Identificación de especies micobacterianas ambientales u oportunistas en pacientes sintomáticos y con VIH/sida / Identification of environmental or opportunistic mycobacterial species in symptomatic symptomatic and HIV/AIDS patients

El aumento de las infecciones por micobacterias ambientales u oportunistas (MAO) coincide mundialmente con el declive de la infección tuberculosa e incremento de la infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). El presente trabajo es un estudio retrospectivo realizado en el Laboratorio Nacional de Referencia-Investigaciones de Tuberculosis/Micobacterias/Lepra (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias), del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), La Habana, Cuba, durante el período enero 2014-diciembre 2018. El objetivo de nuestro estudio fue conocer la variabilidad de especies aisladas para establecer un referente actualizado sobre las infecciones causadas por estas. En este trabajo se clasificaron-identificaron 413 cepas procedentes de pacientes sintomáticos; 162 (39.22%) eran aislamientos de pacientes con VIH/sida atendidos en nuestro Hospital Nacional de Referencia a Atención al paciente VIH/sida (IPK), y el resto (n = 251 [60.77%]), procedentes de pacientes inmunocompetentes, incluyendo aislamientos recibidos de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología, y Microbiología (CPHEM). Las muestras fueron analizadas con las técnicas convencionales establecidas: las pulmonares fueron descontaminadas por el método de Petroff modificado; las extrapulmonares, por el método del ácido sulfúrico al 4%; el cultivo se realizó en medio de Löwenstein-Jensen modificado. Posteriormente se realizó la clasificación-identificación de especies según el esquema fenotípico-bioquímico establecido. Las especies con mayor porcentaje de aislamiento pertenecieron a los Grupos III y IV, complejo Mycobacterium avium-intracellulare (34.14%) y complejo M. fortuitum (20.82%), respectivamente. Estos resultados permitirán conocer la prevalencia de estas especies en nuestro país, reafirmando la importancia diagnóstica de estos microorganismos para aplicar tratamiento específico, sobre todo en pacientes con factores de riesgo, en quienes es más probable la diseminación de la infección.

The increase in infections by environmental or opportunistic mycobacteria (MAO) coincides worldwide with the decline in tuberculosis infection and an increase in infection by the human immunodeficiency virus (HIV). The present work is a retrospective study carried out at the National Reference Laboratory-Tuberculosis/Mycobacterial/Leprosy Research (LNRI-TB / Leprosy / Mycobacteria), of the Pedro Kourí Institute of Tropical Medicine (IPK), La Habana, Cuba, during the period January 2014-December 2018. The objective of our study was to know the variability of isolated species to establish an updated reference on the infections caused by MAO. In this study, 413 strains from symptomatic patients were classified and identified; 162 (39.22%) were isolates from patients with HIV/AIDS treated at our National Hospital of Reference for Attention to HIV/AIDS patients (IPK), and the remaining (n=251 [60.77%]), from immunocompetent patients, including isolates received from the Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology, and Microbiology (CPHEM). The samples were analyzed with the established conventional techniques: the lung samples were decontaminated by the modified Petroff method; the extrapulmonary, by the 4% sulfuric acid method; the culture was carried out in modified Löwenstein-Jensen medium. Subsequently, the classification-identification of species was carried out according to the established phenotypic-biochemical scheme. The species with the highest percentage of isolation belonged to Groups III and IV, Mycobacterium avium-intracellulare complex (34.14%), and M. fortuitum complex (20.82%), respectively. These results will allow us to know the prevalence of these species in our country, emphasizing the diagnostic importance of these microorganisms and thus apply a specific treatment, especially in patients with risk factors, in whom the spread of the infection is more likely

Cuando la baciloscopía positiva no es tuberculosis. A propósito de un caso y breve review de la literatura / When smear positive is not tuberculosis. About a case and brief review of the literature

El método gold standar para el diagnóstico de la tuberculosis (TB) es el cultivo en medio sólido de Lowenstein-Jensen. Dado el alto costo y los requerimientos de infraestructura y personal entrenado que exige este método, tanto el programa nacional, como las recomendaciones de la Organización Mundial de la Salud (OMS), establecen que una baciloscopía positiva (BAAR +) confirma el diagnóstico de TB. Si bien el cultivo amplía la sensibilidad diagnóstica, tipifica los bacilos, y permite realizar pruebas de sensibilidad, no es un requisito operativo para la definición de confirmación bacteriológica de TB. En Argentina, el 1% de las BAAR (+) corresponden a otras etiologías3. Presentamos un caso comprendido en ese 1%, en el cual mostramos los problemas a los que se enfrenta un paciente (fundamentalmente demora diagnóstica y exposición innecesaria a drogas potencialmente tóxicas) cuando tiene un diagnóstico de TB de acuerdo con los stándares nacionales e internacionales y sin embargo no es TB.

The method gold standard for the diagnosis of tuberculosis (TB) is the culture in Lowenstein-Jensen’s solid way. In view of the high cost and the requirements of infrastructure and trained personnel that demands this method, both the national program, and the recommendations of the World Health Organization (WHO), they establish that a smear-positive confirms TB’s diagnosis. In addition, the culture increases the diagnostic sensitivity, typifies the bacillus and allows the sensitivity tests to be performed, but it is not an operative requirement for the definition of TB’s bacteriological confirmation. In Argentina, 1% of the BAAR (+) are due to other etiologies3. We present a case included in that 1%, in which we show the problems that a patient faces (basically diagnostic delay and unnecessary exposure to potentially toxic drugs) when it has TB’s diagnosis of agreement to the national and international standards and nevertheless it is not TB.

Frecuencia de micobacterias ambientales en Chile en el año 2008 / Frequency of environmental mycobacterium in Chile: 2008

Objective: To know the frequency of environmental mycobacterium isolations in Chile in the year 2008. Methods: 600 AFB (acid fast bacilli) positive cultures from 22 laboratories of Tuberculosis Bacteriology of the different Network Health Services that constitute the Tuberculosis Control Program of the country were studied, during four months at 2008. 545 (90.8 percent) were pulmonary and 55 (9.2 percent) extra pulmonary. Acid fast bacilli smears were confirmed by Ziehl Neelsen and identification of mycobacteria species or complex were identified by traditional tests according to Runyon classification and biochemical tests, genetic probes and pattern analysis restriction (PRA). Results: 585 cultures were appropriated for inclusion in the study. In 91.3 percent (n = 534) of the cases Mycobacterium tuberculosis was isolated while 0.3 percent was Mycobacterium bovis subspecie BCG (n = 3) and 8.4 percent (n = 48) corresponded to environmental mycobacterium. Of the latter, Mycobacterium kansasii (2.6 percent), Mycobacterium avium-intracellulare (1.5 percent) and Mycobacterium chelonae (1.0 percent) were the most commonly isolated. Conclusion: According to the figures of this study and comparing them with studies of previous years (1988 and 1998) it is concluded that the number of environmental mycobacterium isolated has been relatively constant during the last decade, as well as the species, more commonly isolated.

Objetivos: Conocer la frecuencia de aislamientos de micobacterias ambientales en Chile en el año 2008. Material y Métodos: Se recibieron 600 cultivos desde 22 laboratorios de Bacteriología de la Tuberculosis de los distintos Servicios de Salud de la red que comprende el Programa de Control de la Tuberculosis del país, durante un período de cuatro meses del año 2008. Quinientos cuarenta y cinco (90,8 por ciento) correspondieron a localización pulmonar y 55 (9,2 por ciento) a extrapulmonar. Se confirmó la alcohol-ácido resistencia por tinción de Ziehl Neelsen y para la identificación de especies o complejos micobacterianos se utilizaron pruebas tradicionales y bioquímicas de acuerdo al criterio de clasificación de Runyon, sondas genéticas y análisis de patrones de restricción (PRA). Resultados: De los 600 cultivos recibidos, 585fueron aptos para ser incluidos en el estudio. De éstos, en el 91,3 por ciento (n = 534) de los casos se aisló Mycobacterium tuberculosis, en un 0,3 por ciento Mycobacterium bovis subespecie BCG (n = 3) y un 8,4 por ciento (n = 48) correspondió a micobacterias ambientales. De estas últimas, Mycobacterium kansasii (2,6 por ciento), Mycobacterium avium-intracellulare (1,5 por ciento) y Mycobacterium chelonae (1,0 por ciento) fueron las más comúnmente aisladas. Conclusiones: De acuerdo a las cifras obtenidas en este estudio y comparadas con estudios de años anteriores (1988 y 1998) se concluye que el número de aislamientos de micobacterias ambientales permaneció relativamente constante esta última década, como también las especies más comúnmente aisladas.

Prevalencia de micobacteriosis y de tuberculosis en pacientes de un hospital de referencia de la provincia de Córdoba / Prevalence of mycobacteriosis and tuberculosis in a reference hospital, Cordoba province

Las micobacterias ambientales (MA) constituyen un importante grupo de especies bacterianas que se encuentran en el medio ambiente, pueden colonizar y ocasionalmente producir enfermedad enel hombre. En este trabajo se investigó la frecuencia de casos de micobacteriosis en relación con los de tuberculosis durante un período de diez años (1.991-2.000). Se estudiaron 16.700 muestras de 9.300 pacientes adultos de ambos sexos asistidos en el Hospital Regional de Tuberculosis de la Provincia de Córdoba, por consulta espontánea. Los aislamientos se realizaron por cultivo en los medios de Lowenstein Jensen y Stonebrink. Las colonias de bacilos ácidoalcohol resistentes (BAAR) se identificaron por pruebas bioquímicas y moleculares. El total de casos diagnosticados fue de 716, de los cuales 684 (95,5%) correspondieron a al complejo Mycobacterium tuberculosis y a micobacterias ambientales 32 (4,5%). Los casos de micobacteriosis se definieron por reiterados aislamientos con desarrollo representativo de una micobacteria ambiental, sospecha clínica y radiológica. De los 32 casos de micobacteriosis, el 75% del total correspondió aMycobacterium avium-intracellulare,15,6% a Mycobacterium fortuitum, 3,1% a Mycobacterium kansasii y 6,3% a Mycobacterium chelonae.Los casos de tuberculosis fueron 94,5% de localización pulmonar y 5,5% extrapulmonar.

Environmental mycobacteria (EM) constitute an important group of bacteria species found in the environment. They can colonize and occasionally produce disease in man. Sixteen thousand three hundred samples from 9300 adult symptomatic patients from the Hospital Regional of Tuberculosis in Cordoba were bacteriolocally investigated. The isolations were performed by culture on Lowenstein Jensen and Stonebrink culture media. The colonies of acid fast bacilli (AFB) were identified by biochemical and molecular tests. Among 716 culture positive cases, 684 (95.5%) were due to Mycobacterium tuberculosis complex and 32 to environmental mycobacteria.Serial samples allowed the confirmation of the etiologicalagent in culture and correlated with consistent clinical and radiological abnormalities. Seventy-five percente of these patients were affected by M. avium complex, 15.6% by M. fortuitum, 3.1% Mycobacterium kansasii and 6.3% Mycobacterium chelonae. Among tuberculosis cases, 94.5% and 5.5% had pulmonary and extrapulmonary disease respectively.