Serological and virological evaluation of human T-lymphotropic virus type 1 infection in family groups from Tumaco, Colombia / Evaluación serológica y virológica de la infección por el virus linfotrópico de células T humanas de tipo 1 en grupos familiares de Tumaco, Colombia

Introduction: To date there has been no statistical evaluation of the profiles of immunoglobulin classes and viral replication as variables in the study of HTLV-1 infection and circulation among families in virus-endemic areas of Colombia. Objective: To evaluate the correlation of several immunological and molecular characteristics with the transmission and circulation of HTLV-1 among families in the town of Tumaco. Materials and methods: Plasma levels of HTLV-1 specific immunoglobulin classes IgG, IgM and IgA1, as well as IgG and sIgA in oral fluids, were calculated for 32 members of 10 family groups from Tumaco in which the mother and at least one child were infected with the virus. Levels of the different immunoglobulin classes were correlated with viral RNA circulating in plasma or oral fluids and the proviral burden as detected by RT-PCR. Results: Significant differences were determined between mothers and carrier children for immunoglobulin levels (p=0.037) and proviral burden (p=0.002). The overall estimate of IgG in plasma and sIgA in oral fluids could be correlated with the circulation of free viral RNA in both fluids and high proviral burden, and associated with HAM/TSP mothers. The detection of anti- tax IgG in plasma revealed differences between HAM/TSP mothers and their offspring. Conclusion: The study of immunological and molecular variables permitted the analysis of HTLV-1 circulation among families of Tumaco. The strong correlation between levels of IgM specific for the virus and viral RNA circulating in fluids indirectly confirmed the transmission of HTLV-1 among families.

Introducción. Todavía no hay una evaluación estadística de los perfiles de las clases de inmuno- globulina s y la replicación viral, como variables para estudiar la infección y la circulació n del HTLV-1 en familias de zonas endémicas en Colombia. Objetivo. Evaluar la correlación de varias características inmunológicas y moleculares, con la transmisión y circulación del virus en familias del municipio de Tumaco. Materiales y métodos. Se calcularon los niveles de IgG, IgM e IgA1 en plasma, e IgG y IgA secretoria en fluido oral, de 32 miembros de 10 grupos familiares de Tumaco, en los que la madre y, al menos, un hijo estaban infectados con el virus. La concentración de las diferentes clases de inmunoglobulinas se pudo correlacionar con la circulación de ARN viral libre en plasma y fluido oral, y la carga proviral, según su detección mediante reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa. Resultados. Se encontraron diferencias significativas en los niveles de inmunoglobulinas (p=0,037) y en la carga proviral (p=0,002) entre madres e hijos portadores. La estimación total de IgG en plasma e IgA secretoria en fluido oral, se pudo correlacionar con la circulación de ARN viral libre en ambos fluidos y una alta carga proviral, y se asoció con las madres paraparesia espástica tropical o mielopatía asociada con el HTLV-1. La detección en plasma de IgG anti-Tax reveló diferencias entre ellas y sus hijos. Conclusión. El estudio de las variables inmunológicas y moleculares permitió analizar la circulación del HTLV-1 en familias de Tumaco. La fuerte asociación entre los niveles de IgM específica para el virus y el ARN viral circulante en los fluidos y la carga proviral, confirmó indirectamente la transmisión intrafamiliar del virus.

Caracterización genómica de la integración in vitro del VIH-1 en células mononucleares de sangre periférica, macrófagos y células T de Jurkat / Genomic characterization of HIV-1 in vitro integration in peripheral blood mononuclear cells, macrophages and Jurkat T cells

Introducción: La mayor parte del genoma celular es accesible a la integración retroviral; sin embargo, se propone que este proceso no es aleatorio y es dependiente de cada retrovirus. Objetivos: Identificar y caracterizar las regiones del genoma humano en donde ocurre la integración del virus de la inmunodeficiencia humana de tipo 1 (VIH-1) en células mononucleares de sangre periférica, macrófagos y células T de Jurkat infectadas. Materiales y métodos: Se seleccionaron 300 secuencias de ADN humano obtenidas por el método de ligación mediada por PCR, previamente depositadas en el GenBank. Utilizando el programa BLAST, sólo 264 de ellas se incluyeron en el estudio, pues se pudo obtener información sobre localización cromosómica, genes anotados, secuencias repetidas, número de islas CpG y tiempo medio de replicación, entre otras variables genómicas. Estas secuencias se exportaron a otras bases de datos. Resultados: El 53% (140/264) de las integraciones se registraron en bandas G. El 70,45% de los provirus se localizaron en los genes humanos anotados, mientras que el restante lo hizo en elementos repetidos. En general, la selección del sitio de integración se relacionó con las características locales genómicas y estructurales de la cromatina, entre las que se incluyen secuencias Alu-Sx y L1, densidad génica y de islas CpG, remodelación de la cromatina y tiempo de replicación. Éstas influenciarían la interacción eficiente del complejo de preintegración con los genomas celulares. Conclusión: Se determinó que la integración del VIH-1 en los genomas celulares estudiados estaría condicionada por características diferenciales de la cromatina y por procesos epigenéticos que influirían la selección del sitio blanco de integración.

Introduction: Most of the infected host cell genome is available for retroviral integration; however, it has been proposed that this process does not occur at random and depends upon each type of retrovirus. Objective: The objective is to identify and characterize differences in human genome regions of peripheral blood mononuclear cells, macrophages and Jurkat T cells in which integration of HIV-1 occurs. Material and Methods: Three hundred human DNA genome sequences, previously deposited in the GenBank, were selected at random. Using program BLAST, only 264 of them were included in the study because relevant information about chromosomal position, associated genes, repetitive sequences, number of CpG islands and average replication time was available; these sequences were exported to other data bases for analysis. Results: 53% (140/264) of integrations were located on G bands. 70.45% of provirus was located in human genes and the rest was located in repetitive elements. In general the integration site selection was correlated with genomics and structural characteristics of cell chromatin including Alu-Sx and L1 sequences, gene and CpG island densities, remodeling of chromatin, and replication time. All of them would influence the efficient interaction between the pre-integration complex and target cell genomes. Conclusion: It was determined that HIV-1 integration in target cellular genomes would be conditioned by differential characteristics of associated chromatin and by epigenetic processes that would influence the selection of integration sites.

Caracterización de la violencia sexual en adolescentes de 10 a 19 años, 2001-2003, Cali / Characteristics of sexual violence in adolescents from 10 to 19 years of age, Cali 2001-2003

Antecedentes: En Colombia entre las lesiones violentas no fatales, los delitos sexuales ocupan el cuarto lugar, siendo mas afectados los menores de edad. La violencia sexual experimentada en la infancia o en la adolescencia deja consecuencias severas. Objetivos: Describir la ocurrencia de los casos de denuncia de violencia sexual en jóvenes entre 10 y 19 años de edad, durante los a±os 2001 y 2003 en Cali. Métodos: Se realizó un estudio de prevalencia de casos de violencia sexual valorados por clínica forense y trabajo social (Instituto de Medicina Legal y Ciencias Forenses), ocurridos en ßrea urbana de Cali. Se calcularon prevalencias y se utilizó la prueba chi2 para explorar diferencias entre las variables. Resultados: De los 250 casos incluidos, 77.5% eran mujeres, siendo el grupo de mayor prevalencia entre 10 y 14 años; 96% eran escolarizados al momento de la ocurrencia del evento. Del total de las víctimas, 46% realizaban actividades en el entorno familiar cuando fue abordada por el agresor. Ademas, 38.2% informaron antecedentes de violencia familiar directa o indirecta; 31.4% pertenecían a familias monoparentales y 40% a familias mixtas; 82.6% de los agresores eran personas conocidas por la víctima y 17% dijo no conocer al agresor. La amenaza y el chantaje fueron las principales formas de abordaje y de inducción al silencio empleadas por el agresor. Se destaca ademas, la presencia de cómplices al momento del abuso. Finalmente, la Comuna 13 (20 casos) presentó el mayor número de denuncias y la de menor número fue la Comuna 17 (un caso). Conclusiones: Un alto porcentaje de víctimas de violencia sexual son mujeres que conocen a su agresor. Las denuncias son mas prevalentes en sectores con desventaja socioeconómica.

Background: In Colombia among violent not fatal injuries the sexual crimes occupy fourth place, being more affected the minors of age. The sexual violence experienced on the infancy or on the adolescence leaves severe consequences. Objectives: To describe the occurrence of sexual violence cases denounced in teenagers from 10 to 19 years, during the 2001-2003 in Cali.Methods: A descriptive study of prevalence of sexual abuse in adolescents from 10 to 19 years assisted in the Institute of Legal Medicine and Forensic Sciences of the Southwest region during the 2001-2003 for clinic and social work evaluation. Prevalence was calculated and the chi2 test was used to explore differences between variables. Results: From 250 cases of accusations of adolescents were included 77.5% of these accusations were filed by women; being the most affected group age between 10 to 14; 96% reported to have any scholarship studies at the moment of the abuse; 46% were doing family-related activities at the moment of the abuse; 31.4% of the victims belonged to monoparental family and 40% to mixed family; 38.2% of the adolescents had records of family domestic violence; 82.6% of the aggressors were a victimÆs acquaintance and only the 17% reported to have been attacked by a stranger. The menace and the blackmail were the principal forms used by the aggressor to persuade victimÆs silence. Also stands out the presence of accomplices in the moment of the abuse. Finally, the commune (or municipality) 13 and 20 were the ones with a greater number of cases, and the one with the least was the 17 with only one case. Conclusions: A high percentage of victims of sexual violence are women who know his aggressor. The accusations are more prevalent in sectors with socioeconomic disadvantage.

Manejo interdisciplinario de la víctima del delito sexualuna mirada desde el laboratorio de biologia forense: [revisión] / Interdisciplinary approach to manage sexually abused victim: an insight from the forensic laboratory point of view: [review]

El delito sexual está constituido por actos o amenazas que atentan contra la dignidad y libertad sexual de la persona y es ejercido mediante el uso de la fuerza física o engaño con el propósito de imponer una conducta sexual en contra de la voluntad de la persona. Su estudio integral en el contexto penal implica la participación de diferentes disciplinas que buscan reconstruir un hecho delictivo a partir del análisis de elementos físicos recolectados en la escena de un crimen o a partir del cuerpo de las posibles víctimas y/o agresores. Médicos, Odontólogos y Bacteriólogos, entre otros profesionales, trasladan los interrogantes legales dentro de una pregunta científica y aconsejan a la administración de justicia sobre las capacidades y limitaciones de las técnicas utilizadas en los estudios practicados a los elementos físicos recolectados por la autoridad competente durante la atención a los sujetos involucrados en el hecho. Por esto, en esta revisión se dará un enfoque a la labor realizada por los Médicos, encargados de la atención directa y evaluación externa de la posible víctima y en contadas ocasiones del agresor; del Odontólogo, que apoya al Médico cuando se requiera su participación y del Bacteriólogo quien responde por los estudios de los Elementos Materiales de Prueba.

Sexual crime is constituted by threats or acts that attempt against people’s dignity and sexual liberty and is practiced by using physical force or deceit with the purposse to impose a sexual behavior against the will of the person. Its entire study in penal context, implies the participation of differents disciplines searching to rebuild a delictive fact starting from analysis of physical elements gathered from a crime scene or in possible victims and/ or agressor’s body. Professionals in medicine, Dentistry, Bacteriology and others, take legal questions into a scientist question and advice to the justice management about capacity and limitations of technics used in practiced study to the physical elements gathered by qualified authority during the assistance to involved subjects in the fact. Therefore, this revision focussing in the labor done by Medicine professionals, who are in charge of direct assitance and external evaluation of possible victims and sometimes of the agressors; the Dentist, that supports the doctors in cases which his participation is required, and Bacteriologists, who are responsable for the study of testing material elements.