Urbanization, habitat extension and spatial pattern, threaten a Costa Rican endemic bird / Urbanización, cantidad de hábitat y distribución espacial, amenazan un ave endémica de Costa Rica

Introduction: Migration of people from rural environments to cities has accelerated urbanization and modified the landscape as well as the ecological processes and communities in these areas. The Costa Rican endemic Cabanis´s Ground-Sparrow (Melozone cabanisi) is a species of limited distribution restricted to the "Gran Area Metropolitana", which is the biggest urban settlement of the country. This area has experimented and still experiment an ongoing fragmentation and loss of habitat used by this species (coffee plantations, shrubs, and thickets). Objective: To determine the effects of urbanization on habitat abundance and spatial pattern for the occurrence of Melozone cabanisi. Methods: We modeled the area of potentially suitable habitat for this species in Costa Rica using occurrence and bioclimatic data. Then, we estimated the actual suitable habitat using land cover type layers. Finally, we analyzed the connectivity among the actual suitable habitat patches using single-patch and multi-patch approaches. Results: From the area of potentially suitable habitat estimated by the bioclimatic model, 74 % were urban areas that are unsuitable for Melozone cabanisi. The largest suitable patches within urban areas were coffee plantations; which also were crucial for maintaining connectivity between habitat patches along the species' range. Conclusions: To preserve and protect the Melozone cabanisi, these areas must be taken into consideration by decision-makers in the present and future management plans. We recommend avoiding change shrubs and thickets to urban cover to preserve the occurrence of Melozone cabanisi, and implement a program for the payment of environmental services to landholders, supported by the local governments, to protect those habitats in urban contexts.

Introducción: La migración desde ambientes rurales hacia las ciudades ha incrementado la urbanización. Esto ha modificado el paisaje, así como los procesos ecológicos y comunidades dentro de estas áreas. El Cuatro-ojos de Jupa-roja (Melozone cabanisi) es una especie distribuida principalmente al interior del asentamiento urbano más grande de Costa Rica. Hasta el presente esta área sigue experimentando fragmentación y pérdida del hábitat utilizado por esta especie (plantaciones de café, charrales y tacotales). Objetivo: Determinar los efectos de la urbanización sobre la cantidad de hábitat y su distribución espacial, basada en datos de presencia para M. cabanisi. Métodos: Modelamos el hábitat potencialmente adecuado para M. cabanisi utilizando datos bioclimáticos y de presencia. Luego estimamos el hábitat real utilizando el hábitat potencialmente adecuado y las capas de cobertura del suelo. Finalmente analizamos la conectividad entre los parches de hábitat real utilizando un enfoque multi y mono-parche. Resultados: Del área del hábitat potencialmente adecuado estimada por el modelo bioclimático, 74 % fueron áreas urbanas, lo que consideramos es un porcentaje inadecuado para M. cabanisi. Los parches más grandes de hábitat real dentro de las áreas urbanas fueron plantaciones de café, que a su vez fueron cruciales para mantener la conectividad entre los parches a lo largo del rango de distribución de la especie. Conclusiones: Para conservar y proteger a M. cabanisi, los tomadores de decisiones deben tener en cuenta los charrales, tacotales y cafetales dentro de la distribución de las especies en los planes de gestión presentes y futuros, evitando su cambio a coberturas urbanas.

Variación en la actividad acústica de Hyalinobatrachium fleischmanni (Anura: Centrolenidae) en un ambiente urbano con diferentes niveles de ruido antropogénico

26. Las señales acústicas producidas por animales pueden ser enmascaradas por el ruido del medio ambiente en que se encuentran, tanto de origen natural como antropogénico. Una especie que puede ver afectada su comunicación por el ruido medio ambiental es la rana de vidrio Hyalinobatrachium fleischmanni (Centrolenidae), porque la distribución actual de esta especie en gran parte se encuentra en ambientes urbanos con altos niveles de ruido. En este trabajo analizamos si existe una relación entre la variación de los niveles de ruido antropogénico a través de la noche y la actividad vocal (cantidad de vocalizaciones por unidad de tiempo) de H. fleischmanni, a lo largo de un gradiente de ruido urbano. El trabajo lo realizamos en tres sitios dentro del Campus Universitario Rodrigo Facio, San José, Costa Rica durante el mes de junio de 2015. Para contabilizar la actividad vocal de la especie en cada sitio instalamos grabadores programables de 17:00 a las 6:00 por dos días consecutivos cada dos semanas. De forma simultánea, cuantificamos el ruido en dB cada hora a lo largo del periodo de grabación utilizando sonómetros. Comparamos la abundancia promedio de vocalizaciones por hora contra los niveles de ruido promedio por hora y sitio utilizando modelos lineales mixtos. Nuestros resultados demuestran que, tanto el ruido como la actividad vocal de H. fleischmanni variaron a lo largo de la noche. Sin embargo, encontramos que en el sitio más ruidoso el patrón de actividad de H. fleischmanni difiere de los dos sitios menos ruidosos.El sitio menos ruidoso fue el que presento una mayor actividad vocal a lo largo de todo el periodo de muestreo. A pesar de que no se encontró una relación directa entre el nivel de ruido antropogénico y la actividad acústica de H. fleischmanni, sí observamos un efecto de los niveles de ruido en los patrones de actividad de la especie.

23. Acoustic signals produced by animals can be masked by natural or anthropogenic environmental noise. A high proportion of the current distribution of the glass-frog Hyalinobatrachium fleischmanni (Centrolenidae) overlaps with noisy urban habitats, and this may affect the species acoustic communication. In this work, we analyzed the relationship between changes in anthropogenic noise level throughout the night and the diel acoustic variation (vocalization per time) in H. fleischmanni, within three sites with different noise level. We conducted this study in three sites inside the Rodrigo Facio University Campus, San José, Costa Rica in June 2015. We used an automated recorder per site to record glass-frog vocalizations, from 17:00 to 6:00 h, during two consecutive days, every two weeks, for a month. Simultaneously, we measured the noise levels in dB each hour using a soundmeter. We used linear mixed models to compare the vocalization mean per hour against the noise levels per hour and site. Our results showed that noise levels and H. fleischmanni acoustic activity varied throughout the night. The H. fleischmanni acoustic activity at the noisier site was different from sites with lower noise levels. The highest acoustic activity was found in the less noisy site throughout the sampled period. Although we fail to found a direct relationship between noise level and H. fleischmanni acoustic activity, noise level variation affects vocal activity pattern in this species.

Shifts in the diversity of an amphibian community from a premontane forest of San Ramón, Costa Rica

Biological communities are experiencing rapid shifts of composition in Neotropical ecosystems due to several factors causing population declines. However, emerging evidence has provided insights on the adaptive potential of multiple species to respond to illnesses and environmental pressures. In Costa Rica, the decline of amphibian populations is a remarkable example of these changes. Here we provide evidence of variation in the amphibian richness of a premontane forest of San Ramón (Costa Rica) across a ~30 year period. We also quantified changes in the composition and abundance of the leaf-litter frog community occurring in the same premontane forest, by comparing diversity data with a difference of ~18 years. We evaluated the similarity of species richness from 1980s to 2010s based on several sources, and the dissimilarity of species diversity in the site comparing 28 standardized surveys from 1994-1995 and 2011-2012. We compared the relative abundance of some frogs that inhabit the leaf-litter layer between these same periods. Our results show that there is more similarity in amphibian richness between 1980s and 2010s (~ 52 %) than between 1980s and 1990s (~ 40 %). The richness of leaf-litter anurans was ~ 65 % similar between 1990s and 2010s. The diversity of leaf-litter anuran was clearly different between 1994-1995 and 2011-2012, and it was clustered among those periods. We determined that the amphibian community in this premontane forest drastically changed: many species have disappeared, or gradually declined through the decades (e.g. Pristimantis ridens, P. cruentus, Craugastor bransfordii) as in other well studied localities of Costa Rica, while some few species flourished after being almost absent from the site in the 1990s (e.g. Craugastor crassidigitus, Lithobates warszewistchii). Currently dominant species such as C. crassidigitus would be using developed resistance against Bd-fungus as an advantage (apparent competition) in the premontane forest where the disease is more virulent than in lowlands. Our analysis supports the hypothesis of individualized responses of anuran populations under distinct site and elevations. We suggest to continue monitoring the amphibian communities of premontane tropical forests to understand how this ecosystem gradually resist and adapts to this catastrophic time of biodiversity loss.

Las comunidades biológicas están experimentando rápidos cambios de composición en los ecosistemas neotropicales debido a varios factores que causan disminuciones de las poblaciones. Sin embargo, la evidencia emergente ha proporcionado información sobre el potencial de adaptación de múltiples especies para responder a enfermedades y presiones ambientales. En Costa Rica, el declive de las poblaciones de anfibios es un ejemplo notable de estos cambios. Aquí proporcionamos evidencia de variación en la riqueza de anfibios de un bosque premontano de San Ramón (Costa Rica) en un período de ~ 30 años. También cuantificamos los cambios en el ensamblaje, y las oscilaciones poblacionales, de la comunidad de ranas de hojarasca que ocurren en el mismo bosque premontano, tras comparar datos de diversidad con una diferencia de ~ 18 años. Evaluamos la similitud de la riqueza de especies desde la década de 1980 hasta la de 2010 basados en varias fuentes, así como la disimilitud de la diversidad de especies en el sitio comparando 28 muestreos estandarizados entre 1994-1995 y 2011-2012. Comparamos la abundancia relativa de algunas ranas que habitan la hojarasca entre 1994-1995 y 2011-2012. Nuestros resultados muestran que existe una similitud un poco mayor en la riqueza de anfibios entre los años 1980 y 2010 que entre los 1980 y 1990 (~ 40 %). La riqueza de los anuros de la hojarasca fue aproximadamente un 65 % similar entre la década de 1990 y 2010. La diversidad de anuros de la hojarasca fue claramente diferente entre 1994-1995 y 2011-2012, y se agrupó entre esos períodos. Determinamos que la comunidad de anfibios en este bosque premontano cambió drásticamente: muchas especies han desaparecido o han disminuido gradualmente a lo largo de las décadas como en otras localidades bien estudiadas de Costa Rica (por ejemplo, Pristimantis ridens, P. cruentus, Craugastor bransfordii), mientras algunas pocas especies florecieron tras casi desaparecer de nuestro sitio en la década de 1990 (por ejemplo, Craugastor crassidigitus, Lithobates warszewistchii). Actualmente, las especies dominantes como C. crassidigitus podrían tener resistencia contra el hongo quitridio, desarrollada como una ventaja (competición aparente) en el bosque premontano donde la enfermedad es más virulenta que en las tierras bajas. Nuestro análisis apoya la hipótesis de las respuestas individualizadas de las poblaciones de anuros en distintos sitios y elevaciones. Sugerimos continuar con el monitoreo de las comunidades de anfibios de los bosques neotropicales premontanos para comprender cómo este ecosistema resiste gradualmente y se adapta a este momento catastrófico de pérdida de biodiversidad.