agent of the disease.

Realizou-se o diagnóstico direto por esfregaço sanguíneo e nested PCR (nPCR) em 309 amostras de sangue de bovinos mestiços leiteiros provenientes do município de Ibicaraí, Bahia. A frequência observada no diagnóstico por lâminas de esfregaço sanguíneo foi 31,1% para Anaplasma marginale e 20,4% para Babesia sp. Enquanto que no diagnóstico por nPCR foi 63% para A. marginale, 34% para Babesia bigemina e 20,4% Babesia bovis. Verificaram-se diferenças significativas (P<0,01) na comparação entre os dois métodos de diagnósticos (nPCR e esfregaço sanguíneo). A concordância ao teste KAPPA obtida foi de 0,41 e 0,48 para A. marginale e Babesia sp., respectivamente. As amostras de carrapatos das seis propriedades analisadas por nPCR foram positivas apenas para A. marginale. Na avaliação dos fatores de risco verificou-se que a presença de carrapato e idade dos animais apresentaram associação significativa (P<0,01) com a frequência de animais infectados por ambos os patógenos analisados por nPCR. Portanto, nas condições estudadas, a nPCR revelou-se uma boa ferramenta para diagnóstico dos agentes do complexo tristeza parasitária bovina (TPB) devido a sensibilidade e especificidade, quando comparado ao esfregaço sanguíneo. O município de Ibicaraí apresenta-se como uma área endêmica para TPB com prevalência comprovada através de nPCR e, A. marginale o principal agente encontrado.

Positioning and number of nutritional levels in dose-response trials to estimate the optimal-level and the adjustment of the models / Posição e número de níveis nutricionais em experimentos dose-resposta na estimativa do nível-ótimo e ajuste dos modelos

The aim of this research was to evaluate the influence of the number and position of nutrient levels used in dose-response trials in the estimation of the optimal-level (OL) and the goodness of fit on the models: quadratic polynomial (QP), exponential (EXP), linear response plateau (LRP) and quadratic response plateau (QRP). It was used data from dose-response trials realized in FCAV-Unesp Jaboticabal considering the homogeneity of variances and normal distribution. The fit of the models were evaluated considered the following statistics: adjusted coefficient of determination (R²adj), coefficient of variation (CV) and the sum of the squares of deviations (SSD).It was verified in QP and EXP models that small changes on the placement and distribution of the levels caused great changes in the estimation of the OL. The LRP model was deeply influenced by the absence or presence of the level between the response and stabilization phases (change in the straight to plateau). The QRP needed more levels on the response phase and the last level on stabilization phase to estimate correctly the plateau. It was concluded that the OL and the adjust of the models are dependent on the positioning and the number of the levels and the specific characteristics of each model, but levels defined near to the true requirement and not so spaced are better to estimate the OL.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência do número e posição de níveis nutricionais utilizados em ensaios dose-resposta na estimativa do nível-ótimo (OL) e ajuste dos modelos polinomial quadrático (QP), exponencial (EXP), linear response plateau (LRP) e quadratic respose plateau (QRP). Utilizaram-se dados provenientes de ensaios dose-resposta realizados na FCAV-Unesp Jaboticabal, atendendo as pressuposições de homocedasticidade e normalidade. O ajuste dos modelos foi avaliado considerando as seguintes estatísticas: coeficiente de determinação ajustado (R²adj), coeficiente de variação (CV) e soma dos quadrados dos desvios (SSD).Verificou-se que, nos modelos QP e EXP, pequenas mudanças na localização e distribuição dos níveis ocasionam grandes alterações na estimativa do OL. O modelo LRP foi influenciado pela ausência ou presença do nível intermediário às fases de resposta e estabilização (mudança da reta crescente para platô). O modelo QRP precisou de um número maior de níveis na fase de resposta e o último nível da fase de estabilização para estimar corretamente o platô. Pôde-se concluir que a determinação do OL e o ajuste dos modelos dependem da posição e quantidade de níveis, além das características específicas de cada modelo, mas níveis definidos próximos do verdadeiro requerimento e não muito espaçados são melhores para estimar corretamente o OL.

Avaliação da estabilidade foto-oxidativa dos óleos de canola e de milho em presença de antioxidantes sintéticos / Evaluation of stability photo-oxidative of canola oil and corn oilin the presence of synthetic antioxidants

A estabilidade dos óleos vegetais à oxidação depende do equilíbrio entre a composição e a presença de pró-oxidantes e antioxidantes. O objetivo deste estudo consistiu em avaliar o efeito da presença de antioxidantes sintéticos durante o processo de foto-oxidação dos óleos de canola e milho. As amostras dos óleos de canola e milho em presença e em ausência dos antioxidantes butil-hidroxitolueno (BHA), propil galato (PG) e terc butil-hidroquinona (TBHQ), foram submetidas ao estresse foto-oxidativo. A reação de foto-oxidação seguiu uma cinética de primeira ordem. A constante de velocidade no período de 20 dias de foto-oxidação evidenciou que o antioxidante PG apresentou maior efeito protetor para o óleo de canola e o TBHQ para o óleo de milho. A partir dos dados de UV e RMN de ¹H, no período de 60 dias, constatou-se que os três antioxidantes apresentaram um efeito protetor a foto-oxidação. Os dados de UV evidenciaram aumento de absorção da banda em 232 nm devido à foto-oxidação e formação de dienos conjugados. A redução da intensidade de absorção desta banda na foto-oxidação com o tempo de exposição revelou que a proteção, tanto para o óleo de canola como para o de milho, foi mais efetiva com o antioxidante PG. Os índices de oxidação Roa e fração residual de hidrogênios (H) dialílicos, alílicos e vinílicos também evidenciaram que o antioxidante PG apresentou o melhor desempenho na proteção dos dois tipos de óleo.

The stability of vegetable oils in relation to oxidation depends on the balance between the composition and the presence of antioxidants and pro-oxidants. The objective of this study was to evaluate the effect of the presence of antioxidants in vegetable oils in the protection of photo-oxidation. Samples of canola oil and corn oil in the presence and absence of the antioxidants, butylated hydroxytoluene (BHA), propyl gallate (PG) and tert-butylhydroquinone (TBHQ), were subjected to photo-oxidative stress at room temperature for 60 days. The photo-oxidation reaction followed a first order kinetics. The rate constant for the period of 20 days of photo-oxidation showed that the PG antioxidant showed greater protective effect for canola oil and TBHQ showed a greater protective effect for corn oil. The UV and ¹H NMR data at 60 days showed that the three antioxidants had a protective effect on photo-oxidation. The UV data showed increased absorption at the 232nm band due to photo-oxidation and the formation of conjugated dienes. The reduction in intensity of this absorption band in photo-oxidation with time of exposure revealed that the protection, both for the canola oil and for the corn oil, was more effective with the PG antioxidant. The rates of Roa oxidation and residual fraction of diallyl, allyl and vinyl hydrogens also showed that the PG antioxidant showed the best performance in protecting both oils.

Interação genótipo x local x regime alimentar em bovinos nelore por meio de componentes principais de três modos

O principal objetivo deste estudo foi aplicar componentes principais com múltiplas matrizes de dados para verificar a interação tripla genótipo x local x regime alimentar no valor genético do efeito direto do peso, aos 205 dias de idade. Foram utilizados touros com filhos em três regiões de produção do Nordeste Brasileiro (Maranhão, Mata e Agreste, e Recôncavo Baiano) e criados nos regimes alimentares a pasto ou com suplementação. Não se evidenciou interação genótipo x local para a característica estudada, entretanto, constatou-se interação do genótipo x regime alimentar. A utilização dos touros deve ser direcionada de acordo com o regime alimentar de seus filhos.

The main objective of this study was to apply three-mode principal component analysis to assess the triple interaction (genotype x location x feeding) on direct genetic value for weight at 205 days of age. We used 60 sires with offspring in three regions of northeastern Brazil (Maranhão, Mata and Agreste, and Recôncavo Baiano) and raised on a pasture regime or with supplementation. There was no interaction between genotype and location, but there was a correlation between genotype and direct effect of feeding. The use of sires should be dictated according to the system of rearing of their offspring.

Genetic variability in Mediterranean buffalos evaluated by pedigree analysis / Variabilidade genética na raça bubalina Mediterrânea avaliada por meio de análise de pedigree

The objective of this research was to study the population genetic structure of four herds of Mediterranean buffaloes in Brazil. It was used pedigree data from 6,588 buffaloes of Mediterranean breed born from 1980 to 2002. Of the total number of animals studied, 60.5, 15.3 and 2.1% had a pedigree in the first, second and third ascendancy, respectively. The effective number of herds that provided breeding males was 1.60 for parents, 1.16 for grandparents and 1.00 for great-grandparents. There were 923 founder animals and only 71 effective founders. The effective number of ancestors explaining the genetic variability of the population was 71 and only 30 ancestors accounted for 50% of the genetic variability of the population. The average relatedness coefficient (AR) between individuals and inbreeding (F) of the population were estimated at 0.37 and 0.34% respectively. The average estimate of generation interval was 8.71±2.85 years. The variability of the current population is the result of a few ancestors, who are mostly also founders showing that the population was developed from a narrow genetic base which characterizes the occurrence of founder effect.

O objetivo deste trabalho foi estudar a estrutura genética populacional de bubalinos da raça Mediterrâneo, em quatros rebanhos, no Brasil. Foram utilizados dados de pedigree de 6.588 bubalinos da raça Mediterrâneo nascidos no período de 1980 a 2002. Do total de animais estudados, 60,5; 15,3 e 2,1% possuíam pedigree na primeira, segunda e terceira ascendência, respectivamente. O número efetivo de rebanhos que forneceram machos reprodutores foi de 1,60 para pais; 1,16 para avôs e 1,00 para bisavôs. O número de animais fundadores foi 923 e o número efetivo de fundadores foi apenas 71. O número efetivo de ancestrais que explicaram a variabilidade genética da população foi de 71 e somente 30 ancestrais explicaram 50% da variabilidade genética da população. Os coeficientes médios de relação (CR) entre os indivíduos da população e de endogamia (F) foram estimados em 0,37 e 0,34%, respectivamente. A estimativa média do intervalo de gerações foi de 8,71±2,85 anos. A variabilidade da população atual é fruto da contribuição de poucos ancestrais, que são, na sua maioria, também fundadores, evidenciando que a população se desenvolveu a partir de uma base genética estreita, o que caracteriza a ocorrência do efeito fundador.

Análise de agrupamento na seleção de modelos de regressão não-lineares para curvas de crescimento de ovinos cruzados / Cluster analysis applied to nonlinear regression models selection to growth curves of crossed lambs

Este estudo teve como objetivo utilizar a análise de agrupamento para classificar modelos de regressão não-lineares usados para descrever a curva de crescimento de ovinos cruzados, tendo em vista os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste. Para tanto, utilizaram-se dados de peso-idade dos seguintes cruzamentos entre raças de ovinos de corte: Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. Após a indicação do melhor modelo, objetivou-se ainda aplicar a técnica de identidade de modelos a fim de identificar o cruzamento mais produtivo. Foram ajustados doze modelos não-lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, critérios de informação de Akaike e Bayesiano, erro quadrático médio de predição e coeficiente de determinação de predição. A análise de agrupamento indicou o modelo Richards como o mais adequado para descrever as curvas de crescimento dos três grupos genéticos considerados, e os testes de identidade de modelos indicaram o cruzamento Dorper x Santa Inês como sendo o mais indicado para a pecuária local.

This study had the objectives to use the cluster analysis in order to classify nonlinear regression models used to describe the growth curve in relation to different quality fit evaluators. Were utilized weight-age data from the following crossbred beef lambs Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. After the choice of the best model, we aimed also to apply the model identity in order to identify the most efficient crossbred group. Eleven nonlinear models were used, whose fit quality was measured by determination coefficient, Akaike information criterion, Bayesian information criterion, mean quadratic error of prediction and predicted determination coefficient. The cluster analysis indicated the Richards as the best model for the three data sets, and the model identity tests revealed that the Dorper x Santa Inês crossbred group was recommend for meat production.

A canonical correlation analysis of the association between carcass and ham traits in pigs used to produce dry-cured ham

The association between carcass and ham traits in a pig population used to produce dry-cured ham was studied using canonical correlation analysis. The carcass traits examined were hot carcass weight (HCW), backfat thickness (BT) and loin depth (LD), and the ham traits studied were gross ham weight (GHW), trimmed ham weight (THW), ham inner layer fat thickness (HIFT), ham outer layer fat thickness (HOFT), pH (pH) and the Göfo value. Carcass and ham traits are not independent. The canonical correlations (r) between the carcass and ham traits at 130 kg were 0.77, 0.24 and 0.20 for the first, second and third canonical pair, respectively, and were all significant (p < 0.01) by the Wilks test. The corresponding canonical correlations between the three canonical variate pairs for the carcass and ham traits at 160 kg were 0.88, 0.42 and 0.14, respectively (p < 0.05 for all, except the third). The correlations between the traits and their canonical variate showed an association among HCW, GHW and THW, and between BT and HOFT. These results indicate that carcass traits should be used to cull pigs that are not suitable for dry-cured ham production.

History of registered Gyr breed in Brazilian Northeast: population structure and genetic improvement of growth traits / Histórico da raça Gir registrada no Nordeste brasileiro: melhoramento genético em características de crescimento e estrutura populacional

This paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.

Com o intuito de fornecer subsídios para programas de conservação, seleção e expansão da raça Gir no Nordeste do Brasil, objetivou-se avaliar o histórico do rebanho Gir registrado no nordeste brasileiro, com base na sua estrutura populacional e no progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O progresso genético para a raça no Nordeste foi ocasionado exclusivamente pelo melhoramento ambiental. O tamanho efetivo da população reduziu a partir da década de 90, e o coeficiente de endogamia médio aumentou durante o período estudado. É imprescindível que o tamanho efetivo da raça Gir do nordeste seja ampliado e que haja maior controle de acasalamentos entre indivíduos aparentados, para prevenção da endogamia e conservação da variabilidade genética e viabilidade da raça.

Actinic lesions in fishermen's lower lip: clinical, cytopathological and histopathologic analysis

INTRODUCTION: Actinic cheilitis (AC) is considered to be a pre-malignant lesion or an incipient and superficial form of lip squamous cell carcinoma. It is commonly found in individuals whose occupational activities are related to chronic sun exposure and the definitive diagnosis is performed with biopsy. Althoug Exfoliative cytology has been used as a screening procedure to evaluate cancer of the oral cavity no studies have proposed the use of exfoliative cytologic analysis to evaluate and diagnose AC. OBJECTIVE: The purpose of this study was to evaluate lower lip lesions on fishermen related to chronic solar exposure using clinical, cytologic and histopathologic analyses. PATIENTS AND METHODS: Smears taken from the vermilion of the lower lips of 125 fishermen and 30 control individuals were subjected to cytologic analysis. RESULTS: The harvested cells were sufficient for cytologic analysis in 83.2 percent of the samples. Sixteen fishermen exhibited prominent lower lip lesions that justified biopsy and histological studies. In total, 4 specimens were malignant (3.2 percent), and 12 displayed epithelial dysplasia, demonstrating that the prevalence of epithelial dysplasia and malignant lesions was high among the fishermen population. These conditions were strongly associated with infiltration and blurring of the vermilion margin of the lower lip. CONCLUSION: The cytologic analysis was not useful for detecting epithelial dysplasia or malignant alterations.

Transport of jundiá Rhamdia quelen juveniles at different loading densities: water quality and blood parameters

Fish transportation is a common practice on fish farms and is considered to be a stressor that could negatively affect fish health. The objective of this study was to evaluate several physiological responses of stress in jundiá caused by transport at different loading densities. Jundiá juveniles were placed in plastic bags on a mechanical transport simulator for four hours at four different loading densities (75, 150, 250 and 350 g L-1) and then transferred to sixteen 80-L plastic boxes for 96 hours after transport. Water samples were collected before and after transport to measure dissolved oxygen, temperature, pH and ammonia levels. Blood samples were taken at departure and arrival, as well as at 24 and 96 hours after transport to monitor cortisol, glucose, ammonia, chloride and hematocrit levels. Water ammonia levels were found to increase gradually as loading densities increased. Plasma ammonia was higher after transport in fish from all treatments. Compared to initial values, substantial increases in plasma cortisol and ammonia levels were detected mainly in those fish submitted to the highest loading density. Blood glucose appeared to be positively influenced by the increase of transport densities. No statistical differences were observed in any of the other blood parameters. The costs in fish culture, as in other animal production systems, must be minimized and fish producers depend on optimal techniques to ensure better profit. Therefore, based on fish survival and the physiological indicators determined in the present study, especially during recovery, the best density at which to transport jundiá in plastic bags for four hours is about 350 g/L.

O transporte de peixes é uma prática comum em piscicultura e considerado como um agente estressor que causa efeitos negativos na saúde do peixe. O objetivo deste estudo foi avaliar algumas respostas fisiológicas de estresse no jundiá causadas pelo transporte em densidades diferentes. Juvenis de jundiá foram transportados em sacos plásticos num simulador de transporte por quatro horas em diferentes densidades (75, 150, 250 e 350 g L-1) e transferidos para 16 caixas plásticas de 80 L por 96 horas após o transporte. Amostras de água foram coletadas antes e após o transporte para determinações de oxigênio dissolvido, temperatura, pH e amônia. Além dos momentos da saída e da chegada, amostras de sangue foram retiradas 24 e 96 horas após o transporte para monitorar os níveis de cortisol, glicose, amônia, cloreto e hematócrito. A amônia na água aumentou gradualmente acompanhando o aumento das densidades. A amônia plasmática estava elevada após o transporte nos peixes de todos os tratamentos. Comparando com os valores iniciais, aumentos substanciais nos níveis plasmáticos de cortisol e amônia foram registrados principalmente nos peixes submetidos à densidade de transporte mais elevada. Os níveis glicêmicos parecem ter sido influenciados pelo aumento nas densidades de transporte. Não foram registradas diferenças significativas nos demais parâmetros sanguíneos. O custo da criação de peixes, da mesma forma que de outros animais, deve ser minimizado e os produtores dependem de técnicas que permitam lucros maiores. Portanto, com base nos indicadores fisiológicos e na taxa de sobrevivência obtidos no presente estudo, especialmente considerando o período de recuperação, sugere-se que a melhor densidade para o transporte do jundiá em sacos plásticos por quatro horas seja de aproximadamente 350 g/L.

Acidic polysaccharides from Psidium cattleianum (Araçá)

The aim of this work was to study the acidic polysaccharides of Psidium cattleianum. Pectic fractions were obtained by successive extractions with water, EDTA and sodium carbonate (4 and 25ºC). Monosaccharide composition, total carbohydrates, uronic acids and protein contents were determined for each fraction. The yield of water and EDTA-soluble fractions and high content of uronic acid were consistent with the presence of pectins probably arising from the middle lamellae. On the other hand, sodium carbonate-soluble pectins had a higher neutral sugar content, indicating highly branched polysaccharides in these fractions, consistent with pectins from cell wall.

Psidium cattleianum, árvore nativa do sul do Brasil, produz frutos popularmente conhecidos como araçá e que muitas vezes não são colhidos e estragam nos campos. Neste trabalho, os frutos de P. cattleianum foram utilizados como fonte de polissacarídeos ácidos. Frações de pectinas foram obtidas por extrações seqüenciais com água, agente quelante (EDTA) e carbonato de sódio (4 e 25ºC). A composição monossacarídica, os teores de açúcar total, ácidos urônicos e proteínas foram determinados para cada fração. O rendimento das frações solúveis em água e EDTA e o elevado teor de ácidos urônicos são consistentes com a presença de pectinas oriundas provavelmente da lamela média. Por outro lado, as pectinas solúveis em carbonato de sódio têm o maior teor de açúcares neutros, indicando a presença de polissacarídeos altamente ramificados nestas frações, consistentes com pectinas da parede celular.

Biogeography and comparative cytogenetics between two populations of Hoplias malabaricus (Bloch, 1794) (Ostariophysi: Erythrinidae) from coastal basins in the State of Bahia, Brazil

The species Hoplias malabaricus is a predator fish found in nearly all cis-Andean basins. From a cytogenetic point of view, this species comprises, at least, seven differentiated karyomorphs. Several localities have been formerly analyzed in Brazil, however, some regions, such as Bahia State, remain underrepresented. Recently, the Brazilian Environment Ministry classified both Itapicuru and Contas river basins (entirely located within Bahia territory) as priority conservation areas, whose biodiversity status lacks enough information. Therefore, the goal of the present work was to characterize, cytogenetically, populations of H. malabaricus from both basins, by using conventional staining, Ag-NOR and C-banding techniques. All specimens presented a diploid number of 2n = 40 with metacentric/submetacentric chromosomes, without differences between sexes, thereby representing the so-called "karyomorph F". The first metacentric pair presented a remarkably larger size in relation to the other pairs. The NORs were multiple, comprising the terminal region on long arms of two chromosomal pairs in both populations. However, the C-banding pattern was somewhat distinguishable between samples. Although sharing heterochromatic blocks at centromeric region of all chromosomes, the population from Itapicuru River basin appeared to have some more conspicuous blocks than those observed in the population from Contas River basin. The similar karyotype observed in both populations suggests a common geological history between them. The present results represent an advance in the knowledge about the cytogenetic pattern of H. malabaricus populations from poorly studied basins.(AU)

A espécie Hoplias malabaricus é um predador que ocorre em praticamente todas as bacias cis-andinas. Sob o ponto de vista citogenético, ela compreende, pelo menos, sete cariomorfos diferenciáveis. Várias localidades já foram previamente analisadas no Brasil, porém, algumas regiões, como o Estado da Bahia, permanecem pouco amostradas. Recentemente, o Ministério de Meio Ambiente classificou as bacias do rio Itapicuru e Contas (inteiramente localizadas na Bahia), como áreas prioritárias de conservação, cuja biodiversidade carece de informações suficientes. Neste sentido, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar citogeneticamente populações de H. malabaricus nessas bacias, por meio de técnicas de coloração convencional, Ag-RON e bandamento C. Todos os espécimes e populações analisadas apresentaram número diploide 2n = 40 com cromossomos metacêntricos/submetacêntricos, sem diferenças entre os sexos, representando assim o denominado "cariomorfo F". O primeiro par metacêntrico apresentou tamanho notavelmente maior que os demais pares. As RONs foram múltiplas, ocupando a região terminal do braço longo de dois pares cromossômicos em ambas populações. Entretanto, os padrões de heterocromatina foram relativamente diferenciáveis entre as bacias hidrográficas estudadas. Apesar de compartilharem blocos heterocromáticos na região centromérica de todos os cromossomos, a população da bacia do Itapicuru apresentou alguns blocos mais conspícuos em relação aos da bacia do rio de Contas. O cariótipo similar encontrado em ambas as populações parece indicar uma história geológica em comum. Os dados obtidos representam um avanço no conhecimento dos padrões citogenéticos de populações de H. malabaricus provenientes de bacias pouco estudadas(AU)

A multi-approach analysis of the genetic diversity in populations of Astyanax aff. bimaculatus Linnaeus, 1758 (Teleostei: Characidae) from Northeastern Brazil

Few reports are available about the ichthyofauna of typical semi-arid rivers, although the regional diversity has been constantly threatened by human activities, mainly related to impoundment and construction of dams. The goal of the present work was to evaluate using different methods, the population genetic structure of a characin fish, Astyanax aff. bimaculatus, widespread throughout hydrographic basins of Bahia, Northeastern Brazil. Morphological (meristic and morphometric data), cytogenetic (karyotype and Ag-NOR), and molecular (RAPD and SPAR) analyses were carried out in specimens collected upstream and downstream of Pedra Dam, in the main channel of Contas River (Contas River Basin), and in the Mineiro stream, which belongs to the adjacent Recôncavo Sul basin. Few external differences were detected among populations, where the individuals collected upstream of Pedra Dam were slightly larger than the others. Cytogenetic data also showed a similar karyotypic pattern (2n=50; 6m+28sm+12st+4a; FN= 96) and NORs located on the short arms of up to two chromosome pairs, with numerical inter- and intra-populational variation. Nonetheless, RAPD and SPAR analyses differentiated reliably the three populations, revealing striking differences in the allele frequencies among the localities studied and a significant difference in population structure index (Fst=0.1868, P<0.0001). The differences between populations within a same river were as significant as those between distinct hydrographic basins, indicating that the dam/reservoir represents an effective barrier to gene flow. Additionally, environmental peculiarities from each locality are also believed to influence the genetic patterns detected herein. On the other hand, the similarity between samples from Contas River and Recôncavo Sul basins could be related to a common evolutionary history, since both basins are geographically close to each other. Finally, the present study shows that a...

Poucos estudos ictiofaunísticos estão disponíveis em rios típicos do semi-árido, apesar da constante ameaça à diversidade local devido a influências antrópicas, com destaque para o represamento e construção de barragens. O presente trabalho teve como objetivo avaliar, por meio de diferentes metodologias, a estrutura genética de populações de uma espécie de caracídeo, Astyanax aff. bimaculatus, amplamente distribuída em bacias hidrográficas da Bahia, Nordeste do Brasil. Análises morfológicas (dados merísticos e morfométricos), citogenéticas (cariótipo e Ag-RONs) e moleculares (RAPD e SPAR) foram realizadas em espécimes coletados à montante e à jusante da Barragem da Pedra, na calha principal do médio rio de Contas (bacia do Rio de Contas) e no ribeirão Mineiro, pertencente à bacia adjacente do Recôncavo Sul. Poucas diferenças externas foram detectadas entre as populações, sendo os indivíduos originários do reservatório, à montante da barragem, ligeiramente maiores. Os dados citogenéticos também mostraram padrões cariotípicos semelhantes (2n=50; 6m+28sm+12st+4a; FN= 96) e RONs situadas nos braços curtos de até dois pares cromossômicos, com variação numérica inter- e intra-populacional. Contudo, as análises por RAPD e SPAR diferenciaram as três populações de forma eficiente, revelando freqüências alélicas significativamente diferentes entre as localidades amostradas e índices significativos de estruturação populacional (Fst=0.1868, P<0.0001). As diferenças entre populações do mesmo rio foram tão significativas quanto entre bacias hidrográficas distintas, indicando que a represa constitui uma barreira eficiente ao fluxo gênico. Além disso, acredita-se que peculiaridades ambientais de cada localidade possam também influenciar os padrões genéticos encontrados. Por outro lado, a similaridade entre amostras das bacias do Rio de Contas e Recôncavo Sul pode estar relacionada a uma história evolutiva comum, já que ambas estão geograficamente próximas...

Cytogenetic and morphological diversity in populations of Astyanax fasciatus (Teleostei, Characidae) from Brazilian northeastern river basins

In the present work, morphometric and cytogenetic analyses were carried out in populations of the fish Astyanax fasciatus (Characidae) from Contas and Recôncavo Sul River basins (State of Bahia, Brazil), providing new data on the genetic structure of this species along the region. Based on morphologic measurements, we observed that populations from the same hydrographic basin were more similar to each other (Contas and Preto do Costa Rivers), and remarkably divergent from Recôncavo Sul (Mineiro Stream), as indicated by clustering analysis. Cytogenetic data revealed a same diploid number for all populations (2n = 48), but distinct karyotype formulae (8M+24SM+12ST+4A, FN = 92 in Contas River, 8M+24SM+10ST+6A, FN = 90 in Preto do Costa River, and 8M+18SM+16ST+6A, FN = 90 in Mineiro Stream). Ag-NORs were identified at telomeres on a subtelocentric chromosome pair, although multiple ribosomal sites have been detected in some specimens from Contas River. These results show that A. fasciatus populations from northeastern river basins are well differentiated and present peculiar cytogenetic features when compared to populations from other regions. Therefore, the apparent chromosomal plasticity of this species, likely to represent a complex of cryptic forms, is corroborated. Finally, we demonstrated that morphological features can be successfully used to support other sources of genetic information.