BASE GROWTH TEMPERATURE AND PHYLLOCHRON FOR KIKUYU GRASS (Cenchrus clandestinas; Poaceae) / Temperatura base de crecimiento y filocrono para el pasto kikuyo (Cenchrus clandestinus; Poacea)

ABSTRACT In order to estimate the base temperature (Bt) of growth through the appearance of leaves and calculate the phyllochron for kikuyu grass, three plots were established on three farms in the Provincia of Ubaté (Cundinamarca, Colombia) located at different altitudes (2560, 2640, 3143 m. a. s. l.). Measurements were made in four cycles in a period of eight months. The Bt was estimated by the least coefficient of variation method using a second order regression model and the model obtained was validated by the cross-validation method. The Bt values for the first, second, third and fourth leafwere 4.02, 3.68, 3.93, and 3.62 °C, respectively. For the appearance of the first leaf, the kikuyu required more thermal time (TT) (97.5 accumulated growing degree days (AGDD)) than for the second (74.2 AGDD), third (73.8 AGDD) and fourth leaf (76.0 AGDD) (p <0.05). There were no differences in TT among farms (p> 0.05). There was a tendency to a greater number of days required to reach each leaf stage in the farm located at higher altitude and with lower mean temperature. The validation showed an adequate adjustment (r2 = 0.94) and a substantial concordance (CCC = 0.97) between the observed values and the predicted values for the estimated TT with the Bt value obtained for each leaf stage. The results ofBt for kikuyu grass obtained, will allow to make more precise predictions about the phyllochron and generate growth models close to reality.

RESUMEN Con el fin de estimar la temperatura base (Tb) de crecimiento a través de la aparición de hojas y calcular el filocrono para el pasto kikuyo, se establecieron tres parcelas en tres fincas de la provincia de Ubaté (Cundinamarca, Colombia) ubicadas a diferente altitud (2560, 2640, 3143 m. s. n. m.). Se realizaron cuatro ciclos de mediciones en un tiempo total de ocho meses. La Tb se estimó por el método de mínimo coeficiente de variación utilizando un modelo de regresión de segundo grado y el modelo obtenido se validó por el método de validación cruzada. La Tb para la primera, segunda, tercera y cuarta hoja fue 4,02, 3,68, 3,93 y 3,62 °C, respectivamente. El kikuyo requirió mayor tiempo térmico (TT) para la aparición de la primera hoja (97,5 grados día de crecimiento acumulados (GDCA)) que para la segunda (74,2 GDCA), tercera (73,8 GDCA) y cuarta hoja (76,0 GDCA) (p<0,05). No hubo diferencias en el TT entre fincas (p > 0,05). Hubo tendencia a un mayor número de días calendario requeridos para alcanzar cada estado de hoja en la finca ubicada a mayor altitud y con menor temperatura media. La validación mostró un adecuado ajuste (r2 = 0,94) y una concordancia sustancial (CCC= 0,97) entre los valores observados y los valores predichos para el TT estimado con los valores de Tb obtenidos para cada estado de hoja. Los resultados de Tb de crecimiento del pasto kikuyo obtenidos permiten realizar predicciones más precisas sobre el filocrono y generar modelos de crecimiento cercanos a la realidad.

Age and growth of Pseudoplatystoma corruscans (Siluriformes: Pimelodidae) at the confluence of the Paraná and Paraguay rivers

he age and growth of Pseudoplatystoma corruscans, is analyzed on specimens landed in Puerto Antequera, Province of Chaco, Argentina. The study is based on length frequency distribution of 1192 individuals and growth marks of 293 pectoral spines. Previously to age assignation based on spines readings, we performed analyses that ruled out age-associated resorption of rings and corroborated the annual periodicity of mark formation. The average sizes of the radius of each ring were obtained, and the total length of fish were back-calculated to the time of the ring formation, by the regression model fitted between the total radius of the spines to the respective sizes of each fish. Such data showed a good fitting to growth models of von Bertalanffy, Gompertz and logistic for both sexes separately. Results indicate that the study of the species growth must be carried out for each sex separately and that the fishing regulations must consider this characteristic of the species since the current management guidelines could be promoting differential capture by sexes.(AU)

En este trabajo se analiza el crecimiento y la edad del Pseudoplatystoma corruscans, a partir de ejemplares desembarcados en el Puerto Antequera, provincia de Chaco, Argentina. El estudio se basó en la distribución de frecuencias de tallas de 1192 individuos y marcas de crecimiento en 293 espinas pectorales. Para asignar las edades a partir de las lecturas se realizaron análisis que permitieron descartar la reabsorción de anillos asociada a la edad y corroborar la periodicidad anual de la formación de marcas. Se obtuvieron los tamaños medios de los radios de cada anillo y se retrocalcularon las tallas al momento de su formación, mediante la relación del radio total de las espinas con las tallas respectivas de cada pez. Dichos datos mostraron un buen ajuste a las curvas de crecimiento de von Bertalanffy, Gompertz y logística para ambos sexos por separado. Los resultados demostraron que el estudio del crecimiento de la especie debe realizarse para cada sexo por separado y que las normas pesqueras deben contemplar esta característica de la especie ya que las actuales pautas de manejo podrían estar promoviendo la captura diferencial por sexos.(AU)

Kinetics of Gluconacetobacter diazotrophicus Growth Using Cane Molasses and Sucrose: Assessment of Kinetic Models / Cinética de crecimiento de gluconacetobacter diazotrophicus usando melaza de caña y sacarosa: evaluación de modelos cinéticos

RESUMEN Gluconacetobacter diazotrophicus es una bacteria endófita promotora del crecimiento vegetal utilizada como inoculante microbiano en diferentes cultivos agrícolas. El objetivo del presente trabajo fue aplicar diferentes modelos matemáticos para representar su crecimiento en un cultivo sumergido por lotes empleando un biorreactor de 3 L y usando melazas de caña y sacarosa como fuente de energía. Se obtuvo el perfil temporal de pH, biomasa celular y azúcares totales. Se compararon los modelos estudiados por calidad de ajuste y complejidad y se realizó un análisis de sensibilidad paramétrica. Se consideraron modelos de cuatro y cinco parámetros con expresiones que incluyen efectos de inhibición por sustrato y por biomasa. El modelo con mayor calidad de ajuste fue el de Herbert-Pirt-Contois con coeficientes de determinación para biomasa y sustrato de 0,888 y 0,425 respectivamente. Estos valores indican una mayor correspondencia de los datos experimentales de biomasa con los datos calculados por el modelo, en comparación con los resultados obtenidos para azúcares totales para los que esta correspondencia fue menor. Este modelo generó la mejor combinación de calidad de ajuste y complejidad según el criterio de información de Akaike. El estudio cinético desarrollado permitió observar un comportamiento bifásico en la etapa de crecimiento de la bacteria cuando se cultiva en melaza y un efecto de limitación de su crecimiento por la biomasa. Los resultados obtenidos proporcionan una descripción matemática útil para el diseño, escalamiento y operación de un futuro proceso de producción de un inoculante microbiano a base de la bacteria G. diazotrophicus.

ABSTRACT Gluconacetobacter diazotrophicus is a plant-growth promoting endophytic bacterium used as a microbial inoculant for different crops. The objective of this work was to apply different mathematical models to represent its growth in a batch submerged culture employing a 3-L bioreactor and using sugarcane molasses and sucrose as energy sources. The time profile of pH, cell biomass, and total sugars was obtained. Models studied were compared considering their fit quality and complexity, and a parametric sensitivity analysis was performed. Four- and five-parameter models with expressions involving substrate and biomass inhibition effects were considered. The Herbert-Pirt-Contois model achieved the highest fit quality with determination coefficients of 0.888 and 0.425 for biomass and substrate, respectively. These values indicate a higher correspondence between the experimental data of biomass concentration and the data calculated by the model, compared to results obtained for total sugars for which this correspondence was lower. This model reached the best combination considering the fit quality and complexity according to the Akaike's information criterion. The kinetic study performed enabled to observe a bi-phasic behavior in the growth stage of the bacterium when grown on molasses, and a growth limitation effect due to biomass concentration. The outcomes obtained provide a mathematical description useful for design, scale-up, and operation of a future process for the production of a microbial inoculant based on G. diazotrophicus.

Allometric relationship and growth models of juveniles of Cichlasoma festae (Perciforme: Cichlidae), a freshwater species native in Ecuador / Relación alométrica y modelos de crecimiento de juveniles de Cichlasoma festae (Perciforme: Cichlidae), una especie nativa de agua dulce en Ecuador

Abstract: Ecuador is considered the fishing capital of the Southeastern tropical Pacific with more than 900 native species. Cichlasoma festae represents an economic important freshwater species of much local use. Thus, in this study, our goal was to characterize this fish species during juvenile stages, as the first step for its conservation and valuation, and also for the preparation of proposals for sustainable rural development and formulation of plans for environmentally responsible fisheries management. The study lasted 25 weeks and was undertaken in the ictiohidrographic area of Province of Los Rios, which accounts for 35 % of native fish species in Ecuador. Weekly, the individual biometric parameters total length (L), body width (BW) and body depth (BD) of 90 juveniles of C. festae were measured. Growth was determined using non-linear biological regression models. The average standard length varied between 6.30 cm and 12.25 cm and the average weight varied between 4.99 and 35.71 g. The length-weight relationship was best fit by the equation lnW = -3.92 + 2.96 ln(L), and the species presented negative allometric growth. Finally, the best fit for the growth of C. festae was the Von Bertalanffy's model where L∞ = 19.758 cm, k = 0.028 cm week-1 and t0 = -14.463 week-1. We concluded that to support sustainable and reliable fisheries production studies, the growth record from length may be obtained with standard methods as those evaluated in this study, or may be obtained with new safer tools such as photogrammetry. Rev. Biol. Trop. 65 (3): 1185-1193. Epub 2017 September 01.

Resumen: Ecuador se considera la capital pesquera del Pacífico tropical suroriental con más de 900 especies nativas. Cichlasoma festae representa una importante especie de agua dulce de gran uso local. Por lo tanto, en este estudio, nuestro objetivo fue caracterizar esta especie durante la etapa juvenil, como primer paso para su conservación y valoración, así como para la preparación de propuestas para el desarrollo rural sostenible y la formulación de planes para una gestión pesquera ambientalmente responsable. El estudio duró 25 semanas y se llevó a cabo la zona ictiohidrográfica de la Provincia de Los Ríos, que representa el 35 % de las especies nativas en Ecuador. Semanalmente, se midieron los parámetros biométricos individuales longitud total (L), ancho corporal (BW) y profundidad corporal (BD) de 90 juveniles de C. festae. El crecimiento se determinó utilizando modelos de regresión biológicos no lineales. La longitud media estándar varió entre 6.30 y 12.25 cm y el peso promedio varió entre 4.99 y 35.71 g. La relación longitudpeso se ajustó a la ecuación lnW = -3.92 + 2.96 ln(L), y la especie presentó crecimiento alométrico negativo. Finalmente, el mejor ajuste para el crecimiento de C. festae fue el modelo de Von Bertalanffy donde L∞ = 19.758 cm, k = 0.028 cm week -1 y t0 = -14.463 week -1. Concluimos que el registro de crecimiento de la longitud podría estar asociado a la fotogrametría como una herramienta para el desarrollo de una producción pesquera sostenible y segura.

Modelación del crecimiento individual del callo de hacha Atrina maura (Bivalvia: Pinnidae) a partir de la inferencia multi modelo / Individual growth modeling of the penshell Atrina maura (Bivalvia: Pinnidae) using a multi model inference approach

Growth models of marine animals, for fisheries and/or aquaculture purposes, are based on the popular von Bertalanffy model. This tool is mostly used because its parameters are used to evaluate other fisheries models, such as yield per recruit; nevertheless, there are other alternatives (such as Gompertz, Logistic, Schnute) not yet used by fishery scientists, that may result useful depending on the studied species. The penshell Atrina maura, has been studied for fisheries or aquaculture supplies, but its individual growth has not yet been studied before. The aim of this study was to model the absolute growth of the penshell A. maura using length-age data. For this, five models were assessed to obtain growth parameters: von Bertalanffy, Gompertz, Logistic, Schnute case 1 and Schnute and Richards. The criterion used to select the best models was the Akaike information criterion, as well as the residual squared sum and R² adjusted. To get the average asymptotic length, the multi model inference approach was used. According to Akaike information criteria, the Gompertz model better described the absolute growth of A. maura. Following the multi model inference approach the average asymptotic shell length was 218.9mm (IC 212.3-225.5) of shell length. I concluded that the use of the multi model approach and the Akaike information criteria represented the most robust method for growth parameter estimation of A. maura and the von Bertalanffy growth model should not be selected a priori as the true model to obtain the absolute growth in bivalve mollusks like in the studied species in this paper.

El molusco bivalvo Atrina maura (Sowervy 1835) habita aguas marinas someras y estuarios en la costa del Pacífico desde Baja California, México hasta Perú. Es un organismo cuyo crecimiento individual ha sido insuficientemente modelado. El objetivo del estudio fue modelar su crecimiento individual absoluto mediante el uso de datos de longitud a la edad obtenidos de una región del Golfo de California. Los parámetros fueron obtenidos con el uso de cinco modelos de crecimiento; von Bertalanffy, Gompertz, Logístico, Caso 1 de Schnute y Schnute & Richards. Se seleccionó el mejor modelo usando el criterio de información de Akaike, AIC, pero se calcularon también la suma de residuos al cuadrado y la R² ajustada. Para obtener la longitud asintótica se siguió el enfoque de inferencia multi modelo IMM. Según el AIC el modelo que mejor describe el crecimiento absoluto de A. maura es el de Gompertz y colocó en cuarto lugar jerárquico el de von Bertalanffy. La longitud asintótica promedio encontrada, siguiendo la IMM, fue de 218.9mm (IC 212.3-225.5) de longitud de concha. Se concluye que tanto la IMM como el AIC representan las herramientas más sólidas para evaluar parámetros de crecimiento individual de A. maura y que el modelo de crecimiento de von Bertalanffy no debe ser seleccionado a priori como la opción para describir el crecimiento individual en moluscos bivalvos como la especie estudiada.

Enfermedades transmitidas por los alimentos: Análisis del riesgo microbiológico / Risk analysis of foodborne diseases: Microbial risk assessment

The basic goals of risk assessment include the following: to identify potentially hazardous situations and apply appropriate methods to estimate the likelihood that a hazard occurs. In The uncertainty in that estimate, to provide alternative solutions to reduce the risk, estimate the effectiveness of those solutions, provide information to base a risk management decision, and estimate the uncertainty associated with the analysis. Risk analysis provides the rational framework for assembling and then analysing the evidence relating to risk and presenting the results in a form that is easy to understand and then act upon fairly and effectively. Progress made is no excuse for arrogance. The present review is definitely not designed as the last word on risk analysis for foodborne diseases. Rather, this review has been designed to continue an evolving and necessary process and to provide a reference point that indicates the state of development in 2010.

Las metas básicas del análisis de riesgo incluyen las siguientes: identificar las situaciones potencialmente peligrosas, aplicar los métodos apropiados para estimar la probabilidad que un peligro ocurra, y en la incertidumbre en esa estimación, proporcionar las soluciones alternativas para reducir el riesgo, estimar la eficacia de esas soluciones, proporcionar la información sobre las que se base una decisión de la gestión de riesgos, y estimar la incertidumbre asociada a la evaluación. El análisis de riesgos constituye un sistema de referencia coherente para reunir y analizar indicios sobre los factores de riesgo, y también para presentar los resultados de modo inteligible y obrar después eficazmente. Pero los progresos realizados no pueden excusar la arrogancia. La presente revisión no pretende sentar cátedra sobre el análisis de riesgo microbiano, más bien está pensado como una etapa más de un proceso necesario y permanente, como un jalón que describe el estado de cosas en 2010.