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Rev. med. vet. zoot ; 62(3): 34-48, sep.-dic. 2015. ilus, tab
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: lil-779683

RESUMO

En este estudio se analizaron los niveles de diversidad y estructura genética de 161 cerdos domésticos pertenecientes a tres poblaciones del departamento de Córdoba, mediante 20 marcadores microsatélites. Todos los microsatélites utilizados resultaron polimórficos. Para todos los loci, el valor promedio de la heterocigosidad esperada fue mayor al valor promedio de la heterocigosidad observada, lo cual puede sugerir una posible endogamia en el sistema de apareamiento. El índice (0,12 ± 0,08) mostró un 88% de la varianza en las frecuencias alélicas reportadas dentro de cada población y solo el 12% de la varianza atribuible a diferencias entre poblaciones. Los valores de F IS (0,079) y F IT (0,13), indican deficiencia de heterocigotos dentro de cada población y a nivel global. Desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg (p < 0,05) fueron observadas en ocho de los marcadores utilizados. El árbol Neighbor-Joining obtenido reveló que Momil estuvo más estrechamente relacionada con Cereté, mientras Tierralta se mostró más alejada. El análisis de componentes principales (ACoP) genera la individualización geográfica de cada población, siendo distante la población de Tierralta de las poblaciones Momil y Cereté, resultados similares a los obtenidos con la metodología Neighbor-Joining. El programa Structure con un K = 3, confirma la existencia de tres grupos o poblaciones distintas, generándose un patrón filogeográfico observado en la relación entre Momil, Cereté y Tierralta. Es importante señalar que son 3 grupos raciales diferentes, valiosos y deben conservarse.


Diversity and genetic structure of 161 domestic pigs from three populations of the department of Cordoba, were analyzed by means 20 microsatellite markers; all of them were polymorphic microsatellites. The expected average value of heterozygosity was higher than the observed average value for all loci, which may suggest a possible inbreeding mating system. The F ST index (0.12 ± 0.08) showed 88% of variance in allele frequencies reported within each population and only 12% of the variance was attributable to differences between populations. F K values (0.079) and F IT (0.13) indicate heterozygote deficiency within each population and globally. Significant deviations from Hardy-Weinberg balance (p < 0.05) were observed in eight of the markers used. The Neighbor-Joining tree showed than Momil was more closely related with Cerete while Tierralta was further. The main components analysis (ACoP) generates the geographical identification of each population, being more far Tierralta from Momil and Cerete populations, similar results were obtained with the Neighbor-Joining method. The Structure program with K = 3, confirms the existence of three groups or different populations, which generates a phylogeographic pattern observed in the relationship between Momil, Cerete and Tierralta. It is important to note that there are 3 different racial groups, valuable and must be preserved.

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