Detección de Patotipos de Cepas de Escherichia coli Causantes de Diarrea Infantil de Establecimientos de Salud de la Región Lambayeque-Perú, 2018 / Detection of Patotypes of Escherichia coli Strains Causing Childhood Diarrhea in Health Establishments of the Lambayeque-Peru Region, 2018

Objetivo: Identificar patotipos de genes de virulencia de Escherichia coli de muestras diarreicas de niños menores de cinco años de la Región Lambayeque, en el periodo abril­setiembre 2018. El estudio: Estudio descriptivo y transversal. Se analizaron 75 cepas de E. coli de muestras diarreogénicas usando PCR Multiplex en tiempo real y primers para genes de patotipos de E. coli: daaD, aggR, eaeA, stx, ipaH y st. Hallazgos: Se detectó 34,66 % (26/75) de genes de virulencia del total de cepas aisladas. El patotipo de E. coli Enterotoxigénica presentó mayor frecuencia, 18,67% (14/75) del total de cepas aisladas. También se detectó que el patotipo E. coli Enterotoxigénica se presentó en 53,86% (14/26) del total de cepas positivas. También en un 11,54% de cepas positivas (3/26) presentaron más de un patotipo. Conclusión: La epidemiologia molecular ayudará a un mejor diagnóstico adecuado y oportuno de las diarreas infantiles en esta población vulnerable.

Objetive. To identify pathotypes of virulence genes of Escherichia coli from diarrheal samples of children under five years of age in the Lambayeque Region, in the period April-September 2018. The study: Descriptive and cross-sectional study. 75 E. coli strains from diarrheogenic samples were analyzed using realtime Multiplex PCR and primers for E. coli pathotype genes: daaD, aggR, eaeA, stx, ipaH and st. Findings: 34.66% (26/75) of virulence genes were detected from the total isolates. The enterotoxigenic E. coli pathotype presented the highest frequency, 18.67% (14/75) of the total isolates. It was also detected that the enterotoxigenic E. coli pathotype appeared in 53.86% (14/26) of the total positive strains. Also, in 11.54% of positive strains (3/26) they presented more than one pathotype. Conclusion: Molecular epidemiology will help a better, adequate and timely diagnosis of childhood diarrhea in this vulnerable population

Genes de virulencia de Escherichia coli detectados en muestras diarreicas de niños de la Región Lambayeque - Perú / Escherichia coli virulence genes detected in diarrheal samples of children from the Lambayeque region - Peru

Objetivo: Detectar genes asociados a factores de virulencia de Escherichia coli aisladas de muestras diarreicas de niños menores de cinco años con el empleo de PCR Multiplex. Materiales y métodos: Se realizó un trabajo descriptivo, transversal, de una sola cohorte de muestras diarreicas de niños menores de cinco años colectadas desde enero 2014 a marzo 2015. Se usaron primers específicos para genes de los seis patotipos causantes de diarreas infantiles: gen daaD (Escherichia coli difusamente adherente - DAEC), gen aggR (Escherichia coli enteroagregativa - EAEC), gen eaeA(Escherichia coli enteropatógena - EPEC), gen stx (Escherichia coli productora de toxina Shiga - STEC), gen ipaH (Escherichia coli enteroinvasiva - EIEC)y gen st (Escherichia coli enterotoxigénica - ETEC). Resultados: Se aislaron 106 cepas de Escherichia coli en las que se encontraron genes de virulencia analizados en el 37,74 % (40/106) de las mismas. El grupo etario más afectado con la presencia de estos genes fue el comprendido entre 1-2 años (48,6 %). Conclusiones: El gen daaD del patotipo DAEC presentó la mayor distribución en un 16,98 %; así mismo la detección de los genes de virulencia específicos podría ayudar a tratar de manera adecuada y oportuna un episodio de diarrea aguda infantil

Objective: This study aimed to detect, by multiplex PCR, genes associated with virulence factors of Escherichia coli de isolated from diarrheal samples of children under 5 years of age. Materials and methods: A descriptive, cross-sectional, single-cohort study, in which diarrheal samples from children under five years of age collected from January 2014 to March 2015 were analyzed. Specific primers for detecting the genes of the six pathotypes that cause childhood diarrhea were used: daaD gene (diffusely adherent Escherichia coli - DAEC), aggR gene (Enteroaggregative Escherichia coli - EAEC), eaeA gene (enteropathogenic Escherichia coli - EPEC), stx gene (Shiga toxin-producing Escherichia coli - STEC), ipaH gene (Enteroinvasive Escherichia coli - EIEC) and st gene (Enterotoxigenic Escherichia coli - ETEC). Results: Virulence genes were found in 37.74 % ( 40/106) of the 106 Escherichia coli isolated strains. The 1-to 2-year-old age group was the most affected with these genes (48.6 %). Conclusions: The daaD gene of the DAEC pathotype showed the greatest distribution (16.98 %). The detection of specific virulence genes could help to treat an episode of acute childhood diarrhea in an appropriate and timely manner