Programa de atención de vacunación contra el COVID-19 al personal del hospital de Huaycán / COVID-19 vaccination program for Huaycán hospital personnel / Programa de vacinação contra a COVID-19 para a equipe do hospital de Huaycán

A la fecha las vacunas para prevenir el COVID-19, representan la mejor esperanza para combatir el virus, además que éstas constituyeron un reto en la cadena de participación de reparto y distribución para las autoridades estatales en Perú, con respecto a priorizar dentro de la ciudadanía la adecuada administración por parte de quienes participaron en el proceso de vacunación. Objetivo. Analizar la gestión de la distribución y aplicación de la vacuna contra el COVID-19 en el Hospital de Huaycán. Materiales y Métodos. Se diseñó un estudio no experimental, de nivel aplicativo de enfoque cuantitativo, tipo de análisis descriptivo de corte transversal. La población estuvo conformada por 700 profesionales que laboran en dicho hospital. Las técnicas que fueron utilizadas fue la entrevista y la encuesta usando como instrumento un formulario de tipo cuestionario. Resultados. En cuanto a las medidas de prevención del virus en el personal de salud se realizaban pruebas diagnósticas a los trabajadores (pruebas rápidas y PCR) para identificar los casos sospechosos a un total de 2590 trabajadores, de los cuales 2372 se les realizó pruebas rápidas y 218 hisopados. En cuanto al nivel de ejecución de la vacunación se pudo determinar que totalidad de los trabajadores del Hospital de Huaycán, no alcanzaron a estar vacunados en el tiempo de aplicación de vacuna. Conclusiones. La gestión de la distribución y aplicación de la vacuna contra el COVID-19 en el Hospital de Huaycán revela una serie de aspectos tanto positivos como preocupantes. Si bien se observan indicadores de gestión adecuados en la administración de la vacuna, es evidente que la cobertura no ha alcanzado el 100%, lo cual implica retos en términos de alcance y eficacia de la inmunización en la población hospitalaria.

To date, vaccines to prevent COVID-19 represent the best hope for combating the virus, and they represent a challenge in the chain of distribution and distribution participation for state authorities in Peru, with respect to prioritizing the adequate administration by those who participated in the vaccination process among the citizens. Objective. To analyze the management of the distribution and application of the vaccine against COVID-19 in the Huaycán Hospital. Materials and Methods. A non-experimental study was designed, with a quantitative approach, descriptive cross-sectional analysis. The population consisted of 700 professionals working in the hospital. The techniques used were the interview and the survey using a questionnaire-type form as an instrument. Results. Regarding virus prevention measures in health personnel, diagnostic tests were performed on workers (rapid tests and PCR) to identify suspected cases in a total of 2,590 workers, of whom 2,372 underwent rapid tests and 218 swabs. As for the level of implementation of vaccination, it was determined that all the workers of the Hospital de Huaycán were not vaccinated at the time of vaccine application. Conclusions. The management of the distribution and application of the vaccine against COVID-19 in the Huaycán Hospital reveals a series of both positive and worrying aspects. Although adequate management indicators are observed in the administration of the vaccine, it is evident that coverage has not reached 100%, which implies challenges in terms of scope and efficacy of immunization in the hospital population.

Até o momento, as vacinas para prevenir a COVID-19 representam a melhor esperança para o combate ao vírus e têm representado um desafio na cadeia de participação na distribuição e distribuição para as autoridades estatais no Peru, com relação à priorização da administração adequada por parte dos envolvidos no processo de vacinação entre os cidadãos. Objetivo. Analisar a gestão da distribuição e aplicação da vacina contra a COVID-19 no Hospital Huaycán. Materiais e métodos. Foi projetado um estudo não experimental, com uma análise quantitativa, descritiva, transversal e transversal. A população foi composta por 700 profissionais que trabalham no hospital. As técnicas utilizadas foram entrevistas e pesquisas usando um formulário do tipo questionário como instrumento. Resultados. Em termos de medidas de prevenção do vírus entre o pessoal de saúde, foram realizados testes diagnósticos nos trabalhadores (testes rápidos e PCR) para identificar casos suspeitos em um total de 2.590 trabalhadores, dos quais 2.372 foram submetidos a testes rápidos e 218 a swabs. Em termos do nível de implementação da vacinação, foi determinado que todos os trabalhadores do Hospital Huaycán não foram vacinados dentro do período de vacinação. Conclusões. O gerenciamento da distribuição e aplicação da vacina contra a COVID-19 no Hospital Huaycán revela uma série de aspectos positivos e preocupantes. Embora sejam observados indicadores de gestão adequados na administração da vacina, é evidente que a cobertura não atingiu 100%, o que implica desafios em termos de alcance e eficácia da imunização na população do hospital.

Factors associated with carrying out molecular tests for the diagnosis of COVID-19 in the State of Espírito Santo, Brazil / Fatores associados à realização de testes moleculares para o diagnóstico da COVID-19 no Estado do Espírito Santo, Brasil

Backgroung: Brazil was slow to implement an expanded testing policy for COVID-19, which may have affected the most vulnerable population's access to testing services.Objective: to evaluate the factors associated with performing the molecular test for COVID-19.Methods: cross-sectional study of secondary data from the COVID-19 panel in the state of Espírito Santo. COVID-19 suspicion notification forms were included between September 11, 2020 and March 2, 2021. Hierarchical logistic regression was used to estimate the odds ratio (OR) with 95% confidence interval (CI95%).Results: 419,771 notification forms were analyzed. The prevalence of performing the molecular teste for COVID-19 was 81.1% (CI95% 81.0-81.2). Elderly (OR= 2.70 ­ CI95% 2.56-2.85), health professional (OR=1 .43 ­ CI95% 1.36-1.50), chronic cardiovascular disease (OR=1.13 ­ CI95% 1.09-1.17), diabetes mellitus (OR=1.07 ­ CI95% 1.01- 1.14) and hospitalization (OR=5.95 ­ CI95% 4.53;7.82) were more likely to have undergone the molecular test. Male sex (OR=0.96 ­ CI95% 0.94-0.98), black skin color (OR=0.75 ­ CI95% 0.73-0.78), yellow skin color (OR=0.74 ­ CI95% 0.71-0.77), residing in the northern health region (OR=0.37 ­ CI95% 0.36-0.39) and the homeless population (OR=0.76 ­ CI95% 0.67-0.85) had the lowest chance of having undergone the molecular test.Conclusion: Social, economic, contextual factors and the risk of aggravation of the disease were associated with carrying out the molecular test for COVID-19 in the state of Espírito Santo. Actions are needed to guarantee the access of the most vulnerable population to molecular testing.

Introdução: o Brasil demorou a implementar uma política de testagem ampliada para COVID-19 no qual pode ter afetado o acesso da população mais vulnerável aos serviços de testagem.Objetivo: analisar os fatores associados à realização de testes moleculares para o diagnóstico da COVID-19.Método: estudo transversal de dados secundários do painel COVID-19 do estado do Espírito Santo. Foram incluídas fichas de notificação de suspeita de COVID-19 entre 11 de setembro de 2020 a 02 de março de 2021. Empregou-se regressão logística hierárquica para estimativa de razão de chances (odds ratio, OR) com intervalo de confiança de 95% (IC95%).Resultados: Foram incluídos no estudo 419.771 fichas de notificação. A prevalência da realização do teste molecular para COVID-19 foi 81,1 % (IC95% 81,0%;81,2%). Idosos (OR= 2,70 ­ IC95% 2,56-2,85), profissional da saúde (OR=1,43 ­ IC95% 1,36-1,50), doença cardiovascular crônica (OR=1,13 ­ IC95% 1,09-1,17), diabetes mellitus (OR=1,07 ­ IC95% 1,01-1,14) e hospitalização (OR=5,95 ­ IC95% 4,53;7,82) apresentaram maior chance de ter realizado o teste molecular. Sexo masculino (OR=0,96 ­ IC95% 0,94-0,98), cor da pele preta (OR= 0,75 ­ IC95% 0,73-0,78), cor da pele amarela (OR=0,74 ­ IC95% 0,71-0,77), residir na região norte de saúde (OR=0,37 ­ IC95% 0,36-0,39) e a população em situação de rua (OR=0,76 ­ IC95% 0,67-0,85) apresentaram a menor chance de ter realizado o teste molecular.Conclusão: Fatores sociais, econômicos e o risco de agravamento da doença foram associados a realização do teste molecular para COVID-19 no estado do Espírito Santo. É necessário ações que garantam o acesso da população mais vulnerável ao teste molecular.

Overview of SARS-COV-2 infection at the Butantan Penitentiary Progression Center / Panorama da infecção pelo SARS-COV-2 no Centro de Progressão Penitenciária do Butantan

ABSTRACT OBJECTIVE To estimate the prevalence of exposure to the SARS-CoV-2 virus among individuals living in restricted freedom. METHODS A seroprevalence survey was carried out with the population of the female penitentiary of the Centro de Progressão Penitenciária (CPP) in Butantan (municipality of São Paulo), between June 24 and August 20, 2020. During this period, according to the Secretariat of Penitentiary Administration (SAP), the positivity of rapid tests among inmates ranged from 65% to 78%. The evaluation method used in the study was the "One Step COVID-19" rapid test (chromatography), from the company Wondfo, also using the RT-PCR method in symptomatic participants to confirm the viral condition. The study population consisted of 879 female inmates and 170 employees of the institution. RESULTS The prevalence of total antibodies (IgG/IgM) against the SARS-CoV-2 virus in the total population of 1049 study participants was 6.1%; among the population of 879 inmates,a prevalence of 5.8% was observed, and among the institution's employees, 7.5%. CONCLUSIONS The prevalence of covid-19 at the Butantan CPP was low, which is due to the implementation of simple prevention measures at the institution, such as the use of masks (with appropriate changes), emphasis on hygiene, hand washing and social distancing, in addition to other strategies, such as suspending inmates' visits from relatives and friends and cutting back on elective medical appointments and outside work.

RESUMO OBJETIVO Estimar a prevalência da exposição ao vírus SARS-CoV-2 entre indivíduos vivendo em restrição de liberdade. MÉTODOS Foi realizado inquérito de soroprevalência com a população da penitenciária feminina do Centro de Progressão Penitenciária (CPP) do Butantan (município de São Paulo), entre 24 de junho e 20 de agosto de 2020. Nesse período, segundo a Secretaria de Administração Penitenciária (SAP), a positividade dos testes rápidos entre detentos variou de 65 a 78%. O método de avaliação utilizado no estudo foi o teste rápido "One Step COVID-19" (cromatografia), da empresa Wondfo, empregando-se também o método RT-PCR em participantes sintomáticos para confirmação do quadro viral. A população do estudo foi constituída por 879 reeducandas e 170 funcionários da instituição. RESULTADOS A prevalência de anticorpos totais (IgG/IgM) contra o vírus SARS-CoV-2 na população total de 1.049 participantes do estudo foi de 6,1%; entre a população de 879 reeducandas foi observada prevalência de 5,8% e entre os servidores da instituição, 7,5%. CONCLUSÃO Houve baixa prevalência de covid-19 no CPP do Butantan, o que se deve à implementação de medidas de prevenção simples na instituição, como o uso de máscaras (com trocas adequadas), ênfase na higiene, lavagem das mãos e distanciamento social, além de outras estratégias, como suspensão de visitas de familiares e amigos das reeducandas, cortes de consultas médicas eletivas e do trabalho externo.

Prevalência de covid-19 e fatores associados entre servidores públicos / Prevalencia de covid-19 y factores asociados entre servidores públicos / Prevalence of covid-19 and associated factors among public workers

Objetivo: identificar a prevalência da Covid-19 e fatores associados entre servidores públicos do município de João Pessoa, Paraíba. Método: estudo transversal, analítico, realizado com 373 servidores de João Pessoa, Paraíba. Utilizou-se informações do portal de Vigilância em Saúde do estado sobre a evolução da Covid-19. A população do estudo foram os servidores públicos que realizaram o teste RT-PCR para a Covid-19 entre abril e junho de 2021. Realizou-se estatística descritiva e inferencial. Resultados: prevalência de Covid-19 foi de 19,8%; sexo feminino tem chances reduzidas para apresentar diagnóstico positivo da doença; anosmia esteve associada com o diagnóstico da referida infecção. Conclusão: disponibilidade de equipamentos de proteção individual, medidas para higienização das mãos, estímulo a vacinação e reorganização do espaço são algumas das estratégias para a garantia da segurança dos trabalhadores no ambiente de trabalho.

Objetivo: to identify the prevalence of Covid-19 and associated factors among public workers in the city of João Pessoa, Paraíba. Método: cross-sectional, analytical study, conducted with 373 workers in João Pessoa, Paraíba. Information from the state's Health Surveillance portal on the evolution of Covid-19 was used. The study population were public workers who performed the RT-PCR test for Covid-19 between April and June 2021. Descriptive and inferential statistics were performed. Resultados: prevalence of Covid-19 was 19.8%; female gender has reduced chances to present a positive diagnosis of the disease; anosmia was associated with the diagnosis of the referred infection. Conclusión: availability of personal protective equipment, measures for hand hygiene, stimulation of vaccination and reorganization of space are some of the strategies for ensuring the safety of workers in the work environment.

Objective: identificar la prevalencia de la Covid-19 y factores asociados entre servidores públicos del municipio de João Pessoa, Paraíba. Method: estudio transversal, analítico, realizado con 373 servidores de João Pessoa, Paraíba. Se utilizó información del portal de Vigilancia en Salud del estado sobre la evolución de Covid-19. La población del estudio fueron los funcionarios públicos que realizaron la prueba RT-PCR para Covid-19 entre abril y junio de 2021. Se realizó estadística descriptiva e inferencial. Results: prevalencia de Covid-19 fue de 19,8%; sexo femenino tiene probabilidades reducidas para presentar diagnóstico positivo de la enfermedad; anosmia estuvo asociada con el diagnóstico de dicha infección. Conclusion: disponibilidad de equipos de protección individual, medidas para higienización de las manos, estímulo a la vacunación y reorganización del espacio son algunas de las estrategias para la garantía de la seguridad de los trabajadores en el ambiente de trabajo.

Monitoreo serológico y psicológico en personal de salud durante el comienzo de la pandemia COVID-19 / Serological and psychological monitoring of healthcare workers during the start of the COVID-19 pandemic

Introducción: el personal de salud (PdS) es esencial en la lucha contra el COVID-19. Al inicio de la pandemia, el riesgo de adquirir la enfermedad en este grupo era desconocido. Buscamos estimar incidencia y prevalencia de anticuerpos anti-SARS-CoV-2, y prevalencia de burnout en una cohorte de PdS durante la pandemia COVID-19, así como valorar la prevalencia de burnout y depresión en la cohorte. Materiales y métodos: cohorte prospectiva conformada por médicos que atendían pacientes COVID-19 desde marzo de 2020 hasta enero de 2021, en un hospital de alta complejidad de la ciudad de Buenos Aires. Se evaluó IgM e IgG anti-SARS-CoV-2 quincenalmente durante 3 meses, así como la presencia de síntomas compatibles y factores asociados a la exposición. Se remitió a participantes con alteraciones de la esfera psíquica a contacto con el equipo de salud mental del hospital. Resultados: se incluyeron 52 participantes; de ellos, 31 eran mujeres; mediana de edad 32 años (rango 25-58). La mediana de horas semanales de trabajo autoinformadas fue 48 (IIC [intervalo intercuartil] 40-69,5). Inicialmente todos fueron PCR SARS-CoV-2 negativos en hisopado nasal; 11 (21,50% IC 95%; 9,62-32,53%) tuvieron COVID-19 sintomático con anticuerpos positivos. Los factores con mayor asociación a riesgo de COVID-19 fueron anosmia/disgeusia OR 403,33 (IC 95%; 47,60-3417,02), fiebre OR 172,53 (IC 95%; 28,82-1032,65), mialgias OR 41,97 (IC 95%; 8,08-217,84), conviviente con COVID-19 OR 28,17 (IC 95%; 5,67-179,97). Cerca del 40% presentaba alteraciones en las escalas de medición de burnout o depresión. Discusión: la incidencia hallada coincide con las cifras informadas acerca de personal de salud en la etapa inicial de la pandemia en la Argentina. Otro aspecto similar fue una mayoría de infecciones de curso leve, sin ningún paciente hospitalizado. No obstante, se halló una elevada incidencia de alteraciones de la esfera psíquica, tanto al comienzo como al final del seguimiento. Conclusiones: la incidencia de positivización de anticuerpos anti-SARS-CoV-2 fue cercana al 20%. No evidenciamos infecciones presintomáticas o asintomáticas. En cambio, la prevalencia de burnout y depresión fue elevada. La salud mental es un componente del personal de salud que debe ser priorizado en situaciones futuras de impacto similar. (AU)

Introduction: healthcare personnel are essential in the response against COVID-19. At the beginning of the pandemic the risk of acquiring the disease in this group was unknown. We sought to estimate incidence and prevalence of anti SARS-CoV-2 antibodies, as well as burnout prevalence in a cohort of healthcare staff during the pandemic, as well as assessing the prevalence of burnout and depression in this group. Materials and methods: prospective cohort formed by physicians tending to COVID-19 patients from march 2020 to january 2021 in a high-complexity hospital in the city of Buenos Aires. We evaluated anti SARS-CoV-2 IgM and IgG each 15 days for 3 months as well as the presence of compatible symptoms and factors associated to exposition to the virus. Patients showing signs of burnout and/or depression were referred to proper care by the mental health team in the hospital. Results: we included 52 patients, 31 women, median age was 32 years (range 25 - 58). Median amount of self-reported hours worked each week was 48 (IQR 40 - 69.5). Initially all participants had a negative COVID-19 PCR nasopharyngeal swab; 11 (21.50% CI95% 9.62 - 32.53%) had symptomatic COVID-19 with positive antibodies. Factors showing stronger association with testing positive were anosmia/dysgeusia OR 403.33 (CI95% 47.60-3417.02), fever OR 172.53 (CI95% 28.82 - 1032.65), myalgia OR 41.97 (CI95% 8.08 - 217.84), cohabitation with confirmed COVID-19 case OR 28.17 (CI95% 5.67 - 179.97). Near 40% showed alterations in burnout or depression scales. Discussion: the incidence rate we found was like reported values in the initial stages of the pandemic in Argentina. Another similarity was that all cases were mild; no hospitalization was required for any participant. We found an elevated incidence of alterations in the psychic sphere, both at the beginning and end of the follow up period. Conclusions:the incidence of positive SARS-CoV-2 antibodies was around 20%. No pre or asymptomatic cases were identified. Burnout and depression incidence was high. Mental health is a component that should never be overlooked in similar situations to come. (AU)

Factores asociados a la positividad de la PCR para SARS-CoV-2 en menores de 15 años / Related PCR positivity factors for SARS-CoV-2 in children under 15 years of age / Fatores associados à positividade da PCR para SARS-CoV-2 em crianças menores de 15 anos de idade

Introducción: la infección por SARS-CoV-2 en niños representa un porcentaje menor en la incidencia global de pacientes infectados por este virus. La prueba de reacción en cadena de polimerasa (PCR) para SARS-CoV-2 en muestra de secreciones nasofaríngeas es considerada como estándar de referencia, con niveles de sensibilidad y especificidad superiores a otras técnicas. Objetivo: describir las características de los pacientes menores de 15 años a los que se realizó PCR para SARS-CoV-2 en un prestador privado de salud del interior del país entre el 1° julio 2020 y el 30 de abril 2021. Analizar posibles factores asociados a la positividad de la prueba. Describir las características de los casos con PCR positiva Metodología: estudio observacional prospectivo con un análisis retrospectivo de tipo caso-control, a partir del seguimiento de una cohorte de menores de 15 años a los que se les realizó una prueba de PCR para SARS-CoV-2 en el período analizado, en un prestador integral de salud privado del interior del país. Se recabaron datos durante el seguimiento de los pacientes de acuerdo a un protocolo institucional que incluye: datos patronímicos, causa de la solicitud de la PCR, características del contacto, resultado de PCR y umbral de ciclo (CT), manifestaciones clínicas y evolución. Resultados: se solicitaron 2.361 PCR a menores de 15 años (15% del total de las PCR de la institución). Promedio de edad: 8,6 años (rango 7 días-14 años y 11 meses); 49% niñas y 51% varones. Motivo de solicitud de la prueba: 78,4% para estudio de contacto, 14,3% por síntomas sin noción de contacto y 7,3% previo a ingreso hospitalario (de urgencia o coordinación). Porcentaje de positividad de todo el período: 14,7%, con una importante variabilidad mensual (5,6% en diciembre y 27% en abril). La PCR fue positiva en 346 casos, con CT promedio de 27, y rango entre 16,8 y 37,3. No se encontraron diferencias estadísticas en relación a la edad y sexo entre casos positivos y negativos. Solo un caso fue PCR positivo previo al ingreso hospitalario (OR 0,03; IC 95% 0,004-0,22) y 20 de las 611 PCR solicitadas por contacto institucional (escolar, deportivo, etc.), siendo la diferencia estadísticamente significativa cuando el caso era mayor de 15 años (p 0,029). Del estudio retrospectivo de casos (PCR positiva) y controles (PCR negativa) surge una asociación estadísticamente significativa (p<0,000001) con la causa de solicitud por contacto en comparación con otra causa (OR 5,2; IC 95% 3,28-8,26), que el caso índice sea mayor de 15 años (OR 4,57 IC 95% 2,95 - 7,10) y que sea conviviente (OR 5,28 IC 95% 3,97 - 7,04). No hubo hospitalizaciones ni fallecimientos por COVID en la población analizada. Conclusiones: el testeo de niños y adolescentes en busca de COVID 19 continúa siendo una estrategia válida cuando existen síntomas sugestivos o contacto con un caso confirmado. En este estudio, los niños con antecedente de contacto con conviviente positivo, y mayor de 15 años, mostraron una mayor proporción de resultados positivos de PCR para SARS-CoV-2.

Introduction: the SARS-CoV-2 infection has shown a lower percentage in children compared to the global incidence of patients infected by this virus. The Polymerase Chain Reaction (PCR) test for SARS-CoV-2 in a sample of nasopharyngeal secretions is considered the reference standard test, and it has shown higher sensitivity and specificity levels than other techniques. Objective: describe the characteristics of patients under 15 years of age who underwent PCR for SARS-CoV-2 in a private health provider in the interior of the country between July 1, 2020 and April 30, 2021. Analyze possible factors linked to test positivity. Describe the characteristics of cases with positive PCR Methodology: prospective observational study with a retrospective case-control analysis based on the follow-up of a cohort of children under 15 years of age who underwent a PCR test for SARS-CoV-2 in the period analyzed, at a private health provider in the interior of Uruguay. Data were collected during patients' follow-up according to the institutional protocol that includes: personal data, reason for requesting the PCR, contact data, PCR result and cycle threshold (CT), clinical manifestations and evolution. Results: 2,361 PCRs were performed to children of under 15 years of age (15% of all PCRs in the institution). Average age 8.6 years (range 7 days - 14 years and 11 months); 49% girls and 51% boys. Reason for requesting the test: 78.4% due to previous contact, 14.3% due to symptoms without knowledge of contact and 7.3% prior to hospital admission (emergency or scheduled). Positivity percentage for the entire period 14.7% with significant monthly variability (5.6% in December and 27% in April). The PCR was positive in 346 cases, with a mean CT of 27, and a range between 16.8 and 37.3. No statistical differences were found regarding age and sex between positive and negative cases. Only 1 case was positive PCR prior to hospital admission (OR 0.03 95% CI 0.004 - 0.22) and 20 out of the 611 PCR were requested due to prior institutional contact (school, sports centers, etc.), the difference being statistically significant when the patient was older than 15 years (p 0.029). From the retrospective study of cases (PCR positive) and controls (PCR negative), a statistically significant link (p<0.000001) arose regarding: when the request resulted from a prior contact compared to other causes (OR 5.2 CI 95% 3.28-8.26), when the index case was older than 15 years of age (OR 4.57 95% CI 2.95-7.10) and when the patient and the contact had cohabited (OR 5.28 95% CI 3.97-7.04). There were no hospitalizations or deaths from COVID in the population analyzed. Conclusions: testing children and adolescents for COVID 19 continues to be a valid strategy in case of suggestive symptoms or contact with a confirmed positive case. In this study, children with a history of contact with a positive case, and older than 15 years, showed a higher proportion of positive PCR results for SARS-CoV-2.

Introdução: a infecção por SARS-CoV-2 em crianças representa um percentual menor do que na incidência global de pacientes infectados por esse vírus. O teste de reação em cadeia da polimerase (PCR) para SARS-CoV-2 em uma amostra de secreções nasofaríngeas é considerado o padrão de referência, com níveis de sensibilidade e especificidade mais elevados do que outras técnicas. Objetivo: descrever as características dos pacientes menores de 15 anos de idade que realizaram PCR para SARS-CoV-2 em uma prestadora de saúde privada do interior do país entre 1º de julho de 2020 e 30 de abril de 2021. Analisar possíveis fatores associados à positividade do teste. Descrever as características dos casos com PCR positivo. Metodologia: estudo observacional prospectivo com análise retrospectiva caso-controle a partir do acompanhamento de uma coorte de crianças menores de 15 anos que realizaram teste de PCR para SARS-CoV 2 no período analisado, em uma assistência médica de saúde no interior do país. Os dados foram coletados durante o acompanhamento dos pacientes de acordo com o protocolo institucional e incluíram: informação pessoal, motivo da solicitação do PCR, características do contato, resultado do PCR e limiar de ciclo (CT), manifestações clínicas e evolução. Resultados: foram solicitados 2.361 PCRs de menores de 15 anos (15% do total de PCRs da instituição). Idade média 8,6 anos (variação 7 dias - 14 anos e 11 meses); 49% meninas e 51% meninos. Motivo do pedido do exame: 78,4% por estudo de contato, 14,3% por sintomas sem conhecimento de contato e 7,3% antes da internação (por emergência ou coordenação). Porcentagem de positividade para todo o período 14,7% com significativa variabilidade mensal (5,6% em dezembro e 27% em abril). O PCR foi positivo em 346 casos, com média de TC de 27 e variação entre 16,8 e 37,3. Não foram encontradas diferenças estatísticas em relação à idade e sexo entre os casos positivos e negativos. Apenas 1 caso foi PCR positivo antes da admissão hospitalar (OR 0,03 IC 95% 0,004 - 0,22) e 20 dos 611 PCR solicitados por contato institucional (escola, centros de esportes, etc.), sendo a diferença estatisticamente significativa para os casos que tinham mais de 15 anos de idade (p 0,029). Do estudo retrospectivo de casos (PCR positivo) e controles (PCR negativo), emergiu uma associação estatisticamente significativa (p <0,000001) quando: a causa da solicitação do teste tinha sido um contato positivo prévio em relação a outra causa (OR 5,2 IC 95% 3,28 - 8,26), e quando o caso índice era mais velho do que 15 anos (OR 4,57 IC 95% 2,95 - 7,10) ou coabitava com o paciente (OR 5,28 IC 95% 3,97 - 7,04). Não houve internações ou óbitos por COVID na população analisada. Conclusões: a testagem de crianças e adolescentes em busca de COVID-19 continua sendo uma estratégia válida quando há sintomas sugestivos ou contato com um caso positivo confirmado. Neste estudo, crianças com histórico de contato com casos positivos na mesma casa e mais velhos do que 15 anos de idade apresentaram maior proporção de resultados positivos de PCR para SARS-CoV-2.

Resultados de una estrategia de vigilancia con prueba de antígeno de SARS-CoV-2 / Results of a surveillance strategy with SARS-CoV-2 antigen testing

Resumen El objetivo fue describir los resultados de la implementación de una estrategia de vigilancia con el uso de test rápidos de detección de antígeno de SARS-CoV-2. Se realizó un estudio de cohorte retrospectiva entre diciembre de 2020 y marzo de 2021, que incluyó casos sospechosos de COVID-19 evaluados en un hospital público mediante test rápidos y, en los negativos, por test moleculares. Se realizó seguimiento telefónico de los casos positivos y sus contactos estrechos. Se estimaron indicadores de implementación y de transmisibilidad viral (probabilidad de generar transmisión, cantidad de contagios secundarios generados, tasa de ataque secundaria e índice de sobredispersión). Se analizó su asociación con el resultado del test diag nóstico por modelos multivariados. De 1706 pacientes analizados con test rápidos de detección de antígeno, 526 resultaron positivos y 1180 negativos (65 fueron positivos por test moleculares). Se contactaron 579 casos confirmados e identificaron 1669 contactos estrechos (85% con seguimiento completo); 398 contactos fueron positivos durante su cuarentena (tasa de ataque secundaria de 27.9%). De los 579 casos, 205 (35%) reportaron contagios sintomáticos, con un promedio de 0.91 casos secundarios por infector. Se observó sobredispersión de la transmisión. Los positivos confirmados por test rápido tuvieron mayores chances de generar casos secun darios, más casos secundarios por infector y mayor tasa de ataque que los confirmados por test molecular. En conclusión, la estrategia con test rápido de detección de antígeno tuvo una aceptabilidad y cobertura elevada y aceleró el diagnóstico e identificación de los individuos con mayor contagiosidad.

Abstract The objective was to describe the results of a surveillance strategy based on the use of SARS-CoV-2 rapid antigen de tection tests. A retrospective cohort study was held between December 2020 and March 2021, which included suspected cases of COVID-19 evaluated by rapid antigen tests at a public hospital, with confirmatory molecular tests in negative cases. Positive cases and their close contacts were followed up by telephone. The scope, ac ceptability, follow-up coverage and positivity rate of the strategy were estimated, as well as indicators of viral transmissibility (probability of generating transmission, number of secondary infections generated, secondary attack rate, and overdispersion index). Its association with diagnostic tests results was analyzed by multivariate models. Of 1706 patients tested by rapid antigen tests, 526 were positive and 1180 were negative (65 tested positive by molecular tests); 579 confirmed cases could be contacted and 1669 close contacts were identified (85% of these contacts had full follow-up); 398 contacts tested positive during their quarantine (secondary attack rate of 27.9%). Of the 579 contacted cases, 205 (35%) reported symptomatic transmission, with an average of 0.91 secondary cases per infector. Transmission overdispersion was observed. Positive cases confirmed by rapid antigen tests had a higher chance of generating secondary cases, a higher number of secondary cases per infector and a higher secondary attack rate than those confirmed by molecular tests. In conclusion, the rapid antigen tests strategy showed high acceptability and coverage, and accelerated the diagnosis and identification of individuals with the highest contagiousness.

Plataforma laboratorial para monitorear el SARS-CoV-2 basada en la vigilancia de influenza y otros virus respiratorios en Perú / Laboratory platform for monitoring SARS-CoV-2 based on surveillance of influenza and other respiratory viruses in Peru

RESUMEN En el Perú, la pandemia de la COVID-19 ha evidenciado la utilidad de tener un sistema de vigilancia laboratorial estructurado y en funcionamiento desde hace 22 años, basado en la vigilancia de influenza; inicialmente en modalidad de unidades centinela, y después fortaleciéndose e innovándose, con recursos propios y con apoyo externo, para generar información de calidad. Se han implementado avances biotecnológicos para la confirmación diagnóstica e incrementado las capacidades de la red nacional de laboratorios, manteniendo la eficiencia, considerando las diversas y complejas realidades de los niveles regionales, y superando dificultades de comunicación y articulación entre instituciones. Resulta necesario consolidar este sistema, con trabajo colaborativo y coordinado entre sus componentes, impulsando su eficacia y oportunidad y promoviendo la vigilancia genómica de nuevos virus y variantes, como actualmente ocurre con el SARS-CoV-2.

ABSTRACT In Peru, the COVID-19 pandemic demonstrated the usefulness of having a structured laboratory surveillance system that has been operational for 22 years, based on influenza surveillance; initially in the form of sentinel units, and later strengthened and innovated, with its own resources and with external support, to provide quality information. Biotechnological advances have been implemented for diagnostic confirmation and the capacity of the national laboratory network has been expanded, maintaining efficiency, considering the diverse and complex realities of each region, and overcoming difficulties regarding communication and articulation between institutions. It is necessary to consolidate this system, with collaborative and coordinated work between its components, boosting its effectiveness and timeliness and promoting genomic surveillance of new viruses and variants, as is currently the case with SARS-CoV-2.

"Pegar" ou "passar ": medos entre profissionais da linha de frente da COVID-19 / "To Catch" or "to give": fears among frontline professionals at COVID-19

OBJETIVO: Investigar a relação entre a realização de testes para detectar COVID-19 e indícios de sofrimento psíquico, estresse e burnout entre profissionais de saúde da linha de frente da pandemia em um hospital geral. MÉTODOS: Estudo prospectivo de abordagem mista usando SRQ-20, PSS, OBI e entrevistas em profundidade em série de três entrevistas em 2020. RESULTADOS: Prevalências preocupantes de escores elevados de SRQ20, Burnout e Estresse Percebido ocorreram nas três entrevistas, e o registro de testes realizados foi crescente no período estudado, mas não houve associação entre desfechos e realização de testes para detectar COVID-19. Os temores de contrair a doença e de ser transmissor do vírus apareceram como os principais estressores para profissionais de saúde, mantidos apesar da realização de testes. CONCLUSÃO: Nesse grupo, testes realizados não se mostraram suficientes para modificar os efeitos psicossociais da atividade em linha de frente sobre profissionais de saúde.

OBJECTIVE: To investigate the relationship between the performance of tests to detect COVID-19 and signs of psychological distress, perceived stress and burnout among health professionals on the frontline of the pandemic in a general hospital. METHODS: Prospective mixed-approach study using SRQ-20, PSS, OBI and in-depth interviews in a series of 3 interviews throughout 2020. RESULTS: Worrying prevalences of high scores of SRQ20, Burnout and Perceived Stress occurred on the three interviews and the number of tests performed increased during the study period, but there was no association between outcomes and testing to detect COVID- 19. Fear of contracting the disease or being a transmitter of the virus appeared as the main stressors for health professionals, maintained despite testing. CONCLUSION: In this group, tests performed were not sufficient to modify the psychosocial effects of the front line activity on health professionals.

SARS-CoV-2 Drive/Walk-Thru screening centers in Colombia: The CoVIDA Project / Centros de tamizaje masivo para SARS COV-2 en Colombia: Proyecto CoVIDA

Abstract Objective: The CoVIDA project is a public-private collaboration led by Universidad de los Andes that contributed to the SARS-CoV-2 epidemiological surveillance in Bogotá and nearby municipalities. We aimed to describe the development and performance of the Drive/Walk-through free RT- PCR for SARS-CoV-2 testing strategy implemented by CoVIDA. Material and method: We performed a descriptive analysis of the characteristics and performance of the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers. The model and the process indicators to assess the model's performance were based on international experiences and scientific literature. Two screening centers were imple mented in shopping centers in the north and south of Bogotá. We reported the number of tests taken, the number of positive tests, and the number of participants that used the model by the type of occupations. Results: In total, 36,689 nasopharyngeal RT-PCR tests for SARS-CoV-2 were performed with a 5.75% cumulative positivity. Process indicators showed an excellent performance and an important contribution in reducing barriers to access to testing. Conclusions: the CoVIDA Drive/Walk-through testing centers supported the epidemiological surveillance in asymptomatic or mild-symptomatic population in Bo gotá. Low and middle-income countries can use this model as a cost-effective and innovative solution strategy to intensify testing and help mitigate the pandemic.

Resumen Objetivo: El proyecto CoVIDA es una colaboración público-privada liderada por la Universidad de los Andes que contribuyó a la vigilancia epidemiológica del SARS-CoV-2 en Bogotá y municipios cercanos. Nuestro objetivo fue describir el desarrollo y rendimiento de la estrategia de tamizaje gratuito con RT-PCR mediante un modelo Drive/Walk through para SARS-CoV-2 implementado por CoVIDA. Materiales y métodos: Realizamos un análisis descriptivo de las características y desempeño de los centros de tamizaje Drive/Walk through de CoVIDA. El modelo y los indicadores de proceso para evaluar el desempeño del modelo se basaron en experiencias internacionales y la literatura científica. Se implementaron dos cen tros de tamizaje en centros comerciales del norte y sur de Bogotá. Se reportó la cantidad de pruebas tomadas, pruebas positivas y de participantes que utilizaron el modelo de acuerdo con el tipo de ocupaciones. Resultados : En total, se realizaron 36,689 pruebas RT-PCR nasofaríngeas para SARS-CoV-2 con una positividad acumulada del 5,75%. Los indicadores de proceso mostraron un excelente desempeño y una contribución importante en la reducción de las barreras de acceso a las pruebas. Conclusiones: los centros de tamizaje con modelo Drive/Walk through de CoVIDA apoyaron la vigilancia epidemiológica en población asintomática o con síntomas leves en Bogotá. Los países de ingresos bajos y medianos pueden utilizar este modelo como una estrategia innovadora y rentable para aumentar la realización de las pruebas y ayudar a mitigar la pandemia.

A retrospective report on the preoperative mandatory SARS-COV-2 infection screening in a single pediatric center. Is it time to stop testing our patients? / Estudo retrospectivo de rastreamento pré-operatoria mandatória de SARS-COV-2 na população pediátrica. Será hora de parar de testar nossos pacientes?

ABSTRACT The novel coronavirus SARS-COV-2 (COVID-19) pandemic dramatically changed the workflow of healthcare professionals around the world. Surgical procedures were withheld and postponed in a scenario of fear and uncertainty. Despite numerous medical institutions having swiftly and widely implemented pre-operative screening protocols, cost-effective studies remain scarce specially when comparing to other mitigation measures such as the donning of masks and social distancing measures. The objective of our study is to report the monthly positivity rates of SARS-COV-2 infection in our service and compare our data with monthly positivity rates reported by the State Health Department. Between April, 2020, to February, 2022, 7,199 patients had the RT-PCR for SARS-COV-2 collected, with 187 (2.59%) testing positive for COVID-19. Most of them (62.1%) were asymptomatic. The most common symptoms were coryza (10.7%), fever (10%), and diarrhea (8.7%). Nonetheless, there were two deaths due to COVID-19 reported in our center. Further studies are necessary to elucidate the impact of pre-operative screening for SARS-COV-2 in asymptomatic patients.

RESUMO A pandemia causada pelo novo coronavírus (SARS-COV-2) alterou a rotina de pacientes, profissionais e serviços de saúde em todo o mundo levando ao adiamento ou suspensão de muitos procedimentos cirúrgicos. Muitos serviços implementaram protocolos de triagem sistemática pré-operatória para SARS-COV-2. No entanto, segue incerta a eficácia da triagem sistemática de pacientes assintomáticos para SARS-COV-2 quando comparada com outras medidas de mitigação como o uso de máscaras e o distanciamento social apesar da aparente sensação de segurança conferida pela testagem pré-operatória de pacientes para SARS-COV-2. Sendo assim, descrevemos a experiência de dois anos de um hospital pediátrico (n=7.199) na triagem sistemática pré-operatória para SARS-COV-2 e comparamos a taxa de positividade mensal reportada pelo serviço em relação a taxa de positividade mensal regional do Estado de São Paulo. No período de Abril de 2020 a Fevereiro de 2022 houveram 187 (2,56%) RT-PCR positivos para COVID-19 dos quais 62.1% assintomáticos. Os sintomas mais comuns foram coriza (10,7%), febre (10%) e diarreia (8,7%). Dois pacientes faleceram em decorrência de sintomas relacionados a COVID-19. Mais estudos são necessários para determinar o impacto da testagem pré-operatória de RT-PCR para SARS-COV-2 em pacientes assintomáticos na mitigação da transmissão intra-hospitalar e na morbidade cirúrgica.

Seroconversion in asymptomatic COVID-19 pediatric patients with rheumatic diseases of one tertiary referral hospital

Abstract Objectives: To evaluate seroconverted asymptomatic COVID-19 in pediatric Autoimmune Rheumatic Diseases (ARDs) patients and to identify the risk factors related to contagion. Methods: A cross-sectional study was conducted in March 2021, before vaccination of children and adolescents in Brazil, including 77 pediatric ARDs patients, followed at a tertiary hospital and 45 healthy controls, all of them without a previous diagnosis of COVID-19. Data was obtained by a questionnaire with demographic data, symptoms compatible with COVID-19 over the previous year, and contact with people with confirmed COVID-19. Patient's medical records were reviewed to access data regarding disease and current medications. A qualitative immunochromatographic SARS-CoV-2 test was performed on all participants. Results: Patients and controls were similar in terms of female gender (70.1% vs. 57.8%, p = 0.173), age (14 vs. 13 years, p = 0.269) and SARS-CoV-2 positive serology (22% vs. 15.5%, p = 0.481). 80.5% of rheumatic patients were in use of immunosuppressive drugs: 27.3% of them used corticosteroids (33.3% in high doses), and 7.8% on immunobiologicals. No statistical differences were found between positive (n = 17) and negative serology (n = 60) patients regarding demographic/socioeconomic data, contact with people with confirmed COVID-19, use and number of immunosuppressive drugs, use and dose of corticosteroids, use of hydroxychloroquine and immunobiological drugs (p > 0.05). Conclusions: Pediatric rheumatic disease patients were infected at the same rate as healthy ones. Neither the underlying pathology nor its immunosuppressive treatment seemed to interfere with contagion risk.

Detección del SARS-CoV-2 mediante RT-qPCR utilizando saliva en pacientes ambulatorios con estudio de COVID-19

Resumen Introducción: La pandemia de COVID-19 ha afectado a millones de personas en todo el mundo. La identificación de sujetos infectados ha sido importante para el control. Objetivo: Evaluar el rendimiento de una reacción de polimerasa en cadena (RPC) cuantitativa en tiempo real (en inglés: RT-qPCR) para SARS-CoV-2, utilizando saliva como matriz en comparación con un hisopado nasofaríngeo (HNF). Metodología: Se reclutaron adultos en atención ambulatoria, la mayoría sintomáticos. Fueron estudiadas 530 muestras pareadas de saliva e HNF con RT-qPCR. Resultados: Fueron positivas 59 muestras de HNF y 54 de saliva. La sensibilidad con saliva fue 91%, especificidad 100%, el valor predictor positivo (VPP) 100%, valor predictor negativo (VPN) 98%. El índice Kappa fue de 0,95 y LR-0,08. En promedio, el umbral de ciclo (en inglés cycle threshold-CT) de la saliva fue 3,99 puntos más alto que los de HNF (p < 0,0001) mostrando que la carga viral (CV) es menor en saliva. La carga viral en ambas disminuyó con el tiempo después del inicio de los síntomas. El muestreo de saliva fue preferido por los sujetos en lugar de HNF. Conclusión: Este estudio demuestra que la RPC para SARS-CoV-2 utilizando saliva, es adecuada para el diagnóstico de COVID-19 en adultos ambulatorios, especialmente en la etapa temprana de los síntomas.

Abstract Background: The COVID-19 pandemic has affected millions of people around the world. Part of control strategies is testing a large proportion of the population to identify and isolate the infected subjects. Aim: To evaluate the SARS-CoV-2 detection by the performance of a reverse transcription and quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) against SARS-CoV-2, using saliva as a matrix compared to a nasopharyngeal swab (NPS) to simplify obtaining a diagnostic sample. Methods: Adults in outpatient care were recruited, 95% of them symptomatic. We studied 530 paired saliva and NPS samples by SARS-CoV-2 RT-qPCR. Results: Fifty-nine individuals tested positive in NPS and 54 in saliva samples. Sensitivity for saliva sample was 91%, specificity 100%, positive predictive value (PPV) 100%, negative predictive value (NPV) 98%. The Kappa index was 0.95 and LR-0.08. On average, the cycle threshold (CT) of saliva was 3.99 points higher than those of NPS (p < 0.0001) showing that viral load (VL) is lower in saliva than in NPS. Viral load in both decreased over the time after onset of symptoms. Saliva sampling was preferred by subjects instead of NPS. Conclusion: This study demonstrates that SARS-CoV-2 RT-qPCR using saliva, even with lower VL, is suitable for the diagnosis of COVID-19 in outpatient adults, especially at early stage of symptoms.

Testes diagnósticos nacionais: insumos essenciais para a vigilância sindrômica da Covid-19 / Brazilian diagnostic tests: essential health supplies for COVID-19 syndromic surveillance

RESUMO Existe ampla evidência que a contenção da pandemia de Covid-19 requer vigilância sindrômica e isolamento de casos suspeitos/confirmados. É essencial a disponibilidade de testes diagnósticos no Sistema Único de Saúde, que poderia ser facilitada pela soberania nacional no desenvolvimento e produção, considerando-se a alta demanda/escassez no mercado internacional. Este estudo identificou as etapas da pesquisa translacional de testes diagnósticos para Covid-19 no Brasil, verificando sua distribuição geográfica, entre outros indicadores. Estudo transversal, exploratório, partindo de banco público com 789 projetos de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação (PD&I) em Covid-19, complementado com outras buscas, inclusive no CVLattes dos pesquisadores. No banco, havia 89 projetos de testes diagnósticos. Em 45 casos, foi possível obter informações complementares para classificá-los conforme as etapas da pesquisa translacional. Identificaram-se 15 inovações que atingiram o estágio T3, ou seja, tiveram seus produtos incorporados em protocolos clínicos na atenção à saúde, mesmo considerando-se as profundas restrições orçamentárias em PD&I. O Brasil possui potencial de desenvolvimento e implementação de produtos tecnológicos na área de testes de diagnóstico para Sars-CoV-2. Políticas públicas de PD&I em saúde necessitam ser priorizadas para ampliação de cooperações nacionais e internacionais, a fim de promover efetiva autonomia nacional na vigilância sindrômica e à saúde da população.

ABSTRACT There is much evidence suggesting that mitigating the COVID-19 pandemic requires syndromic surveillance and isolation of suspected/confirmed cases. The availability of diagnostic tests in the Brazilian Unified Health System (SUS) is essential, which could be facilitated by national sovereignty in development and production, considering the high demand/lack of supply in the international market. This study identified the stages of translational research into diagnostic tests for COVID-19 in Brazil, verifying their geographic distribution, among other indicators. A cross-sectional, exploratory study based on a public database with 789 Research, Development, and Innovation (RD&I) projects regarding COVID-19, complemented by other searches, including the researchers' curricula (CVLattes). There were 89 diagnostic test projects in the database. In 45 cases, it was possible to obtain additional information to classify them according to the translational research stages. Fifteen innovations that reached the T3 stage were identified, with their products incorporated into clinical protocols in healthcare, even considering the deep budget restrictions in RD&I. Brazil has the potential to develop and implement technological products in the field of diagnostic tests for SARS-CoV-2. Public health RD&I policies need to be prioritized to expand national and international cooperation to promote effective national autonomy in syndromic surveillance and population health.

Diagnostic accuracy of a SARS-CoV-2 rapid test and optimal time for seropositivity according to the onset of symptoms / Acurácia diagnóstica de um teste rápido para SARS-CoV-2 e tempo ótimo para a soropositividade a partir do início dos sintomas / Precisión diagnóstica del test rápido SARS-CoV-2 y período óptimo para la seropositividad según la aparición de síntomas

Point-of-care serological tests for SARS-CoV-2 have been used for COVID-19 diagnosis. However, their accuracy over time regarding the onset of symptoms is not fully understood. We aimed to assess the accuracy of a point-of-care lateral flow immunoassay (LFI). Subjects, aged over 18 years, presenting clinical symptoms suggestive of acute SARS-CoV-2 infection were tested once by both nasopharyngeal and oropharyngeal RT-PCR and LFI. The accuracy of LFI was assessed in periodic intervals of three days in relation to the onset of symptoms. The optimal cut-off point was defined as the number of days required to achieve the best sensitivity and specificity. This cut-off point was also used to compare LFI accuracy according to participants' status: outpatient or hospitalized. In total, 959 patients were included, 379 (39.52%) tested positive for SARS-CoV-2 with RT-PCR, and 272 (28.36%) tested positive with LFI. LFI best performance was achieved after 10 days of the onset of symptoms, with sensitivity and specificity of 84.9% (95%CI: 79.8-89.1) and 94.4% (95%CI: 91.0-96.8), respectively. Although the specificity was similar (94.6% vs. 88.9%, p = 0.051), the sensitivity was higher in hospitalized patients than in outpatients (91.7% vs. 82.1%, p = 0.032) after 10 days of the onset of symptoms. Best sensitivity of point-of-care LFI was found 10 days after the onset of symptoms which may limit its use in acute care. Specificity remained high regardless of the number of days since the onset of symptoms.

Os testes sorológicos no local de atendimento (point-of-care) para a infecção pelo SARS-CoV-2 têm sidos utilizados para o diagnóstico da COVID-19. Entretanto, não está plenamente elucidada a acurácia dos testes ao longo do tempo em relação ao início dos sintomas. Nosso objetivo foi de avaliar a acurácia, no local de atendimento, do imunoensaio de fluxo lateral (LFI). Pacientes com ≥ 18 anos de idade que apresentavam sintomas clínicos sugestivos de infecção aguda pelo SARS-CoV-2 foram testados uma vez com RT-PCR da nasofaringe e orofaringe, além do LFI. A acurácia do LFI foi avaliada com intervalos periódicos de 3 dias a partir do início dos sintomas. O ponto de corte ótimo foi definido como o número necessário de dias para atingir a melhor sensibilidade e especificidade. Esse ponto foi utilizado também para comparar a acurácia do LFI de acordo com a situação do paciente (ambulatorial ou hospitalizado). Foram incluídos 959 pacientes, dos quais 379 (39,52%) testaram positivos para SARS-CoV-2 pelo RT-PCR e 272 (28,36%) pelo LFI. Foi atingido o melhor desempenho para o LFI com 10 dias a partir do início dos sintomas, com sensibilidade e especificidade de 84,9% (IC95%: 79,8-89,1) e 94,4% (IC95%: 91,0-96,8), respectivamente. Embora a especificidade não tenha sido diferente entre os grupos de pacientes (94,6% vs. 88,9%, p = 0,051), a sensibilidade foi mais alta nos pacientes hospitalizados que nos ambulatoriais (91,7% vs. 82,1%, p = 0,032) no dia 10 depois do início dos sintomas. A melhor sensibilidade do LFI no local de atendimento ocorre 10 dias depois do início dos sintomas, o que pode limitar seu uso no atendimento agudo. A especificidade permanece alta, independentemente do número de dias desde o início dos sintomas.

Los puestos de atención para pruebas serológicas del SARS-CoV-2 han sido usado para la diagnosis de la COVID-19. No obstante, su precisión a lo largo del tiempo, en lo que respecta a la aparición de los síntomas, no se ha comprendido completamente. Nuestro objetivo fue evaluar la precisión de un puesto de atención de inmunoanálisis de flujo lateral (LFI). Se hizo pruebas a individuos ≥ 18 años, presentando síntomas clínicos compatibles con una infección aguda de SARS-CoV-2, tanto vía nasofaríngea y orofaríngea RT-PCR, como LFI. La precisión de LFI fue evaluada en intervalos periódicos de 3 días con respecto a la aparición de los síntomas. El punto óptimo de corte se definió como el número de días requerido para alcanzar la mejor sensibilidad y especificidad. Este punto también se usó para comparar la precisión del LFI, según el estatus de los participantes: ambulatorios u hospitalizados. Se incluyeron a 959 pacientes, 379 (39,52%) dieron positivo en las pruebas de SARS-CoV-2 RT-PCR, y 272 (28,36%) fueron positivos en los LFI. Se alcanzó el mejor rendimiento de los LFI tras 10 días de la aparición de los síntomas, con una sensibilidad y especificidad de un 84,9% (IC95%: 79,8-89,1) y 94,4% (IC95%: 91,0-96,8), respectivamente. A pesar de que la especificidad no fue diferente (94,6% vs. 88,9%, p = 0,051), la sensibilidad fue mayor en pacientes hospitalizados que en los ambulatorios (91,7% vs. 82,1%, p = 0,032) tras 10 días desde la aparición de los síntomas. La mejor sensibilidad LFI del puesto de cuidado se produce tras 10 días de la aparición de los síntomas, lo que quizás limite su uso en el cuidado de urgencias. La especificidad permanece alta independientemente del número de días desde la aparición de los síntomas.

A pandemic guided by the SARS-CoV-2 PCR test: What should the clinician know?

Amidst an ever-evolving pandemic, the demand for timely and accurate diagnosis of coronavirus disease 2019 (COVID-19) continues to increase. Critically, managing and containing the spread of the disease requires expedient testing of infected individuals. Presently, the gold standard for the diagnosis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection remains the polymerase chain reaction (PCR) test. Potential vulnerabilities of this testing methodology can range from preanalytical variables to laboratory-related analytical factors and, ultimately, to the interpretation of results.

COVID-19 testing and diagnosis: A comparison of current approaches

@#The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 is a novel coronavirus that causes the coronavirus disease 2019 (COVID-19). COVID-19 has been declared a pandemic by the World Health Organisation since March 2020. To date, the number of confirmed COVID-19 cases has exceeded 47 million and more than 1.2 million people have lost their lives to the disease. The disease is spreading at an exponential rate with no signs of slowing down. COVID-19 testing and early diagnosis play a crucial role in not just patient management, but also the prevention of the further spread of the disease. Various diagnostic approaches have been applied to detect SARS-CoV-2 infection. This article will critically review these diagnostic approaches and compare each with the gold-standard, which is viral RNA detection using reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR).

Open-source real-time quantitative RT-PCR-based on a RNA standard for the assessment of SARS-CoV-2 viral load

BACKGROUND Detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) target genes by molecular methods has been chosen as the main approach to identify individuals with Coronavirus disease 2019 (COVID-19) infection. OBJECTIVES In this study, we developed an open-source RNA standard-based real-time quantitative RT-PCR (RT-qPCR) assay for quantitative diagnostics of SARS-CoV-2 from nasopharynx, oropharynx, saliva and plasma samples. METHODS AND FINDINGS We evaluated three SARS-CoV-2 target genes and selected the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene, given its better performance. To improve the efficiency of the assay, a primer gradient containing 25 primers forward and reverse concentration combinations was performed. The forward and reverse primer pairs with 400 nM and 500 nM concentrations, respectively, showed the highest sensitivity. The LOD95% was ~60 copies per reaction. From the four biological matrices tested, none of them interfered with the viral load measurement. Comparison with the AllplexTM 2019-nCoV assay (Seegene) demonstrated that our test presents 90% sensitivity and 100% specificity. MAIN CONCLUSIONS We developed an efficient molecular method able to measure absolute SARS-CoV-2 viral load with high replicability, sensitivity and specificity in different clinical samples.

COVID-19 Infection and Its Influence in Otorhinolaryngology-Head and Neck Surgery

Abstract Introduction The novel coronavirus disease 2019 pandemic has rapidly spread worldwide, challenging healthcare resources and communities to an unprecedent degree. Simultaneously, the amount of clinical and scientific information released has overwhelmed journal platforms. Objectives This review aims to summarize the available diagnostic tools and current guidelines to safely assist patients while limiting the exposure of otolaryngologists during this pandemic. Data Synthesis Key articles were retrieved from the following databases: PubMed, Lancet, Springer Nature, BioMed Central, JAMA network and MEDLINE, as well as updated documents from the Spanish Ministry of Health, World Health Organization, Centers for Disease Control and Prevention, Spanish Association of Surgeons, ENT-UK, American College of Surgeons, and American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery. The terms used for the search were: COVID-19, Test COVID, Surgery in COVID, 2019-nCoV, 'coronavirus', and SARS-CoV-2. A total of 10,245 papers were retrieved. The inclusion criteria for the review included: COVID-19 testing (n = 531), society guidelines for otolaryngology-head and neck surgery patient care in the outpatient clinic (n = 10) and surgical (n = 18) settings. Studies not related to COVID-19 diagnosis were excluded. Conclusion Healthcare institutions around the world are outlining their own protocols regarding laboratory testing and personnel protective equipment usage based upon medical societies recommendations during the COVID-19 pandemic. We have summarized the available laboratory tests and their respective sensitivity and specificity. Moreover, clinical guidelines from different societies were reviewed and summarized to facilitate guidance for otolaryngologists in the operating room and in the clinical settings.