Tempo de viabilidade da saliva humana em meio externo para fins de extração e purificação do DNA: uma revisão de escopo / Viability time of human saliva in the external environment for DNA extraction and purification: a scoping review

Introdução: A análise do DNA salivar é uma dos métodos de identificação humana relacionados à Odontologia Legal. A coleta do material genético salivar consiste num processo simples e pouco invasivo, por possuir grande potencial discriminatório tem sido amplamente aplicado em investigações criminais. Objetivo: Por meio de uma revisão de escopo, objetivou-se mapear o tempo de viabilidade da saliva humana em meio externo para fins de extração e purificação de DNA. Material e Métodos: A revisão foi conduzida seguindo o protocolo JBI e registrada (doi: 10.17605/OSF.IO/PN9ET). A estratégia de busca foi adaptada para as bases: Pubmed, Web of Science, Scopus, LILACS, Cochrane e Google Scholar, sem restrições sobre período de publicação ou idioma. Foram excluídos estudos que exploraram apenas as metodologias e materiais relacionados a extração de DNA , também aqueles que estudaram DNA de outros componentes que não a saliva. Resultados: Identificou-se 283 estudos. Após triagem inicial, 15 referências foram lidas na íntegra, sendo 6 incluídas na revisão, em função da confirmação da elegibilidade. Bitucas de cigarro, próteses dentárias, pastilhas de compressão dentária, cavidade oral e cartões de FTA foram os substratos descritos como fonte de saliva coletada. A viabilidade do DNA foi verificada em tempos que variaram de 1 dia à 11 anos. Conclusão: O protocolo de coleta e armazenamento das amostras é um fator que pode influenciar a quantidade e qualidade do material examinado, todavia, observou-se DNA viável em análise realizada uma década após a coleta da saliva e esse foi o tempo máximo de acompanhamento relatado nos estudos

Introduction: Salivary DNA analysis is one of the human identification methods related to forensic dentistry. Collection of salivary genetic material consists of a simple and poorly invasive process because it has great discriminatory potential has been widely applied in criminal investigations. Objective: Through a scope review, the feasibility time of human saliva was mapped in the external environment for DNA extraction and purification purposes. Material and Methods: The review was conducted following the JBI protocol and registered (doi: 10.17605/OSF.IO/PN9ET). The search strategy was adapted for the databases: Pubmed, Web of Science, Scopus, LILACS, Cochrane and Google Scholar, with no restrictions on period of publication or language. Studies that explored only methodologies and materials related to DNA extraction were excluded, as well as those that studied DNA from components other than saliva. Results: 283 studies were identified. After initial screening, 15 references were read in full, 6 of which were included in the review. Cigarette butts, dentures, dental compression tablets, oral cavity and FTA cards were the substrates described as a source of collected saliva. DNA viability was verified in times ranging from 1 day to 11 years. Conclusion: The sample collection and storage protocol is a factor that can influence the quantity and quality of the material examined, however, viable DNA was observed in an analysis performed a decade after saliva collection and this was the maximum reported follow-up time in the studies

Resultados del ejercicio de calidad de la Sociedad Latinoamericana de Genética Forense, 2023 / Results of the quality exercise of the Latin American Society of Forensic Genetics, 2023

Introducción: La Sociedad Latinoamericana de Genética Forense, desde el año 2003 organiza ejercicios colaborativos de comparación interlaboratorios a fin de apoyar el fortalecimiento de los laboratorios de Genética Forense de Latinoamérica, siendo el ejercicio de calidad de SLAGF el único que incluye muestras óseas. Objetivo: Presentar los resultados del análisis del ejercicio de calidad de SLAGF correspondientes al año 2023. Metodología: Se diseñó un ejercicio práctico con cinco muestras: dos hisopados bucales (M1 y M2), una muestra de sangre en FTA (M3), una muestra mezcla 1:1 de sangre- sangre en FTA (M4) y un resto óseo (M5), Se envió a los laboratorios un ejercicio teórico con cinco casos; dos de los cuales eran opcionales. Al igual que cinco ejercicios teóricos para los peritos independientes participantes. Por primera vez se incluyó un ejercicio de IVD opcional, los ejercicios están disponibles en: http://slagf.org/resultados-control- slagf-2023/x Resultados: Participaron 30 laboratorios y 12 peritos independientes. En el ejercicio práctico, la muestra cadavérica de restos óseos presentó los mayores desafíos, en la parte teórica fue el ejercicio de IVD. Conclusión: Los desafíos que enfrentan los laboratorios de Genética Forense Latinoamericanos, reflejados en el ejercicio de calidad de SLAGF 2023, son similares a los encontrados por otros grupos que realizan ejercicios de control de calidad en Genética Forense...(AU)

Análise das características e viabilidade de amostras questionadas de tecidos rígidos submetidas a exame de DNA forense / Analysis of characteristics and feasibility of questioned samples submitted to forensic DNA examination

Este estudo teve como objetivo analisar as características das amostras questionadas de tecidos rígidos enviadas para análise de DNA forense, especificando o tipo e a região anatômica alvo de coleta, bem como a viabilidade da amostra após o processamento. Caracterizada por ser de corte transversal, com abordagem quantitativa e descritiva, utilizou dados secundários extraídos de planilhas do Instituto, com os quais construiu banco de dados, posteriormente analisado. Os resultados demonstraram que ossos e dentes são coletados como amostra para os testes de DNA, representando o percentual de 47,4% de todos os exames recebidos no ano de 2020, sendo 99,5% provenientes de crimes contra a vida. Das amostras obtidas de tecido rígido, 42% tiveram processamento concluído (39,1% para dentes e 42,6% para ossos), 10% não concluído (17,2% para dentes e 8,5% para ossos) e 48% constavam como não informado. Todas as amostras compostas por dente não especificaram a classificação dentária. Já as amostras compostas por ossos corresponderam a fragmento ósseo não especificado em 81% dos casos, 13,4% eram fragmento de fêmur e o percentual restante distribuído entre fragmentos de clavícula, crânio, escápula, fêmur, manúbrio, osso longo, tíbia, vértebra, osso esterno, mandíbula e ulna, variando entre 1-2% para cada. Pode-se concluir que o perfil dos exames de DNA extraído de amostras de tecidos duros do Instituto pesquisado é composto por ossos e dentes, sendo em sua maioria por fragmentos ósseos de vários tipos, principalmente fêmur, sendo necessária a melhor qualificação dos tipos de amostra utilizados para extração

This study aimed to analyze the characteristics of questioned hard tissue samples sent for forensic DNA analysis, specifying the type and anatomical region targeted for collection, as well as the viability of the sample after processing. Characterized by being cross-sectional, with a quantitative and descriptive approach, it used secondary data extracted from the Institute's spreadsheets, with which it built a database, later analyzed. The results showed that bones and teeth are collected as samples for DNA testing, representing the percentage of 47.4% of all exams received in the year 2020, with 99.5% coming from crimes against life. Among the samples obtained from hard tissue, 42% had its processing completed (39.1% for teeth and 42.6% for bones), 10% were not completed (17.2% for teeth and 8.5% for bones), and 48% were listed as not informed. All tooth-composite samples didn´t specify the tooth classification. Bone samples corresponded to unspecified bone fragments in 81% of the cases, 13.4% were femur fragments, and the remaining percentage was distributed among fragments of clavicle, skull, scapula, femur, manubrium, long bone, tibia, vertebra, sternum bone, mandible, and ulna, ranging from 1-2% for each. Therefore, it can be concluded that the profile of DNA tests extracted from hard tissue samples at the researched institute is composed of bones and teeth, being mostly bone fragments of various types, especially femur, and a better qualification of the sample types used for extraction is needed

Resultados del ejercicio de control de calidad externo 2022 de la Sociedad Latinoamericana de Genética Forense / Results of the 2022 external quality control exercise of the Latin American Society of Forensic Genetics

Introducción: La Sociedad Latinoamericana de Genética Forense, desde el año 2003 organiza ejercicios colaborativos de comparación interlaboratorios a fin de apoyar el fortalecimiento de los laboratorios de genética forense de Latinoamérica. Objetivo: presentar los resultados del análisis del ejercicio de calidad correspondiente al año 2022. Metodología: se diseñó un ejercicio práctico con cinco muestras: dos hisopados bucales (M1 y M2), una muestra de sangre en FTA (M3), una muestra mezcla de sangre-semen en FTA (M4) y un resto óseo (M5), siendo el ejercicio de calidad de SLAGF el único grupo que incluye en su ejercicio de calidad muestras óseas. Se envió además un ejercicio teórico con seis casos; dos contenían una mutación en un marcador especifico, uno consistió en una exclusión materna, otro de exclusión paterna, una paternidad sencilla trío y un caso de identificación de desaparecido, con muestras de referencia de presunta hija; su madre y abuela y tíos paternos, los ejercicios teóricos están disponibles en: http://slagf.org/resultados-control-slagf-2022/x Resultados: participaron 16 laboratorios y cinco peritos. En el ejercicio práctico, las muestras de mezcla y los restos óseos presentaron los mayores desafíos, el consenso por muestra fue de 100% para M1, de 93,75% para M2, de 87,5% para M3, 0% para M4 y de 75% para M5...(AU)

Trazas de ADN y su implicancia en la obtención de perfiles genéticos: revisión bibliográfica / Trace DNA and its implication in obtaining genetic profiles: bibliographic review

Introducción: El aumento en la sensibilidad de las técnicas empleadas ha permitido la obtención de perfiles genéticos a partir de trazas de ADN que se hayan depositado mediante contacto antes, durante o después de la comisión de los hechos investigados. Por otro lado, la contaminación accidental de los indicios biológicos, con la consecuente interpretación errónea de los resultados genéticos, tienen importantes consecuencias en el proceso judicial. Debido a ello, minimizar las contaminaciones que se pueden generar durante algunas de las fases de recolección o análisis genético, como así también la detección de estos eventos, es una prioridad para los laboratorios forenses. Objetivo: analizar las publicaciones más relevantes respecto a las trazas de ADN, los diferentes tipos de transferencia y contaminación que se pueden obtener en una evidencia. Metodología: se realizó la búsqueda en PubMed, del Instituto Nacional de Salud (NIH), y Google Académico usando las palabras clave en español e inglés: ADN de toque, Transferencia de ADN, Contaminación, Trazas, DNA-TTPR, Persistencia del ADN, Perfiles genéticos contaminados. Resultados: se encontraron más de 500 trabajos relacionados a la temática propuesta en esta revisión. El criterio de selección fue el número de citas, el enfoque y el impacto de estos. Se analizaron 71 artículos donde evaluaron la composición de las muestras de contacto y el origen del material genético que contienen. Además, de las metodologías de recolección, análisis de dichas muestras, la importancia que tiene la transferencia y contaminación del ADN en distintos escenarios posibles. Conclusión: existe riesgo de transferencia de ADN que puede conducir a resultados erróneos, por lo tanto es importante asegurar la actualización de los procedimientos de la práctica y brindar la capacitación adecuada para garantizar que el personal policial y del que recolecta indicios sea consciente de los riesgos de contaminación y de los diferentes mecanismos de transferencia de material genético...(AU)

Uso de evidencia genética en la investigación del tráfico ilegal de reptiles en Colombia: reporte de caso / Use of genetic evidence in the investigation of illegal reptile trafficking in Colombia. Case Report

Justificación: En Colombia, el comercio de especies de fauna silvestre sin la documentación necesaria es prohibido por ley, por lo que, en el contexto de una investigación penal sobre venta de reptiles a través de internet, como parte de una diligencia de allanamiento y registro, se realizó el procesamiento del lugar de los hechos. Objetivo: realizar la asignación taxonómica más probable utilizando análisis genético en muestras biológicas recolectadas del lugar de los hechos para establecer la presencia de reptiles, dada la ausencia de animales en el momento del allanamiento. Métodos: se recolectaron seis muestras biológicas que incluyeron un trozo de muda de piel, hisopados de superficies y materia fecal, para su posterior procesamiento siguiendo los protocolos de análisis establecidos. Se realizó extracción de ADN empleando sílice y se amplificó un marcador mitocondrial 12S-120pb; los fragmentos resultantes fueron secuenciados y las secuencias fueron comparadas con la información disponible en la base de datos Genbank mediante el algoritmo BLASTn. Resultados y discusión: a partir de los datos obtenidos de la comparación realizada, 100% de cobertura y 100% de identidad y tras analizar las características de cada grupo taxonómico y la información genética disponible se realizó la asignación taxonómica. En la muestra de muda de piel se encontró dificultad para la amplificación y secuenciación de todo el fragmento, lo que limitó el empleo de marcadores de mayor tamaño, sin embargo, a partir de la información obtenida se logró la identificación de la especie Boa constrictor (boa común); en el caso de la materia fecal y los hisopados se determinó la presencia de muestras provenientes de grupos taxonómicos comúnmente empleados para alimentación de algunas especies de reptiles, como Mus musculus (ratón común) y el género Rattus (especies de ratas). Conclusión: El marcador mitocondrial 12S-120pb empleado en este caso resultó exitoso para la obtención de secuencias a partir de muestras forenses, sin embargo, la utilización de cualquier marcador para la asignación taxonómica depende en gran medida de la información disponible y las características propias de cada grupo taxonómico...(AU)

El genoma humano y el desarrollo de la genética forense / The human genome and the development of forensic genetics

El objetivo de este artículo es introducir al médico generalista en los adelantos científicos y técnicos de la genética forense. A partir de los trabajos de Mendel en 1865 sobre hibridación en las plantas se sucedieron avances en el conocimiento del ADN y se incorporaron nuevas técnicas de laboratorio, que permitieron detectar en el ADN un sector no codificante. El conocimiento de este sector junto con los adelantos de informática (software) han permitido progresos innovadores en el desarrollo de las técnicas de identificación forense, logrando que la Genética Forense se convierta en un auxiliar de la justicia para la resolución de casos de filiación, el reconocimiento de restos humanos y el descubrimiento de responsables de crímenes a través de la identificación de ADN encontrado en la escena. (AU)

The objective of this article is to introduce the general practitioner to the scientific and technical advances of forensic genetics. From the work of Mendel in 1865 on hybridization in plants, advances were made in the knowledge of DNA and new laboratory techniques were incorporated, which made it possible to detect a non-coding sector in DNA. Knowledge of this sector together with the advances in computer science (software) have allowed innovative progress in the development of forensic identification techniques, making Forensic Genetics an auxiliary of justice, for the resolution of filiation cases, the recognition of human remains and the discover of the person responsible for the crimes through the identification of their DNA found at the scene of a crime. (AU)

Las pruebas de ADN en el contexto forense parte II. Interpretación estadística / Basic concepts of DNA testing in the forensic context part II. Statistical interpretation

Este artículo expone los conceptos básicos de las pruebas de ADN en el contexto forense. Describe como se establece la coincidencia entre el perfil genético de la muestra biológica encontrado en la escena del crimen con el perfil de un sospechoso o imputado; como se estima la probabilidad de que la coincidencia haya sido por azar evaluando la frecuencia del perfil genético en la población, es decir, la probabilidad de que el sospechoso en realidad no haya sido la fuente de la evidencia; y otros parámetros estadísticos importantes al momento de evaluar un análisis de ADN...(AU)

Identifying missing people: the contribution of forensic dentistry and DNA / Identificação de desaparecidos: a contribuição da perícia em odontologia forense e do exame de DNA

Introduction: Human identification is considered one of the major steps concerning missing people. The Forensic Anthropology Sector of Legal Medical Institutes identifies corpses. Forensic dentistry and DNA tests stand out among the existing standard tests. Objective: This article aimed to evaluate human identification effectiveness through forensic dental examination performed in the forensic anthropology sector in a Forensic Medical Institute, comparing them with DNA analyses. Methodology: This is a cross-sectional study using secondary data available in the department´s database, from 2008 to 2014, concerning identification procedures using forensic dentistry and DNA techniques. Result: The analysis of the examinations eligible to this study (241) showed that DNA analysis was the method used for identification in 79.3% of the cases and forensic dental examinations were used in 20.7% of the cases. As for the type of biological material used during these examinations, unidentified corpses corresponded to 131 cases (53.9%), skeleton structures corresponded to 109 cases (44.9%) and there were 3 cases of body segments (1.2%). When analyzing the time spent to complete the tests, dental examinations were faster than DNA tests. The time spent for forensic dental examination does not depend on the type of dental documentation evaluated. Conclusion: The analysis of the results in this study showed that human identification through forensic dentistry is effective, rapid and less costly, contributing to greater agility in solving issues related to locating missing people.

Introdução: A identificação humana é uma das principais etapas referentes às questões relacionadas à pessoa desaparecida. Objetivo: O presente estudo visou avaliar a efetividade da identificação humana pelas perícias odontolegais realizadas no Serviço de Antropologia Forense de Belo Horizonte-Minas Gerais, comparando-as com as realizadas por DNA. Metodologia: Estudo transversal, utilizando dados secundários registrados no arquivo do Setor de Antropologia Forense, considerando o período de 2008 a 2014, referente às perícias de identificação odontolegais e DNA. Resultado: Analisando-se apenas as perícias de interesse deste estudo (241), a análise de DNA foi o método utilizado para identificação em 79,3% dos casos e exame odontolegal, 20,7%. Quanto ao tipo de material biológico encaminhado para análise, os cadáveres desconhecidos totalizaram 131 (53,9%), as ossadas 109 (44,9%) e segmentos corporais 3 (1,2%). A análise do tempo efetivamente despendido para a conclusão dos exames mostrou que os realizados pela Odontologia foram mais rápidos que os de DNA. No exame odontolegal, o tempo gasto independe do tipo de documentação odontológica avaliada. Conclusão: A análise dos resultados do presente estudo mostrou que a identificação humana pela técnica odontolegal é eficaz, mais ágil e menos onerosa, contribuindo para uma maior celeridade na resolução de questões envolvidas na localização de pessoas desaparecidas.

A análise proteômica no contexto forense / The proteomic analysis in the forensic context

Realizou-se uma revisão de literatura consultando as bases de dados Medline, LILACS, BBO e Scielo, de 1997 a 2017, com o objetivo de ressaltar a importância do estudo da proteômica e sua aplicação nas diversas áreas forenses. Conclui-se que a evolução da tecnologia de espectrometria de massa juntamente com os bancos de dados proteômicos aplicados para o estudo das proteínas do corpo humano são de grande importância no contexto forense e podem fornecer subsídios nas diversas áreas da Criminalística, assim como na identificação e diferenciação de fluidos, tecidos e órgãos do corpo humano; na Criminologia no diagnóstico de doenças mentais; na Arqueologia e na Antropologia Forense no estudo da evolução das espécies, na estimativa da ancestralidade, do sexo, da cor dos olhos e cabelo e da idade, auxiliando nos processos de identificação humana.

It was performed a literature review on Medline, LILACS, BBO and Scielo databases from 1997 to 2012 in order to highlight the importance of the study of proteomics and its application in the various forensic areas. It is concluded that the evolution of the technology of mass spectrometry together with the proteomic databases applied to the study of proteins of the human body are of great importance in the forensic context and can provide subsidies in the different areas of Criminalistics as well as in the identification and differentiation of fluids, tissues and organs of the human body; in Criminology in the diagnosis of mental illness; in Archeology and Forensic Anthropology in the study of the evolution of species, in the estimation of ancestry, sex, eye color and hair and age, aiding in the processes of human identification.

Aplicabilidade do cromossomo X no DNA forense / Chromosome X of applicability in DNA forensic

Introdução: os casos de identificação humana com a ausência do pai se tornam de difícil solução com marcadores moleculares autossômicos, do cromossomo Y e situados no DNA mitocondrial. Objetivo: contribuir com a solução destes casos utilizando o polimorfismo genético de marcadores moleculares situados no cromossomo X. Metodologia: buscas foram realizadas em bases de dados nacionais e internacionais até novembro de 2015. Foram selecionados artigos relacionados com o uso de marcadores moleculares e com a solução de casos de paternidade com e sem a ausência do suposto pai. Discussão: os achados na literatura mostram que casos de paternidade com a ausência do pai podem ser solucionados com o polimorfismo do cromossomo X (repetições de tetranucleotídeos), inclusive com menos marcadores em relação às demais classes de marcadores, pois o padrão de herança mostrase diferente entre os pais. Conclusão: a principal aplicabilidade do polimorfismo do cromossomo X situa-se nos casos complexos de identificação humana que não poderiam ser solucionados devido à ausência do material biológico de parentes.

Introduction: cases of human identification, with the father's absence become difficult to solve with autosomal molecular markers of the Y chromosome and located on the mitochondrial DNA. Objective: contribute to the solution of these cases using the genetic polymorphism of molecular markers located on chromosome X. Methodology: searches were carried out in national and international databases until November 2015. We selected articles related to the use of molecular markers and the solution for paternity cases with and without the absence of the alleged father. Discussion: the findings in the literature show that paternity cases with the absence of the father can be solved with the polymorphism of the X chromosome (repeats tetranucleotídeos), including fewer markers in relation to other classes of markers because the inheritance pattern shows different between the parents. Conclusion: the main applicability of X chromosome polymorphism lies in the complex cases of human identification that could not be solved due to the absence of biological material from relatives.

A utilização de técnicas de biologia molecular na genética forense: uma revisão / The use of molecular biology techniques in foresinc genetics: a review

Os avanços nas tecnologias de DNA surtiram um enorme impacto no campo da ciência forense. Com uma incrível sensibilidade e um alto poder de discriminação, a análise de DNA tem sido uma poderosa ferramenta para a identificação humana e investigaçõescriminais. O presente estudo fará uma revisão sobre as técnicas de Biologia Molecular mais significativas – RFLP, VNTR, PCR e STR – que foram desenvolvidas nas últimas décadas, tendo como princípio o estudo de diferentes polimorfismos de DNA para a identificação precisa de indivíduos. Por um longo tempo, estes polimorfismos foram detectados por técnicas que possuíam como base a eletroforese.Outra técnica que também será exposta, Southern Blotting, visa a identificação de uma seqüência de bases específicas do DNA, que foi por muito tempo aplicada tanto na detecção de SNPs como de VNTRs e STRs. Além disto, será descrita a reação em cadeia da polimerase (PCR), um método laboratorial capaz de copiar milhões de vezes um segmento do DNA, que se destaca perante outras técnicas por ser um procedimento relativamente simples e fácil de realizar em laboratório, gerando resultados precisos e satisfatórios, em um curto espaço de tempo. Por fim, serão descritos os métodos automatizados que, a partir de PCR, permitem a detecçãorápida de marcadores moleculares, a fim de facilitar e tornar mais precisa a identificação forense.

The advent of DNA-based technologies promoted significant impact in the field of forensic science. According to its highsensibility and powerful discrimination, the DNA analyses have been a powerful tool to human identification and criminal investigations. The present study will be taken to produce a review about the most important techniques of molecular biology developed in recent decades, such as RFLP, VNTR, PCR and STR. These techniques are based in the study of different polymorphisms in the DNAand it could be used in the precise subjects identification. For a period, these polymorphisms were detected through techniques based in electrophoresis. Besides, other procedures will be explained, like Southern Blotting that aims to identify specific DNA sequences and could be applied in the research of SNPs, VNTRs and STRs. It will be also described the Polimerase Chain Reaction (PCR), alaboratorial method able to amplify millions of a short DNA segment. This technique has some advantages through the others because it is a simple and easy procedure to be done in laboratories, and could offer accurate and satisfactory results in a short period of time. Concluding, automated techniques based in PCR will be present that permit fast detection of molecular evidences in order to facilitate and promote reliable forensic identification.

La implementación forense de la tecnología del ADN en Costa Rica: un análisis retrospectivo: [revisión] / Forensic implementation of DNA technology in Costa Rica: a retrospective analysis: [review]

La reciente utilización de la tecnología del ADN para la identificación individual a traído consigo una revolución en las ciencias forenses, que ha alcanzado también a la America Latina. El análisis histórico muestra que en Costa Rica sehan logrado importantes avances y en la actualidad se encuentra consolidado el trabajo con los STRs, y se están en proceso de implementación los marcadores de ADNmt y del cromosoma Y. Sin embargo, la incorporación delas innovaciones de la genética forense se ha venido realizando, cíclicamente, de 5 a 10 años tarde respecto a lospaises desarrollados en este campo. Se espera un cambio de actitud en el futuro, al estar disponibles nuevas generacionesde marcadores de ADN, que permitan explotar a corto plazo todo el potencial de esta útil herramienta al servicio de la justicia.