Petroleum contamination and bioaugmentation in bacterial rhizosphere communities from Avicennia schaueriana

ABSTRACT Anthropogenic activity, such as accidental oil spills, are typical sources of urban mangrove pollution that may affect mangrove bacterial communities as well as their mobile genetic elements. To evaluate remediation strategies, we followed over the time the effects of a petroleum hydrocarbon degrading consortium inoculated on mangrove tree Avicennia schaueriana against artificial petroleum contamination in a phytoremediation greenhouse experiment. Interestingly, despite plant protection due to the inoculation, denaturing gradient gel electrophoresis of the bacterial 16S rRNA gene fragments amplified from the total community DNA indicated that the different treatments did not significantly affect the bacterial community composition. However, while the bacterial community was rather stable, pronounced shifts were observed in the abundance of bacteria carrying plasmids. A PCR-Southern blot hybridization analysis indicated an increase in the abundance of IncP-9 catabolic plasmids. Denaturing gradient gel electrophoresis of naphthalene dioxygenase (ndo) genes amplified from cDNA (RNA) indicated the dominance of a specific ndo gene in the inoculated petroleum amendment treatment. The petroleum hydrocarbon degrading consortium characterization indicated the prevalence of bacteria assigned to Pseudomonas spp., Comamonas spp. and Ochrobactrum spp. IncP-9 plasmids were detected for the first time in Comamonas sp. and Ochrobactrum spp., which is a novelty of this study.

Thiocyanate degradation by pure and mixed cultures of microorganisms

Uma cultura mixta e uma linhagem bacteriana pura foram isoladas de um bioreator para tratamento de tiocianato. As culturas removeram 5mM de tiocianato do meio em 36 horas. A cultura mixta foi capaz de tolerar concentrações superiores a 60mM. A eficiência da degradação de tiocianato diminuiu quando as células foram imobilizadas.

An optmized protocol for simultaneous extraction of DNA and RNA from soils

Nesse trabalho descrevemos um protocolo otimizado para extração simultânea de DNA e RNA de solo. O tratamento das amostras de solo com etanol e posterior agitação com partículas foi uma estratégia bem sucedida para lise das células sem degradação significativa dos ácidos nucléicos, resultando em bom rendimento de DNA e RNA íntegros. O RNA transcrito pode ser amplificado com iniciadores com alvo no fragmento do gene da glutamina sintetase (glnA). Os fragmentos 16S rDNA, tanto do DNA como do cDNA, foram amplificados e analisados por DGGE. O método foi aplicado para amostras de solo e rizosfera (morango e canola). Dois outros protocolos para extração de ácidos nucléicos de solo foram aplicados para o mesmo lote de amostras, de forma a comparar os métodos quanto à eficiência e reprodutibilidade. Os perfis de DGGE mostraram não haver diferença relevante nos padrões obtidos. O método descrito é apropriado para o processamento rápido de muitas amostras e, conseqüentemente, adequado para estudos ecológicos.

Management of severe falciparum malaria.

Plasmodium falciparum is the most common cause of severe and life-threatening malaria. Falciparum malaria causes over one million deaths every year. In Africa, a vast majority of these deaths occur in children under five years of age. The presentation of severe malaria varies with age and geographical distribution. The mortality rate is higher in adults than in children but African children develop neuro-cognitive sequelae following severe malaria more frequently. The management of severe malaria includes prompt administration of appropriate parenteral anti-malarial agents and early recognition and treatment of the complications. In children, the complications include metabolic acidosis (often caused by hypovolaemia), hypoglycaemia, hyperlacticacidaemia, severe anaemia, seizures and raised intracranial pressure. In adults, renal failure and pulmonary oedema are more common causes of death. In contrast, concomitant bacterial infections occur more frequently in children and are associated with mortality in children. Admission to critical or intensive care units may help reduce the mortality, and the frequency and severity of sequelae related to severe malaria.

Uptake of free and complexed silver ions by different strains of Rhodotorula mucilaginosa

Five strains of Rhodotorula mucilaginosa were tested for the ability to accumulate free and complexed silver ions by metabolism-dependent and -independent processes. The ability to take up Ag+ was observed in both live and dead biomass, whereas silver dicyanide [Ag (CN)2-] uptake was strictly glucose dependent. In contrast to Ag (CN)2-, glucose addition inhibited by 16 to 25(per cent) the Ag+ uptake rate of living UFMG - Y02, Y27, and Y35 cells, while strains CBS 316 and UFMG-Y01 showed an improved uptake rate of about 115(per cent) and 13(per cent), respectively. The Langmuir sorption model was used to evaluate the silver sorption capability of the R. mucilaginosa strains. The calculated qmax value suggested that R. mucilaginosa strains UFMG-Y27 had the highest loading capacity. The type strain CBS 316 had the lowest qmax but showed the highest affinity for silver ions. The results provided by the Fourier Transform Infra Red analysis (FTIR) suggest that C=O groups represent the main reactive site for silver uptake by the strain UFMG-Y27.

Papiloma invertido: experiência e tratamento cirúrgico / Inverted papilloma: experience and surgical treatment

Introdução: O papiloma invertido é uma neoplasia epitelial benigna de carater invasivo, constituindo de 0,5 a 4 por cento de todos os tumores nasais. Tem potencial de malignização que varia de 5 a 13 por cento e recorrência freqüente. Objetivo: Avaliar os aspectos epidemiológicos e o tratamento cirúrgico dessa patologia no Serviço de Otorrinolaringologia do Hospital do Servidor Público Estadual de São Paulo, nos últimos quatro anos. Forma de estudo: Retrospectivo clínico. Material e método: Foram avaliados oito pacientes, operados de agosto de 1996 a julho de 2000, com diagnóstico de papiloma invertido, observando-se idade, sexo, sintomas pré-operatórios, localização do tumor, recorrência, transformação maligna,tratamento ciúrgico realizado. Resultados: Dos oito pacientes estudados, cinco (62,5 por cento) eram do sexo masculino; e três (37,5 por cento), do feminino. O sintoma pré-operatório principal foi a obstrução nasal. A localização principal foi na parede lateral nasal (62,5 por cento). Foram feitas três sinusectomias maxiloetmoidais via degloving medio-facial; três ressecções endoscópicas e duas ressecções via Caldwell-Luc. O seguimento variou de um a 47 meses. Conclusão: O papiloma invertido apresentou comportamento benigno; porém, invasivo. Acometeu mais indivíduos na quinta e sexta décadas de vida, preferencialmente os do sexo masculino. A abordagem cirúrgica foi ampla, variando de acordo com a localização e tamanho da lesão. Embora não tenhamos observado recidiva ou transformação maligna, os pacientes devem ser acompanhados durante vários anos para confirmação da cura clínica

Programa comunitário e deficiência de G-6-PD no Brasil / Community program and G-6-PD deficiency in Brazil

A viabilidade e a eficiência da implantaçäo de um programa comunitário relativo à deficiência de desidrogenase de 6-fosfato de glicose foram investigadas em uma populaçäo brasileira (Bragança Paulista, SP). A comunidade foi abordada a partir dos seus doadores de sangue, examinando-se 4.621 indivíduos do sexo masculino e diagnosticando-se 80 portadores da alteraçäo genética. O índice de positividade na amostra foi de 1,7 por cento, a taxa de aceitaçäo à orientaçäo genética oferecida em caráter opcional atingiu 61 por cento e a percentagem de assimilaçäo satisfatória dos deficientes de desidrogenase de 6-fosfato de glicose quanto às informaçöes fornecidas foi de 81 por cento. A análise molecular demonstrou a presença quase que exclusiva na comunidade da variante A ou Africana de desidrogenase de 6-fosfato de glicose, relativamente benigna do ponto de vista clínico. Com um baixo custo anual, foi possível diagnosticar e orientar de forma ética um número significativo de famílias com a deficiência de desidrogenase de 6-fosfato de glicose, além de iniciar a educaçäo da comunidade a respeito do problema.

Projeto saúde: controle da parasitose intestinal: moradores da Vila Murici - Montes Claros/MG / Health project: control of intestinl parasitsis: residents of Murici Village - Montes Claros/MG

O referido estudo foi realizado em duas etapas, por alunos e professores da disciplina de parasitologia – Curso Médico – UNIMONTES, sendo a 1ª etapa (abril a agosto de 1996) e a 2ª etapa (outubro de 1997 a maio de 1998). Foram realizados exames parasitológicos pelo H.P.J. de 397 moradores da Vila Murici, sendo positivos 269 (67,76%); 125 adultos (46,47%) e 144 crianças até 12 anos (53,53%). As maiores prevalências foram de Entamoeba histolytica (50,56%), Entamoeba coli (45,35%) e Ancylostomatidae (16,36%). Foi feito o tratamento de todas as pessoas parasitadas, orientações de higiene e profilaxia através de audio-visual e cartilha educativa. Após 12 meses, repetimos os exames de 192 pessoas medicadas na 1ª etapa, das quais 77 positivas (40,1%), sendo 33 adultos (42,86%) e 44 crianças (57,14%$). Houve permanência de 40,8% do índice de parasitoses, o que se justifica, pela péssima condição sócio-econômica, carência de água potável, saneamento básico e o espaço decorrido entre a 1ª e 2ª etapa. Finalmente, repetimos o tratamento das pessoas e através da participação dos alunos do Curso Médico UNIMONTES e ROTARACT (Rotary Club de Jovens), doamos 1 filtro para cada moradia do bairro.

Programa comunitário de hemaglobinopatias hereditárias em populaçäo estudantil brasileira / Public health programs hereditary hemoglobinopathies on high school students in Brazil

Foram testadas a viabilidade e a eficiência de um programa comunitário de investigaçäo em hemoglobinopatias, focalizando estudantes de primeiro e segundo graus, de Bragança Paulista, Estado de Säo Paulo, (Brasil). A triagem das hemoglobinopatias foi oferecida em caráter opcional, sendo realizada pela eletroforese de hemoglobinas e exames hematológicos complementares. Em um período de 24 meses foram examinadas 1.,118 estudantes e 53 parentes dos mesmos, em um total de 1.171 pessoas. Foram diagnosticados 47 indivíduos com alteraçöes hereditárias da hemoglobina (4,0 por cento da amostra examinada). A comunidade de estudantes mostrou razoável receptividade ao programa, com índice geral de aceitaçäo à realizaçäo dos exames laboratoriais de 55,4 por cento. A investigaçäo despertou o interesse da comunidade, levando à implantaçäo de um serviço especializado de diagnóstico, orientaçäo e tratamento de hemoglobinopatias hereditárias na cidade onde a pesquisa foi realizada

Phenobarbitone in young children with severe falciparum malaria

The mortality of cerebral malaria (CM) in children remains 10-40; and seizures have been shown to effect outcome adversely. Phenobarbitone (PB) is cheap; widely available in Kenya and reduces the incidence in adults with CM (single IM dose; 3.5 mg kg-1. Its value in children with CM is unkown. We have studied the pharmacokinetics and effect of PB in children with CM as a dose-finding exercise prior to controlled trial. 14 children entered the treatment group and 39 entered the control group. Over the first 6 h; the motor component of the coma score improved in 29 of the treatment group and 26 of the controls; was unchanged in 36 and 51; worsened in 7 and 8; and was not available in 29 and 13 respectively. The time taken to localise pain was 21 + 19 h (x+SD) in the treatment group; and 22 + 14 h in the control. There was no difference between the groups in the incidence of seizure; number of seizures during admission; incidence of neurological sequelae or mortality. Peak PB concentrations exceeded 15 mgL-1 in only 27 of patients. Prophylactic PB (10 mg/kg) has neither apparent benefit nor risk in young children with CM.; probably because of the low blood concentrations achieved