High prevalence of hepatitis A and E viruses in environmental and clinical samples from West Argentina

ABSTRACT Environmental surveillance of water sources is important to monitoring viral hepatitis transmission in clinical settings. This study investigated the circulation of hepatitis A (HAV) and E (HEV) viruses in sewage and clinical samples from Argentina. Between 2016 and 2017, 80 raw sewage samples and 86 clinical samples (stool and serum) from suspected cases of hepatitis A and hepatitis E were obtained. HAV and HEV were tested by both real-time and nested PCR. Positive samples were sequenced for genotype determination and phylogenetic analysis. Overall, HAV was recovered in 39% of sewage samples and 61.1% of clinical samples. HEV was detected in 22.5% of sewage samples and 15.9% of clinical samples. HAV was found more frequently in sewage during the winter and in clinical samples in spring; HEV was more prevalent in sewage during summer and in clinical samples in autumn. All HAV isolates belonged to genotype IA and HEV isolates belonged to genotype 3, the most prevalent genotypes in South America. High prevalence of HAV and HEV in environmental and clinical samples in Mendoza, Argentina was observed. These findings reinforce the importance of environmental surveillance and implementation of health strategies to control the spread of HAV and HEV in developing countries.

Infección Respiratoria Aguda por metapneumovirus humano en Ushuaia, Argentina: descripción del primer caso / Acute lower respiratory infection by human metapneumovirus in Ushuaia, Argentina: description of the first patient

RESUMEN Hacia fines del año 2003, en la ciudad de Ushuaia resultó llamativa la cantidad de niños internados con cuadros respiratorios graves y estudios virológicos negativos. Sobre la base de publicaciones acerca de la circulación de un nuevo virus respiratorio, metapneumovirus humano, se decidió investigar su presencia en tres muestras respiratorias de niños internados con infección respiratoria aguda en el Hospital Regional de Ushuaia. Los aspirados nasofaríngeos, previamente negativos para los virus respiratorios comunes por la técnica de inmunofluorescencia, fueron estudiados mediante la técnica de transcripción inversa y amplificación genómica por reacción en cadena de la polimerasa para metapneumovirus humano. Una de las muestras resultó positiva para metapneumovirus humano. En ninguno de los pacientes se detectaron anticuerpos de clase IgM para Chlamydia spp y Mycoplasma pneumoniae, por la técnica de inmunofluorescencia. La descripción del presente caso enfatiza la necesidad de ampliar el espectro diagnóstico en niños internados que resulten negativos para los virus respiratorios más comunes.

En anticipación de una vacuna antirrotavirus: revisión de estudios epidemiológicos sobre la diarrea por rotavirus en la Argentina / Anticipating rotavirus vaccines: review of epidemiologic studies of rotavirus diarrhea in Argentina

En todo el mundo, los rotavirus son la causa más común de diarrea grave en los niños pequeños y actualmente se están ensayando sobre el terreno vacunas que posiblemente permitan inmunizar a la población infantil dentro de varios años. Con el fin de estimar la carga de enfermedad por rotavirus en la Argentina y la utilidad de establecer en el país un sistema de vigilancia de la enfermedad, se revisaron datos sobre la detección de estos virus, según estudios publicados y otros inéditos de nueve ciudades argentinas y uno multicéntrico. Los informes revisados indican que se detectaron rotavirus en 20 por cien de 5.226 especímenes (con un recorrido de 6 a 54 por ciento entre estudios) tomados de niños hospitalizados por diarrea y en 9 por ciento de 6.587 especímenes (recorrido de 5 a 22 por ciento entre estudios) tomados de pacientes ambulatorios, miembros de poblaciones mixtas (niños hospitalizados y ambulatorios) y sujetos de encuestas comunitarias. Los datos hospitalarios muestran que, si bien los virus se detectaron durante todo el año, en los meses de invierno (mayo a julio) hubo un pico de intensidad cuando hasta la mitad de los niños con diarrea dieron resultados positivos a los rotavirus. En tres laboratorios se logró serotipificar para la proteína G 230 de 294 especímenes positivos (78 por ciento); los resultados indican que el serotipo G1 fue el más común (presente en 60 por cien de los especímenes serotipificados) seguido del G2 (en 20 por cien), G4 (en 14 por cien) y G3 (en 5 por cien). Sobre la base de los datos obtenidos en el país, se estimó que en 1991 en la Argentina hubo aproximadamente 84.500 visitas de pacientes ambulatorios (1 de cada 8 nacimientos) y 21000 hospitalizaciones de 4 días en promedio (1 de cada 31 nacimientos) asociadas con rotavirus, que en conjunto costaron unos US$ 27.7 millones. Estos datos preliminares muestran que la carga de enfermedad por rotavirus en los niños argentinos es muy pesada y podría disminuirse con una vacuna segura y efectiva. Además se necesita ampliar la vigilancia para mejorar el conocimiento de la epidemiología y de la distribución de las cepas de rotavirus en el país, calcular más exactamente la eficacia en función del costo de un programa de vacunación antirrotavirus y determinar los mejores métodos de monitorear sus efectos

Anticipating rotavirus vaccines: review of epidemiologic studies of rotavirus diarrhea in Argentina / En anticipación de una vacuna antirrotavirus: revisión de estudios epidemiológicos sobre la diarrea por rotavirus en la Argentina

Rotavirus is the most common cause of severe diarrhea in children worlwide, and vaccines currently being field-tested could be available for childhood immunization in several years. To asses the rotavirus disease in Argentina and the value of future national surveillance for the disease, we reviewed data on rotavirus detections reported by published an unpublished studies conducted in nine Argentine cities and by a multicenter study. Data from these studies indicated that rotavirus was detected in 20 por cent of 5226 specimens (within a range of 6 por cent to 54 por cent for different studies) from children hospitalized for diarrhea and in 9 por cent of 6587 spcimens (within a range of 5 por cent to 22 por cent for different studies) from children who were outpatients, members of mixed populations (hospitalized patiens and outpatients), or survey subjects in community-based studies. The hospital data showed that while rotavirus was detected throughout the year, a peak occurred during the winter months (May-July), when up to half of the children with diarrhea were found positive for rotavirus. Attemped serotyping of 294 rotavirus-positive speciments for G-protein by three laboratories was successful in 230 cases (78 por cent); the resulting data indicated that serotype G1 was the most common (being present in 60 por cent of the successfully serotyped specimens), followed by G2 (in 20 por cent), G4 (in 14 por cent), and G3 (in 5 por cent). Based on national data for Argentina, we estimate that in 1991 there were roughly 84500 rotavirus-associated outpatient visits (1 for every 8 births) and 21000 hospitalizations averaging 4 days in length (1 for every 31 births), all of which entailed direct medical costs estimated at US$ 27.7 million. These preliminary data show that the rotavirus disease burden in Argentine children is extensive and could be decreased by a safe and effective vaccine. Further surveillance is needed to improve our understanding of the epidemiology and distribution of rotavirus strains in Argentina, to more accurately asses the cost-effectiveness of a rotavirus vaccine program, and to indicate what methods might best be used to monitor such a program's impact

En todo el mundo, los rotavirus son la causa más común de diarrea grave en los niños pequeños y actualmente se están ensayando sobre el terreno vacunas que posiblemente permitan inmunizar a la población infantil dentro de varios años. Con el fin de estimar la carga de enfermedad por rotavirus en la Argentina y la utilidad de establecer en el país un sistema de vigilancia de la enfermedad, se revisaron datos sobre la detección de estos virus, según estudios publicados y otros inéditos de nueve ciudades argentinas y uno multicéntrico. Los informes revisados indican que se detectaron rotavirus en 20% de 5 226 especímenes (con un recorrido de 6 a 54% entre estudios) tomados de niños hospitalizados por diarrea y en 9% de 6 587 especímenes (recorrido de 5 a 22% entre estudios) tomados de pacientes ambulatorios, miembros de poblaciones mixtas (niños hospitalizados y ambulatorios) y sujetos sometidos a encuestas comunitarias. Los datos correspondientes a hospitales muestran que, si bien los virus se detectaron durante todo el año, en los meses de invierno (mayo a julio) hubo un pico de intensidad cuando hasta la mitad de los niños con diarrea tuvieron resultados positivos a los rotavirus. En tres laboratorios se logró serotipificar para la proteína G a 230 de 294 especímenes positivos (78%); los resultados indican que el serotipo G1 fue el más común (presente en 60% de los especímenes serotipificados), seguido del G2 (en 20%), G4 (en 14%) y G3 (en 5%). Sobre la base de los datos obtenidos en el país, se estimó que en 1991 en la Argentina hubo aproximadamente 84 500 visitas de pacientes ambulatorios (uno de cada ocho nacimientos) y 21 000 hospitalizaciones de 4 días en promedio (uno de cada 31 nacimientos) asociadas con rotavirus, que en conjunto costaron unos US$ 27,7 millones. Estos datos preliminares muestran que la carga de enfermedad por rotavirus en los niños argentinos es muy pesada y podría disminuirse con una vacuna segura y efectiva. Además se necesita ampliar la vigilancia para mejorar el conocimiento de la epidemiología y de la distribución de las cepas de rotavirus en el país, calcular más exactamente la eficacia en función del costo de un programa de vacunación antirrotavirus y determinar los mejores métodos de monitorear sus efectos