Local circulating clones of Staphylococcus aureus in Ecuador

ABSTRACT The spread of pandemic Staphylococcus aureus clones, mainly methicillin-resistant S. aureus (MRSA), must be kept under surveillance to assemble an accurate, local epidemiological analysis. In Ecuador, the prevalence of the USA300 Latin American variant clone (USA300-LV) is well known; however, there is little information about other circulating clones. The aim of this work was to identify the sequence types (ST) using a Multiple-Locus Variable number tandem repeat Analysis 14-locus genotyping approach. We analyzed 132 S. aureus strains that were recovered from 2005 to 2013 and isolated in several clinical settings in Quito, Ecuador. MRSA isolates composed 46.97% (62/132) of the study population. Within MRSA, 37 isolates were related to the USA300-LV clone (ST8-MRSA-IV, Panton-Valentine Leukocidin [PVL] +) and 10 were related to the Brazilian clone (ST239-MRSA-III, PVL−). Additionally, two isolates (ST5-MRSA-II, PVL−) were related to the New York/Japan clone. One isolate was related to the Pediatric clone (ST5-MRSA-IV, PVL−), one isolate (ST45-MRSA-II, PVL−) was related to the USA600 clone, and one (ST22-MRSA-IV, PVL−) was related to the epidemic UK-EMRSA-15 clone. Moreover, the most prevalent MSSA sequence types were ST8 (11 isolates), ST45 (8 isolates), ST30 (8 isolates), ST5 (7 isolates) and ST22 (6 isolates). Additionally, we found one isolate that was related to the livestock associated S. aureus clone ST398. We conclude that in addition to the high prevalence of clone LV-ST8-MRSA-IV, other epidemic clones are circulating in Quito, such as the Brazilian, Pediatric and New York/Japan clones. The USA600 and UK-EMRSA-15 clones, which were not previously described in Ecuador, were also found. Moreover, we found evidence of the presence of the livestock associated clone ST398 in a hospital environment.

Susceptibility rates in Latin American nations: report from a regional resistance surveillance program (2011)

OBJECTIVE: To establish a resistance (R) surveillance program monitoring antimicrobial susceptibility patterns in Latin America (LATAM; Argentina [ARG], Brazil [BRA], Chile, Colombia [CBA], Costa Rica, Ecuador [ECU], Guatemala [GUA], Mexico [MEX], Panama [PAN], Peru, and Venezuela [VEN]). METHODS: In 2011, 4979 organisms were collected from 11 nations (20 laboratories) for susceptibility testing in a central laboratory design. Antimicrobials were tested by CLSI methods and results interpreted by CLSI and EUCAST breakpoints. Most common Gram-positive (Staphylococcus aureus [SA, 921], other staphylococci [CoNS; 299], enterococci [218], Streptococcus pneumoniae [SPN; 182], β-haemolytic streptococci [115]) and Gram-negative (E. coli [EC; 644], Klebsiella spp. [KSP; 517], Enterobacters [272], Pseudomonas aeruginosa [PSA; 586], Acinetobacters [ACB; 494]) pathogens were analyzed against linezolid (LZD), vancomycin (VAN), tigecycline (TIG), colistin (COL), cefoperazone/sulbactam (C/S), and amikacin (AMK). RESULTS: MRSA rates varied from 29% (CBA, BRA) to 79% (Peru); but LZD (MIC90, 2 mg/L), TIG (MIC90, 0.12mg/L) and VAN (MIC90, 1mg/L) covered all strains. Enterococci showed a 14% VRE rate, highest in BRA and MEX; all inhibited by TIG and daptomycin, but not LZD (three non-susceptible with G2576T mutations or cfr). Penicillin-R among SPN and viridans streptococci was 51.6 and 41.1%, respectively. LZD overall R against Gram-positives was 0.3%. High ESBL rates were observed in EC (54-71%) and KSP (>50%) from GUA, MEX and Peru, and six nations, respectively. Carbapenem-R in KSP was 9%, highest rates associated with KPC in BRA, CBA, ECU, PAN and VEN; also a NDM-1 in KSP from CBA. AMK, TIG, C/S and carbapenems were the broadest-spectrum agents tested against Enterobacteriaceae. Only COL inhibited >90% of PSA; COL and TIG (<2 mg/L) covered >85% of ACB. CONCLUSIONS: LATAM nations demonstrated variable levels of antimicrobial R especially among Enterobacteriaceae (β-lactamase-mediated), PSA and ACB. MRSA (48%), VRE (14%) and multidrug-R SPN were also regional therapeutic challenges.

Sepsis por Vibrio vulnificus: reporte de dos casos en ciudades de altura en el Ecuador / Vibrio vulnificus sepsis: report of two cases in high altitude cities from Ecuador

La infección por Vibrio vulnifcus está generalmente relacionada con el contacto de heridas con agua de mar y el consumo de mariscos bivalvos. No se han publicado hasta la fecha casos causados por Vibrio vulnifcus en el Ecuador. Presentación de los casos Se describen dos casos de sepsis fatal. El primer caso fue un hombre de 69 años, residente en Ibarra (2220 m.s.n.m.), que tenía como enfermedad de base diabetes mellitus tipo 2, artritis reumatoide y hepatopatía. El segundo fue un hombre de 26 años, residente en Quito (2800 m.s.n.m.), con antecedente de anemia aplásica bajo tratamiento. Ambos pacientes ingresaron febriles y presentaron un deterioro rápidamente progresivo, sin respuesta al manejo de soporte y antibiótico-terapia en cuidados intensivos, falleciendo en menos de 48 horas posteriores a su ingreso. En los hemocultivos se identifcó la presencia de Vibrio vulnifcus. Conclusión El reporte de estos casos pone en alerta la presencia de esta bacteria como causa de sepsis en pacientes con factores de riesgo. El reconocimiento oportuno del cuadro clínico, el tratamiento de soporte, terapia antibiótica y un equipo multidisciplinario, son pilares fundamentales en el manejo de este tipo de infecciones.

Vibrio vulnifcus infection usually is related to the contact of wounds with seawater and bivalve shellfsh consumption. Non-cases has been published of this infection in Ecuador. Case Report Two cases of septic shock are described. The frst case was a man (69 years old) from Ibarra city (2220 m.s.l.) who had diabetes mellitus, rheumatoid arthritis and liver disease. The second case was a man (26 years old) resident in Quito city (2800 m.s.l.) with a history of treated aplastic anemia. Both patients were admitted febrile and showed a fast and progressive deterioration, without response to support management and antibiotic therapy in the intensive care unit. They died within 48 hours after admission. Blood cultures were positive for Vibrio vulnifcus. Conclusion The report of these cases must put on alert for the presence of this bacterium as a cause of sepsis in patients with risk factors. Early recognition of clinical data, the supportive management, antibiotic therapy and a multidisciplinary team are essentials for the outcome.

Epidemiology and surveillance of methicillin-resistant staphylococcus aureus in Latin America

Surveillance systems monitoring the spread and divergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains are critical if preventive and therapeutic measures targeting MRSA infection are to be employed optimally. Surveillance provides information on the spread of MRSA, on the emergence of new strains within hospitals and communities, on the antibiotic resistance profile and virulence of strains, and on the risk factors associated with infection. These data help clinicians to provide appropriate empiric treatment of infections circulating in their region, leading to improved patient outcomes. While information on MRSA epidemiology in Latin America is growing, significant gaps exist in the available data, especially in local areas where fewer resources are available for characterizing and reporting MRSA strains. Here, we describe current knowledge of healthcare- and community-associated MRSA epidemiology in the region, and provide recommendations for future development of surveillance systems with a view to providing robust data at regional, national and local levels.

Diagnosis and susceptibility testing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Latin America

Strategies to monitor and control the spread of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) infections are dependent on accurate and timely diagnosis of MRSA in both hospital and community settings. In Latin America, significant diversity in diagnostic and susceptibility testing procedures exists at the regional, national and local levels. Various tests for S. aureus and MRSA are available in clinical settings, but the application of these techniques differs between and within countries, and quality control measures are not uniformly applied to verify diagnoses. To optimize the diagnosis of MRSA infections across Latin America, a more consistent approach is required. This may include: adoption and appropriate adaption of specific guidelines for MRSA testing, depending on local resources; establishment of a coordinated system for quality control; regional access to central reference facilities; education of medical and healthcare professionals in best practices; and development of systems to evaluate the implementation of guidelines and best practices.

Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype are rarely observed in tuberculosis patients in South America

The frequency of the Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis as a cause of tuberculosis (TB) in South America was determined by analyzing genotypes of strains isolated from patients that had been diagnosed with the disease between 1997 and 2003 in seven countries of the subcontinent. In total, 19 of the 1,202 (1.6 percent) TB cases carried Beijing isolates, including 11 of the 185 patients from Peru (5.9 percent), five of the 512 patients from Argentina (1.0 percent), two of the 252 Brazilian cases (0.8 percent), one of the 166 patients from Paraguay (0.6 percent) and none of the samples obtained from Chile (35), Colombia (36) and Ecuador (16). Except for two patients that were East Asian immigrants, all cases with Beijing strains were native South Americans. No association was found between carrying a strain with the Beijing genotype and having drug or multi-drug resistant disease. Our data show that presently transmission of M. tuberculosis strains of the Beijing genotype is not frequent in Latin America. In addition, the lack of association of drug resistant TB and infection with M. tuberculosis of the Beijing genotype observed presently demands efforts to define better the contribution of the virulence and lack of response to treatment to the growing spread of Beijing strains observed in other parts of the world.

Genotipo Beijing de mycobacterium tuberculosis / Beijing genotype of mycobacterium tuberculosis

Desde su primera descripción en el este de Asia, en los a;os 90, el genotipo Beijing de Mycobacterium tuberculosis ha sido descrito en vastas áreas del mundo. Este linaje esta asociado con una alta resistencia a las drogas antituberculosas con una rápida capacidad de diseminación y producción de epidemias, con propiedades patogénicas propias, junto con una incrementada virulencia, con una capacidad de diseminarse a nuevas áreas geográficas, en particular se han descrito diseminaciones a partir inmigrantes, provenientes de zonas con altas tazas de tuberculosis a zonas consideradas con baja incidencia.

Since its first description in East Asia in the 1990s, the Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis has been described in vast areas of the world. This lineage is associated with a high resistance to anti-tuberculosis drugs with a rapid capacity for dissemination and the production of epidemics, with its own pathogenic properties, together with an increased virulence, with an ability to spread to new geographical areas, in particular disseminations have been described. from immigrants, coming from areas with high rates of tuberculosis to areas considered to have low incidence.

Infecciones por staphylococcus aureus oxacilino - resistentes de la comunidad en un Hospital de Quito / Staphylococcus aureus oxacillin infections - community resistant in a Quito hospital

El staphylococcus aureus es el patógeno aislado con mayor frecuencia tanto en las infecciones de la comunidad como las adquiridas en el hospital. Sin embargo el staphylococcus aureus resistente a la oxacilina (ORSA) es un patógeno nosocomial primario, considerado siempre dentro del ambiente hospitalario. Recientemente ha surgido a nivel comunitario, una variedad de S. aureus resistente a la oxicilina con patrones de sensibilidad muy distintos al clásico ORSA hospitalario. Este agente microbiano es un patógeno emergente y las infecciones que produce se comportan como tales, afectando principalmente a niños e individuos jóvenes. Están fundamentalmente asociados a la piel y tejidos blandos así como respiratorias severas. Durante el año 2004 se aislaron de diversas muestras clínicas cultivadas en el Hospital Vozandes, 343 Staphylococcus aureus provenientes de procesos infecciosos de 415 pacientes. de estos 257 pacientes fueron atendidos en los servicios de emergencia y consulta externa correspondiendo al 74,9% de los aislamientos. Un total de 31 aislamientos (9%) fueron cepas oxacilino-resistentes. La resistencia mayor se presentó en ciprofloxacino con el 12,9% (4 aislamientos), ninguna presentó resistencia a rifampicina.

Staphylococcus aureus is the most frequently isolated pathogen in both community-acquired and hospital-acquired infections. However, oxacillin-resistant staphylococcus aureus (ORSA) is a primary nosocomial pathogen, always considered within the hospital environment. Recently, a variety of oxycillin-resistant S. aureus has emerged at the community level with sensitivity patterns very different from the classic hospital ORSA. This microbial agent is an emerging pathogen and the infections it produces behave as such, mainly affecting children and young individuals. They are fundamentally associated with the skin and soft tissues as well as severe respiratory. During 2004, 343 Staphylococcus aureus from infectious processes of 415 patients were isolated from various clinical samples cultured at the Vozandes Hospital. of these 257 patients were attended in the emergency and outpatient services, corresponding to 74.9% of the isolates. A total of 31 isolates (9%) were oxacillin-resistant strains. The greatest resistance was presented in ciprofloxacin with 12.9% (4 isolates), none presented resistance to rifampicin.

Aislamiento de la bacteria CDC grupo Nº-1, un "Nuevo" Bacilo Gram negativo asociado con la mordedura de perro / Isolation of the CDC group Nº-1 bacteria, a "New" Gram negative Bacillus associated with dog bite

La bacteria CDC grupo NO-1 es una bacteria asociada a las mordeduras de perros y gatos en individuos sanos. De 1974 a 1998, 22 aislamientos han sido identificados en Estados Unidos por el laboratorio de referencia " Centros para el control y prevención de las enfermedades" conocidos como CDC. La bacteria tiene características similares a Acinectobacter, pero se diferencia por su morfología celular y su superficie de ácidos grasos. Reportamos el caso de un paciente de 16 años de edad que fue mordido por un perro en el miembro inferior izquierdo, desarrollo una celulitis y en el cultivo de la secreción purulenta se identifico la bacteria NO-1, mediante el sistema Remel, ERIC! ( Electronic RapID NF plus) para no fermentadores (RapID NF plus) con el código 000002. El paciente recibió un esquema terapéutico de ampicilina/sulbactam y evolucionó favorablemente. El reporte de este aislamiento es importante debido a que la incidencia de esta bacteria es prácticamente desconocida y está considerada como una zoonosis emergente. Referirla pondrá en alerta a los médicos y a los laboratorios que podrían no reconocerla y pasarla por alto.

The CDC group NO-1 bacterium is a bacterium associated with dog and cat bites in healthy individuals. From 1974 to 1998, 22 isolates have been identified in the United States by the reference laboratory "Centers for Disease Control and Prevention" known as CDC. The bacterium has characteristics similar to Acinectobacter, but it is differentiated by its cellular morphology and its fatty acid surface. We report the case of a 16-year-old patient who was bitten by a dog in the lower left limb, developed cellulite and the NO-1 bacteria was identified in the culture of the purulent secretion, using the Remel system, ERIC! (Electronic RapID NF plus) for non-fermenters (RapID NF plus) with the code 000002. The patient received an ampicillin / sulbactam treatment regimen and did well. The report of this isolation is important because the incidence of this bacterium is practically unknown and is considered an emerging zoonosis. Referring her will alert doctors and laboratories that may not recognize her and overlook her.

Pericarditis tuberculosa; Presentación de casos y revisión de la literatura / Tuberculous pericarditis; Case presentation and literature review

La infección por Mycobacterium tuberculosis, es un diagnóstico de exclusión que siempre debe estar presente en todos los casos de derrame pericárdico agudo y crónico, más aún en nuestro país donde la prevalencia de tuberculosis es cada vez más alta. El diagnóstico precoz y el inicio del tratamiento influyen directamente en la sobrevida del paciente y su mortalidad. Aquí presentamos 4 pacientes con diagnóstico de pericarditis tuberculosa quienes tuvieron diferente evolución y grados variables de derrame.

Mycobacterium tuberculosis infection is a diagnosis of exclusion that must always be present in all cases of acute and chronic pericardial effusion, even more so in our country where the prevalence of tuberculosis is increasingly high. Early diagnosis and initiation of treatment directly influence patient survival and mortality. Here we present 4 patients with a diagnosis of tuberculous pericarditis who had different evolution and variable degrees of effusion.

Tuberculosis mamaria un problema que continua: presentación de dos casos / mamaria Tuberculosis a continuous problem that: presentation of two cases

La tuberculosis es un problema de salud pública a nivel mundial. La localización extrapulmonar a nivel mamario es rara y sin manifestaciones sistémicas. Clínicamente es indistinguible de las neoplasias de la glándula, esto dificulta el diagnóstico y retarda el incio del tratamiento. Presentamos dos casos de tuberculosis mamaria, además se revisa la literatura sobre el tema e insistimos sobre el problema diagnóstico.

Shigella flexneri: una causa subestimada de vulvovaginitis en niñas con sangrado genital / Shigella flexneri: an underestimated cause of vulvovaginitis in children with bled genital

Con el objetivo de establecer los patógenos comunes asociados a vulvovaginitis en población infantil, sestudiaron 144 muestras de secreciones vaginales de niñas cuyas edades comprendían entre 1 a 5 años, que acudieron al Hospital Vozandes de Quito. De las 144 muestras procesadas 91 (63 por ciento) presentaron un microorganismo potencialmente patógeno, mientras que en las 53 restantes (37 por ciento) se aisló flora normal de la mucosa vaginal como staphylococcus coagulasa negativa, corynebacterium spp, streptococcus viridans, enterobacterias, enterococcus etc., considerándose que en este grupo la etiología de la vulvovaginitis era por una causa inespecífica, resultado de una higiene deficiente y malos hábitos de limpieza...

Histoplasmosis infección oportunista común en el Ecuador / Histoplasmosis opportunistic infection common in Ecuador

Debido a las referencias geográficas en la endemnicidad de infecciones, cada país necesita establecer su propio perfil de infecciones oportunistas en el manejo de SIDA. Histoplasmosis es una infección que suele confundirse con tuberculosis. En este artículo se presenta 6 pacientes HIV positivos con histoplasmosis diseminada. La mayoría de los pacientes presentaron pancitopenia, hepatitis infiltrada difusa reticulonodular. El método de diagnóstico más rápido y confiable era la biopsia de la médula ósea. Dentro de 6 meses 5 de los 6 pacientes murieron con histoplasmosis diseminada.

Patrones de resistencia secundaria de helicobacter pylori a metronidazol y claritromicina en Quito / Patterns of secondary resistance of helicobacter pylori to metronidazol and claritromicina in Quito

La infección por helicobacter pylori está implicada en el desarrollo de varias enfermedades gástricas y constituye un grave problema de salud pública. La resistencia a los antibacterianos por parte del helicobacter pylori se ha convertido en un nuevo desafío para su erradicación. El objetivo de este estudio fue identificar los patrones de resistencia secundaria a metronidazol, clritromicina y amoxicilina en cepas de H. pylori aisladas de pacientes (biopsia) que habían recibido tratamiento para este agente y en quienes persistía la sintomatología. Ciento ochenta biopsias de mucosa gástrica fueron obtenidas de sesenta pacientes (32 mujeres y 28 varones) provenientes de diferentes centros hospitalarios de Quito...

Infecciones causadas por streptococcus beta hemolítico grupo B (S agalactiar) en adultos

El Streptococcus beta hemolítico del grupo B, ha sido asociado con infecciones en neonatología y enfermedades relacionadas al parto, sin embargo su reporte como patógeno oportunista y nosocomial en infecciones graves en población adulta no embarazada ha experimentado un aumento en las últimas décadas. Describimos los aislamientos de esta bacteria de los pacientes adultos que fueron atendidos en el Hospital Vozandes. Se presentan 25 pacientes con distintos cuadros infecciosos: 1 con sepsis, 9 con infecciones de piel y tejidos blandos 14 con infección de vías urinarias y 1 de tracto respiratorio. Se encontró asociación con los siguientes factores: edad avanzada, diabetes, alcoholismo, cirrosis y neoplasias.

Tejido Adenoideo: un oculto reservorio bacteriano? / Adenoid Weave: hidden reservorio bacterial

Durante el periodo comprendido ente enero de 1995, a diciembre de 1996, se estudiaron 88 pacientes con hipertrofia adenoidea que fueron atendidos en los hospitales Baca Ortíz y Vozandes. Los pacientes tenían edades comprendidas entre 1 y 12 años, 44,31 por ciento pertenecían al sexo femenino y 55,58 por ciento al masculino. Los niños que presentaron sintomatología compatible con hipertrofia adenoidea y verificada la sospecha diagnóstica por RX, entraron al estudio. El tejido adenoideo fue enviado en suero fisiológico y procesado de acuerdo con normas estandar, identificación y antibiograma establecidas bajo normas microbiológicas. Dentro de los patógenos aislados, el stafilococus aureus, fue el más frecuente, segido por Haemaphilus influenzae. De acuerdo con la edad, los microorganismos varían así: en menores de 2 años el más frecuente Haemaphilus influenzae; entre 3 y 8 años el Stafilococus aureus...

Fiebre tifoidea en niños: valor diagnóstico del cultivo de médula ósea frente al hemocultivo / Tifoidea fever in children: value diagnosis of the culture of bony marrow forehead to the hemocultivo

Anualmente se registran mundialmente alrededor 12,5 millones de casos de fiebre tifoidea con una tasa de mortalidad de 15 al 30xcto. En el Ecuador la enfermedad es endémica con una incidencia de 40-50 casos por cada 100.000 habitantes. Estas tasas pueden reducirse a niveles muy bajos con un diagnóstico y terapia adecuados. En nuestro medio se continúan utilizando los métodos diagnósticos tradicionales como el cultivo en sangre, heces, orina y reacciones febriles de aglutinación. Ultimamente han aparecido nuevos métodos como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y el cultivo de médula ósea. Sin embargo, de que éste último es considerado el método más sensible para aislamiento de Samonella typhi, éste no es comúnmente utilizado. El presente estudio compara el valor del cultivo del aspirado medular frente a tres hemocultivos, en población infantil y valora si éste método invasivo puede remplazar a los otros empleados frecuentemente.

Micosis superficiales en un hospital pediátrico de Quito

Se estudiaron 108 pacientes con lesiones en piel, cuero cabelludo y uñas para investigación de hongos, mediante KOH y/o cultivo. 47 pacientes (43 por ciento) presentaron KOH (+), de estos 43 fueron cultivados 35(81 por ciento) presentaron cultivo positivo para hongos. El KOH fue (-) en 62 (57 por ciento) realizándose cultivo en 34(97 por ciento) y apenas 1 fue positivo para hongos. Las muestras fueron sembradas en Mycocel y posteriormente en Sabouraud para su identificación. el dermatofito más aislado fue tricofiton mentagrafites 19 (54 por ciento). En relación a la distribución de las lesiones el cuero cabelludo fue el mas afectado 37 (40.6 por ciento). Las micosis en piel y anexos en los ninños de este estudio es frecuente (43 por ciento), siendo la zona, más afectada el cuero cabelludo . Hay correlación con el KOH y el cultivo. El dermatofito aislado con mayor frecuencia es el tricifiton mentagofites.