Whole genome sequence of Mycobacterium kansasii isolates of the genotype 1 from Brazilian patients with pulmonary disease demonstrates considerable heterogeneity

Mycobacterium kansasii is an opportunistic pathogen and one of the most commonly encountered species in individuals with lung disease. We here report the complete genome sequence of 12 clinical isolates of M. kansasii from patients with pulmonary disease in Brazil.

Fatores associados ao abandono e ao óbito de casos de tuberculose drogarresistente (TBDR) atendidos em um centro de referência no Rio de Janeiro, Brasil / Factores asociados al abandono y al fallecimiento por casos de tuberculosis farmacorresistente (TBFR), atendidos en un centro de referencia en Río de Janeiro, Brasil / Factors associated with loss to follow-up and death in cases of drug-resistant tuberculosis (DR-TB) treated at a reference center in Rio de Janeiro, Brazil

Resumo: A tuberculose drogarresistente (TBDR) representa hoje uma grave ameaça aos avanços no controle da tuberculose (TB) no Brasil e no mundo. Neste estudo, investigam-se fatores associados ao abandono e ao óbito de casos em tratamento para TBDR, em um centro de referência terciária do Município do Rio de Janeiro, Brasil. Trata-se de um estudo de coorte retrospectiva, a partir dos casos notificados no Sistema de Informação de Tratamentos Especiais de Tuberculose (SITETB), no período de 1º de janeiro de 2012 a 31 de dezembro de 2013. Um total de 257 pacientes foi notificado no SITETB e iniciou o tratamento para TBDR. Desse total, 139 (54,1%) tiveram sucesso terapêutico como desfecho, 54 (21%) abandonaram o tratamento e 21 (8,2%) evoluíram para óbito. Após análise de regressão logística multinomial múltipla, a faixa etária acima de cinquenta anos foi observada como único fator de proteção ao abandono, ao passo que ter menos de oito anos de escolaridade e reingresso após abandono foram considerados como fatores de risco. Reingresso após abandono, recidiva e falência indicaram fatores de risco. Nossos dados reforçam a concepção de que o abandono do tratamento de tuberculose resistente é um sério problema de saúde pública, sendo necessário um adequado acompanhamento no tratamento de pacientes com esse histórico e com baixa escolaridade. Além disso, uma rede de apoio social ao paciente é imprescindível para que desfechos desfavoráveis sejam evitados.

Resumen: La tuberculosis farmacorresistente (TBFR) representa hoy una grave amenaza para los avances en el control de la tuberculosis (TB) en Brasil y en el mundo. En este estudio, se investigan factores asociados al abandono y al óbito de casos en tratamiento para TBDR, dentro de un centro de referencia de carácter terciario del municipio de Río de Janeiro, Brasil. Se trata de un estudio de cohorte retrospectiva, a partir de los casos notificados en el Sistema de Información de Tratamientos Especiales de Tuberculosis (SITETB), durante el período del 1 de enero de 2012 al 31 de diciembre de 2013. Un total de 257 pacientes fue notificado en el SITETB y comenzó el tratamiento para TBDR. De ese total, 139 (un 54,1%) tuvieron éxito terapéutico como desenlace, 54 (un 21%) abandonaron el tratamiento y un 21 (8,2%) evolucionaron hacia óbito. Tras el análisis de regresión logística multinomial múltiple, la franja de edad por encima de cincuenta años se observó como el único factor de protección al abandono, al mismo tiempo que tener menos de ocho años de escolaridad y reingresar en el sistema educativo tras el abandono fueron considerados como factores de riesgo. Reingreso tras abandono, recidiva e insolvencia indicaron factores de riesgo. Nuestros datos refuerzan la concepción de que el abandono del tratamiento de tuberculosis resistente es un serio problema de salud pública, siendo necesario un adecuado acompañamiento en el tratamiento de pacientes con este historial y con baja escolaridad. Además, una red de apoyo social entorno al paciente es imprescindible para que los desenlaces desfavorables sean evitados.

Abstract: Drug-resistant tuberculosis (DR-TB) poses a serious threat to tuberculosis (TB) control in Brazil and worldwide. The current study investigated factors associated with loss to follow-up and death in the course of treatment for DR-TB in a tertiary reference center in the city of Rio de Janeiro, Brazil. This was a retrospective cohort study of cases reported to the Information System on Special Treatments for Tuberculosis (SITETB) from January 1, 2012, to December 31, 2013. A total of 257 patients were reported to the SITETB and initiated treatment for DR-TB. Of this total, 139 (54.1%) achieved treatment success as the outcome, 54 (21%) were lost to follow-up, and 21 (8.2%) died. Following a multiple multinomial logistic regression analysis, the age bracket older than 50 years was the only protective factor against loss to follow-up, whereas less than eight years of schooling and reentry after loss to follow-up were considered risk factors. Reentry after loss to follow-up, relapse, and treatment failure appeared as risk factors. Our data reinforce the concept that loss to follow-up in drug-resistant tuberculosis is a serious public health problem, and that adequate follow-up of treatment is necessary in patients with this history and low schooling. A social support network for patients is also indispensable for avoiding unfavorable outcomes.