RESUMO
Colletotrichum, a genus of Ascomycota fungi with a diversity of species grouped into several species complexes, or clades, is associated with diseases known as "Anthracnose". It affects significantly different tropical and subtropical fruit species. Infections occur in the field and postharvest; quiescent stages are mainly responsible for postharvest losses. An analysis of this pre-infective stage is made based on consulted papers. The infective process is modulated by the length of the quiescent period of the fungus during the vegetative or pre-productive stages of trees. Quiescent stage is determined by the host's biochemical responses and the pathogen's activity. Once the pathogen is activated, it develops an infectious necrotrophic process. Colletotrichum quiescence has been studied mainly in subtropical fruits and horticultural species, and the studies highlight the role of volatile compounds, metabolites and enzymes involved in the length and breaking of quiescence, as well as the differential responses according to the phenological stage and the genotype of the plant. Transcriptomic and proteomic analysis of the host-fungus interaction have revealed the role of genes in the occurrence and breaking of quiescence. Knowledge about the quiescence of Colletotrichum in tropical fruits is necessary to improve management efficiency. Detection and induction of quiescent infections has been studied and genomics has allowed to understand the occurrence of quiescence in the infective process; however, in crops in the tropics, such as mango, an important crop in Colombia, questions about associated species and biology of their quiescence are still unanswered.
Colletotrichum es un hongo ascomicete, con diversidad de especies agrupadas en complejos o clados y se asocia a enfermedades conocidas, como "Antracnosis" y afecta significativamente especies de frutas tropicales y subtropicales. Las infecciones ocurren en el campo y postcosecha; los estados quiescentes son los principales responsables de pérdidas en postcosecha. Se realizó un análisis de esta etapa pre-infectiva, a partir de publicaciones consultadas. La infección está modulada por la duración del período de quiescencia del hongo durante las etapas vegetativa o pre-productivas de los árboles y está determinado por las respuestas bioquímicas del hospedante y la actividad del patógeno. Una vez se activa el patógeno, se desarrolla un proceso infeccioso necrotrófico. La quiescencia de Colletotrichum se ha estudiado, principalmente, en frutas subtropicales y especies hortícolas y destacan el papel de compuestos volátiles, metabolitos y enzimas en la duración y en la pérdida de la quiescencia, así como las respuestas diferenciales, según la fenología y el genotipo. Análisis transcriptómicos y proteómicos de la interacción hospedante-hongo han revelado el papel de genes en la ocurrencia y pérdida de quiescencia. Conocer la quiescencia de Colletotrichum en frutas tropicales es necesario para hacer más eficiente el manejo de la enfermedad. Se ha estudiado la detección e inducción de infecciones quiescentes y estudios genómicos han permitido entender su ocurrencia durante la infección; sin embargo, en cultivos en el trópico, como el mango, un cultivo importante en Colombia, las preguntas sobre las especies asociadas y la biología de la quiescencia de estas, aún están sin respuesta.
RESUMO
Abstract The species Spondias mombin, is native to the Amazonian region. Since these trees' cultivation is incipient, their exploitation is done through extraction techniques. The aim of the present study was to assess the genetic divergences between S. mombin genotypesand to quantify the relative contribution from 12 morphological traits of the species' fruits and seeds, as well as to collect data able to subsidize future research on the species conservation and domestication. 60 genotypes were assessed in total, and ten fruits of each genotype were analyzed. Eight descriptors were used for fruit characterization, namely: fruit mass, pulp weight, volume, length, width, thickness, total soluble solids content and hydrogenionic potential. The seed descriptors were mass, length, width and thickness. The data were assessed through the principal components and groupings by applying the UPGMA and Tocher methods. They were analyzed in the GENES software, based on the dissimilarity matrix (Euclidean distance average). The analysis applied to the principal components showed that the first three components explained 83 % accumulated variation. The main traits contributing to the genotype discrimination were fruit width, fruit pulp weight, pH, seed length and thickness, and the most responsive traits to S. mombin genotype selection. The features fruit mass, seed width, fruit thickness, fruit volume, fruit length, seed mass and total soluble solid content presented the smallest contribution to diversity. The grouping methods UPGMA and Tocher evidenced genetic divergence between the analyzed genotypes. Genotypes 37 and 41 were more divergent than the others, what makes them promising for crossings in future genetic enhancement programs focused on the species' domestication.
Resumen Spondias mombin es un árbol nativo de la región amazónica; su explotación se produce de manera extractiva, siendo aún incipiente el cultivo de la especie. El objetivo de este estudio fue evaluar la divergencia genética entre genotipos de S. mombin y cuantificar la contribución relativa de 12 características morfológicas de frutos y semillas, para obtener datos que permitan investigaciones futuras relativas a la conservación y domesticación de la especie. Se evaluaron 60 genotipos; de cada uno se analizaron diez frutos. Los descriptores utilizados para la caracterización de los frutos fueron ocho: masa del fruto, peso de la pulpa, volumen, longitud, anchura, espesor, contenido total de sólidos solubles y pH; los descriptores de semillas fueron cuatro: masa, longitud, anchura y espesor. Los datos se evaluaron por medio de componentes principales y agrupaciones obtenidas por métodos UPGMA y Tocher, de la matriz de disimilitud (distancia euclideana media) con ayuda del programa GENES. A través del análisis de los componentes principales, se verificó que los tres primeros componentes explican 83.63 % de la variación acumulada. Las características que más contribuyen a la discriminación de los genotipos fueron: anchura del fruto, peso de la pulpa, pH, longitud y espesor de semillas, y son las más significativas para la selección de genotipos de S. mombin. Las contribuciones más pequeñas a la diversidad se deben a: la masa del fruto, anchura de semilla, espesor, volumen y longitud del fruto, así como a la masa de las semillas y el contenido de sólidos solubles totales. Ambos métodos de agrupación, UPGMA y Tocher, revelaron que existe divergencia genética entre los genotipos analizados. Los genotipos 37 y 41 son los más divergentes respecto a los otros; por eso son ideales para programas de mejoramiento genético con miras a la domesticación de la especie.