Construção de uma ontologia de referência para o domínio da HIV/aids / Construction of a reference ontology for the domain of HIV/Aids / Construcción de una ontología de referencia para el dominio del VIH/sida

O uso da Tecnologia da Informação está presente nos mais diversos domínios, inclusive no da saúde, ao utilizar várias metodologias e ferramentas computacionais. O objetivo deste artigo é apresentar o modelo conceitual baseado em ontologia sobre o domínio HIV/aids denominado OntoHI. No processo para desenvol-ver a OntoHI adotam-se a metodologia SABiO e a ontologia de fundamentação UFO, além do conhecimento de especialistas da área da saúde, o que garante a representação da realidade. Artefatos da ontologia aqui apresentados: representação gráfica, glossário de termos, questões de competência. O controle de qualidade se dá através dos processos de validação e verificação das questões de competências. A OntoHI possibilita a integração com representações de outros domínios. Pode ser utilizado como artefato para a construção de ferramentas computacionais, principalmente sistemas de informações e aplicativos móveis para acompanhar o tratamento de pacientes, além de poder ser expandida para se adaptar a novas situações

The use of Information Technology is present in the most diverse domains, including health care, using various methodologies and computational tools. The goal of this work is to present an ontology-driven con-ceptual model on the HIV/AIDS domain called OntoHI. In the process of developing OntoHI, the SABiO methodology and the UFO foundational ontology are adopted, in addition to the specialist's knowledge in the field of health care, which guarantees a consistent representation of reality. Ontology artifacts that are presented here: graphical representation, glossary of terms, validation of competence questions. Quality control happens in the process of validation and verification of competency questions. OntoHI enables in-tegration with representations from other domains. It can be used as an artifact for building computational tools, mainly information systems and mobile applications to monitor patient treatment, in addition to being able to be expanded to adapt to new situations

El uso de las Tecnologías de la Información ocurre en los más diversos dominios, incluido el de la salud, uti-lizando diversas metodologías y herramientas computacionales. El objetivo de este trabajo es presentar el modelo conceptual basado en ontologías sobre el dominio del VIH/sida denominado OntoHI. En el proceso de desarrollo de OntoHI se adoptan la metodología SABiO y la ontología de fundamentos OVNI, además del conocimiento de especialistas en el campo de la salud, lo que garantiza la representación de la realidad. Artefactos ontológicos presentados: representación gráfica, glosario, temas competenciales. El control de calidad se lleva a cabo a través del proceso de validación y verificación de problemas de competencia. Onto-HI permite la integración con representaciones de otros dominios. Puede usarse como artefacto para cons-truir herramientas computacionales, principalmente sistemas de información y aplicaciones móviles para monitorear el tratamiento del paciente, además de poder expandirse para adaptarse a nuevas situaciones

O uso do Twitter como minerador de eventos adversos de medicamentos de combate à malária: o caso da doxiciclina / El uso de Twitter como localizador de eventos adversos con medicamentos de combate a la malaria: el caso de la doxiciclina / Mining in Twitter for adverse events from malaria drugs: the case of doxycycline

Durante o período de pós-comercialização, quando medicamentos são usados por grandes populações e por períodos de tempo maiores, eventos adversos (EA) inesperados podem ocorrer, o que pode alterar a relação risco-benefício dos medicamentos o suficiente para exigir uma ação regulatória. Eventos adversos são agravos à saúde que podem surgir durante o tratamento com um produto farmacêutico, os quais, no período de pós-comercialização do medicamento, podem requerer um aumento significativo de cuidados de saúde e resultar em danos desnecessários aos pacientes, muitas vezes fatais. Portanto, o quanto antes, a descoberta de EA no período de pós-comercialização é um objetivo principal do sistema de saúde. Alguns países possuem sistemas de vigilância farmacológica responsáveis pela coleta de relatórios voluntários de EA na pós-comercialização, mas estudos já demonstraram que, com a utilização de redes sociais, pode-se conseguir um número maior e mais rápido de relatórios. O objetivo principal deste projeto é construir um sistema totalmente automatizado que utilize o Twitter como fonte para encontrar EA novos e já conhecidos e fazer a análise estatística dos dados obtidos. Para isso, foi construído um sistema que coleta, processa, analisa e avalia tweets em busca de EA, comparando-os com dados da Agência Americana de Controle de Alimentos e Medicamentos (FDA) e do padrão de referência construído. Nos resultados obtidos, conseguimos encontrar EA novos e já existentes relacionados ao medicamento doxiciclina, o que demonstra que o Twitter, quando utilizado em conjunto com outras fontes de dados, pode ser útil para a farmacovigilância.

Durante el período de poscomercialización, cuando grandes poblaciones consumen medicamentos durante períodos más prolongados de tiempo, se pueden producir eventos adversos (EA) inesperados, lo que puede alterar la relación riesgo-beneficio de los medicamentos. Esta situación es suficiente para exigir una acción regulatoria. Los EA son agravios a la salud que pueden surgir durante el tratamiento con un producto farmacéutico, los cuales, durante el período de poscomercialización del medicamento, pueden requerir un aumento significativo de cuidados de salud y resultar en lesiones innecesarias para los pacientes, muchas veces fatales. Por lo tanto, el hallazgo anticipado de EA durante el período de poscomercialización es un objetivo primordial del sistema de salud. Algunos países cuentan con sistemas de vigilancia farmacológica, responsables de la recogida de informes voluntarios de EA durante la poscomercialización, pero algunos estudios ya demostraron que, con la utilización de las redes sociales, se puede conseguir un número de informes mayor y más rápido. El objetivo principal de este proyecto es construir un sistema totalmente automatizado que utilice Twitter como fuente para encontrar nuevos EA y ya conocidos, además de realizar un análisis estadístico de los datos obtenidos. Para tal fin, se construyó un sistema que recoge, procesa, analiza y evalúa tweets en búsqueda de eventos adversos, comparándolos con datos de la Agencia Americana de Control de Alimentos y Medicamentos (FDA) y del estándar de referencia construido. En los resultados obtenidos, conseguimos encontrar nuevos eventos adversos y ya existentes, relacionados con el medicamento doxiciclina, lo que demuestra que Twitter, cuando es utilizado junto a otras fuentes de datos, puede ser útil para la farmacovigilancia.

During the post-marketing period, when medicines are used by large population contingents and for longer periods, unexpected adverse events (AE) can occur, potentially altering the drug's risk-benefit ratio enough to demand regulatory action. AE are health problems that can occur during treatment with a pharmaceutical product, which in the drug's post-marketing period can require a significant increase in health care and result in unnecessary and often fatal harm to patients. Therefore, a key objective for the health system is to identify AE as soon as possible in the post-marketing period. Some countries have pharmacovigilance systems responsible for collecting voluntary reports of post-marketing AE, but studies have shown that social networks can be used to obtain more and faster reports. The current project's main objective is to build a totally automated system using Twitter as a source to detect both new and previously known AE and conduct the statistical analysis of the resulting data. A system was thus built to collect, process, analyze, and assess tweets in search of AE, comparing them to U.S. Food and Drug Administration (FDA) data and the reference standard. The results allowed detecting new and existing AE related to the drug doxycycline, showing that Twitter can be useful in pharmacovigilance when employed jointly with other data sources.

Sistemas para la organización del conocimiento: definición y evolución histórica

n este ensayo se analizan los Sistemas para la Organización del Conocimiento (SOC) con el objetivo de establecer su definición y la forma en que evolucionó históricamente. Se propone que los SOC son fundamentales en la bibliotecología, en tanto que estandarizan los procesos ordenadores y posibilitan el efectivo rescate de la información. Se determina que: (1) en la parte conceptual confluyen diversos conceptos de SOC, (2) su evolución histórica está asociada a visiones interdisciplinarias (epistemología, ciencias cognitivas, bibliotecología, ciencias computacionales), (3) históricamente, han pasado por diversas etapas, asociadas a los paradigmas organizadores imperantes y, (4) actualmente, están en un proceso de ajuste a contextos digitales asociados a la Web 2.0, la Web Semántica y el Linked Data. Finalmente, puede concluirse que el estudio teórico de los SOC es importante, ya que contribuye a una mejor planeación de las aplicaciones prácticas que éstos pueden tener en la organización de recursos de información.

his essay analyzes Knowledge Organization Systems (KOS) with the aim to establish its concept and historical evolution. It proposes that KOS are essential in library science because standardizes the ordering process and enable an effective information retrieval. It determines that: (1) in the conceptual facet converges many concepts of KOS, (2) their historical evolution is associated with interdisciplinary visions (epistemology, cognitive sciences, library science, computer science), (3) along the time, have gone through various stages, associated with prevailing organizers paradigms and, (4) currently, KOS are in a process of adjustment to digital contexts: associated with the Web 2.0, Semantic Web and Linked Data. Finally, it concludes that the theoretical study about the KOS is important because it contributes to a better planning of the practical applications that it may have in the organization of information resources.

Modelo de sistema de organización del conocimiento basado en ontologías / Model of a knowledge organization system based on ontologies

El presente trabajo tiene como objetivo proponer un modelo para el diseño y construcción de un sistema de organización del conocimiento basado en ontologías. Se propone, a través del uso de métodos descriptivos y criterios de otros autores, un modelo a partir del cual se puede obtener un sistema de información basado en ontologías. Se muestra y se explica la relación entre cada una de las partes del modelo, y se demuestran sus propiedades holísticas. Se plantean los resultados obtenidos de la evaluación del modelo para su validación a través del criterio de expertos. Todos los pasos establecidos a través del modelo resultaron importantes. La mayoría de los encuestados estuvieron a favor y en ningún caso se consideró que los pasos eran poco importantes o no importantes. Con la aplicación del modelo se espera estructurar las bases de un dominio del conocimiento en específico, tras una progresiva sustitución de los modelos convencionales del proceso de recuperación de la información por un modelo cognitivo...

The study is aimed at proposing a model for the design and construction of a knowledge organization system based on ontologies. Descriptive methods and criteria provided by other authors were used to devise and propose a model to obtain an information system based on ontologies. It is expected that the bases of a specific knowledge domain may be structured with the application of this method, following gradual replacement of conventional information retrieval models by a cognitive model. A discussion is also provided about the relationship between the various parts of the model, showing its holistic properties. The results obtained from evaluation of the model are presented for consideration by experts. All the steps established by the model were important. Most respondents were in favor and none considered that the steps were not very important or not important at all...

Ontologias para a Teoria TRIZ: uma necessidade? / Ontologies to Teoria TRIZ: a need?

A Ciência da Informação surgiu há aproximadamente quarenta anos, é multidisciplinar por natureza e uma de suas contribuições é o planejamento e a organização de Sistemas de Conhecimento com o uso de computador. Os cientistas da informação são profissionais formados em diversas áreas e se utilizam das ontologias para organizar o conhecimento. Um dos desafios é o uso de ontologias para sistemas de conhecimento contido nas bases de patentes. O presente ensaio aborda aspectos relacionados à necessidade de uso de ontologias no campo de domínio da Teoria da Resolução de Problemas Inventivos para a construção de Sistemas de Conhecimento capazes de oferecer soluções na prática da Inovação Sistemática; analisa a literatura disponível sobre o assunto; esclarece questões a respeito da Teoria TRIZ; e questiona se o uso de Ontologias contribui na aplicação do desenvolvimento dos métodos da TRIZ. As reflexões finais deixam em aberto o campo de estudos que envolvam ontologias, TRIZ e Sistemas de Conhecimento, como proposta de objeto de estudo a parti r da Ciência da Informação e da Engenharia do Conhecimento

The Science of the Information appeared there are approximately forty years, it is by nature multidisciplinary, and one of your contributions is the planning and the organization of Systems of Knowledge with the computer use. The cientists of the information are professional formed in severalareas and they are used of the ontologies to organize knowledge. One of the challenges is the ontologies use for knowledge systems contained in the basesof patents.The present empirical text approaches aspects related to the need of ontologies use in the field of domain of the Theory of the Resolution of Inventive Problems to the construction of Systemsof Knowledge that it capable off ering solutions in practice of the Systematic Innovation. It analyzes the available literature about subject, and it's clears regarding about the TRIZ Theory, and the use of Ontologies is questioned if they contribute in the application of the development of the methods of TRIZ. The final reflections leave in open the field of studies of ontologies, TRIZ and Systems of Knowledge, as proposal of study object starting from the Science of the Information and of the Engineering of the Knowledge

Producción científica sobre ontologías en el Web of Science, 1998 - 2007 / Scientific production on ontologies in Web of Science, 1998-2007

Se estudian brevemente algunas cuestiones conceptuales relacionadas con las ontologías. Se analiza el comportamiento de las ontologías como dominio científico en las revistas procesadas por el Web of Science en el período 1998-2007. A partir de la exploración bibliográfica de las bases de datos Science Citation Index y Social Science Citation Index de Thomson Scientific, se obtuvieron un total de 240 registros. Para el procesamiento y representación de la información se utilizaron como herramientas los programas Ucinet, Sitkis 2.0, MS Access y MS Excel. Se emplearon indicadores métricos tradicionales y el análisis de redes de co-citación. Se identificaron los autores, instituciones, países, palabras clave y revistas más frecuentes, así como los niveles de colaboración existentes entre autores e instituciones.

Some conceptual issues on ontologies are studied. We analyzed the behavior of ontologies as a scientific domain in journals processed by Web of Science during 1998-2007. From a literature search of the Web of Science databases, using the Science Citation Index and Social Science Citation Index of the Thomson Scientific, a total of 240 records was obtained. For the handling and representation of information we used as tools the software Ucinet, Sitkis 2.0, MS Access and MS Excel display and the traditional metric indicators and network analysis of co- citation. We identified also the principal authors, institutions, countries, keywords, journals and levels of collaboration between authors and institutions.