Genomic constellations of RVA detected in Brazil from 1986 to 2016: a temporal and geographical distribution and occurrence of reassortments / Constelações genômicas de RVA detectadas no Brasil de 1986 a 2016: uma distribuição temporal e geográfica e ocorrência de rearranjos

INTRODUCTION: Species A rotavirus (RVA) infections are a major cause of severe gastroenteritis in children of <5 years worldwide. In Brazil, before vaccination, RVA was associated with 3.5 million episodes of acute diarrheal disease per year. Due to the segmented nature of their genomes, rotaviruses can exchange genes during co-infections, and generate new virus strains and new reinfections. OBJECTIVE: To evaluate the genomic diversity of RVA isolated in Brazil in 30 years, between 1986 to 2016, to investigate possible changes in the frequency of genotype constellations before and after the implementation of the vaccine. METHODS: In total, 4,474 nucleotide sequences were obtained from the Virus Variation Database. Genomic constellation was compared, and the proportion of rotavirus genotypes was analyzed by time and geographic region. RESULTS: Our results showed that major known genotypes were circulating in the country during the period under analysis, with a prevalence of the G1P[8] Wa-like genotype, decreasing only in the period immediately after the introduction of the vaccine. Regarding the geographical distribution, most of our constellations, 62 (39.2%), and 50 (31.6%) were concentrated in the North and Northeast regions. Our analysis also showed the circulation of multiple strains during the periods when the DS-1-like and AU-1-like genotypes were co-circulating with the Wa-like genotype. CONCLUSION: Therefore, it is likely that inter-genogroup reassortments are still occurring in Brazil and so it is important to establish an efficient surveillance system to follow the emergence of novel reassorted strains that might not be targeted by the vaccine.

INTRODUÇÃO: As infecções por rotavírus A (RVA) são uma das principais causas de gastroenterite grave em crianças <5 anos em todo o mundo. No Brasil, antes da vacinação, o RVA estava associado a 3,5 milhões de episódios de diarreia aguda por ano. Devido à natureza segmentada de seus genomas, os rotavírus podem trocar genes durante as coinfecções, gerar novas cepas de vírus e novas reinfecções. OBJETIVO: Avaliar a diversidade genômica de RVA isolados no Brasil entre 1986 a 2016 para investigar possíveis alterações na frequência das constelações de genótipos antes e após a implantação da vacina. MÉTODOS: No total, 4.474 sequências de nucleotídeos foram obtidas do Banco de Dados de Variação de Vírus. A constelação genômica foi comparada e a proporção dos genótipos de rotavírus foi analisada por tempo e região geográfica. RESULTADOS: Nossos resultados mostraram que os principais genótipos conhecidos circulavam no país no período em análise, com prevalência do genótipo G1P[8] Wa-like, diminuindo apenas no período imediatamente após a introdução da vacina. Em relação à distribuição geográfica, a maioria das nossas constelações, 62 (39,2%) e 50 (31,6%), concentrava-se nas regiões Norte e Nordeste. Nossa análise também mostrou a circulação de cepas múltiplas durante os períodos em que os genótipos DS-1-like e AU-1-like estavam co-circulando com o genótipo Wa-like. CONCLUSÃO: Portanto, é provável que rearranjos inter-genogrupos ainda estejam ocorrendo no Brasil e por isso é importante estabelecer um sistema de vigilância eficiente para acompanhar o surgimento de novas cepas rearranjadas que podem não ser protegidas pela vacina.

Leucemia eosinofílica crônica com expressão do rearranjo FIPILI-PDGFRa-realto ce caso e revisão da literatura / Chronic easinophilic leukemia with a FIPILI-PDGFRa fuison - case report and literature review

A eosinofilia no sangue e em tecidos está habitualmente associada a condições alérgicas, infecciosas, inflamatórias, neoplásicas, endocrinológicas, uso de medicamentos e exposição a agentes tóxicos. No entanto, pode ocorrer proliferação eosinofílica primária, sem causa aparente ou por expansão clonal da célula-tronco hematopoética. As neoplasias mielo ou linfoproliferativas associadas a rearranjos gênicos como PDGFRα, PDGFRβ e FGFR1 constituem condições raras nas quais ocorre mieloproliferação crônica, alterações no sangue periférico e na medula óssea e lesão tecidual de diferentes órgãos, a partir da liberação de citocinas e fatores humorais pelos grânulos eosinofílicos. A presença do rearranjo PDGFRα relaciona-se comumente à leucemia eosinofílica crônica, com envolvimento de mastócitos e neutrófilos e, mais raramente, à leucemia mielóide aguda ou ao linfoma linfoblástico T, com eosinofilia. O rearranjo PDGFRα mais comum é aquele resultante da deleção intersticial no braço longo do cromossomo 4, que permite a formação de um neogene a partir da fusão dos genes FIP1L1 e PDGFRα. Este codifica uma tirosino-quinase constitutivamente ativa que é inibida pelo mesilato de imatinibe. Em 2002 foi relatado o uso bem sucedido de mesilato de imatinibe em baixas doses em um paciente com síndrome hipereosinofilica e, desde então, vem-se utilizando esta droga com respostas clínicas rápidas, completas e duradouras. Descrevemos um caso de LEC com expressão do rearranjo FIP1L1-PDGFRα.

Chronic eosinophilia is habitually associated with allergic, infectious, inflammatory, neoplastic and endocrine conditions and exposure to certain drugs and toxic agents. However, eosinophilic proliferation may be primary, without identifiable causes, or provoked by clonal hematopoietic stem cell proliferation. Gene fusions involving PDGFR-α, PDGFR-β, and FGFR1 predispose patients to rare conditions with chronic myeloproliferation or lymphoproliferation, alterations in peripheral blood and bone marrow and diffuse tissue injury due to the release of cytokines and humoral factors from eosinophilic granules. The presence of the PDGFR-α rearrangement is commonly related to chronic eosinophilic leukemia, with alterations in peripheral mastocytes and neutrophils, and rarely to acute myeloid leukemia or T lymphoblastic lymphoma with eosinophilia. The most prevalent PDGFR-α rearrangement is one resulting from an interstitial deletion in the long arm of chromosome 4, that allows the formation of a neogene from the fusion of the FIP1L1 and PDGFRα genes. This codes a constitutively active tyrosine kinase, which can be inhibited by imatinib mesylate. In 2002, the successful treatment of a patient using imatinib to treat hypereosinophilic syndrome was reported. Since then, this drug has been utilized with fast, complete and lasting clinical responses. Here we describe a case of chronic eosinophilic syndrome with expression of the FIP1L1-PDGFR-α rearrangement.