Antibiotic resistance and consumption before and during the COVID-19 pandemic in Valle del Cauca, Colombia / Resistencia antibiótica y consumo de antibióticos antes y durante la pandemia de COVID-19 en el Valle del Cauca, Colombia / Resistência a antibióticos e consumo de antibióticos antes e durante a pandemia de COVID-19 no Valle del Cauca, Colômbia

ABSTRACT Objective. To assess changes in antibiotic resistance of eight of the World Health Organization priority bug-drug combinations and consumption of six antibiotics (ceftriaxone, cefepime, piperacillin/tazobactam, meropenem, ciprofloxacin, vancomycin) before (March 2018 to July 2019) and during (March 2020 to July 2021) the COVID-19 pandemic in 31 hospitals in Valle del Cauca, Colombia. Methods. This was a before/after study using routinely collected data. For antibiotic consumption, daily defined doses (DDD) per 100 bed-days were compared. Results. There were 23 405 priority bacterial isolates with data on antibiotic resistance. The total number of isolates increased from 9 774 to 13 631 in the periods before and during the pandemic, respectively. While resistance significantly decreased for four selected bug-drug combinations (Klebsiella pneumoniae, extended spectrum beta lactamase [ESBL]-producing, 32% to 24%; K. pneumoniae, carbapenem-resistant, 4% to 2%; Pseudomonas aeruginosa, carbapenem-resistant, 12% to 8%; Acinetobacter baumannii, carbapenem-resistant, 23% to 9%), the level of resistance for Enterococcus faecium to vancomycin significantly increased (42% to 57%). There was no change in resistance for the remaining three combinations (Staphylococcus aureus, methicillin-resistant; Escherichia coli, ESBL-producing; E. coli, carbapenem-resistant). Consumption of all antibiotics increased. However, meropenem consumption decreased in intensive care unit settings (8.2 to 7.1 DDD per 100 bed-days). Conclusions. While the consumption of antibiotics increased, a decrease in antibiotic resistance of four bug-drug combinations was observed during the pandemic. This was possibly due to an increase in community-acquired infections. Increasing resistance of E. faecium to vancomycin must be monitored. The findings of this study are essential to inform stewardship programs in hospital settings of Colombia and similar contexts elsewhere.

RESUMEN Objetivo. Evaluar los cambios en la resistencia a los antibióticos de ocho de las combinaciones de fármacos y agentes patógenos incluidos en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud y el consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina, vancomicina) antes de la pandemia de COVID-19 (de marzo del 2018 a julio del 2019) y durante la pandemia (de marzo del 2020 a julio del 2021) en 31 hospitales del Valle del Cauca (Colombia). Métodos. En este estudio se analiza el antes y el después empleando datos recopilados de forma rutinaria. Para el consumo de antibióticos, se compararon las dosis diarias definidas (DDD) por 100 días-cama. Resultados. Hubo 23 405 cepas bacterianas aisladas prioritarias con datos sobre la resistencia a los antibióticos. El número total de cepas aisladas aumentó de 9 774 antes de la pandemia a 13 631 durante la pandemia. Si bien la resistencia disminuyó significativamente en las cuatro combinaciones seleccionadas de agentes patógenos y fármacos (Klebsiella pneumoniae, productora de betalactamasa de espectro extendido [BLEE], de 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a los carbapenémicos, de 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a los carbapenémicos, de 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a los carbapenémicos, de 23% a 9%), el nivel de resistencia de Enterococcus faecium a la vancomicina aumentó significativamente (de 42% a 57%). No hubo cambios en la resistencia en las tres combinaciones restantes (Staphylococcus aureus, resistente a la meticilina; Escherichia coli, productora de BLEE; E. coli, resistente a los carbapenémicos). El consumo de todos los antibióticos aumentó. Sin embargo, el consumo de meropenem disminuyó en los entornos de las unidades de cuidados intensivos (de 8,2 a 7,1 DDD por 100 días-cama). Conclusiones. Aunque el consumo de antibióticos aumentó, se observó una disminución en la resistencia a los antibióticos de cuatro combinaciones de agentes patógenos y medicamentos durante la pandemia, que posiblemente se debió a un aumento en las infecciones adquiridas en la comunidad. Es necesario vigilar el aumento de la resistencia de E. faecium a la vancomicina. Los resultados de este estudio son esenciales para que sirvan de orientación en los programas de optimización del uso de los antibióticos en los entornos hospitalarios de Colombia y en contextos similares en otros lugares.

RESUMO Objetivo. Avaliar as mudanças na resistência a antibióticos em oito das combinações microrganismo/antimicrobiano prioritárias da Organização Mundial da Saúde e o consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropeném, ciprofloxacino, vancomicina) antes (março de 2018 a julho de 2019) e durante (março de 2020 a julho de 2021) a pandemia de COVID-19 em 31 hospitais em Valle del Cauca, Colômbia. Métodos. Este foi um estudo antes/depois utilizando dados coletados rotineiramente. Para avaliar o consumo de antibióticos, foram comparadas doses diárias definidas (DDD) por 100 leitos-dias. Resultados. Havia dados sobre resistência a antibióticos para 23.405 isolados bacterianos prioritários. O número total de isolados aumentou de 9.774 para 13.631 antes e durante a pandemia, respectivamente. Embora a resistência tenha diminuído significativamente para quatro das combinações microrganismo/antimicrobiano selecionadas (Klebsiella pneumoniae, produtora de betalactamase de espectro estendido [ESBL], 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a carbapenêmicos, 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a carbapenêmicos, 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a carbapenêmicos, 23% a 9%), o nível de resistência de Enterococcus faecium a vancomicina aumentou significativamente (42% a 57%). Não houve mudança na resistência para as três combinações restantes (Staphylococcus aureus, resistente a meticilina; Escherichia coli, produtora de ESBL; E. coli, resistente a carbapenêmicos). O consumo de todos os antibióticos aumentou. Entretanto, o consumo de meropeném nas unidades de terapia intensiva diminuiu (de 8,2 para 7,1 DDD por 100 leitos-dias). Conclusões. Embora o consumo de antibióticos tenha aumentado, observou-se uma diminuição na resistência a antibióticos de quatro combinações microrganismo/antimicrobiano durante a pandemia. Isso ocorreu possivelmente devido a um aumento nas infecções adquiridas na comunidade. O aumento da resistência de E. faecium à vancomicina deve ser monitorado. Os achados deste estudo são essenciais para guiar os programas de gerenciamento de antimicrobianos em ambientes hospitalares da Colômbia e em outros contextos similares.

Monitoring delays in diagnosis of pulmonary tuberculosis in eight cities in Colombia / Supervisión del retraso en el diagnóstico de la tuberculosis pulmonar en ocho ciudades de Colombia

ABSTRACT Objective To measure time between onset of tuberculosis (TB) symptoms and start of treatment, and to identify factors associated with delay in eight Colombian cities. Methods Operational research with a retrospective analytical cohort design was conducted in 2014 using routinely collected data about new smear-positive pulmonary TB patients from eight cities in Colombia (Barranquilla, Bogotá, Bucaramanga, Cali, Cúcuta, Medellín, Pereira, and Villavicencio). Date of symptom onset was sourced from TB surveillance databases. Data on all other variables came from National TB Program (NTP) registers. Results There were 2 545 new cases of smear-positive pulmonary TB, but a plausible date of symptom onset was available for only 1 456 (57%). Median number of days between symptom onset and treatment start was 51 days (interquartile range: 27–101). A total of 72% of patients had a delay (> 30 days between symptom onset and treatment start), and 28% had a 3+ bacillary load at diagnosis. Based on multiple logistic regression, three factors were significantly associated with delay: being uninsured (odds ratio (OR): 1.30; 95% confidence interval (CI): 1.01–1.68) and having an unknown HIV status (OR: 1.81; CI: 1.04–3.17), which increased risk, and coming from a neighborhood with NTP-employed community health workers, which decreased risk (OR: 0.56; CI: 0.34–0.90). Conclusions Delays still prevent timely TB diagnosis and treatment in Colombia. As the country aims for TB elimination, delays must be reduced, especially in cities and vulnerable neighborhoods, to stop community transmission. The NTP should focus not only on the number of cases detected but also on how long it takes to detect them. To monitor interventions designed to reduce delays, additional dates in the process should be recorded routinely. In addition, reliability and completeness of data are crucial for monitoring.

RESUMEN Objetivo Medir el lapso entre la aparición de los síntomas de tuberculosis y el comienzo del tratamiento y reconocer los factores que se asocian con este retraso en ocho ciudades de Colombia. Métodos Investigación operativa con un estudio de cohortes analítico retrospectivo realizado en el 2014, a partir de los datos corrientes consignados en los casos nuevos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia positiva en ocho ciudades de Colombia (Barranquilla, Bogotá, Bucaramanga, Cali, Cúcuta, Medellín, Pereira y Villavicencio). La fecha de aparición de los síntomas se obtuvo de las bases de datos de vigilancia de la tuberculosis. Los datos sobre todas las demás variables provinieron de los registros de Programa Nacional contra la Tuberculosis. Resultados Se registraron 2 545 casos nuevos de tuberculosis pulmonar con baciloscopia positiva, pero solo se contó con una fecha verosímil de aparición de los síntomas en 1 456 casos (57%). La mediana del número de días entre la aparición de los síntomas y el comienzo del tratamiento fue 51 días (intervalo intercuartil: de 27 a 101). En 72% de los pacientes se comprobó un retraso (más de 30 días entre la aparición de los síntomas y el comienzo del tratamiento) y en 28% de los casos se observó una carga bacilar de 3+ en el momento del diagnóstico. Según el análisis de regresión logística multivariante, tres factores se asociaron de manera significativa con el retraso, a saber: la falta de seguro de enfermedad (razón de posibilidades [OR]: 1,30; intervalo de confianza [IC] de 95%: de 1,01 a 1,68) y el desconocimiento de la situación frente al virus de la inmunodeficiencia humana (OR: 1,81; IC de 95%: de 1,04 a 3,17), factores que aumentaron el riesgo de retraso y el hecho de provenir de un vecindario donde operan agentes sanitarios de la comunidad empleados por el Programa Nacional contra la Tuberculosis, que disminuyó el riesgo (OR: 0,56; IC: de 0,34 a 0,90). Conclusiones Los retrasos todavía obstaculizan el diagnóstico y el tratamiento oportuno de la tuberculosis en Colombia. Al buscar la eliminación de la tuberculosis en el país es preciso disminuir los retrasos, sobre todo en las ciudades y los vecindarios vulnerables, con el objeto de interrumpir la transmisión en la comunidad. El Programa Nacional contra la Tuberculosis debe prestar atención no solo al número de casos detectados, sino también al tiempo que precisa su detección. Con el propósito de llevar a cabo un seguimiento de las intervenciones encaminadas a disminuir los retrasos, es necesario registrar de manera sistemática otras fechas de la evolución clínica. Además, la fiabilidad y la integridad de los datos registrados constituyen aspectos primordiales del seguimiento.

HIV testing, antiretroviral therapy, and treatment outcomes in new cases of tuberculosis in Brazil, 2011 / Pruebas de detección del VIH, tratamiento antirretrovírico y resultados del tratamiento en casos nuevos de tuberculosis en Brasil en 2011

ABSTRACT Objective To assess the implementation of HIV-related interventions for patients with tuberculosis (TB), as well as TB treatment outcomes in patients coinfected with HIV in Brazil in 2011. Methods This was a cross-sectional, operational research study of HIV-related interventions among TB cases and the sociodemographic and clinical characteristics of TB-HIV coinfected patients. It also used a retrospective cohort design to determine the association between antiretroviral therapy (ART) and favorable TB treatment outcomes. The source of data was a linkage of 2011 administrative health databases used by the National TB and HIV/AIDS Programs. Results Of 73 741 new cases of TB reported, 63.6% (46 865 patients) were tested for HIV; 10.3% were positive. Of patients with HIV, 45.9% or 3 502 were on ART. TB favorable outcome was achieved in 63.1% or 2 205 coinfected patients on ART and in only 35.4% or 1 459 of those not on ART. On multivariate analysis, the relative risk for the association between ART and TB treatment success was 1.72 (95% Confidence Interval = 1.64–1.81). Conclusions The linkage between national TB and HIV datasets has created a convenient baseline for ongoing monitoring of HIV testing, ART use, and TB treatment outcomes among coinfected patients. The low rates of HIV screening and ART use in 2011 need to be improved. The association between ART and treatment success adds to the evidence supporting timely initiation of ART for all patients with TB-HIV coinfection.

RESUMEN Objetivo Evaluar la ejecución de las intervenciones relacionadas con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) en los pacientes con diagnóstico de tuberculosis y examinar los desenlaces del tratamiento antituberculoso en los pacientes coinfectados por el VIH en Brasil en 2011. Métodos Estudio de investigación operativa. Mediante un diseño transversal se evaluaron las intervenciones relacionadas con el VIH en los casos de tuberculosis y se describieron las características sociodemográficas y clínicas de los pacientes coinfectados por el VIH y la tuberculosis; con un diseño retrospectivo de cohortes se determinó la asociación entre el tratamiento antirretrovírico y los desenlaces favorables del tratamiento antituberculoso. Los datos se obtuvieron mediante un enlace administrativo de las bases de datos de salud del 2011 que utilizaron el Programa Nacional contra la Tuberculosis y el Programa contra el VIH/sida. Resultados De los 73 741 casos nuevos de tuberculosis notificados, se practicó detección del VIH en 63,6% (46 865 pacientes) y los resultados fueron positivos en 10,3%. De los pacientes coinfectados por el VIH, 45,9% o 3 502 pacientes, recibían tratamiento antirretrovírico. Se alcanzó un desenlace favorable de la tuberculosis en 63,1% (2 205) de los pacientes coinfectados que recibían tratamiento antirretrovírico, y en solo 35,4% (1 459) de los pacientes coinfectados que no recibían este tratamiento. Según el análisis multivariante, el riesgo relativo de asociación entre el tratamiento antirretrovírico y el éxito del tratamiento antituberculoso fue 1,72 (intervalo de confianza de 95%: de 1,64 a 1,81). Conclusiones El enlace de los registros nacionales sobre la tuberculosis y la infección por el VIH creó una referencia de base útil para el seguimiento continuo de la utilización de las pruebas de detección del VIH, la administración del tratamiento antirretrovírico y los desenlaces del tratamiento antituberculoso en los pacientes coinfectados. Es necesario mejorar las bajas tasas de detección sistemática del VIH y de administración del tratamiento antirretrovírico que se observaron en el 2011. Esta correlación entre el tratamiento antirretrovírico y el éxito del tratamiento antituberculoso avala la evidencia que respalda la iniciación oportuna del tratamiento antirretrovírico en todos los pacientes que presentan coinfección por el VIH y la tuberculosis.