Serotipos vacunales y no vacunales de Streptococcus pneumoniae en niños de Latinoamérica: revisión del último reporte SIREVA II / Vaccine and non-vaccine serotypes of Streptococcus pneumoniae in children from Latin America: a review of the last SIREVA II report

Resumen Las infecciones por Streptococcus pneumoniae se encuentran dentro de las principales causas de muerte por enfermedades inmunoprevenibles en los niños menores de cinco años. Actualmente, existen vacunas conjugadas contra diversos serotipos de S. pneumoniae, por lo que su introducción ha sido una buena estrategia para la inmunización de la población en riesgo, además de contribuir indirectamente con la disminución de la resistencia antimicrobiana. Se realizó una revisión del último reporte disponible de los serotipos de S. pneumoniae circulantes en niños menores de cinco años residentes en Latinoamérica. Los serotipos vacunales 19A, 3, 14, 1 y no vacunal 12F, fueron los más frecuentes. En Latinoamérica la implementación de la vacuna PCV13 sigue siendo una excelente opción; sin embargo, con la introducción de las vacunas conjugadas se ha visto el fenómeno de enfermedad de reemplazo evidenciado con la circulación de diversidad de serotipos no vacunales. Es necesario realizar regularmente estudios epidemiológicos en los países latinoamericanos a fin de monitorear las estrategias de vacunación y el efecto de las vacunas conjugadas en la región.

Abstract Streptococcus pneumoniae infections are among the leading causes of death from vaccine-preventable diseases in children under the age of 5. There are currently conjugated vaccines against several S. pneumoniae serotypes, thus the introduction of this type of vaccine has been a good strategy for immunizing the population at risk, in addition to indirectly contributing to the decrease in antimicrobial resistance. A review of the last available report of circulating S. pneumoniae serotypes in children under five years of age residing in Latin America was performed. Vaccine serotypes 19A, 3, 14, 1 and non-vaccine serotype 12F were the most frequent. In Latin America the implementation of the PCV13 vaccine continues to be an excellent option; however, with the introduction of conjugate vaccines, the phenomenon of replacement disease has been evidenced by the circulation of diverse non-vaccine serotypes. Epidemiological studies in Latin American countries are necessary to monitor vaccination strategies and the effect of conjugate vaccines in the region.

Estudio de algunos biomarcadores para infecciones de transmisión sexual en un centro de inclusión social venezolano: período 2013-2018 / Study of biomarkers of sexually transmitted infections in a social inclusion center in Venezuela: 2013­2018

INTRODUCCIÓN: Las infecciones de transmisión sexual (ITS) se expresan con mayor frecuencia en poblaciones marginadas, como lo son los ciudadanos que se encuentran en situación de calle y con problemas de drogadicción. MATERIALES Y MÉTODOS: Mediante un estudio de campo descriptivo retrospectivo, se determinó la prevalencia de las ITS que se detallan en los ciudadanos residentes de un Centro de Inclusión Social en Venezuela durante los años 2013 a 2018. Para ello, suero de 280 individuos fue analizado mediante la prueba ELISA de diferentes compañías biotecnológicas. RESULTADOS: 50 casos (17,8%) fueron reactivos a cualquiera de las enfermedades investigadas. El biomarcador de mayor prevalencia durante el lapso estudiado fue el antiHBc con 13,9% y las menores fueron HBsAg con 0,75%, VHC con 0,71% y Treponema pallidum con 2,85%, así como 2,14% para VIH. No se detectó ningun caso de HTLV. Del mismo modo, se observó una tasa de co-infección entre hepatitis B y VIH de 2,32%, entre hepatitis C y VIH de 1,5% y en dos años se consiguió co-infeccion de hepatitis B y Sífilis con 1,5% y 5,8% en el 2014 y 2018 respectivamente. DISCUSIÓN: Se encontró que los sujetos acogidos en el Centro de Inclusión Social son un grupo vulnerable a las ITS y las coinfecciones, por lo que deben llevarse a cabo campañas de preven-ción y pruebas de detección de estas enfermedades en dicha población.

INTRODUCTION: Sexually Transmitted Infections (STIs) are most frequently expressed in marginalized populations, such as as homeless individuals or those with substance abuse issues. MATERIALS AND METHODS: Through a retrospective descriptive study, the prevalence of various STDs was determined among residents of a Social Inclusion Center in Venezuela from 2013 to 2018. For this purpose, serum from 280 individuals were analyzed with ELISA tests from different biotech companies. RESULTS: 50 cases (17.86%) were sero-reactive to any of the STIs investigated. The most preva-lent biomarker during the study period studied was antiHBc (13.9%) and the lowest prevalen-ces were HBsAg with 0.75%, HCV with 0.71%, and Treponema pallidum with 2.85%, as well as 2.14% for HIV. No cases of HTLV were detected. Similarly, there was coinfection between hepatitis B and HIV in 2.32% of cases, between hepatitis C and HIV in 1.5%, and between syphillis and hepatitis in 1,5% and 5,8% of cases (in 2014 and 2018 respectively). DISCUSSION: Individuals in Centers for Social Inclusion are at risk of presenting STIs and co-infections; therefore, STI prevention campaigns and screenings should be conducted in this vulnerable group.

Caracterización genética de cepas de Listeria monocytogenes aisladas durante los años 2007-2014 en Chile / Genetic characterization of Listeria monocytogenes strains isolated during 2007-2014 in Chile

Resumen Introducción: Listeria monocytogenes es un patógeno transmitido por alimentos que causa listeriosis, una enfermedad que puede presentarse como gastroenteritis febril o en una forma invasora que tiene altas tasas de mortalidad. Hasta el momento, ha sido poco estudiada la diversidad genética de cepas de L. monocytogenes aisladas desde pacientes, alimentos y fuentes ambientales en Chile. Objetivo: Caracterizar genéticamente cepas de L. monocytogenes de estos tres orígenes recibidas por el Instituto de Salud Pública de Chile (ISP) entre los años 2007 y 2014. Material y Métodos: Se seleccionaron 94 cepas de L. monocytogenes correspondientes a 94 pulsotipos diferentes identificados por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), se extrajo ADN y se realizó serotipificación mediante reacción de polimerasa en cadena (RPC) y tipificación de secuencias multilocus (MLST). Resultados: El serotipo más común fue 4b (55,3%), seguido de 1/2a (25,5%), 1/2b (17%) y 1/2c (2,2%). Se identificaron 32 secuencias tipo (ST), de las cuales cuatro fueron nuevas, y las predominantes fueron ST1 (28,7%) y ST2 (13,8%). La totalidad de las cepas se agrupó en los Linajes I y II. Conclusiones: Se observó una gran variabilidad genética en las cepas de L. monocytogenes analizadas, siendo predominantes las secuencias tipo ST1 y ST2, ambas pertenecientes al Linaje I. Nuestros resultados contribuyen a conocer la estructura poblacional de este patógeno en Chile y su presencia en muestras clínicas, alimentos y el medio ambiente.

Background: Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen that causes listeriosis, a disease that can present as febrile gastroenteritis or as an invasive form that has high mortality rates. So far, the genetic diversity of strains of L. monocytogenes isolated from patients, foods and environmental sources in Chile has been poorly studied. Aim: To characterize genetically L. monocytogenes strains received by the Institute of Public Health of Chile (ISP) between 2007 and 2014. Methods: We selected 94 strains of L. monocytogenes corresponding to 94 different pulsotypes identified by pulsed field gel electrophoresis (PFGE), DNA was extracted and serotyping was performed by polymerase chain reaction (PCR) and multilocus sequence typing (MLST). Results: The most common serotype was 4b (55.3%), followed by serotypes 1/2a (25.5%), 1/2b (17%) and 1/2c (2.2%). 32 sequence-type (ST) were identified, of which 4 were new, and the predominant ones were ST1 (28.7%) and ST2 (13.8%). All the strains of L. monocytogenes were grouped in Lineages I and II. Conclusions: A great genetic variability was observed in the strains of L. monocytogenes analyzed, being predominant the ST1 and ST2, both belonging to Lineage I. Our results contribute to know the population structure of this pathogen in Chile and its presence in clinical samples, food and the environment.

Perfil de resistencia a antibióticos de serotipos de Salmonella spp. aislados de carne de res molida en la Ciudad de México / Antibiotic of resistence profile of Salmonella spp. serotypes isolated from retail beef in Mexico City

Resumen: Objetivo: Determinar el serotipo y perfil de resistencia a antibióticos de cepas de Salmonella spp. presentes en la carne de res que se expende en la capital mexicana. Material y métodos: Se analizaron 100 muestras de carne molida. Se aisló el patógeno por métodos convencionales y se confirmó por PCR (gen InvA, 284 pb). El perfil de resistencia a antibióticos se determinó por el método de Kirby-Bauer y la serotipificación por el esquema de Kauffman-White. Resultados: Se detectaron los serotipos Lomita (6), Derby (4), Senftenberg (2), Javiana y Cannsttat (1). Se observó alta resistencia a ampicilina (18/19), carbenicilina (16/19), tetraciclina (13/19) y trimetoprim-sulfametoxasol (13/19). Cinco cepas fueron no tipificables y 14 mostraron multirresistencia. Conclusiones: La carne de res que se vende en el principal centro de consumo del país está contaminada con serotipos de Salmonella spp. relevantes para la salud pública. Una importante proporción de éstos es resistente a múltiples antibióticos.

Abstract: Objective: To determine the serotype and antibiotic resistance profile of Salmonella spp. isolated from retail ground beef in Mexico City. Materials and methods: A total of 100 samples of ground beef were analyzed. The pathogen was isolated by conventional methods and confirmed by PCR (invA gene, 284 bp).The antibiotic resistance profile was determined by the Kirby-Bauer method while serotyping was performed according to the Kauffman-White scheme. Results: We isolated a total of 19 strains of Lomita (6), Derby (4), Senftenberg (2), Javiana and Cannsttat (1) and undetermined (5) serotypes. The strains showed a high resistance rate to ampicillin (18/19), carbenicillin (16/19), tetracyclin (13/19), and trimethoprim-sulfamethoxazole (13/19). Multidrug resistance was observed in 14 isolates. Conclusions: Several Salmonella spp. serotypes of public health significance are circulating in ground beef sold in the major Mexican city. Some of these strains are multi-drug resistance.

Characterization of Salmonella species from pork meat in Tolima, Colombia / Caracterización de las especies de Salmonella en carne porcina en Tolima, Colombia / Caracterização de espécies de Salmonella a partir de carne de porco em Tolima, Colômbia

Background: Salmonella is a Gram-negative bacterium and the principal cause of human gastroenteritis that originates from the consumption of animal products.Objective: to determine serotype and antibiotic resistance of Salmonella spp. isolated from pork meat and environmental samples in 6 slaughterhouses and 14 butcheries in Tolima, Colombia. Methods: slaughterhouses and butcheries were selected depending on their slaughter capacity and compliance with good manufacturing practices. Samples (n = 507) were taken from carcasses, the environment, and fomites (i.e., surfaces of knives, hooks, floor, siphons, work surfaces, and transport trucks), then cultured in Salmonella selective media. Following this, the isolated Salmonella spp. was identified using a conventional biochemical test and genus antiserum (Poli A + Vi). The Kauffman-Whyte scheme was used for serotyping and the agar diffusion method (Kirby-Bauer) was used to determine antibiotic sensitivity. Results:Manhattan, Derby, Typhimurium, Javiana, Muenster, Hvittingfoss, Sinsfort, Kattbus, and Saint Paul serotypes of Salmonella were isolated from both pork meat and environmental samples, being Derby the most common serotype. Salmonella isolates showed antibiotic multiresistance mainly to tetracycline, lincomycin and nalidixic acid. Conclusion: several Salmonella serotypes are present in slaughterhouses and meat samples from butcheries, and they show similar antibiotic resistance patterns. This work represents the first report on Salmonella serotypes in slaughterhouses and pork meat from butcheries in Tolima, Colombia.

Antecedentes: Salmonella es una bacteria Gram-negativa y la principal causa de gastroenteritis en humanos transmitida por consumo de alimentos de origen animal.Objective: determinar el serotipo y la resistencia antibiótica de Salmonella spp. aisladas de carne porcina y muestras ambientales en 6 plantas de beneficio y 14 expendios en Tolima, Colombia. Métodos:las plantas de beneficio y los expendios fueron seleccionados dependiendo del volumen de animales sacrificados y el establecimiento de las buenas prácticas de manufactura. Las muestras (n = 507) fueron tomadas de las carcasas, ambiente y fómites (i.e. superficie de cuchillos, ganchos, piso, sifones, mesones y camiones de transporte), cultivadas en medios de cultivo selectivos para Salmonella. Las Salmonella spp., aisladas fueron identificadas mediante purnas bioquímicas convencionales y antisuero de género (Poli A + Vi). La sero-tipificación fue llevada a cabo a través del esquema Kauffman-Whyte y la sensibilidad antibiótica a través del método de difusión en agar (Kirby-Bauer).. Resultados: fueron aislados los serotipos de Salmonella Manhattan, Derby, Typhimurium, Javiana, Muenster, Hvittingfoss, Sinsfort, Kattbus y Saint Paul tanto de carne porcina como muestras ambientales, siendo el serotipo Derby el más frecuente. Los aislamientos mostraron patrones de multi-resistencia antibiótica, principalmente a tetraciclina, lincomicina y ácido nalidíxico. Conclusión: diversos serotipos de Salmonella fueron aislados de muestras de plantas de beneficio y expendios de carne porcina y estos demostraron patrones similares de resistencia antibiótica. Este trabajo representa el primer reporte de serotipos de Salmonella en plantas de beneficio y expendios de carne porcina en Tolima, Colombia.

Antecedentes: a Salmonella é uma bactéria Gram-negativa e causa principal de gastroenterite humana transmitida por consumo de produtos de origem animal. Objetivo: determinar o serotipo e de resistência a antibióticos de Salmonella spp. isolada a partir de carne de porco e amostras ambientais em 6 frigoríficos e lojas 14 açougues em Tolima, Colômbia. Métodos: abatedouros e açougues foram selecionados de acordo com o volume de animais sacrificados eo estabelecimento de boas práticas de manufatura. As amostras (n = 507) foram retirados de cadáveres, meio ambiente e fômites (ou seja, superfícies de facas, ganchos, piso, sifões, mésons e caminhões de transporte), cultivadas em meios de cultura de Salmonella seletiva e a isolada Salmonella spp., foram identificados usando e anti-soro de teste género bioquímica convencional (Poli A + Vi). A sorotipagem foi realizada utilizando esquema de Kauffman-Whyte e teste de sensibilidade aos antibióticos foi feito pelo método de difusão em ágar (Kirby-Bauer). Resultados: ''o'' sorotipos de Salmonella de Manhattan,= o surotipos de Salmonella Derby, Typhimurium, Javiana, Muenster, Hvittingfoss, Sinsfort, Kattbus e Saint Paul foram isolados de ambas as carnes de porco e amostras ambientais, sendo o sorotipo Derby o mais frequente. Os isolados de Salmonella apresentaram padrões de multirresistência aos antibióticos, principalmente para tetraciclina, lincomicina e ácido nalidíxico. Conclusão: vários sorotipos de Salmonella estão presentes em matadouros e lojas amostras de carne de porco de talho e mostram padrões similares de resistência a antibióticos. Este trabalho representa o primeiro relato de sorotipos de Salmonella em abatedouros e açougues de carne de porco em Tolima, Colômbia.

Antisuero AA479: nuevo reactivo para la serotipificación de variantes atípicas se Shigella flexneri / AA479 antiserum: new reagent for the serotype characterization of atypical variants of Shigella flexneri

Shigella flexneri is divided into 13 serotypes based on the combination of antigenic determinants present in the O-antigen. A new O-antigen modification with phosphoethanolamine has been identified. The presence of this antigenic determinant (called E1037) is recognized by monoclonal antibody MASF IV-1. Given the increasing incidence of these new variants and the difficulty in supplying the monoclonal antibody to our country, we produced a polyclonal antiserum (AA479) through immunization with a S. flexneri Xv strain. The antiserum specificity was assessed by slide agglutination against isolates from clinical cases and a culture collection representing all Shigella serotypes. The results obtained demonstrated a 100% correlation between AA479 absorbed antiserum and monoclonal antibody MASF IV-1. The availability of AA479 antiserum in every public hospital in Argentina will allow us to identify atypical S. flexneri isolates in order to strengthen Shigella surveillance in our country and to compare with global epidemiological dat

Shigella flexneri se divide en al menos 13 serotipos sobre la base de la combinación de determinantes antigénicos presentes en el antígeno O. Se identificó una nueva modificación del antígeno O con fosfoetanolamina. La presencia de este determinante antigénico (denominado E1037) es reconocida por el anticuerpo monoclonal MASF IV-1. Teniendo en cuenta la incidencia creciente de estas nuevas variantes y la dificultad en la provisión del anticuerpo monoclonal para nuestro país, se elaboró un antisuero de tipo policlonal (AA479) mediante la inmunización con un cultivo de S. flexneri Xv. La especificidad del antisuero se evaluó por aglutinación en lámina con aislamientos clínicos y cultivos de colección, con lo que quedaron representados todos los serotipos de Shigella. Los resultados obtenidos demostraron una correlación del 100% entre el antisuero AA479 absorbido y el anticuerpo monoclonal MASF IV-1. La disponibilidad del antisuero AA479 en todos los hospitales públicos de Argentina permitirá identificar los aislamientos atípicos de S. flexneri; de esta forma se podrá fortalecer la vigilancia de Shigella en nuestro país y comparar con los datos epidemiológicos a nivel global

Caracterización fenotípica y genotípica de Salmonella Typhimurium variante 5- asociada a un brote de enfermedad transmitida por alimentos en el municipio de Paz de Río, Boyacá, 2010 / Phenotypic and genotypic characterization of Salmonella Typhimurium variant 5- isolates associated with an outbreak of food-borne disease in Paz de Rio, Boyacá, Colombia, in 2010

Introducción: Salmonella enterica serotipo Typhimurium variante 5- es un patógeno muy relacionado con animales, especialmente con palomas, y asociado en pocos casos con infecciones esporádicas en humanos. Sin embargo, los sistemas de vigilancia epidemiológica han permitido detectarla en brotes en humanos. Objetivo: caracterizar por técnicas fenotípicas y genotípicas los aislamientos de Salmonella Typhimurium variante 5- asociados a un brote de enfermedad transmitida por alimentos (ETA) en el municipio de Paz de Río, Boyacá, en el 2010. Materiales y métodos: doce aislamientos de Salmonella spp., fueron remitidos para confirmación bioquímica, identificación del serotipo y perfil de susceptibilidad antimicrobiana. Se analizaron genotípicamente por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) con las enzimas Xbal y Blnl. Resultados: todos los aislamientos se confirmaron como Salmonella spp., y presentaron resistencia a tetraciclina y estreptomicina y sensibilidad a los demás antibióticos ensayados; 11/12 se identificaron como Salmonella Typhimurium variante 5- y mostraron en la PFGE el patrón COIN10.JPX.X01.0168 con la enzima XbaI y dos aislamientos de este mismo grupo se confirmaron con la enzima BlnI obteniendo el patrón de PFGE COIN10.JPX.A26.0002. El aislamiento restante se identificó como Salmonella Typhimurium con patrón de PFGE con la enzima Xbal COIN10.JPX.X01.0221. Conclusión: se reporta por primera vez en Colombia un brote de ETA asociado epidemiológicamente con aislamientos de Salmonella Typhimurium variante 5- que estuvieron relacionados fenotípica y genéticamente.

Introduction: Salmonella enterica serotype Typhimurium variant 5- is a pathogen closely related to animals, especially pigeons, which has been also associated in rare cases with sporadic infections in humans. However, epidemiological surveillance systems have enabled the detection of this variant in human outbreaks. Objective: To characterize by means of phenotypic and genotypic techniques the isolates of Salmonella Typhimurium variant 5- associated with an outbreak of food-borne disease in Paz de Rio, Boyacá, Colombia (2010), in order to establish their molecular relationships. Materials and methods: Twelve isolates of Salmonella spp., were analyzed by biochemical, serotyping and antimicrobial susceptibility tests. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) with XbaI and Blnl enzymes was used to establish their molecular relationships. Results: All isolates were confirmed as Salmonella spp. They were resistant to tetracycline and streptomycin and sensitive to the rest of antibiotics tested. Eleven isolates were identified as Salmonella Typhimurium variant 5- and grouped in COIN10.JPX.X01.0168 pattern using the enzyme XbaI; two isolates in this group were confirmed using the enzyme BlnI with the COIN10. JPX.A26.0002 pattern. One isolate was identified as Salmonella Typhimurium with COIN10.JPX.X01.0221 pattern with the enzyme XbaI. Conclusion: This is the first outbreak in Colombia of foodborne illness epidemiologically associated with isolates of Salmonella Typhimurium variant 5 -, which were phenotypically and genetically related.

Brote de Salmonella Enteritidis resistente a ácido nalidíxico en Popayán, Cauca, 2011 / A nalidixic acid-resistant Salmonella Enteritidis outbreak in Popayán, Cauca, 2011

Introducción. Salmonella Enteritidis es reconocida a nivel mundial como uno de los principales agentes de infección gastrointestinal. Varios reportes indican la presencia de aislamientos con sensibilidad disminuida a la ciprofloxacina que puede conllevar a una respuesta retardada o al desarrollo de resistencia durante el tratamiento. Objetivo. Describir y caracterizar los aislamientos de Salmonella Enteritidis asociados a un brote de enfermedad transmitida por alimentos en Popayán, Cauca. Materiales y métodos. Se analizaron 10 aislamientos de Salmonella Enteritidis, nueve de pacientes y uno de alimentos (emparedado de pollo), por pruebas bioquímicas, serotipificación y sensibilidad antimicrobiana. La concentración inhibitoria mínima a la ciprofloxacina se determinó por E-test y el perfil genético de los aislamientos se evaluó por electroforesis en gel de campo pulsado (Pulsed Field Gel Electrophoresis, PFGE) con las enzimas Xbal y Blnl. Resultados. En todos los aislamientos se identificó Salmonella Enteritidis con resistencia al ácido nalidíxico y sensibilidad disminuida a la ciprofloxaxina entre 0,25 y 0,5 µg/ml; todos fueron sensibles a los demás antimicrobianos ensayados. La PFGE agrupó los 10 aislamientos con la enzima Xbal en el patrón COIN11.JEG.X01.0038 y siete aislamientos se confirmaron con la enzima BlnI con el patrón COIN11.JEG.A26.0009. Conclusión. Se reporta por primera vez en Colombia un brote de Salmonella Enteritidis con resistencia al ácido nalidíxico y se confirma por análisis fenotípico y genotípico la asociación entre los aislamientos de los pacientes con el del emparedado de pollo como la fuente de infección.

Introduction. Salmonella Enteritidis is recognized worldwide as one of the main agents of human gastrointestinal infection. Several reports indicate the presence of isolates with decreased sensitivity to ciprofloxacin that can lead to a delayed response or the development of resistance during treatment. Objective. To describe and characterize isolates of Salmonella Enteritidis associated to an outbreak of food-borne diseases in Popayán, Cauca. Materials and methods. Ten Salmonella Enteritidis isolates from nine patients and one food sample (chicken sandwich) were analyzed by biochemical tests, serotyping and antimicrobial sensitivity. The minimum inhibitory concentration to ciprofloxacin was determined by E-test and the genetic profile of the isolates was tested by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) with XbaI and Blnl enzymes. Results. Salmonella Enteritidis was identified in all isolates. They were resistant to nalidixic acid and had a decreased sensitivity to ciprofloxaxin between 0.25 and 0.5 µg/ml; all isolates were sensitive to all the other antimicrobials we tested. Ten isolates were grouped by PFGE with the XbaI enzyme in the COIN11.JEG.X01.0038 pattern, and seven isolates were confirmed with the BlnI enzyme using the COIN11.JEG.A26.0009 pattern. Conclusion. We report for the first time an outbreak of nalidixic acid-resistant Salmonella Enteritidis in Colombia and confirmed by phenotypic and genotypic analysis the association between the isolates from patients and the chicken sandwich as the source of infection.

Serotipos de neumococo en niños portadores antes de la vacunación antineumocócica en el Perú / Pneumococcal serotypes in carrier children prior to the introduction of anti-pneumococcal vaccines in Peru

Objetivos. Determinar la frecuencia y distribución de serotipos de S. pneumoniae en portadores nasofaríngeos sanos menores de dos años previa al uso universal de la vacuna conjugada antineumocócica en el Perú. Materiales y métodos. Entre los años 2007 y 2009 se tomaron muestras de hisopado nasofaríngeo a 2123 niños sanos entre 2 y 24 meses de edad en los consultorios de crecimiento y desarrollo o vacunación de hospitales y centros de salud de siete ciudades del Perú: costa (Lima, Piura); sierra (Cusco, Abancay, Arequipa y Huancayo) y selva (Iquitos). Las cepas de neumococo fueron aisladas e identificadas en el laboratorio central del proyecto en Lima y serotipificadas por reacción de Quellung en el Laboratorio de Referencia de Neumococo del Centro de Control y Prevención de Enfermedades. Resultados. Se encontró 27,0% (573/2123) de portadores nasofaríngeos sanos de neumococo. En las 526 cepas analizadas se encontraron 42 serotipos; los más frecuentes fueron: 19F (18,1%), 6B (14,3%); 23F (8,9%) y 14 (6,5%). Conclusiones. La distribución de serotipos vacunales en las cepas analizadas fue de 50,0% para los serotipos presentes en la vacuna conjugada heptavalente; 50,2% para los serotipos presentes en la vacuna decavalente y 57,2% para la vacuna 13-valente.

Objectives. To determine the carriage rate and serotype distribution of Streptococcus pneumoniae in the nasopharynx of healthy children younger than 2 years prior to the universal use of the pneumococcal conjugate vaccines in Peru. Materials and methods. Between 2007 and 2009 we collected nasopharyngeal swab samples from 2,123 healthy children aged 2 to 24 months in the vaccination and healthy children consultation offices of pediatric hospitals and health centers in 7 cities in Peru: on the coast (Lima, Piura), highlands (Cusco, Abancay, Arequipa and Huancayo) and amazon basin (Iquitos). The pneumococcal strains were isolated and identified at the central laboratory of the project in Lima, and serotyped by Quellung reaction in the pneumococcal reference laboratory at the Center for Diseases Control and Prevention (CDC). Results. We found 27% (573/2123) of pneumococcal nasopharyngeal healthy carrier children. Among the 526 analyzed strains, we found 42 serotypes; the most common were: 19F (18.1%), 6B (14.3%); 23F (8.9%) and 14 (6.5%). Conclusions. The distribution of vaccine serotypes in the analyzed strains was of 50% for the serotypes present in the seven-valent vaccine, 50.2% for the serotypes present in the ten-valent vaccine and 57.2% for those present in the thirteen-valent vaccine.

Genotipificación y resistencia antibacteriana de cepas de Campylobacter spp aisladas en niños y en aves de corral / Genotyping and antibacterial resistance of Campylobacter spp strains isolated in children and in free range poultry

Poultry is a main reservoir and source of human infection in campylobacteriosis. Three hundred and forty one stool samples (291 human, 50 avian) were analyzed. In the human group, 220 samples were collected from children with acute diarrheal disease (183 inpatients, 37 outpatients) and 71 from healthy children. Erythromycin and ciprofloxacin agar dilution MIC tests, Penner serotyping and RAPD-PCR genotyping were performed on 23 strains isolated. C. jejuni was reported only in patients with acute diarrhea (5.4 percent inpatients, 2.2 percent outpatients). Campylobacter prevalence in poultry was 34 percent. Cross-resistance to nalidixic acid and ciprofloxacin was found in 33.3 percent of human samples and 11.8 percent of animal samples. Human samples could not be typed using the Penner method. F serotype was the most expressed in poultry. We obtained a total of 14 genotypes (4 / 5 human and 10/15 avian). In conclusion, the predominant species in poultry and humans was C. jejuni, a significant amount of quinolone-resistant human and avian samples were obtained, and avian genotypes and serotypes were not found in human samples. The latter would mean that another source of infection could exist; therefore other reservoirs must be studied.

Las aves de consumo constituyen uno de los principales reservorios y fuente de infección humana de la campilo-bacteriosis. Se analizaron 341 muestras de deposiciones, 291 humanas y 50 aviares. De las muestras, 220 de niños con síndrome diarreico agudo-SDA (183 hospitalizados y 37 consultantes ambulatorios) y 71 niños sanos. A las 23 cepas obtenidas se les realizó CIM por dilución en agar a eritromicina y ciprofloxacina, serotipificación de Penner y genotipiicación por RAPD-PCR. Se encontró Campylobacterjejuni sólo en pacientes con SDA, de ellos 5,4 por ciento ambulatorios y 2,2 por ciento hospitalizados. En aves, la prevalencia de Campylobacter spp., fue de 34 por ciento. Hubo resistencia cruzada a ácido nalidixico y ciprofloxacina en 33,3 por ciento cepas de origen humano y 11,8 por ciento animal. Las cepas humanas fueron no tipiicables por el método de Penner. Predominó entre las aves el serotipo F. Se obtuvo un total de 14 genotipos (4/5 humanos y 10/15 aviares). En conclusión, la especie predominante en aves de corral y en humanos fue C. jejuni, existiendo una alta prevalencia de cepas de origen humano y aviar resistentes a quinolonas. Los genotipos y serotipos aviares no fueron encontrados en cepas de origen humano, lo que indica que podría existir otra fuente de infección, por lo que se requiere estudiar otros reservorios.

Prevalencia del Streptococcus agalactiae en maternas usuarias del Hospital Militar Central: Bogotá, (Colombia) año 2010 / The prevalence of Streptococcus agalactiae in pregnant women attending the Hospital Militar Central: Bogota, Colombia, 2010

Objetivo: establecer la prevalencia del Streptococcus agalactiae en gestantes que asisten al servicio de medicina materno fetal del Hospital Militar Central en el periodo comprendido entre enero 15 de 2010 y septiembre 15 de 2010. Materiales y métodos: estudio observacional descriptivo de corte transversal en gestantes con edad gestacional entre 35 y 37,6 semanas, del Hospital Militar Central de Bogotá. Muestreo por conveniencia de 130 gestantes. Previo consentimiento informado, se realizó hisopado para la toma de muestras del introito vaginal y ampolla rectal, las cuales se incubaron durante 24 horas. Se realizó serotipificación y prueba de susceptibilidad antibiótica a los aislamientos de bilis esculina negativo y la prueba de CAMP (Christie, Atkins, Munch y Petersen) positivo. Los datos de las gestantes incluidas en el estudio, junto con los resultados de cultivo, fueron organizados en una base de datos de Excel® y posteriormente se realizó un análisis descriptivo de variables sociodemográficas y positividad para el aislamiento de S. agalactiae. Resultados: la edad materna promedio fue 28±6,76 años. De un total de 260 muestras analizadas correspondientes a las 130 gestantes, solo una muestra resultó positiva para Streptococcus agalactiae serotipo Ia (0,38%), correspondiente a una gestante de 37 semanas procedente de Bogotá, con un perfil de susceptibilidad que manifestó resistencia a ampicilina y vancomicina, y sensibilidad a cefalotina, ceftriaxona, eritromicina y clindamicina. Conclusiones: la prevalencia reportada es baja para la población de este estudio, por esta razón es cuestionable realizar el tamizaje de rutina para el Streptococcus agalactiae a las maternas que consultan al Hospital Militar Central...

Objective: establishing the prevalence of Streptococcus agalactiae in pregnant women attending the Hospital Militar Central’s maternal/fetal medicine service from January 15th 2010 to September 15th 2010. Materials and methods: this was a cross-sectional descriptive study of women with pregnancies lasting 35 to 37.6 weeks, attending the Hospital Militar Central in Bogotá. Sequential sampling of 130 expectant mothers was used. Once they had signed their informed consent forms, swabs were taken for samples of vaginal introit and rectum. Samples were incubated for 24 hours. The isolates were serotyped and subjected to antibiotic susceptibility tests: bile esculin agar negative and Christie-Atkins-Munch-Petersen (CAMP) test positive. A descriptive analysis of the sociodemographic variables was made and S. agalactiae isolates tested for positivity. Results: average expectant mothers’ age was 28±6.76 years. Only one simple proved positive for Streptococcus agalactiae serotype 1a (0.38%) from a total of 260 samples taken from 130 expectant mothers; that isolation came from a 37-week pregnant woman from Bogotá, having a susceptibility profile showing resistance to ampicillin and vancomycin and sensitivity to cefalotin, ceftriaxone, erythromycin and clindamycin. Conclusions: the prevalence reported in this study was low for the target population. Carrying out routine screening for Streptococcus agalactiae on expectant mothers attending the Hospital Militar Central is thus questionable...

Aislamiento y serotipificación de Salmonella sp. en estanques con Crocodylus intermedius y testudines cautivos en Villavicencio - Colombia / Isolation and serotyping of Salmonella sp. in ponds with captive Crocodylus intermedius and testudines in Villavicencio – Colombia

Objetivo. Determinar la presencia de microorganismos del género Salmonella sp. en el ambiente acuático de los ejemplares Crocodylus intermedius y testudines en la Estación de Biología Tropical Roberto Franco (EBTRF). Materiales y métodos. En este estudio se utilizó la metodología estándar para aislar e identificar microorganismos del género Salmonella sp., a partir de muestras de agua y sedimento de 52 estanques (nEstanques Crocodylus=25; nEstanques testudines=27); se procedió a serotipificar los aislamientos por el método convencional de Kaufmann-White y se realizaron pruebas de sensibilidad a antimicrobianos por la técnica de Kirby Bauer. Resultados. Se determinó la presencia de Salmonella sp., en un 33% del total de estanques muestreados. El 29% de los aislamientos de Salmonella sp. serotipificados, correspondió al serogrupo B; los serogrupos C, C1, C2 y D1 presentaron menores porcentajes. Con las pruebas de sensibilidad a antimicrobianos se determinó que el 100% de los aislamientos fueron sensibles a norfloxacina. Conclusiones. La ocurrencia de Salmonella sp., en los estanques de la EBTRF fue del 33%, con la mayor presencia del serogrupo B, donde se encuentran especies con características ampliamente zoonóticas. Con los resultados obtenidos es necesario el seguimiento de las normas de bioseguridad establecidas en la estación para el manejo de las poblaciones allí mantenidas y evitar de esa manera la ocurrencia de cuadros zoonóticos.

Streptococcus pneumoniae serotypes isolated from the middle ear of Mexican children diagnosed with acute otitis media / Serotipificación de Streptococcus pneumoniae aislados de líquido de oído medio en niños mexicanos con diagnóstico de otitis media aguda

OBJECTIVE: The aim of this study was to identify the etiology and the serotypes of S. pneumoniae (Sp) in Mexican children with acute otitis media (AOM). MATERIALS AND METHODS: The study includessamples frompatientsdiagnosed with AOM at the Federico Gomez Children's Hospital of Mexico (2002-2003),with positive culture for Sp bacteriologically confirmed in middle ear fluid obtained by tympanocentesis. All Sp were serotyped. A total of 138 samples from 135 children with AOM were included. RESULTS: Sp was isolated in 72 samples from 70 children. Sixty (85.7 percent) were previously healthy and 10 (14.3 percent) were immunocompromised. The most common serotypes were 6B and 19F (16.67 percent), and 6 A, 14 and 23F (15.27 percent). CONCLUSION: The distribution of serotypes among the children with AOM in the study is similar to that reported in developing cities, and 63.9 percent of the isolated serotypes are found to be included in the 7-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccine (PCV), 68.1 percent in the 10-Valent PCV and 83.3 percent in 13-Valent PCV.

OBJETIVO: Conocer la etiología y serotipos de S. pneumoniae (Sp) en niños mexicanos, con otitis media aguda (OMA). MATERIAL Y MÉTODOS: Se incluyeron las muestras de pacientes con OMA del Hospital Infantil de México Federico Gómez (2002-2003), con cultivo positivo para Sp, (bacteriológicamente confirmados en el líquido del oído medio obtenido por timpanocentesis). Todos los Sp. fueron serotipificados. Se incluyeron 138 muestras de 135 niños con OMA. RESULTADOS: Sp. se aisló en 72 muestras de 70 niños: 60 (85.7 por ciento) eran previamente sanos y 10 (14.3 por ciento) eran inmunocomprometidos. Los serotipos más frecuentes fueron 6B y 19F (16.67 por ciento), y 6 A, 14 y 23F (15.27 por ciento). CONCLUSIONES: La distribución de los serotipos en niños con otitis media aguda fue similar a la reportada en ciudades en desarrollo y se observó que 63.9 por ciento de los serotipos aislados están incluidos en la vacuna conjugada 7-valente, 68.1 por ciento en la 10-valente y 83.3 por ciento en la 13-valente.

Caracterización microbiológica de Salmonella en alimentos de venta callejera en un sector universitario de Bogotá, Colombia. Julio a octubre de 2010 / Microbiological characterization of Salmonella in Street-vended foods an university sector in Bogotá, Colombia. july-october 2010

Introducción. Salmonella spp. perteneciente a la familia Enterobacteriaceae, es uno de los principales microorganismos implicados en las enfermedades transmitidas por alimentos. La infección conocida como salmonelosis se puede manifestar como dos procesos patológicos diferentes, la fiebre tifoidea o la gastroenteritis. El objetivo de esta investigación fue demostrar la presencia de Salmonella spp. en alimentos de venta callejera en un sector universitario delimitado de la ciudad de Bogotá y su posterior caracterización por medio de técnicas de microbiología clínica. Materiales y Métodos. Estudio observacional descriptivo de corte transversal. Se recolectaron 42 muestras de alimentos en ventas callejeras a través de un muestreo no probabilístico. Para el aislamiento y caracterización de Salmonella spp. se realizó el método propuesto por la Food and Drug Administration, empleando pruebas bioquímicas, de serotipificación para Salmonella spp. y realizando la prueba de susceptibilidad antimicrobiana. Resultados. Se detectó crecimiento microbiano en un total de 18 muestras (42,9%), de las cuales solo dos fueron positivas por serotipificación para Salmonella entérica con un 11,1%, 11 de estas 18 muestras fueron positivas para otras bacterias pertenecientes a la familia Enterobacteriaceae (61,1%) y cinco muestras no pudieron ser identificadas (27,8%). Las cepas sometidas a antibiograma fueron susceptibles a Ciprofloxacina, y resistentes al Trimetoprim-Sulfametoxazol, Cloramfenicol y Ampicilina. Conclusiones. Esta investigación permitió identificar la presencia de Salmonella enterica y otras enterobacterias en alimentos de venta callejera, lo cual puede representar un alto riesgo para la salud de los habitantes y la población estudiantil de un sector universitario en Bogotá, Colombia...

Introduction. Salmonella belongs to the Enterobacteriaceae family, and is one of the main microorganisms involved in foodborne disease. It produces a clinical entity known as salmonelosis can manifest as two different pathological processes, typhoid fever or gastroenteritis. The objective of this research was to demonstrate the presence of Salmonella spp. in street-vended foods in an area bounded by Universities in the city of Bogotá and its subsequent characterization by means of clinical microbiology techniques. Materials and Methods. Observational cross sectional study. Was analyze 42 samples of street-vended foods obtained through a non-probability sampling, the isolation of Salmonella spp. was performed following the method proposed by the Food and Drug Administration, performing biochemical identification and serological tests for Salmonella spp. and antimicrobial susceptibility testing. Results. Growth was detected in a total of 18 samples (42.9%), of which only 2 were positive for Salmonella enterica with a 11.1%, 11 out of 18 samples were positive for other bacteria belonging to the family Enterobacteriaceae (61.1%) and 5 samples without profile identified (27.8%). The samples tested were susceptible to ciprofloxacin susceptibility, showing resistance to Trimethoprim-Sulfamethoxazole, Chloramphenicol and Ampicillin. Conclusions. This investigation established the presence of Salmonella enterica and other Enterobacteriaceae in street-vended foods, showing a high risk to the health of residents and student population of a university sector in the city of Bogotá, Colombia...

Evolución de los serotipos, fagotipos y resistencia a antimicrobianos de Salmonella sp en el departamento de salud 02 de la provincia de Castellón, España (2000-2006) / Evolution of serotypes, phagotypes and antibiotic resistance of Salmonella spp in the 02 health district of Castellón, Spain (2000-2006)

Retrospective study of serotypes, phage types and antibiotic resistance of Salmonella spp isolates in the 02 Health District of Castellón, Spain (2000-2006). Strains were serotyped using commercial sera, and they were tested for antimicrobial susceptibility with automated systems. Serotyping confirmation and phage typing were performed by the National Reference Laboratory. A total of 1505 strains were isolated, with 49 different serotypes, being the most frequent Enteritidis. The most common serotype/phage type combination was S. Enteritidis phagetype 1. Of the isolates 81.6 percent were susceptible to amoxicillin/clavulanic acid; 65.2 percent to ampicilin; 99.9 percent to ciprofloxa-cin; 93.4 percent to trimethoprim-sulphametoxazole; and 99.8 percent to cefotaxime. Molecular methods could be useful to complete epidemiologic studies since 25 percent of our isolates showed the same serotype/phage type combination. In our health district antimicrobial resistance in Salmonella is not an important problem.

Serotypes and susceptibility of Streptococcus pneumoniae strains isolated from children in Mexico / Serotipos y susceptibilidad de cepas de Streptococcus pneumoniae aisladas de niños en México

Objective. To identify serotypes and susceptibility of S. pneumoniae strains from 48 children with invasive infections and 50 carriers. Material and Methods. Typing was performed by the Quellung reaction and susceptibility by Kirby-Bauer and Etest according to CLSI standards. Results. Of 31 meningeal strains, serotypes 19F, 3, 6B, 14 and 23F were predominant. Resistance to penicillin and STX was 16 and 58 percent, respectively; of 17 invasive non-meningeal strains, serotypes 19F and 3 were predominant and resistance to penicillin and SXT was 0 and 82 percent, respectively; of carrier strains, serotypes 6A, 6B, 19F and 23F were predominant. Conclusions. A 10-valent conjugate vaccine could offer a better coverage for meningeal strains.

Objetivo. Identificar serotipos y susceptibilidad en cepas aisladas de 48 niños con infecciones invasivas y de 50 portadores. Material y métodos. Serotipificación mediante reacción de Quellung y susceptibilidad mediante Kirby-Bauer y E-test. Resultados. De 31 cepas meníngeas, predominaron serotipos 19F, 3, 6B, 14 y 23F y la resistencia a penicilina (P) y trimetoprim-sulfametoxazol (SXT) fue de 16 y 58 por ciento. En 17 cepas invasivas no meníngeas, predominaron serotipos 19F y 3 y la resistencia a P y SXT fue de 0 y 82 por ciento, en cada caso. En portadores predominaron serotipos 6A, 6B, 19F y 23F. Conclusiones. La resistencia es similar a otros informes. La vacuna conjugada 10-valente podría ofrecer mejor cobertura para serotipos asociados a meningitis.

Estudio mediante PCR múltiple de serotipos de Listeria monocytogenes aislados en Argentina / Study by multiplex PCR of Listeria monocytogenes serotypes isolated in Argentine

Se comparó una PCR múltiple recientemente validada para la caracterización de serotipos de Listeria monocytogenes con el método tradicional de serotipificación. Se estudiaron 342 aislamientos de origen humano, alimentario, veterinario y ambiental obtenidos durante el período 1992-2005. La concordancia entre ambos métodos para los serotipos 1/2a, 1/2b y 1/2c fue del 100%, y para el serotipo 4b fue del 98%. La serotipificación constituye una herramienta importante como primer nivel de diferenciación de cepas de L. monocytogenes para llevar a cabo la vigilancia epidemiológica y, sobre todo, el estudio de brotes. La PCR múltiple es una técnica alternativa rápida, de bajo costo y fácilmente adaptable en laboratorios de bacteriología clínica y bromatología.

A multiplex PCR assay, recently validated to characterize the serotypes of Listeria monocytogenes was evaluated in comparison to conventional serotyping. Three hundred forty two L. monocytogenes strains isolated from human, food, animal and environmental sources during the 1992-2005 period were assayed. The concordance between the two methods for serotypes 1/2a, 1/2b and 1/2c was 100%, whereas for serotype 4b it was 98%. Serotyping is a useful tool for first line strain differentiation during epidemiological surveillance and outbreaks. The multiplex PCR assay offers a fast and low-cost alternative, which is easily adaptable to clinical bacteriology and bromatology laboratories.

Identificación rápida de los serotipos del virus del dengue mediante la reacción en cadena de la polimerasa

Se emplearon 4 juegos de cebadores que permitieron la amplificación de una secuencia nucleotídica con talla única para cada uno de los serotipos del virus del dengue mediante la reacción en cadena de la polimerasa (RCP), con un método que consistió de extracción del ácido ribonucleico (ARN) de sobrenadante de cultivos celulares infectados, transcripción reversa - reacción en cadena de la polimerasa (TR-RCP), todo lo cual pudo ser completado en aproximadamente 7 horas, en un simple tubo. La talla de la secuencia amplificada se evidenció por electroforesis en un gel de agarosa, teñido con bromuro de etidio. El método demostró una sensibilidad de al menos 2,5 unidades formadoras de placa (ufp) por tubo de reacción, siendo útil para la detección e identificación simultánea de los 4 serotipos, a partir de sobrenadante de cultivos infectados de cepas provenientes de varios países del Caribe, América Central y del Sur.

4 primer sets, were used to allow the amplification of a nucleotide sequence with unique size for each of the dengue virus serotypes by polymerase chain reaction (PRC). The method consisted in the extraction of ribonucleic acid from supernatant of infected cell cultures, reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR). This was completed in approximately 7 hours in a simple tube. The size of the amplified sequence was evidenced by electrophoresis in Agarose gel stained with ethidium. The method showed a sensitivity of at least 2.5 plate forming units (pfu) per tube of reaction. It es useful for the detection and simultaneous identification of the 4 serotypes, starting from supernatants of infected strains cultures from different countries of the Caribbean, Central America, and South America.