Using in situ flow cytometry images of ciliates and dinoflagellates for aquatic system monitoring / Usando imagem de citometria de fluxo in situ de ciliados e dinoflagelados para o monitoramento de sistemas aquáticos

Abstract Short-period variability in plankton communities is poorly documented, especially for variations occurring in specific groups in the assemblage because traditional analysis is laborious and time-consuming. Moreover, it does not allow the high sampling frequency required for decision making. To overcome this limitation, we tested the submersible CytoSub flow cytometer. This device was anchored at a distance of approximately 10 metres from the low tide line at a depth of 1.5 metres for 12 hours to monitor the plankton at a site in the biological reserve of Barra da Tijuca beach, Rio de Janeiro. Data analysis was performed with two-dimensional scatter plots, individual pulse shapes and micro images acquisition. High-frequency monitoring results of two interesting groups are shown. The abundance and carbon biomass of ciliates were relatively stable, whereas those from dinoflagellates were highly variable along the day. The linear regression of biovolume measures between classical microscopy and in situ flow cytometry demonstrate high degree of adjustment. Despite the success of the trial and the promising results obtained, the large volume of images generated by the method also creates a need to develop pattern recognition models for automatic classification of in situ cytometric images.

Resumo A variabilidade de curto período em comunidades do plâncton é pouco documentada, especialmente as variações que ocorrem em grupos específicos das assembleias por causa das análises tradicionais serem muito trabalhosas e demoradas. Além disso, não permitem que a alta frequência amostral necessária para a tomada de decisão. Para superar esta limitação, nós testamos o CytoSub, um citômetro de fluxo submersível. Este aparelho foi ancorado a aproximadamente 10 metros de distância da linha de maré baixa a uma profundidade de 1,5 metros por 12 horas para monitorar o plâncton em um sítio da reserva biológica da praia da Barra da Tijuca, Rio de Janeiro. A análise dos dados foi realizada a partir de gráficos de dispersão bidimensionais, pelas assinaturas ópticas individuais escaneadas (pulse shape profile) e aquisição de micro imagens. Resultados do monitoramento de alta frequência de dois grupos interessantes são apresentados. A abundância e a biomassa de carbono de um grupo de ciliados foram relativamente estáveis, ao passo que o grupo de dinoflagelado, foi altamente variável ao longo do dia. O modelo de regressão linear das medidas de biovolume entre a clássica microscopia e a citometria de fluxo in situ apresentou alto grau de ajustamento. Apesar do sucesso deste ensaio e dos resultados promissores obtidos, o grande volume de imagens geradas por este método também gerou a necessidade de se desenvolver modelos de reconhecimento de padrões para a classificação automática de imagens de citometria in situ.

Avaliação do impacto de laboratórios de análises clínicas de hospitais de urgência e emergência do município de Belém-PA na saúde / Health impact assessment of clinical analysis laboratories in Urgency and Emergency hospitals in Belém (PA, Brazil)

Este trabalho teve como objetivo avaliar o impacto de laboratórios de análises clínicas de hospitais de urgência e emergência do município de Belém-PA na saúde. Trata-se de um estudo do tipo descritivo com abordagem quantitativa, no qual os dados foram coletados por meio de entrevistas diretas por meio de um questionário contendo perguntas abertas e fechadas, seguindo uma ordem de questionamentos divididos em diferentes avaliações de impacto na saúde. Os resultados revelaram que os laboratórios de análises clínicas dos hospitais de urgência e emergência apresentam os serviços bem estruturados, com profissionais próprios qualificados e treinados periodicamente. Para a rotina laboratorial há documentos para guiar na operacionalização dos serviços, manuais de qualidade e credenciamento a programas e/ou empresas de certificação ou acreditação de qualidade. Os laboratórios realizam auditorias internas, apresentam dispositivo de medição quanto a ensaios e equipamentos calibrados, com manutenções periódicas e possuem responsáveis técnicos e diretores de laboratório. Quanto à citação do número de exames laboratoriais, o LAC A e o LAC D apresentam todos os exames hematológicos questionados, no entanto, o LAC B e LAC C apresentam 85,71% (n =12) dos exames questionados. Quando questionados em relação às dosagens bioquímicas, o LAC A e LAC D mostraram-se mais abrangentes por realizarem todos os exames bioquímicos propostos. Diante dos resultados obtidos, conclui-se que os laboratórios de urgência e/ou emergência existentes no município de Belém-PA oferecem ampla variedade de serviços, bem como apresentam preocupação com a garantia da qualidade da prestação de seus serviços...

This study is an assessment of the health impact of 4 clinical analysis laboratories (LAC A, B, C and D) in Urgency and Emergency hospitals in Belém (PA). In a descriptive study with a quantitative approach, we collected data through interviews conducted with a questionnaire containing open and closed questions, which were organized into various levels of health impact assessment. The results revealed that the clinical analysis laboratories of urgency and emergency hospitals have well-structured services, with qualified professionals who received periodic in service training. For routine lab work, there are well documented operational guidelines, quality manuals and programs and/or companies offering quality certification and accreditation. The laboratories make internal audits and possess measuring devices for assays and periodically calibrated equipment; they have responsible technicians and laboratory directors. In response to questions on the number of laboratory tests, LAC A and LAC D exhibited all the hematological tests cited, while LAC B and C showed 85.71% (n = 12) of the tests. Regarding the biochemical dosages, LAC A and LAC D proved to be more inclusive, covering all the recommended biochemical tests. On the basis of these results, we conclude that the clinical laboratories in urgency and/or emergency hospitals in Belém offer a wide variety of services, as well as showing concern for quality assurance in the provision of these services...

Virioplankton abundance in trophic gradients of an upwelling field

This work correlates time series of biological and physical variables to the marine viruses across trophic gradients within Arraial do Cabo upwelling system, Southeast of Brazil. The objective is to investigate the major controlling factors of virioplankton dynamics among different water masses. It was used an in situ and ex situ flow cytometry for accessing the plankton community. Viruses were highly correlated to bacteria and phytoplankton, but although the lack of direct correlation with physicals, upwelling turned out to be the main contributing factor to the highest values of viral abundance and virus:bacterial ratio. Our data suggest that the lowest temperature of upwelled South Atlantic Central Waters would help to maintain a high viral abundance and higher temperatures of Coastal and Tropical Waters might be another ecological niche allowing the co-existence.

Alterações da ultra-estrutura miocárdica durante cirurgia cardíaca / Ultrastructural changes of the myocardium during cardiac surgery

Os autores fazem uma revisao da ultra-estrutura miocardica normal e alterada por isquemia cardiaca e circulacao extracorporea, analisando a quantificacao das alteracoes encontradas. Admiten que o estudo da ultra-estrutura miocardica e um bom metodo para estudar a protecao miocardica durante cirurgia cardiaca

Proteção miocárdica por cardiologia sanguínea durante circulação extracorpórea. Avaliação ultra-estrutural miocárdica no cão / Myocardial protection by blood cardioplegia during extracorporeal circulation. Ultrastructural myocardial evaluation in the dog

Os autores desenvolveram metodo simplificado para infusao de cardioplegia sanguinea durante circulacao extracorporea. Fizeram estudo experimental, em caes, para averiguar a eficiencia do metodo. Dois grupos de 5 caes foram submetidos a 60 min de esquemia cardiaca, seguidos de 60 min de reperfusao coronaria. A protecao miocardica, durante isquemia cardiaca, foi obtida com o metodo de cardioplegia sanguinea no grupo I e com cardioplegia acelular gelada no grupo II. Para comparar os dois metodos empregados, foram feitas quatro biopsias de ventriculo esquerdo, para estudo ultra-estrutural: antes da isquemia cardiaca; ao fim de 60 min de isquemia cardiaca; com 30 mim de reperfusao coronaria e com 60 min de reperfusao coronaria.Nas tres primeiras biopsias houve apenas alteracoes ultra-estruturais miocardicas discretas, sem diferencas entre os dois grupos. Nas ultimas, as alteracoes ultraestruturais foram mais severas no grupo II do que no grupo I. Conclui-se que o metodo de protecao miocardica com cardioplegia sanguinea e eficaz para 60 min de isquemia cardiaca, sendo inclusive superior a cardioplegia acelular gelada