Mortality from respiratory infections and chronic non-communicable diseases before the COVID-19 pandemic in Cali, Colombia / Mortalidad por infecciones respiratorias y enfermedades crónicas no trasmisibles antes de la pandemia por COVID-19 en Cali, Colombia

Abstract Introduction: The COVID-19 disease pandemic is a health emergency. Older people and those with chronic noncommunicable diseases are more likely to develop serious illnesses, require ventilatory support, and die from complications. Objective: To establish deaths from respiratory infections and some chronic non-communicable diseases that occurred in Cali, before the SARS-CoV-2 disease pandemic. Methods: During the 2003-2019 period, 207,261 deaths were registered according to the general mortality database of the Municipal Secretary of Health of Cali. Deaths were coded with the International Classification of Diseases and causes of death were grouped according to WHO guidelines. Rates were standardized by age and are expressed per 100,000 people-year. Results: A direct relationship was observed between aging and mortality from respiratory infections and chronic non-communicable diseases. Age-specific mortality rates were highest in those older than 80 years for all diseases evaluated. Seasonal variation was evident in respiratory diseases in the elderly. Comments: Estimates of mortality rates from respiratory infections and chronic non-communicable diseases in Cali provide the baseline that will serve as a comparison to estimate the excess mortality caused by the COVID-19 pandemic. Health authorities and decision makers should be guided by reliable estimates of mortality and of the proportion of infected people who die from SARS-CoV-2 virus infection.

Resumen Introducción: La pandemia de la enfermedad COVID-19 es una emergencia sanitaria. Las personas mayores y aquellos con enfermedades crónicas no trasmisibles tienen más probabilidades de desarrollar enfermedades graves, requerir soporte ventilatorio y morir a causa de las complicaciones. Objetivo: Establecer las defunciones por infecciones respiratorias y por algunas enfermedades crónicas no trasmisibles ocurridas en Cali, antes de la pandemia de la enfermedad por el SARS-CoV-2. Métodos: Durante el periodo 2003-2019, se registraron 207,261 defunciones información obtenida de la base de datos de mortalidad general de la Secretaria de Salud Municipal de Cali. Las defunciones se codificaron con la Clasificación Internacional de Enfermedades y las causas de muerte se agruparon según las guías de la OMS. Las tasas se estandarizaron por edad, son expresadas por 100,000 personas-año. Resultados: Se observó una relación directa entre envejecimiento y la mortalidad por infecciones respiratorias y enfermedades crónicas no trasmisibles. Las tasas de mortalidad específicas por edad fueron más altas en los mayores de 80 años para todas las enfermedades evaluadas. En las enfermedades respiratorias fue evidente una variación estacional en los ancianos. Comentario: Las estimaciones de las tasas de mortalidad por infecciones respiratorias y enfermedades crónicas no trasmisibles para Cali proporcionan la línea de base que servirá de comparación para estimar el exceso de mortalidad que ocasionará la pandemia de COVID-19. Las autoridades sanitarias y los tomadores de decisiones deben guiarse por estimaciones fiables de la mortalidad y de la proporción de infectados que mueren por la infección del virus SARS-CoV-2.

Cali cancer registry methods / Métodos del Registro de Cáncer en Cali, Colombia

Abstract Background: The Population Cancer Registry of Cali (RPCC) has operated since 1962, disseminating high quality information to provide a framework to assess and control the burden of cancer in Cali. Methods: The collection of new cancer cases in permanent residents of Cali is done through active search in and notification from hospitals, and public and private laboratories. The Secretary of Municipal Public Health provides individual information on general mortality and death from cancer. Tumors are coded with ICDO-3 and mortality with ICD-10. Presented rates are standardized by age and trends are assessed by estimating the percentage annual change using the regression analysis in JoinPoint. The 5-year net survival was analyzed with the Pohar-Perme estimator. Results: The 88.5% of the registered cancers had morphological verification (MV). The proportion of unknown primary site represented 5% and the death certificate only cases (DCO) varied between 0 to3% depending on the cancer site. All deaths were certified by a physician, 94.2% of cancer deaths were correctly certified. The ill-defined site proportion was 5.3% and that of uterine cancer not specified (C55) was 0.5%. For survival analysis, existing data collection procedure and infrastructure ensures assessment of the patient's vital status and follow-up, with an average lost to follow-up of 13.2%. Comment: The information has been published in the eleven volumes of "Cancer Incidence in Five Continents" confirming high quality of the collected data. The RPCC PCRC has also participated in the Concord Study and is participating in SURVCAN-3.

Resumen Antecedentes: El Registro Poblacional de Cáncer de Cali (RPCC) opera de manera continua desde 1962 divulgando información de calidad para proporcionar un marco para valorar y controlar el impacto del cáncer en Cali. Métodos: La recolección de los casos nuevos de cáncer en residentes permanentes de Cali se hace mediante búsqueda activa y por notificación en los hospitales y laboratorios públicos y privados. La Secretaria de Salud Pública Municipal proporciona la información individual de mortalidad general y por cáncer. Los tumores se codifican con la CIO-3 y la mortalidad con la CIE-10. Las tasas se estandarizan por edad y la tendencia se estudia con el porcentaje de cambio anual y con la regresión de JoinPoint. La supervivencia neta a 5 años se analizó con el estimador de Pohar-Perme. Resultados: El 88.5% de los canceres tuvieron verificación morfológica (VM). La proporción de los casos codificada como de sitio mal definido representó el 5% y el certificado de defunción como única evidencia del diagnóstico de cáncer (DCO) varió entre 0-3% dependiendo de la localización. Todas las defunciones fueron certificadas por un médico, el 94.2% de las muertes por cáncer fueron bien certificadas. La proporción de sitio mal definido fue 5.3% y la de cáncer de útero no especificado (C55) fue 0.5%. En todos los casos de supervivencia fue posible el seguimiento y la proporción de censuras fue 13.2% Comentario: La información ha sido publicada en los once volúmenes de "Cancer Incidence in Five Continents". El RPCC participó en el Estudio Concord y está participando en SURVCAN-3.

Reliable information for cancer control in Cali, Colombia / Información fiable para el control del cáncer en Cali, Colombia

Abstract Background: The Cali Population Cancer Registry (RPCC) has been in continuous operation since 1962 with the objective of producing valid statistics on the incidence of cancer, its patterns, trends and survival rates. Methods: During the period 2008-2012, 23,046 new cases were registered and during 2011-2015 there were 12,761 cancer deaths. The trend of the rates was described with the APC average annual change rate and with the Joinpoint analysis. We analyzed the individual data of 38,671 adults (15-99 years) diagnosed with cancer between 1995-2009, and we calculated the standardized net survival by age for the 14 most common cancer body sites, using the Pohar-Perme method. Results: Prostate and breast cancer were the first cause of cancer morbidity. The incidence rates in these were susceptible to early detection, tumors stabilized after decades of growth, while an increase in the incidence of colon cancer and papillary thyroid carcinoma was observed. The incidence rates of cervical and stomach cancer and conditions related to infectious agents decreased, although the number of absolute cases increased, due to the growth and aging of the population. Gastric cancer was responsible for the highest number of cancer related deaths. The types of cancer related to tobacco consumption (lung, oral cavity, esophagus, pancreas, urinary bladder) showed low numbers and a tendency to decrease. During the period 2000-2004, the 5-year net survival improved for cancers of the breast, cervix, prostate, melanoma and thyroid, although in the period 2005-2009 a stagnation was observed. In stomach, liver and lung cancer, the 5-year net survival was less than 15%. The 5-year overall survival in children was 51.0% (95% CI: 47.5, 54.3) and in adolescents 44.6% (95% CI: 36.0, 52.8). Comment: RPCC has been an advisor to the Colombian government in the evaluation of CPRs in the country and its data has contributed significantly to different aspects of cancer control in Colombia.

Resumen Antecedentes: El Registro Poblacional de Cáncer de Cali (RPCC) está en operación continua desde 1962 con el objetivo de producir estadísticas válidas sobre la incidencia de cáncer, sus patrones, tendencias y supervivencia. Métodos: Durante el periodo 2008-2012, se registraron 23,046 casos nuevos y durante 2011-2015 se registraron 12,761 defunciones por cáncer. La tendencia de las tasas se describió con el porcentaje de cambio medio anual APC y con el análisis de Joinpoint. Se analizaron los datos individuales de 38,671 adultos (15-99 años) con diagnóstico de cáncer entre 1995-2009, y se calculó la supervivencia neta estandarizada por edad para las 14 localizaciones más comunes de cáncer, con el método de Pohar-Perme. Resultados: Próstata y mama fueron la primera causa de morbilidad por cáncer. Las tasas de incidencia en estos tumores susceptibles de detección temprana se estabilizaron tras décadas de crecimiento, mientras que se observó un incremento de la incidencia de cáncer de colon y carcinoma papilar de tiroides. Las tasas de incidencia de cáncer de cuello uterino y estómago, afecciones relacionados con agentes infecciosos, disminuyeron, aunque el número de los casos absolutos aumentó, debido al crecimiento y envejecimiento de la población. El cáncer gástrico fue responsable del mayor número de muertes por cáncer. Los tipos de cáncer relacionados con el consumo de tabaco (pulmón, cavidad oral, esófago, páncreas, vejiga urinaria) mostraron cifras bajas y con tendencia al descenso. Durante el periodo 2000-2004, la supervivencia neta a 5 años mejoró para los cánceres de mama, cuello uterino, próstata, melanoma y tiroides, aunque en el periodo 2005-2009 se observó un estancamiento. En cáncer de estómago, hígado y pulmón, la supervivencia neta a 5 años fue inferior al 15%. La supervivencia global a 5 años en niños fue de 51.0% (IC 95%: 47.5, 54.3) y en adolescentes de 44.6% (IC 95%: 36.0, 52.8). Comentario: El RPCC ha sido asesor del gobierno colombiano en la evaluación de RPCs en el país y sus datos han contribuido significativamente a diferentes aspectos del control del cáncer en Colombia.