An emerging paradigm for the origin and evolution of shelled amoebae, integrating advances from molecular phylogenetics, morphology and paleontology

The phylogenetic paradigm of eukaryotic evolution has changed dramatically over the past two decades, with profound reflections on the understanding of life on earth. Arcellinida testate (shelled) amoebae lineages represent some of the oldest fossils of eukaryotes, and the elucidation of their phylogenetic relationships opened a window to the distant past, with important implications for understanding the evolution of life on earth. This four-part essay summarises advances made in the past 20 years regarding: (i) the phylogenetic relationships among amoebae with shells evolving in concert with the advances made in the phylogeny of eukaryotes; (ii) paleobiological studies unraveling the biological affinities of Neoproterozoic vase-shaped microfossils (VSMs); (iii) the interwoven interpretation of these different sets of data concluding that the Neoproterozoic contains a surprising diversity of organisms, in turn demanding a reinterpretation of the most profound events we know in the history of eukaryotes, and; (iv) a synthesis of the current knowledge about the evolution of Arcellinida, together with the possibilities and pitfalls of their interpretation.

Una "araña pirata" (Araneae: Mimetidae) en el ámbar del mioceno temprano y actualización del listado de arañas fósiles para Chiapas, México / A "pirate spider" (Araneae: Mimetidae) in early miocene amber and updating the list of the fossil spider in Chiapas, Mexico

RESUMEN En busca de contribuir al conocimiento de la araneofauna fósil en Chiapas, México, se describe y fotografía una "araña pirata" (Araneae: Mimetidae) descubierta en una pieza de ámbar del municipio de Simojovel de Allende, con una edad de 23 millones de años (Ma). Esta familia fue citada anteriormente en el ámbar del Báltico, República Dominicana y la India. Al mismo tiempo, se actualiza el listado arañas fósiles en el ámbar de Chiapas, registrándose a la fecha 20 especies descritas. Subsecuentemente, este número podría aumentar, con la revisión de nuevo material.

ABSTRACT To contribute to the knowledge of the fossil spiders in Chiapas, Mexico, a "pirate spider" (Araneae: Mimetidae) is described and photographed in a piece of amber from the Municipality of Simojovel de Allende, with a geological age of 23 millions of years (My). This family was previously found in Baltic, Dominican and Indian amber. I present an updated list of fossil spiders for Chiapas amber, 20 described species have been registered. However, this number could increase, with the revision of new material.

La hiperdiversificación de Physeteroidea (Cetacea: Mammalia) del Mioceno tardío en el Pacifico Sur, nuevos fósiles del área de Sacaco, Arequipa, Perú / Physeteroidea (Cetacea: Mammalia) hyper-diversification from late Miocene of South Pacific, new fossils from the Sacaco area, Arequipa, Peru

Resumen Los cachalotes (Physeteroidea) son un grupo de cetáceos con una ecología restringida en la actualidad. Las tres especies actuales son el remanente de un grupo que alcanzó su máxima diversificacion durante el Mioceno, incluyendo cinco especies simpátricas descritas en la Formación Pisco, Ica-Arequipa, Perú. Entre estas se incluyen formas piscívoras, bénticas, así como carnívoros de tamaño medio e hipercarnívoros. Se reportan dos dientes aislados provenientes del Mioceno superior de las localidades de Sacaco y Sacaco sur, que corresponden con la morfología típica de Physeteridae. Esta morfología dentaria es similar a la de taxones presentes en el hemisferio norte como Orycterocetus o Aulophyseter del Mioceno medio. Debido a esto se presume que los restos corresponderían a physetéridos con hábitos piscívoros, que quizás poseyeron un desarrollo incipiente de la capacidad de succión. La presencia de este linaje indicaría que a fines del Mioceno los parientes de los modernos Physeter y Kogia compartieron el mar peruano con formas extintas, sin solapamiento de nichos debido a la morfología altamente derivada de cada grupo. Este nuevo registro expande la comunidad de cetáceos fósiles de Sacaco, que se vio favorecida por la gran diversidad de ambientes poco profundos que dominaron el litoral peruano hasta el establecimiento final del Sistema Humboldt.

Abstract Sperm whales (Physeteroidea) are a group of cetaceans with a restricted modern ecology. The three extant species are a remnant of a group that reached its diversity peak during the Miocene, including five already-described species from the Pisco Formation, Ica-Arequipa, Peru. We report two isolated teeth from the upper Miocene localities of Sacaco and Sud-Sacaco, which correspond with the typical morphology of Physeteridae. This morphology is similar to the one present in northern hemisphere taxa as Orycterocetus or Aulophyseter. Because of this the remains could be related to physeterids with piscivorous habits, so there would not be a niche overlap with other coeval sperm whales. This new registry expands the fossil cetacean community of Sacaco, which was favored by the great diversity of shallow environments that dominated the Peruvian coast until the final establishment of the Humboldt System.

Predictive Accuracy of Mandibular Ramus Flexure as a Morphologic Indicator of Sex Dimorphism in Jordanians / Exactitud Predictiva de la Flexura de la Rama Mandibular como Indicador Morfológico de Dimorfismo Sexual en Jordanos

The present study investigated the validity of mandibular ramus flexure in sex differentiation among young Jordanian adults using Orthopantomographic images in a double blind study. A normative sample comprised of 419 images was selected, of which 126 belonged to male patients and 293 images to females. The exclusion criteria used in the selection involved excluding images that showed marked loss of mandibular molars, over erupted, tilted, anomalous molars and teeth or mandibles associated with pathology. Each image was examined for the presence of a flexure on the posterior margin of the ramus at the occlusal plane. The posterior margin of the ramus was carefully traced graphically and the occlusal plane level was delineated as guided by the height of cusp tips at the occlusal surfaces of the mandibular molars. The ramus flexure was more accurately diagnostic for females (94.6%), than for males (47.6%); this gave rise to an overall diagnostic accuracy of 70.9% which is far below the reported 90.6-99.0% by Loth & Henneberg. Our results, however, agreed with some reported findings of other researchers. In conclusion, ramus flexure provides a moderately acceptable predictive accuracy and could be considered as a supplementary rather than a definitive mean of sex determination. In sexing unknown skeletal remains, it is necessary to employ as many methods or traits as possible instead of relying on one morphological trait.

El presente estudio investigó la validez de flexura de la rama mandibular en la diferenciación sexual entre adultos jóvenes jordanos utilizando imágenes de ortopantomografías, en un estudio doble ciego. Se seleccionó una muestra normativa compuesta de 419 imágenes, de las cuales 126 pertenecían a hombres y 293 a mujeres. Se excluyeron imágenes que mostraron una pérdida marcada de los molares mandibulares, dientes sobre erupcionados o inclinados, molares anómalos y los dientes o mandíbulas con enfermedad. Cada imagen fue examinada para detectar la presencia de un ángulo en el margen posterior de la rama en el plano oclusal. El margen posterior de la rama mandibular fue trazado gráficamente y el plano oclusal se delineó estableciendo como guía la altura de las puntas cuspídeas en las superficies oclusales de los molares mandibulares. La flexura de la rama mandibular fue más precisa en el diagnóstico de las mujeres (94,6%) que para los hombres (47,6%); con una precisión diagnóstica global del 70,9%, la cual es inferior a la reportada por Loth & Henneberg entre 90,6­99,0%. Nuestros resultados, concuerdan con algunos hallazgos reportados por otros investigadores. En conclusión, la flexura de la rama mandibular proporciona una exactitud de predicción moderadamente aceptable y podría ser considerada como un complemento en lugar de un medio definitivo de la determinación del sexo. En restos óseos desconocidos, es necesario emplear la mayor cantidad de métodos o rasgos posibles que depender de un solo rasgo morfológico.

Respuesta ambiental en el Pacífico frente a la subducción de la dorsal asísmica de Cocos (Panamá y Costa Rica) / Environmental response in the Pacific to aseismic Cocos Ridge subduction (Panama and Costa Rica)

Environmental response in the Pacific to aseismic Cocos Ridge subduction (Panama and Costa Rica). The evolution of the marine communities along the Pacific coast of Central America, may have changed in response to the formation of the Isthmus of Panama. To evaluate the effect of the Aseismic Cocos Ridge (DAC) subduction on the marine benthic communities, we reconstructed benthic assemblages from Neogene fossiliferous formations in Burica and Nicoya peninsulas of Panama and Costa Rica. Paleoecological and paleoenvironmental conditions were reconstructed by comparing community structure from bulk fossil samples with dredge collections from modern Tropical American seas, using principal component analysis. Our results indicate that during the early Pliocene, before the closing of the Isthmus, some oceanic islands existed with moderate upwelling in the Burica region. After the closure, during the late Pliocene and early Pleistocene the collision of the DAC caused an uplift of the seafloor, where water depth of 2 300m became shallow waters of less than 40m depth. Meanwhile, upwelling intensified in the open ocean the uplift that had formed small islands in coastal areas of Burica, creating protected areas and limiting the upwelling effect that was given in open ocean. The subduction of the DAC continued until the islands were joined to the mainland and gradually disappeared, allowing the return of the upwelling. During the middle Pleistocene a second process of accelerated uplift ith speeds of 8m/1 000 years provoked again the elevation of the seafloor and later the elevation of the Talamanca Range. The new range formed a barrier that blocked the passage of the Trade winds, created new ecological conditions and optimized and allowed the growth of the best coral reefs in the coasts of the tropical Eastern Pacific (POT) between Panama and Costa Rica. Rev. Biol. Trop. 60 (2): 893-908. Epub 2012 June 01.

Con el fin de evaluar el efecto de la Subducción de la Dorsal Asísmica de Cocos (DAC) durante las etapas finales de la formación del Istmo. Realizamos muestreos con bultos en afloramientos fosilíferos en las penínsulas de Burica y Nicoya. Las condiciones paleoecológicas y paleoambientales fueron reconstruidas a partir de la comparación entre la estructura de las comunidades fósiles, con las comunidades modernas dragadas de los mares de Panamá, usando análisis de componentes principales. Los resultados indican que antes del cierre del Istmo, existieron islas oceánicas y un afloramiento moderado en Burica. Posterior al cierre, el choque de la DAC provocó la elevación del fondo marino y las aguas que se encontraban a 2 300m pasaron a 40m. El afloramiento se intensificaba en mar abierto pero la dorsal había formado islas en Burica que limitaban el efecto del afloramiento en la costa. La subducción de la DAC continuó y las islas se unieron gradualmente a tierra firme y desaparecieron, permitiendo el afloramiento. Durante el Pleistoceno medio un segundo proceso de levantamiento acelerado continuó elevando el fondo marino y formó la Cordillera de Talamanca. La cordillera creó una barrera que bloqueó el paso de los vientos Alisios y originó condiciones ecológicas y optimas que permiten el crecimiento de los mejores arrecifes de coral costeros del Pacífico oriental tropical (POT) entre Panamá y Costa Rica.

Fósiles, toxoplasmosis y lipemia retinalis: secuencia de una combinación excepcional / Fossils, toxoplasmosis and lipemia retinalis: sequence of one exceptional combination

Se destacan las similitudes del proceso de fosilización con el caso de una paciente diabética mal controlada en quien coexistió al mismo tiempo, una toxoplasmosis aguda retiniana que dejaría una cicatriz y una lipemia retinalis, condición usualmente transitoria que desaparecería no más al instituir tratamiento insulínico; al favor del proceso inflamatorio, las lipoproteínas quedaron atrapadas en la cicatriz dejando constancia indeleble del hecho fugaz

This article highligths the similarities of the fossilization process with the case of a poorly controlled diabetic patient in whom coexisted at the same time, a retinal acute toxoplasmosis, which would leave a retino-choroidal scar, and a lipemia retinalis, usually transient condition that would disappear not more to institute insulin treatment. Because of the inflammatory process, lipoproteins trapped in the scar left indelible proof of the fleeting fact

El Viaje / The voyage

Las exploraciones hidrográficas y geográficas siempre han sido necesarias para Inglaterra, muy consciente de su condición insular. El marino Robert Fitz Roy participa en dos de ellas incorporando a Charles Darwin en la segunda, quien a los 22 años era bachiller en Teología, Filosofía y Artes en Cambridge. Además se había preparado en geología e historia natural. Gran observador y capaz de llegar a conclusiones generales desde los detalles visibles. Ése viaje duró casi 5 años, tanto por mar como por las exploraciones por tierra que efectúo Darwin. Reconoció el bosque húmedo, los glaciares y fue testigo de erupciones volcánicas, maremotos y terremotos. En las Islas Galápagos hizo sus observaciones zoológicas que dieron base a sus postulados sobre el origen de las especies y la supervivencia de las más aptas. De vuelta en Inglaterra sus observaciones serán maduradas por él y sus seguidores, por décadas, tarea que continúa en la actualidad.

Hydrographical and geographic knowledge have been essential for England, an insular nation. Robert Fitz Roy took part in two voyages as a seaman. In the second, Charles Darwin, aged 22, joined the expedition. He had received a degree in Theology, Philosophy and Arts at Cambridge. He had also studied Geology and Natural History. Darwin was a keen observer, capable of drawing conclusions from details. The voyage and explorations lasted nearly 5 years. He examined the rainforest and glaciers and witnessed volcanic eruptions, earthquakes and tsunamis. At the Galapagos Islands, he made his most important zoological observations, which became the essence of his proposal on the origin of species and natural selection. Back in England, he and other scientists continued improving his ideas, a task yet to be completed.

Levantamiento tectónico de la costa del Pacífico central de Costa Rica / Tectonic elevation of the Central Pacific coast of Costa Rica

Three fossil coral samples (Pocillopora elegans and Pocillopora damicornis) were collected from a beachrock in Puerto Escondido, central Pacific coast of Costa Rica. The age of the samples ranged from 1272+/-60 to 2010+/-60 years BP. They represent some of the few Holocene fossil corals known from the Pacific coast of the Americas. The uplift rate for the central Pacific coast of Costa Rica was calculated in 0.4 to 2.1 mm year(-1).