Impact of kras mutations in clinical features in colorectal cancer / Impacto das mutações kras e características clínicas em câncer colorretal

ABSTRACT Background: KRAS mutations are important events in colorectal carcinogenesis, as well as negative predictors of response to EGFR inhibitors treatment. Aim: To investigate the association of clinical-pathological features with KRAS mutations in colorectal cancer patients treated. Methods: Data from 69 patients with colorectal cancer either metastatic at diagnosis or later, were retrospectively analyzed. The direct sequencing and pyrosequencing techniques were related to KRAS exon 2. The mutation diagnosis and its type were determined. Results: KRAS mutation was identified in 43.4% of patients. The most common was c.35G>T (p.G12V), c.35G>A (p.G12D) and c.38G>A (p.G13D). No correlation was found between KRAS mutation and age (p=0.646) or gender (p=0.815). However, mutated group had higher CEA levels at admission (p=0.048) and codon 13 mutation was associated with involvement of more than one metastatic site in disease progression (p=0.029). Although there was no association between primary tumor site and mutation diagnosis (p=0.568), primary colon was associated with worse overall survival (p=0.009). Conclusion: The KRAS mutation was identified in almost half of patients. Mutated KRAS group had higher levels of CEA at admission and the mutation at codon 13 was associated with involvement of more than one metastatic site in the course of the disease. Colon disease was associated with the worst overall survival.

RESUMO Racional: Mutações KRAS são eventos importantes na carcinogênese colorretal como preditores negativos de resposta ao tratamento. Objetivo: Investigar a associação de características clinicopatológicas com mutações no KRAS em pacientes com câncer colorretal tratados. Métodos: Sessenta e nove pacientes com câncer colorretal metastáticos ao diagnóstico ou posteriormente foram analisados. As técnicas de sequenciamento direto e pirosequenciamento foram relacionadas ao éxon 2 do KRAS e o diagnóstico da mutação e seu tipo foram determinados. Resultados: A mutação KRAS foi identificada em 43,4% dos pacientes, c.35G>T (p.G12V), c.35G>A (p.G12D) e c.38G>A (p.G13D). Não foi encontrada correlação entre a mutação KRAS e a idade (p=0,646) ou o gênero (p=0,815). No entanto, o grupo mutado apresentou níveis mais altos de CEA na admissão (p=0,048). A mutação do códon 13 foi associada ao envolvimento de mais de um local metastático na progressão da doença (p=0,029); não houve associação entre o local primário do tumor e o diagnóstico de mutação (p=0,568); a doença primária do cólon foi associada com pior sobrevida global (p=0,009). Conclusão: A mutação KRAS foi identificada em quase metade dos pacientes. O grupo KRAS mutado apresentou níveis mais altos de CEA na admissão e a mutação no códon 13 foi associada ao envolvimento de mais de um local metastático no curso da doença. A doença do cólon foi associada com pior sobrevida global.

Allele and haplotype frequencies of human platelet and leukocyte antigens in platelet donors / Frequência alélica e haplotípica dos antígenos plaquetários e leucocitários humanos em doadores de plaquetas

ABSTRACT Objective To described the allele and haplotype frequencies of human leukocyte antigen genes at the -A, -B loci and human platelet antigen genes for human platelet antigen systems 1 to 9, 11 and 15 in blood. Methods We included 867 healthy unrelated volunteer donors who donated platelets between January 2011 and December 2014. Microarray genotyping was performed using a BeadChip microarray. Medium resolution typing of the human leukocyte antigen at loci A and B was carried out using sequence-specific oligonucleotide probe hybridization. We used multivariate analysis and our human leukocyte antigen population was compared to data from the United States national bone marrow donor program. Human platelet antigen results were compared to a literature review and data from around the world. Results Our human leukocyte antigen haplotype results were more similar to those of hispanics, followed by caucasians. Likewise, our human platelet antigen sample is more similar to those of Argentina, Rio Grande do Sul and Italy. Conclusion This was the first article that discusses human platelet antigen and human leukocyte antigen data together. Rare genotypes or antibody associations can make patient management difficult. A blood bank with genotyped donors allows for optimal transfusion and can contribute to better results. Our information can serve as basis for a database of platelet antigen polymorphisms.

RESUMO Objetivo Descrever as frequências alélicas e haplotípicas de genes dos antígenos leucocitários humanos nos loci -A,- B e dos antígenos plaquetários humanos para os sistemas HPA-1 a 9, 11 e 15. Métodos Foram incluídos 867 doadores voluntários, saudáveis, não relacionados, que doaram plaquetas por aférese entre janeiro de 2011 e dezembro de 2014. A genotipagem foi realizada usando microarray BeadChip. A tipificação de resolução intermediária dos antígenos leucocitários humanos loci A e B foi realizada por meio de hibridização com sonda para oligonucleotídeos por sequência específica. Utilizamos análises multivariadas e o antígeno leucocitário humano de nossa população foi comparado com a do programa nacional de doadores de medula óssea norte-americano. Já os resultados dos antígenos plaquetários humanos foram comparados à revisão da literatura e a dados de populações de outros países. Resultados Os resultados do haplótipo de antígenos leucocitários humanos são mais parecidos com os dos hispânicos, seguidos dos caucasianos. Igualmente, a amostra de antígenos plaquetários humanos foi mais semelhante às da Argentina, do Rio Grande do Sul e da Itália. Conclusão Este foi o primeiro artigo a discutir antígenos plaquetários e leucocitários humanos simultaneamente. Genótipos raros ou associações de anticorpos podem dificultar o manejo clínico do paciente. Um banco de sangue com doadores genotipados permite um melhor resultado e transfusão possíveis. Estas informações podem servir de base para um banco de dados sobre polimorfismos de antígenos plaquetários.

Polymorphism of the cox-2 gene and susceptibility to colon and rectal cancer / Polimorfismo do gene cox-2 e a suscetibilidade ao câncer de cólon e reto

ABSTRACT Background: The colorectal neoplasm is the fourth most common malignancy among males and the third among females. In the Western world is estimated that 5% of the population will develop it, making this disease a major public health problem. Aim: To analyze the prevalence of the polymorphism -765G / C region of the COX-2 gene in colorectal cancer patients compared to a control group, analyzing the possible association between this polymorphism and susceptibility to colorectal cancer. Method: This is a case-control study with 85 participants. Were selected 25 with colorectal cancer (case group) and 60 participants without colorectal neoplasia (control group). The molecular genetic analysis was perform to identify the polymorphism -765G / C COX2 gene with standard literature technique. In addition, patient's clinical and pathological data were analyzed. Results: There was a light increase in prevalence between men in the case group, although this difference was not statistically significant. The results showed a high prevalence of GC and CC genotype in individuals with colorectal cancer, demonstrating an association between the presence of the polymorphism in the COX2 gene and susceptibility to colorectal cancer in this pattern (p=0.02). Similarly, there was also difference in allele frequencies in the groups. When patients with cancer were separated by tumor location, there was a higher prevalence of polymorphism in the left colon (p=0.02). Conclusion: The polymorphism in the COX2 gene is associated with increased susceptibility to colorectal cancer, specially rectosigmoid tumors.

RESUMO Racional: A neoplasia colorretal representa a quarta malignidade mais comum entre homens e a terceira entre as mulheres. No mundo ocidental estima-se que 5% da população a desenvolverá, tornando-a grave problema de saúde pública. Objetivo: Analisar a prevalência de polimorfismo na região -765G/C do gene COX-2 em pacientes com câncer colorretal em relação a um grupo controle, analisando a possível associação entre este polimorfismo e a suscetibilidade a ele. Método: Foram incluídos neste estudo caso-controle 85 participantes. Selecionou-se 25 com neoplasia colorretal (grupo caso) e 60 pacientes sem neoplasia colorretal (grupo controle). Realizou-se análise genético-molecular para identificação do polimorfismo -765G/C do gene COX2 com técnica padrão da literatura. Além disso, foram levantados dados clínicos e anatomopatológicos dos pacientes. Resultado: Constatou-se discreto aumento de prevalência entre os homens no grupo caso, embora esta diferença não fosse estatisticamente significante. Os resultados revelaram alta prevalência do genótipo GC e CC nos indivíduos com câncer colorretal, demonstrando associação entre a presença do polimorfismo no gene COX2 e a suscetibilidade ao câncer colorretal nesta amostra (p=0,02). Similarmente, também se observou diferença nas frequências alélicas em relação aos grupos. Quando os pacientes com a neoplasia foram separados por localização do tumor, verificou-se maior prevalência do polimorfismo em pacientes de cólon esquerdo (p=0,02). Conclusão: O polimorfismo no gene COX2 está associado com a maior suscetibilidade ao câncer colorretal, especialmente em tumores do retossigmoide.

Associação de alelos HLA e aborto espontâneo recorrente em uma população de São Luís/Maranhão, na região Nordeste do Brasil / HLA alleles association and recurrent spontaneous abortion in a São Luis/Maranhão population, in Brazilian Northeastern region

Investigar a associação dos alelos HLA-A, -B e -DRB1 com a ocorrência de Aborto Espontâneo Recorrente.

Lower frequency of the low activity adenosine deaminase allelic variant (ADA1*2) in schizophrenic patients / Diminuição da frequência da variante alélica de baixa atividade da adenosina desaminase (ADA1*2) em pacientes esquizofrênicos

OBJECTIVE: Adenosine may play a role in the pathophysiology of schizophrenia, since it modulates the release of several neurotransmitters such as glutamate, dopamine, serotonin and acetylcholine, decreases neuronal activity by pos-synaptic hyperpolarization and inhibits dopaminergic activity. Adenosine deaminase participates in purine metabolism by converting adenosine into inosine. The most frequent functional polymorphism of adenosine deaminase (22G→A) (ADA1*2) exhibits 20-30 percent lower enzymatic activity in individuals with the G/A genotype than individuals with the G/G genotype. The aim of this study was to evaluate the ADA polymorphism 22G→A (ADA1*2) in schizophrenic patients and healthy controls. METHOD: The genotypes of the ADA 22G→A were identified with allele-specific PCR strategy in 152 schizophrenic patients and 111 healthy individuals. RESULTS: A significant decrease in the frequency of the G/A genotype was seen in schizophrenic patients (7/152 - 4.6 percent) relative to controls (13/111 - 11.7 percent, p = 0.032, OR = 2.6). CONCLUSION: These results suggest that the G/A genotype associated with low adenosine deaminase activity and, supposingly, with higher adenosine levels is less frequent among schizophrenic patients.

OBJETIVO: A adenosina pode ter um papel importante na fisiopatologia da esquizofrenia, uma vez que modula a liberação de vários neurotransmissores, tais como glutamato, dopamina, serotonina e acetilcolina, diminui a atividade neuronal por hiperpolarização pós-sináptica e inibe a atividade dopaminérgica. A adenosina desaminase participa do metabolismo das purinas pela conversão de adenosina em inosina. O mais frequente polimorfismo funcional da adenosina desaminase (22G →A) (ADA1*2) exibe uma diminuição de 20-30 por cento da atividade funcional em indivíduos com genótipo G/A quando comparados com indivíduos com o genótipo G/G. O objetivo deste estudo foi avaliar o polimorfismo 22G→A (ADA1*2) em pacientes esquizofrênicos e em controles saudáveis. MÉTODO: Os genótipos da ADA 22G →A foram identificados através de uma estratégia de PCR alelo-específica em 152 pacientes esquizofrênicos e 111 controles saudáveis. RESULTADOS: Foi observada uma diminuição significativa na frequência do genótipo G/A em pacientes esquizofrênicos (7 - 4,6 por cento) em relação ao grupo controle (13 - 11,7 por cento, p = 0,032, OR = 2,6). CONCLUSÃO: Estes resultados sugerem que o genótipo G/A associado com baixa atividade de adenosina desaminase, e potencialmente com níveis aumentados de adenosina, é menos frequente entre pacientes esquizofrênicos.

Prevalências das mutações 35delG/GJB2 e del (GJB6-D13S1830) em portadores de surdez não-sindrômica na população do Espírito Santo - Brasil / Prevalence of 35delG/GJB2 and del (GJB6-D13S1830) mutations in patients with non-syndromic deafness from a population of Espírito Santo - Brazil

Mutações no gene GJB2 constituem a principal causa de surdez genética de herança autossômica recessiva, sendo a mutação 35delG a mais comum em muitos grupos étnicos. Além da mutação 35delG em homozigose, a mutação também é encontrada em heterozigose composta, associada com outras mutações nos genes GJB2 ou GJB6. OBJETIVOS: Determinar a prevalência das mutações 35delG/GJB2 e del (GJB6-D13S1830) em portadores de deficiência auditiva neurossensorial, residentes no estado do Espírito Santo (Brasil). MATERIAL E MÉTODOS: Foram avaliados 77 indivíduos não relacionados, com perda auditiva neurossensorial de moderada a profunda. A mutação 35delG foi estudada através da técnica de PCR/RFLP e a mutação del (GJB6-D13S1830) foi rastreada por meio da técnica de PCR multiplex. RESULTADOS: 88,3 por cento apresentaram genótipo normal para as mutações estudadas, 1,3 por cento foram heterozigotos compostos, 3,9 por cento homozigotos para a mutação 35delG, 6,5 por cento heterozigotos para 35delG/GJB2. A frequência do alelo 35delG/GJB2 e do alelo del (D13S1830/GJB6) na amostra foi de 7,8 por cento e 0,65 por cento, respectivamente. CONCLUSÃO: Os dados obtidos confirmaram a existência das mutações estudadas em casos de perda auditiva neurossensorial na população do Espírito Santo/Brasil. Esses achados reforçam a importância do diagnóstico genético, que pode propiciar um tratamento precoce para crianças e aconselhamento genético para as famílias dos afetados.

Mutations in GJB2 gene are the leading cause of deafness in autosomal recessive inheritance, and the 35delG mutation is the most common in many ethnic groups. Besides the 35delG mutation in homozygosis, the mutation is also found in compound heterozygosis, coupled with other mutations in genes GJB2 and GJB6. AIM: To determine the prevalence of 35delG/GJB2 and del (GJB6-D13S1830) mutations in patients with sensorineural hearing impairment in residents from the Espirito Santo state, Brazil. MATERIALS AND METHODS: 77 unrelated individuals with moderate to profound sensorineural hearing loss were evaluated. The 35delG mutation was studied by PCR / RFLP; and the del (GJB6-D13S1830) mutation was screened by the technique of multiplex PCR. RESULTS: 88.3 percent had normal genotype for the studied mutations, 1.3 percent were compound heterozygotes, 3.9 percent homozygotic for the 35delG mutation, 6.5 percent heterozygotic for 35delG/GJB2. The frequency of 35delG/GJB2 and del (D13S1830/GJB6) alleles in the sample was 7.8 percent and 0.65 percent, respectively. CONCLUSION: The data confirmed the existence of the mutations studied in cases of sensorineural hearing loss in a population from Espírito Santo / Brazil. These findings reinforce the importance of genetic diagnosis, which can provide early treatment for children and genetic counseling for the affected families.

Estudo dos polimorfismos das paraoxonases 1 e 2 em pacientes portadores do vírus da imunodeficiência humana e avaliação do potencial de peroxidação lipídica / Frequency of the paraoxonase 1 and 2 genetic polymorphisms and analysis of the lipid peroxidation in plasma of HIV positive patients

A paraoxonase sérica humana (PON) vem sendo amplamente estudada. Além da capacidade de PON1 em hidrolisar compostos organofosfatados, sabe-se, atualmente, que toda a família PON (composta por PON1, PON2 e PON3) promove a proteção de lípides, incluindo-se a lipoproteína de baixa densidade (LDL) contra a oxidação. O gene da PON1 sérica apresenta dois sítios polimórficos bem determinados: a troca Gln192Arg (Q/R) e Met55Leu, os quais estão associados com diferenças na atividade e concentrações séricas da enzima, respectivamente. Também o polimorfismo Cys311Ser parece contribuir sinergisticamente com o alelo PON1-192R quanto ao risco cardiovascular em algumas populações. Já foi demonstrado, por sua vez, que pacientes infectados pelo vírus HIV podem desenvolver dislipidemia e que tanto a atividade como a concentração de PON1 podem ser influenciadas por esta infecção. O objetivo deste estudo foi determinar as freqüências alélicas dos polimorfismos genéticos PON1-192QR, PON1-55LM, PON2-311SC e PON2-148AG, bem como avaliar a atividade de PON1 e a peroxidação lipídica no plasma de indivíduos portadores de HIV. Materiais e Métodos após aprovação pela comissão de ética e da aplicação do termo de consentimento pós-esclarecido, 350 (264 homens e 86 mulheres) pacientes infectados pelo HIV foram incluídos no estudo. Foi avaliado ainda um grupo de 32 (23 homens e 9 mulheres) indivíduos recentemente diagnosticados como portadores do vírus. Uma população saudável composta por 179 doadores de sangue, todos de sexo masculino, foi avaliada como controle. Após a extração do DNA, procedeu-se à genotipagem para os polimorfismos de PON1 e PON2 através de PCR-RFLP. A atividade paraoxonase de PON1 foi avaliada por espectrofotometria empregando-se paraoxon como substrato. O colesterol total, VLDL-colesterol, HDL-colesterol e triglicérides foram determinados por métodos padrão. A fração LDL-colesterol foi calculada pela fórmula de Friedwald. Resultados As frequências alélicas...

Human serum paraoxonase (PON) has been the subject of a number of studies. Beside the capacity of PON1 in hydrolyzing organophosphate compounds, it is known now that the entire PON family (which comprises PON1, PON2 and PON3) protects lipids, including low-density lipoprotein (LDL), from oxidation. Serum PON1 gene presents two well-determined genetic polymorphic sites: a Gln192 Arg (Q/R) and Met55 Leu, which are associated with differences in enzymatic activity and serum concentrations, respectively. Moreover, PON2 Cys311 Ser polymorphism seems to contribute synergistically with PON-192R allele to cardiovascular risk in some populations. It has been shown that HIV infected patients may develop dyslipidemia and that PON1 activity and concentration may be influenced by this infection. The aim of this study was to determine allelic frequencies of PON1-192QR, PON1-55LM, PON2-311SC and PON2-148AG genetic polymorphisms, evaluate PON1 activity and lipid peroxidation in plasma of HIV patients. Methods and Subjects after ethical committee approval and written consent, 350 (264 men and 86 women) HIV infected patients were included in the study. It was also evaluated a group of 32 recently diagnosed HIV individuals (23 men and 9 women). As controls, a healthy population formed by 179 men, blood donors, was studied. After DNA extraction PON1 and PON2 genotyping were performed by PCR-RFLP. Paraoxonase activity of PON1 was evaluated spectrofotometrically using paraoxon as substrate. Serum cholesterol, VLDL-cholesterol, HDL-cholesterol and triglycerides were analyzed by standard methods. LDL-cholesterol was calculated by Friedewald formula. Results: Allelic frequencies for PON1 polymorphisms in patients were: 36,43% for PON1-192R, 57,86% for PON1-55L, 65,57% for PON2-311S and 76,43% for PON2-148A. In recently diagnosed individuals these frequencies were 37,50%, 51,56%, 81,25% and 68,75% respectively. In controls, PON1-192R allelic frequency was 43,02%, PON1-55L...

Correlação entre polimorfismo e atividade da enzima conversora da angiotensina com o grau de hipertrofia miocárdica nas formas familiar e não familiar em pacientes com cardiomiopatia hipertrófica / Correlation between polymorphism and activity of the angiotensin converting enzyme with the degree of myocardium hypertrophy in the familial and nonfamilial forms of the hypertrophic cardiomyopathy

FUNDAMENTOS: O polimorfismo e a atividade da enzima conversora da angiotensina (ECA) contribuem, de forma significante, na expressão fenotípica e no prognóstico de pacientes com cardiomiopatia. OBJETIVOS: Determinar o polimorfismo da ECA, realizar a sua dosagem sérica e correlacioná-los com o grau de hipertrofia miocárdica e o índice de massa do ventrículo esquerdo em pacientes com cardiomiopatia hipertrófica (CMH) nas formas familiar e não familiar. CASUÍSTICA E MÉTODO: Foram estudados 136 pacientes consecutivos com CMH (69 da forma familiar e 67 da forma não familiar) com média de idade de 40,53±17,45 anos, sendo 76 do sexo masculino. Os indivíduos foram submetidos ao ecocardiograma para obtenção das medidas do septo interventricular, parede posterior e massa do ventrículo esquerdo e coleta de sangue para determinação do polimorfismo e dosagem sérica da atividade da ECA. RESULTADOS: Quanto ao genótipo do polimorfismo do gene da ECA, encontramos DD 47(35%), ID 71(52%) e II 18 (13%), sendo que do genótipo DD 34% na forma familiar e 36% na forma não familiar. A média da atividade da ECA foi de 56.414±19.236 para os pacientes com CMH na forma familiar e de 55.085±22.634 para a forma não familiar (p = 0,714). A média do índice de massa do ventrículo esquerdo na forma familiar foi 154±63 g/m2 e na forma não familiar foi 174±57 g/m2 (p = 0,008). A média do septo interventricular nas formas familiar e não familiar foi, respectivamente, 19±5 mm e 21±5 mm (p = 0,020). A média da parede posterior do ventrículo esquerdo nas formas familiar e não familiar foi, respectivamente, 10±2 mm e 12±3 mm (p = 0,0001). Não observamos correlação entre o polimorfismo e o grau de hipertrofia miocárdica (p = 0,651). Houve correlação positiva entre a atividade da ECA e o índice de massa do ventrículo esquerdo (p = 0,038)...

CKGROUND: The polymorphism and the activity of the angiotensin converting enzyme (ACE) contributes of significant form in the phenotypic expression and the prognostic of patients with cardiomyopathy. OBJECTIVES: To determine the ACE polymorphism and ACE plasma levels in patients with hypertrophic cardiomyopathy (HCM) in the familial and nonfamilial forms and to correlate it with the degree of myocardium hypertrophy and with the left ventricular mass index. PATIENTS AND METHODS: 136 consecutive patients with HCM (69 of familial and 67 of nonfamilial forms) were studied. The mean age was 40.53±17.45 years, 76 were male. The individuals were submitted to the Echo-Doppler for the measurement of interventricular septum, wall thickness and the left ventricular mass index. The blood samples were taken for extraction of the DNA for the polymerase reaction and measurement of ACE plasma levels. RESULTS: Regarding the genotype of the ACE gene polymorphism, we found DD 47 (35%), ID 71 (52%) and II 18 (13%), being that of genotype DD 34% in the familial and 36% in the nonfamilial forms. The mean of the activity of the ACE was 56.414±19.236 for the patients with HCM in the familial form and 55.085±22.634 in the non familial form (p = 0.714). The mean of the left ventricular mass index in the familial form was 154±63 g/m2 and in the nonfamilial form was 174±57 g/m2 (p = 0.0080). The mean of interventricular septum in the familial and nonfamilial forms was 19±5 mm and 21±5 mm (p = 0.0200), respectively. The mean of the wall thickness in the familial and nonfamilial forms was 10±2 mm and 12±3 mm (p = 0.0001), respectively. We did not observe correlation between the polymorphism and the degree of myocardium hypertrophy (p = 0.651)...