Caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia a imipenem en Pseudomonas aeruginosa aisladas en un hospital de Buenos Aires / Phenotypic and genotypic characterization of imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolated in Buenos Aires

En el presente estudio, que tuvo por objeto analizar los mecanismos involucrados en la resistencia a carbapenemes, se incluyeron 129 aislamientos de Pseudomonas aeruginosa recuperados durante el año 2006 en el Hospital "Eva Perón" de la Provincia de Buenos Aires. La caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia permitió reconocer la presencia de metalo-beta-lactamasas (MBL) en el 14% de esos aislamientos. En todos ellos se identificó la presencia de la enzima IMP-13; sin embargo, algunos aislamientos resultaron sensibles a carbapenemes de acuerdo con los puntos de corte establecidos por el CLSI e incluso con las sugerencias de la Subcomisión de Antimicrobianos de SADEBAC, AAM. El ensayo de detección fenotípica de MBL de sinergia con doble disco resultó útil en este estudio. Sólo aquellos aislamientos productores de IMP-13 que a su vez presentaron alteraciones en las proteínas de membrana externa resultaron completamente resistentes a imipenem. Los aislamientos productores de MBL correspondieron a varios tipos clonales, lo cual sugiere no sólo la diseminación de una cepa resistente, sino también la diseminación horizontal de este mecanismo de resistencia entre clones diferentes.

From 129 P. aeruginosa isolated at a health care centre located in Buenos Aires (Hospital "Eva Perón"), 14% produced IMP-13. Although 18 isolates were metallo-beta-lactamases (MBL) producers, only those isolates that displayed altered outer membrane protein profiles correlated with the resistant category according to CLSI or even Subcomisión de Antimicrobianos, SADEBAC, AAM. Phenotypic screening of metallo-beta-lactamases proved to be appropriate for detecting MBL producing isolates. IMP-13 producing isolates corresponded to at least five different clonal types, which not only suggests the dissemination of the resistant strain but also of the resistant marker.

Infecciones adquiridas en la comunidad por Staphylococcus aureus resistente a meticilina en un hospital de agudos / Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus infections in a hospital for acute diseases

Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SAMR) es uno de los principales agentes asociados a infecciones intrahospitalarias; sin embargo, en los últimos años ha surgido como un patógeno emergente de la comunidad, causando infecciones graves, principalmente en jóvenes. Se describen 33 casos de infecciones por SAMR de origen comunitario, diagnosticadas entre mayo de 2005 y junio de 2006 en el HIGA "Eva Perón". Se estudiaron retrospectivamente los aislamientos; se confirmó la resistencia a meticilina mediante la detección del gen mecA, se investigó la presencia de genes que codifican dos factores de virulencia (leucocidina de Panton-Valentine -LPV- y g-hemolisina) y el tipo de casete mec mediante PCR. Todos los pacientes se encontraban sanos previamente. Cuatro pacientes menores de 12 años presentaron bacteriemia, uno con neumonía grave y los 3 restantes con infección osteoarticular; todos los pacientes mayores de 12 años presentaron infecciones de piel y partes blandas sin compromiso sistémico. Se constató la presencia de casete mec tipo IV en todos los aislamientos; la resistencia a meticilina no se acompañó de resistencia a otros antimicrobianos; los aislamientos fueron portadores de genes que codifican para LPV y para g-hemolisina. Es importante considerar la presencia de estas cepas de origen comunitario a fin de elaborar estrategias para su correcto tratamiento.

Methicillin- resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the most prevalent pathogens associated with nosocomial infections. However, most recently, MRSA has arisen as an emerging community pathogen, causing serious infections, mainly among young patients. We herein describe 33 cases of infections caused by community-acquired MRSA (CMRSA), diagnosed between May 2005 and June 2006, at "Eva Perón" Hospital. The isolations were retrospectively studied. Methicillin resistance was confirmed by means of the detection of the mecA gene, and the genes for two virulence factors (Panton-Valentine Leucocidin -PVL- and g-haemolysin) as well as the cassette mec type were screened by PCR. All the patients were previously healthy. Four patients under 12, presented bacteremia, one had serious pneumonia, and the three remaining patients had osteoarticular infections; all the patients over 12, had skin and soft tissue infections without systemic damage. The C-MRSA strains harboured cassette mec type IV, and the PVL and g-haemolysin genes. They were methicillin-resistant, with no other associated resistances. It is important to consider the presence of these community- acquired strains in order to develop strategies for their correct treatment.

Comparación de diferentes métodos para identificar las especies del género Proteus / Comparison of different methods in order to identify Proteus spp

Los objetivos de este trabajo fueron: a) identificar a nivel de especie aislamientos de Proteus siguiendo la combinación de los esquemas de Farmer y O'Hara; b) determinar la utilidad del sistema comercial API 20E y de un esquema reducido de pruebas (agar TSI y agar MIO: movilidad, indol y ornitina), comparar estos procedimientos con la metodología convencional y evaluar su sensibilidad y especificidad, y c) evaluar la utilidad del perfil proteico en la identificación de las distintas especies. Se estudiaron 205 aislamientos de Proteus spp. aislados en el período comprendido entre enero de 1998 y setiembre de 2004, recuperados de distintos materiales clínicos correspondientes a pacientes hospitalizados y ambulatorios atendidos en el Hospital de Clínicas. Los organismos fueron identificados mediante la metodología convencional, por el sistema API 20E y con un esquema reducido de pruebas; 48 de ellos fueron sometidos a un SDS-PAGE. API 20E identificó 79 de 87 aislamientos de P. mirabilis (90,8%), 103/103 del complejo P. vulgaris y 15/15 de P. penneri. Ocho aislamientos identificados como Proteus spp. resultaron ser P. mirabilis, al incluir una prueba adicional (maltosa). En la identificación, el esquema reducido coincidió en un 100% con la metodología convencional. A diferencia del sistema API 20E, el esquema reducido alcanza la correcta identificación de todas las especies en laboratorios de baja complejidad, sin la necesidad de pruebas adicionales. El perfil proteico permitió la correcta diferenciación de las tres especies, independientemente de las diferentes atipias de P. mirabilis.

The objectives were: a) to identify Proteus strains to species level, following Farmer's and O'Hara's conventional biochemical reactions; b) to evaluate the sensitivity and specificity of both the API 20E method and a schema of reduced reactions (TSI and MIO agar: motility, indole and ornithine) comparing them with conventional methodology, and c) to evaluate the utility of SDS-PAGE (total proteins) in order to identify Proteus strains to species level. Two hundred and five Proteus spp. clinical isolates, were collected between January 1998 and September 2004, from inpatients and outpatients at Hospital de Clínicas. Strains were identified by means of conventional methodology, the API 20E method, and a schema of reduced reactions. SDS-PAGE (total proteins) was used in 48 out of the 205 strains. The API 20E method identified 79 out of 87 (90.8%) strains of P. mirabilis, 103 out of 103 P. vulgaris complex, and 15 out of 15 P. penneri. Eight strains of P. mirabilis were identified as Proteus spp., the acid production from maltose being necessary to identify them to species level. The schema of reduced reactions identified 205 out of 205 (100%) strains, that is, this schema of reduced reactions identified all the strains to species level without any additional tests, in marked contrast to the API 20E method. The SDS-PAGE (total proteins) identified the three species of the genus, even if the strains of P. mirabilis showed different biochemical reactions.

Prevalencia de metalo-β-lactamasas en Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenemes en un Hospital Universitario de Buenos Aires / Prevalence of metallo-β-lactamase in carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa at an University Hospital of Buenos Aires City

Se estudiaron 91 aislamientos de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenemes con el objetivo de conocer la prevalencia de metalo-β-lactamasas y evaluar la habilidad del ensayo de inhibición empleando discos de EDTA (1 µmol) en su detección. Se determinó la presencia de carbapenemasas en 10 (11%) de los aislamientos recuperados. La sensibilidad a aztreonam en los aislamientos resistentes a ambos carbapenemes resultó un buen predictor de la presencia de estas enzimas. Dichas carbapenemasas correspondieron a la enzima VIM-2 en tres de ellos y a VIM-11 en otros siete. En todos los casos los genes codificantes de estas enzimas se encontraron localizados en integrones de clase 1 seguidos corriente abajo de genes codificantes de enzimas acetilantes de antibióticos aminoglucosídicos. El ensayo de detección fenotípica de metalo-β-lactamasas empleando discos de EDTA mostró un 100% de especificidad y sensibilidad en la detección de estas enzimas en la población de Pseudomonas aeruginosa analizadas.

The present study was conducted to estimate the prevalence of metallo-β-lactamases in 91 consecutive carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa isolates, recovered from inpatients at Hospital de Clínicas in Buenos Aires. Both, phenotypic and genotypic methods detected the presence of carbapenemases in 10 (11%) isolates, corresponding to VIM-11 in 7/10 and VIM-2 in the others. Codifying genes were all included in class 1 integrons, upstream genes coding for aminoglycoside modifying enzymes. One hundred percent sensitivity and specificity was achieved by the metallo-β-lactamases phenotypic screening method using EDTA (1 µmol) disks in the Pseudomonas aeruginosa isolates included in this study. Sensitivity to aztreonam in carbapenem resistant isolates was suspicious of the presence of these enzymes.

Caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia enzimática a las cefalosporinas de tercera generación en Enterobacter spp. / Phenotypic and genotypic characterization of resistance to third-generation cephalosporins in Enterobacter spp.

Enterobacter spp. es un patógeno intrahospitalario que presenta múltiples mecanismos de resistencia a los antibióticos b-lactámicos. Se caracterizaron fenotípica y genotípicamente las diferentes b-lactamasas presentes en 27 aislamientos consecutivos e ininterrumpidos de Enterobacter spp. (25 Enterobacter cloacae y 2 Enterobacter aerogenes). También se evaluó la habilidad de diferentes métodos fenotípicos para detectar b-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en estos microorganismos. En 15/27 aislamientos (63%) se observó resistencia a las cefalosporinas de tercera generación. En 12 de los aislamientos resistentes se detectó un alto nivel de producción de cefalosporinasa cromosómica, siendo 6 de ellos también productores de PER-2. Dicha resistencia en los 3 aislamientos restantes se debió exclusivamente a la presencia de BLEE, PER-2 en 2 de ellos y CTX-M-2 en un caso. Sólo CTX-M-2 se detectó con todas las cefalosporinas probadas en los ensayos de sinergia, utilizando el método de difusión, mientras que cefepima mejoró la detección de PER-2 en 7/8 aislamientos productores de esta BLEE, 4/8 utilizando la prueba de doble disco y 7/8 comparando discos de cefepima con y sin el agregado de ácido clavulánico. El método de dilución empleado solo detectó 1/9 BLEE al comparar las cefalosporinas con y sin el agregado de inhibidor.

Enterobacter spp. are becoming increasingly frequent nosocomial pathogens with multiple resistance mechanism to b-lactam antibiotics. We carried out the phenotypic and genotypic characterization of beta-lactamases in 27 Enterobacter spp. (25 Enterobacter cloacae y 2 Enterobacter aerogenes), as well as the ability of different extended spectrum b-lactamase (ESBL) screening methods. Resistance to third generation cephalosporins was observed in 15/27 (63%) isolates. Twelve resistant isolates produced high level chromosomal encoded AmpC b-lactamase; 6 of them were also producers of PER-2. Resistance to third generation cephalosporins in the remaining 3 isolates was due to the presence of ESBLs, PER-2 in 2 cases, and CTX-M-2 in the other. Only CTX-M-2 production was detected with all tested cephalosporins using difusion synergy tests, while cefepime improved ESBLs detection in 7/8 PER-2 producers, 4/8 in the inhibitor aproximation test and 7/8 with double disk test using cefepime containing disk with and without clavulanic acid. Dilution method, including cephalosporins with and without the inhibitor detected 1/9 ESBLs producers.

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains in Buenos Aires Teaching Hospitals: replacement of the multidrug resistant South American clone by another susceptible to rifampin, minocycline and trimethoprim-sulfamethoxazole / Staphylococcus aureus meticilina-resistente en hospitales universitarios de Buenos Aires: reemplazo del clon Sudamericano multi-resistente por otro sensible a rifampicina, minociclina y trimetoprima-sulfametoxazol

The aim of this study was to characterize methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates recovered from different infectious sites of hospitalized patients at two university hospitals. Fourteen isolates were analyzed by repetitive sequence based PCR (Rep-PCR), randomly amplified polymorphic DNA assay (RAPD-PCR), and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). We found that a prevalent clone of MRSA, susceptible to rifampin, minocycline, and trimethoprim/sulfamethoxazole (RIF S, MIN S, TMS S) was present in both hospitals in replacement of the multiresistant MRSA South American clone, previously described in these hospitals. The staphylococcal chromosomal cassette (SCCmec) type I element was detected in this new clone.

El objetivo de este trabajo fue la caracterización de aislamientos de Staphylococcus aureus meticilina-resistentes (SAMR), provenientes de diferentes procesos infecciosos de pacientes internados en dos hospitales universitarios. Catorce aislamientos fueron analizados mediante la PCR de secuencias repetitivas (Rep-PCR), la amplificación al azar de ADN polimórfico (RAPD-PCR) y la electroforesis de campo pulsado (PFGE). Encontramos que un clon prevalente de SAMR, sensible a rifampicina, minociclina y trimetoprima-sulfametoxazol (RIF S, MIN S, TMS S) estaba presente en ambos hospitales, reemplazando al clon SAMR y multi-resistente previamente descrito en estos mismos hospitales. En este nuevo clon se detectó el cassette cromosómico estafilocócico SCCmec tipo I.

Consenso sobre las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos en Enterobacteriaceae / Consensus for antimicrobial susceptibility testing for Enterobacteriaceae

En este documento se elaboraron una serie de recomendaciones para el ensayo, lectura, interpretación e informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos para las enterobacterias aisladas con mayor frecuencia de especímenes clínicos. Se adoptaron como base las recomendaciones del National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS) de los EEUU, los de la subcomisión de Antimicrobianos, de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC), división de la Asociación Argentina de Microbiología (AAM) y de un grupo de expertos invitados. En él se indican las resistencias naturales de los diferentes miembros que integran la familia Enterobacteriaceae y se analiza la actividad de las diferentes beta-lactamasas cromosómicas, propias de cada especie, sobre las penicilinas, cefalosporinas y carbapenemes. Se recomiendan los antimicrobianos que se deberían ensayar, ubicados estratégicamente, para detectar los mecanismos de resistencia más frecuentes y cuales se deberían informar de acuerdo a la especie aislada, el sitio de infección y el origen de la cepa (intra o extrahospitalario). Se detallan los métodos de "screening" y de confirmación fenotipíca para detectar beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) que son más adecuados a nuestra realidad. Por último, se mencionan patrones infrecuentes de sensibilidad/resistencia que deberían verificarse y los perfiles de sensibilidad que pueden hallarse en las distintas enterobacterias en relación con los probables mecanismos de resistencia. Se debe resaltar que el contenido de este documento debe ser considerado como recomendaciones realizadas por expertos argentinos basadas en una revisión de la literatura y datos personales.

Taking into account previous recommendations from the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS), the Antimicrobial Committee, Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica (SADEBAC), Asociación Argentina de Microbiología (AAM), and the experience from its members and some invited microbiologists, a consensus was obtained for antimicrobial susceptibility testing and interpretation in most frequent enterobacterial species isolated from clinical samples in our region. This document describes the natural antimicrobial resistance of some Enterobacteriaceae family members, including the resistance profiles due to their own chromosomal encoded beta-lactamases. A list of the antimicrobial agents that should be tested, their position on the agar plates, in order to detect the most frequent antimicrobial resistance mechanisms, and considerations on which antimicrobial agents should be reported regarding to the infection site and patient characteristics are included. Also, a description on appropriate phenotypic screening and confirmatory test for detection of prevalent extended spectrum beta-lactamases in our region are presented. Finally, a summary on frequent antimicrobial susceptibility profiles and their probably associated resistance mechanisms, and some infrequent antimicrobial resistance profiles that deserve confirmation are outlined.

Unusual phenotypic characteristic of Neisseria gonorrhoeae from male patients who have sex with men

We describe four isolates of Ng from men who have sex with men (MSM) patients that were able to grow in the abscense of CO2, as previously was described for N. gonorrhoeae ssp. kochii. These isolates were able to grow aerobically (without any added CO2) at 37 degrees C giving small colonies after 48 hs; two of them isolated from pharynx and urethra of one patient, were also able to grow without the blood supplement in the same conditions. In these unusual isolates the major outer-membrane proteins are of the same molecular weight than Ng. These isolates could be taken for other members of the genus if not confirmed by means of these (or other) methods.

Consenso sobre las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos en cocos gram-positivos / Consensus for antimicrobial susceptibility testing for gram-positive cocci

El antibiograma por difusión en agar con discos se encuentra ampliamente difundido en nuestro medio y se basa primariamente en las recomendaciones del National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). En este documento se elaboraron una serie de recomendaciones para el ensayo, lectura, interpretación e informe de las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos en cocos gram-positivos, adaptadas a la realidad argentina. En esta primera etapa se redactaron las consideraciones generales para la realización de la prueba por difusión, los controles de calidad internos para todos los microorganismos y una actualización sobre las pruebas de sensibilidad en cocos gram-positivos. Se debe resaltar que el contenido de este documento debe ser considerado como recomendaciones realizadas por expertos argentinos y que son el resultado de reuniones de consenso organizadas por la Subcomisión de Antimicrobianos de la Sociedad Argentina de Bacteriología Clínica, división de la Asociación Argentina de Microbiología. Se formó un equipo de trabajo integrado por expertos en antimicrobianos y a partir de una propuesta inicial, basada en una revisión de la literatura se fueron elaborando diversos documentos de trabajo que fueron mejorados después de ser debatidos por los miembros del grupo de trabajo hasta llegar al documento final. El criterio general fue elaborar recomendaciones acordes a las necesidades de nuestro país que puedan utilizarse en la práctica diaria con el objeto de colaborar en la adecuada elección del tratamiento antibiótico según la especie bacteriana aislada y la localización de la infección.

Estudio de susceptibilidad a antibióticos beta-lactßmicos en Aeromonas spp. de origen clínico, animal y ambiental / Beta-lactam antibiotic sensitivity in Aeromonas spp. of clinical, animal, and environmental origin

Susceptibility to beta-lactam antibiotics was investigated in Aeromonas spp. Microorganisms were isolated from both, clinical and water creek samples, as well as from processed raw chicken carcasses. Aeromonas like colonies were identified by means of Aerokey II and API 20 E System (Bio-Merieux). A. hydrophila prevailed both of human origin (44) and water creek samples (41), while A. caviae ranked first among raw chicken samples (65). Dilution testing by Agar Method was performed to determine minimum inhibitory concentration (MIC), following NCCLS standards. All tested microorganisms were susceptible to third generation cephalosporin, cefepime, imipenem, aztreonam, and resistant to ampicillin. Only with cefepime and aztreonam exceptions, strains of human origin showed higher values of MIC90 than environmental ones. These results suggest that antibiotic resistance is mainly due to a steady environmental pressure, on account of the widely used above mentioned compounds.