Simulation of the length of sugarcane (Saccharum spp. ) crop rows in the operational management of spraying / Simulação do comprimento das fileiras de cultivo de cana-de- açúcar ( saccharum spp. ) no gerenciamento operacional da pulverização

O Brasil é o maior produtor mundial de cana-de-açúcar destinada às usinas e tem produtividade média, superior aos demais países produtores dessa matéria-prima. A aplicação de defensivos agrícolas em canaviais das agroindústrias é realizada em extensas áreas de cultivo, com pulverizadoreshidráulicos autopropelidos, tratorizados e aéreo. Para tanto é necessário sistematizar as áreas de cultivo, tornando os talhões com longo comprimento de fileiras de cultivo, a fim de diminuir as manobras de cabeceira das máquinas. O objetivo do trabalho é avaliar o impacto causado pelo comprimento das fileiras de cultivo no custo operacional de pulverizadores hidráulicos para os tratos culturais de cana-de-açúcar. Pela dificuldade que existe em realizar o trabalho e atender o objetivo nas condições de campo, optou-se em desenvolver um modelo computacional denominado TratoCana, em planilha eletrônica e em linguagem de programação. O modelo foi verificado quanto a possíveis erros de rotina, validado, utilizado na análise dos fatores e na geração de cenários. Os resultados evidenciaram que o comprimento das fileiras de cultivo, impacta positivamente no desempenho operacional e econômico dos equipamentos.

Brazil is the world's largest producer of sugarcane destined for mills and has average productivity, higher than the other countries producing this raw material. The application of pesticides in sugar cane fields in agribusinesses is carried out in extensive cultivation areas, with self-propelled, sprayed and aerial hydraulic sprayers. Therefore, it is necessary to systematize the cultivation areas, making the plots with a long length of cultivation rows, in order to reduce the machines' headboard maneuvers. The objective of the work is to evaluate the impact caused by the length of the cultivation rows on the operational cost of hydraulic sprayers for the sugarcane crop treatments. Due to the difficulty in carrying out the work and meeting the objective in the field conditions, it was decided to develop a computational model called TratoCana, using an electronic spreadsheet and programming language. The model was checked for possible routine errors, validated, used in the analysis of factors and in the generation of scenarios. The results showed that the length of the cultivation rows has a positive impact on the operational and economic performance of the equipment. is Veja também be

3-D simulation of posterior fossa reduction in Chiari I / Simulação em 3D da redução da fossa posterior no Chiari do tipo I

ABSTRACT We proposed a 3D model to evaluate the role of platybasia and clivus length in the development of Chiari I (CI). Using a computer aided design software, two DICOM files of a normal CT scan and MR were used to simulate different clivus lengths (CL) and also different basal angles (BA). The final posterior fossa volume (PFV) was obtained for each variation and the percentage of the volumetric change was acquired with the same method. The initial normal values of CL and BA were 35.65 mm and 112.66º respectively, with a total PFV of 209 ml. Ranging the CL from 34.65 to 29.65 – 24.65 – 19.65, there was a PFV decrease of 0.47% – 1.12% – 1.69%, respectively. Ranging the BA from 122.66º to 127.66º – 142.66º, the PFV decreased 0.69% – 3.23%, respectively. Our model highlights the importance of the basal angle and clivus length to the development of CI.

RESUMO No presente estudo, propusemos a criação de um modelo computacional em 3D com elaboração de software onde dois arquivos em formato DICOM com uma TC e RNM de crânio foram usados para simular diferentes mensurações na extensão do clivus (EC) e no ângulo basal (AB). O volume final da fossa posterior (VFP) foi obtido em cada variação, bem como a percentagem de volume alterada. O tamanho inicial da EC era de 35,65 mm e o do AB era de 112.66º, com um VFP de 209 ml. Variando a EC de 34,65 para 29,65 – 24.65 e 19.65, houve uma diminuição do VFP de 0.47%, 1.12% e 1.69%, respectivamente. Variando o AB de 122,66º para 127,66º e 142,66º, o VFP diminui para 0.69% e 3.23%, respectivamente. Nosso modelo enfatiza a importância da patogênese do aumento do AB e do encurtamento do clivus no desenvolvimento do Chiari I.

PARAMETRIC ANALYSIS OF DRUG DISTRIBUTION DURING INFUSIONS INTO THE BRAIN USING AN AXISYMMETRIC MODEL WITH BACKFLOW / ANÁLISIS PARAMÉTRICO DE LA DISTRIBUCIÓN DE DROGA DURANTE INFUSIONES EN EL CEREBRO CON UN MODELO AXISIMÉTRICO CON REFLUJO / A ANÁLISE PARAMÉTRICA DE DISTRIBUIÇÃO DE DROGAS NO CÉREBRO DURANTE INFUSÕES COM UM MODELO AXISYMMETRIC COM REFLUXO

Convection-enhanced delivery as a means to deliver therapeutic drugs directly to the brain has shown limited clinical efficacy, primarily attributed to the phenomena of backflow, in which the infused fluid flows preferentially along the shaft catheter rather than forward into the tissue. We have previously developed a finite element model of backflow that includes both material and geometric nonlinearities and the free boundary conditions associated with the displacement of the tissue away from the external surface of the catheter. However, that study was limited to predictions of the tissue deformation and resulting convective fluid velocity in the interstitial space. In this study, we use results from that model to solve for the distribution of the infused therapeutic agent. We demonstrate that a significant percentage of the infused drug is not transported into the region of tissue located forward from the catheter tip, but instead is transported into the region along the lateral sides of the catheter. For lower flow rates, this study suggests that the use of a catheter with a larger radius may be preferable since it will provide the higher amount of drug to be transported to the tissue in front of the catheter. In contrast, for higher flow rates consistent with clinical infusions, the radius of the infusion catheter had minimal effect on the distribution of the infused drug, with most being transported into the tissue around the shaft of the catheter.

Convection-enhanced delivery es una técnica que permite transportar drogas directamente en el cerebro para el tratamiento de enfermedades del sistema nervioso central. Este método ha mostrado una eficacia limitada debido principalmente al fenómeno de reflujo (backflow), según el cual, el fluido inyectado fluye preferiblemente a lo largo del catéter y no hacia el tejido delante de la punta. Previamente desarrollamos un modelo de elementos finitos para representar el reflujo, el cual incluye las no linealidades geométricas y del material y las condiciones de borde libre asociadas con el desplazamiento del tejido en la superficie externa del catéter. Sin embargo, ese modelo solo predice la deformación del tejido y el campo de velocidades en el espacio intersticial. En este estudio, hemos utilizado los resultados provenientes del mencionado modelo bifásico para resolver la ecuación de transporte de masa y predecir la distribución de droga suministrada. Se pudo demostrar que un porcentaje significativo de droga no penetra en el tejido ubicado delante de la punta del catéter, sino que es transportado hacia el tejido ubicado alrededor del catéter. Para bajo caudales, este estudio sugiere que el uso de un catéter con un radio mayor permitiría transportar una mayor cantidad de droga hacia el tejido al frente de la punta. Por otro lado, para los mayores caudales usados en la práctica clínica, el radio del catéter tiene un efecto marginal en la distribución del fármaco, y la mayor cantidad de droga se transporta hacia el tejido ubicado alrededor del catéter.

Convection-enhanced delivery é uma técnica para o transporte de drogas directamente no cérebro para tratar doenças do sistema nervoso central. Este método tem demonstrado eficácia limitada devido, principalmente, ao fenómeno de refluxo (refluxo), através do qual, de preferência, o fluido injectado flui através do cateter para o tecido e não à frente da ponta. Anteriormente desenvolvido um modelo de elementos finitos para representar a refluxo, que inclui geométricas e não-linearidades do material e as condições associadas com a extremidade livre de deslocamento da trama na superfície exterior do cateter. No entanto, este modelo apenas prevê deformação do tecido e campo de velocidades no espaço intersticial. Neste estudo, foram utilizados os resultados do modelo de duas fases acima referidas, para resolver a equação de transporte e prever a distribuição de massa de medicamentos fornecidos. Demonstrou-se que uma percentagem significativa da droga não penetra no tecido localizado em frente da ponta do cateter, que é transportado para o tecido que rodeia o cateter. Para as taxas de fluxo baixas, este estudo sugere que o uso de um cateter com um raio maior do que transportar uma maior quantidade de droga para o tecido em frente da ponta. Além disso, para taxas de fluxo mais elevadas utilizadas na prática clínica, o raio do cateter tem um efeito marginal sobre a distribuição da droga, e tanto fármaco é transportado para o tecido que rodeia o cateter.

Predicción computacional de estructura terciaria de las proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina y HspB8 / Computational prediction of tertiary structure of the human proteins Hsp27, αB-crystalline and HspB8 / Predição computacional da estrutura terciária das proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina e HspB8

Objetivo. Realizar predicciones computacionales de estructura de las proteínas humanas Hsp27, αB cristalina y HspB8. Materiales y métodos. La predicción de la estructura secundaria se obtuvo mediante un consenso de los programas de predicción secundaria GOR 4, nnPred, Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN y Psi-Pred. Los modelos de estructura terciaria se elaboraron a partir de fragmentos homólogos de proteínas con estructura terciaria conocida que fueron obtenidos por múltiples alineamientos. Empleando la secuencia primaria se obtuvieron perfiles de antigenicidad de las proteínas nativas y fueron analizados los perfiles de hidrofobicidad, polaridad, flexibilidad, accesibilidad tanto de las proteínas nativas como de las mutadas. Resultados. Las predicciones de estructura secundaria y terciaria de las proteínas estudiadas muestran que en los tres casos, más del 65% son regiones en coil, 20-25% en hoja plegada y menos del 10% en alfa hélice. Los análisis de estructura primaria muestran que al menos uno de los perfiles estudiados, en cada mutación está alterado. Conclusiones. Los análisis comparativos de estructura sugieren que las mutaciones afectan la solubilidad de las proteínas mutadas y con ello su función como chaperonas moleculares.

Objective: To make computational predictions of the structure of the human proteins Hsp27, αB-crystalline and HspB8. Materials and methods. The prediction of the secondary structure was obtained by a consensus of the programs for secondary prediction GOR 4, nnPred, Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN and Psi-Pred. The models of tertiary structure were built from fragments homologous to proteins with tertiary known structure that were obtained by multiple alignments. Using the primary sequence we obtained the antigenicity profiles of native proteins and we analyzed the profiles of hydrophobicity, polarity, flexibility and accessibility of both native and mutant proteins. Results. Predictions of the secondary and tertiary structures of the studied proteins show that in the three cases, more than 65% are coil regions, 20-25% are folded sheet and less than 10% are alpha helix. Analyses of the primary structure show that at least one of the studied profiles in every mutation is altered. Conclusions. The comparative analyses of structure suggest that mutations affect the solubility of the mutated proteins and hence affect their function as molecular chaperones.

Objetivo. Realizar predições computacionais da estrutura das proteínas humanas Hsp27, αB-cristalina e HspB8. Materiais e métodos. A predição da estrutura secundária foi obtida através de um consenso dos programas de predição secundária GOR 4, nnPred, Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN e Psi-Pred. Os modelos de estrutura terciária foram desenvolvidos a partir de fragmentos homólogos de proteínas com estrutura terciária conhecida que foram obtidos por alinhamentos múltiplos. Utilizando a seqüência primária foram obtidos perfis de antigenicidade das proteínas nativas e foram analisados os perfis de hidrofobicidade, polaridade, flexibilidade e acessibilidade, tanto da proteína nativa, como das mutantes. Resultados. As predições de estrutura secundária e terciária das proteínas estudadas mostram que nos três casos, mais de 65% são regiões em coil, 20-25% de folha pregueada e inferior a 10% em alfa-hélice. A análise da estrutura primária mostra que pelo menos um dos perfis estudados, em cada mutação está alterado. Conclusões. A análise comparativa da estrutura sugere que as mutações afetam a solubilidade das proteínas mutantes e, assim, sua função como chaperones moleculares.